MARBECL’objectif général de l’UMR concerne l’étude de la biodiversité marine des écosystèmes lagunaires, côtiers et hauturiers à différents niveaux d’intégration (moléculaire, individu, population et communauté), et des usages de cette biodiversité par l’Homme.

S’appuyant sur des outils variés d’observation, d’expérimentation, d’analyse et de modélisation, l’unité répond plus spécifiquement aux objectifs suivants :

  • décrire la biodiversité marine, comprendre sa dynamique et le fonctionnement des écosystèmes marins ;
  • analyser l’impact des pressions anthropiques sur ces écosystèmes et développer des scenarii de réponses au changement global ;
  • concilier exploitation (en particulier pêche et aquaculture) et conservation et répondre aux attentes sociétales (expertise, innovation, remédiation).

Label : Unité Mixte de Recherche (UMR)
Tutelles principales : UM, IRD, CNRS, IFREMER
Département scientifique : Biologie, écologie, évolution, environnement, sciences de la terre et de l’eau
École doctorale : Biodiversité, Agriculture, Alimentation, Environnement, Terre, Eau

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2022

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titre
Circulating serogroups of Leptospira in swine from a 7-year study in France (2011–2017)
auteur
Jeanne Naudet, Laurent Crespin, Julien Cappelle, Angeli Kodjo, Florence Ayral
article
Porcine health management, BioMed Central, 2022, 8 (1), ⟨10.1186/s40813-022-00257-y⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03633965/file/s40813-022-00257-y.pdf BibTex
titre
Diversity of fishes collected with light traps in the oldest marine protected area in Vietnam revealed by DNA barcoding
auteur
Manh Hung Pham, Duc Huy Hoang, Jacques Panfili, Dominique Ponton, Jean-Dominique Durand
article
Marine Biodiversity, Springer Verlag, 2022, 52 (3), pp.30. ⟨10.1007/s12526-022-01266-4⟩
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titre
Electronic tagging of Bluefin Tunas from the Maltese spawning ground suggests size-dependent migration dynamics
auteur
Tristan Rouyer, Serge Bernard, Vincent Kerzérho, Nicolas Giordano, François Giordano, Salvu Ellul, Giovanni Ellul, Olivier Derridj, Rémy Canet, Simeon Deguara, Bertrand Wendling, Sylvain Bonhommeau
article
Environmental Biology of Fishes, Springer, 2022, ⟨10.1007/s10641-022-01262-4⟩
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https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-03656290/file/RouyerEtAl2022.pdf BibTex
titre
Impacts of nutrient loading and fish grazing on the phytoplankton community and cyanotoxin production in a shallow tropical lake: Results from mesocosm experiments
auteur
Mathias Ahoutou, Eric Kouamé Yao, Rosine Djeha, Mamadou Kone, Kevin Tambosco, Charlotte Duval, Sahima Hamlaoui, Cécile Bernard, Marc Bouvy, Benjamin Marie, Bernard Montuelle, Marc Troussellier, Felix Konan, Julien Kalpy Coulibaly, Mireille Dosso, Jean-François Humbert, Catherine Quiblier
article
MicrobiologyOpen, Wiley, 2022, 11 (2), ⟨10.1002/mbo3.1278⟩
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titre
Monoculture and co-culture tests of the toxicity of four typical herbicides on growth, photosynthesis and oxidative stress responses of the marine diatoms Pseudo-nitzschia mannii and Chaetoceros decipiens
auteur
Inès Sahraoui, Sondes Melliti Ben Garali, Zoubaida Chakroun, Catherine Gonzalez, Asma Sakka Hlaili, Olivier Pringault
article
Ecotoxicology, Springer Verlag, 2022, ⟨10.1007/s10646-022-02535-5⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03619663/file/Saraoui%20et%20al%20Ecotoxicology%202022%20Version%20finale%20%281%29.pdf BibTex
titre
Revising the Impact and Prospects of Activity and Ventilation Rate Bio-Loggers for Tracking Welfare and Fish-Environment Interactions in Salmonids and Mediterranean Farmed Fish
auteur
Josep Calduch-Giner, Paul George Holhorea, Miguel Ángel Ferrer, Fernando Naya-Català, Enrique Rosell-Moll, Carlos Vega García, Patrick Prunet, Åsa Espmark, Isabelle Leguen, Jelena Kolarevic, Aurelio Vega, Thierry Kerneis, Lionel Goardon, Juan Manuel Afonso, Jaume Pérez-Sánchez
article
Frontiers in Marine Science, Frontiers Media, 2022, 9, ⟨10.3389/fmars.2022.854888⟩
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titre
A bottom-up practitioner-derived set of Essential Variables for Protected Area management
auteur
Herman Hummel, Valerie Kalle, Louise Bienfait, Yolande Boyer, Marco Heurich, Juraj Svajda, Mihai Adamescu, Constantin Cazacu, Félix Medina, Rasa Morkūnė, Arturas Razinkovas-Baziukas, Dimitris Poursanidis, Orhideja Tasevska, Ajman Al Malla, Ana Stritih, Christian Rossi, Salvador Arenas-Castro, Claudia Carvalho-Santos, Izak Smit, Emiliana Valentini, Alessandra Xuan, Daniel Orenstein, Antonello Provenzale, Rutger de Wit, Christiaan Hummel
article
Environmental and Sustainability Indicators, 2022, 14, ⟨10.1016/j.indic.2022.100179⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03605241/file/Hummel-2020-etal.pdf BibTex
titre
Insight into the morphology and genetic diversity of the Chaetoceros tenuissimus (Bacillariophyta) species complex
auteur
Daniel Grzebyk, Vanina Pasqualini, Marie Garrido, Yann Quilichini, Clément Pereto, Philippe Cecchi
article
European Journal of Phycology, Taylor & Francis, 2022, pp.1-19. ⟨10.1080/09670262.2022.2029949⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-03597744/file/Grzebyk_TEJP_2021_0096_accepted_for_publication_preprint.pdf BibTex
titre
Climate and land‐use driven reorganisation of structure and function in river macroinvertebrate communities
auteur
Théophile Mouton, Fabien Leprieur, Mathieu Floury, Fabrice Stephenson, Piet Verburg, Jonathan Tonkin
article
Ecography, Wiley, 2022, 2022 (3, e06148), ⟨10.1111/ecog.06148⟩
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titre
The role of mesopelagic fishes as microplastics vectors across the deep-sea layers from the Southwestern Tropical Atlantic
auteur
Anne K.S. Justino, Guilherme V.B. Ferreira, Natascha Schmidt, Leandro N. Eduardo, Vincent Fauvelle, Véronique Lenoble, Richard Sempéré, Christos Panagiotopoulos, Michael Mincarone, Thierry Frédou, Flávia Lucena-Frédou
article
Environmental Pollution (Elsevier), 2022, 300, pp.118988. ⟨10.1016/j.envpol.2022.118988⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03595969/file/proof_ENPO_118988.pdf BibTex
titre
Patterns of eukaryotic diversity from the surface to the deep-ocean sediment
auteur
Tristan Cordier, Inès Barrenechea Angeles, Nicolas Henry, Franck Lejzerowicz, Cédric Berney, Raphaël Morard, Angelika Brandt, Marie-Anne Cambon-Bonavita, Lionel Guidi, Fabien Lombard, Pedro Martinez Arbizu, Ramon Massana, Covadonga Orejas, Julie Poulain, Craig Smith, Patrick Wincker, Sophie Arnaud-Haond, Andrew Gooday, Colomban de Vargas, Jan Pawlowski
article
Science Advances , American Association for the Advancement of Science (AAAS), 2022, 8 (5), ⟨10.1126/sciadv.abj9309⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03561462/file/sciadv.abj9309.pdf BibTex
titre
Impact of a divergent selective breeding programme on individual feed conversion ratio in Nile tilapia Oreochromis niloticus measured in groups by video-recording
auteur
Hugues de Verdal, Pierrick Haffray, Vincent Douchet, Marc Vandeputte
article
Aquaculture, 2022, 548, ⟨10.1016/j.aquaculture.2021.737572⟩
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titre
Macrozooplankton and micronekton diversity and associated carbon vertical patterns and fluxes under distinct productive conditions around the Kerguelen Islands
auteur
Cédric Cotté, A. Ariza, Adrien Berne, J. Habasque, A. Lebourges-Dhaussy, G. Roudaut, B. Espinasse, B.P.V. Hunt, E.A. Pakhomov, N. Henschke, C. Péron, Anna Conchon, C. Koedooder, Lloyd Izard, Y. Cherel
article
Journal of Marine Systems, Elsevier, 2022, 226, pp.103650. ⟨10.1016/j.jmarsys.2021.103650⟩
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titre
Smaller fish species in a warm and oxygen-poor Humboldt Current system
auteur
Renato Salvatteci, Ralph Schneider, Eric Galbraith, David Field, Thomas Blanz, Thorsten Bauersachs, Xavier Crosta, Philippe Martinez, Vincent Echevin, Florian Scholz, Arnaud Bertrand
article
Science, American Association for the Advancement of Science, 2022, ⟨10.1126/science.abj0270⟩
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titre
Acute and chronic toxicity assessments of 17β-estradiol (E2) and 17α-ethinylestradiol (EE2) on the calanoid copepod Acartia clausi: Effects on survival, development, sex-ratio and reproduction
auteur
Emna Djebbi, Mohamed Néjib Daly Yahia, Emilie Farcy, Delphine Bonnet, Olivier Pringault
article
Science of the Total Environment, Elsevier, 2022, 807, pp.150845. ⟨10.1016/j.scitotenv.2021.150845⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03644440/file/Djebbi%20et%20al%20STOTEN.pdf BibTex
titre
Trade-offs between bycatch and target catches in static versus dynamic fishery closures
auteur
Maite Pons, Jordan T. Watson, Daniel Ovando, Sandra Andraka, Stephanie Brodie, Andrés Domingo, Mark Fitchett, Rodrigo Forselledo, Martin Hall, Elliott L. Hazen, Jason E. Jannot, Miguel Herrera, Sebastián Jiménez, David M. Kaplan, Sven Kerwath, Jon Lopez, Jon Mcveigh, Lucas Pacheco, Liliana Rendon, Kate Richerson, Rodrigo Sant’ana, Rishi Sharma, James A. Smith, Kayleigh Somers, Ray Hilborn
article
Proceedings of the National Academy of Sciences, 2022, 119 (4), ⟨10.1073/pnas.2114508119⟩
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titre
Plant community impact on productivity: Trait diversity or key(stone) species effects?
auteur
Philipp Brun, Cyrille Violle, David Mouillot, Nicolas Mouquet, Brian J. Enquist, Francois Munoz, Tamara Munkemuller, Annette Ostling, Niklaus E. Zimmermann, Wilfried Thuiller
article
Ecology Letters, 2022, ⟨10.1111/ele.13968⟩
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titre
Identifying barriers to gene flow and hierarchical conservation units from seascape genomics: a modelling framework applied to a marine predator
auteur
Germain Boussarie, Paolo Momigliano, William D. Robbins, Lucas Bonnin, Jean-Francois Cornu, Cécile Fauvelot, Jeremy J. Kiszka, Stéphanie Manel, David Mouillot, Laurent Vigliola
article
Ecography, 2022, pp.e06158. ⟨10.1111/ecog.06158⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-03669632/file/Ecography%20-%202022%20-%20Boussarie%20-%20Identifying%20barriers%20to%20gene%20flow%20and%20hierarchical%20conservation%20units%20from%20seascape%20genomics.pdf BibTex
titre
Genomic insights into the historical and contemporary demographics of the grey reef shark
auteur
Cameron A. J. Walsh, Paolo Momigliano, Germain Boussarie, William D. Robbins, Lucas Bonnin, Cécile Fauvelot, Jeremy J. Kiszka, David Mouillot, Laurent Vigliola, Stephanie Manel
article
Heredity, 2022, ⟨10.1038/s41437-022-00514-4⟩
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titre
Metapopulation dynamics of multiple species in a heterogeneous landscape
auteur
Jelena H. Pantel, Thomas Lamy, Maxime Dubart, Jean-Pierre Pointier, Philippe Jarne, Patrice David
article
Ecological Monographs, 2022, pp.e1515. ⟨10.1002/ecm.1515⟩
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titre
Population-Genomic Analysis Identifies a Low Rate of Global Adaptive Fixation in the Proteins of the Cyclical Parthenogen Daphnia magna
auteur
Peter D. Fields, Seanna Mctaggart, Celine M. O. Reisser, Christoph Haag, William H. Palmer, Tom J. Little, Dieter Ebert, Darren J. Obbard
article
Molecular Biology and Evolution, 2022, 39 (3), pp.msac048. ⟨10.1093/molbev/msac048⟩
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titre
Temporal fluctuations in zooplankton size, abundance, and taxonomic composition since 1995 in the North Western Mediterranean Sea
auteur
Guillaume Feuilloley, Jean-Marc Fromentin, Claire Saraux, Jean-Olivier Irisson, Laetitia Jalabert, Lars Stemmann
article
ICES Journal of Marine Science, Oxford University Press (OUP), 2022, 79 (3), pp.882-900. ⟨10.1093/icesjms/fsab190⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03374991/file/Saraux_PapierWP2_ICES_preprint.pdf BibTex
titre
Subtle limits to connectivity revealed by outlier loci within two divergent metapopulations of the deep-sea hydrothermal gastropod Ifremeria nautilei
auteur
Adrien Tran Y. Lu, Stephanie Ruault, Claire Daguin-Thiebaut, Jade Castel, Nicolas Bierne, Thomas Broquet, Patrick Wincker, Aude Perdereau, Sophie Arnaud-Haond, Pierre-Alexandre Gagnaire, Didier Jollivet, Stéphane Hourdez, Francois Bonhomme
article
Molecular ecology, 2022, ⟨10.1111/mec.16430⟩
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titre
Benthic-pelagic coupling under juvenile oyster influence in a French Mediterranean coastal lagoon (Thau Lagoon)
auteur
Élise Lacoste, Beatrice Bec, Patrik Le Gall, Fehmi Boufahja, Patrick Raimbault, Grégory Messiaen, Vincent Ouisse, Emmanuelle Roque D’orbcastel, Dominique Munaron, Annie Fiandrino, Franck Lagarde, Sébastien Mas, Myriam Callier, Nabila Gaertner-Mazouni, Marion Richard
article
Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2022, 267, pp.107779. ⟨10.1016/j.ecss.2022.107779⟩
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titre
Simultaneous Study of the Growth and Grazing Mortality Rates of Microbial Food Web Components in a Mediterranean Coastal Lagoon
auteur
David Pecqueur, Justine Courboulès, Cécile Roques, Sébastien Mas, Romain Pete, Francesca Vidussi, Behzad Mostajir
article
Diversity, MDPI, 2022, 14 (3), pp.186. ⟨10.3390/d14030186⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03635499/file/diversity-14-00186-v2.pdf BibTex
titre
Length-weight relationships of four fish species from Fatala estuary, Guinea, West Africa
auteur
O. Sadio, Monique Simier, François Le Loc’h, Luis Tito de Morais
article
Journal of Applied Ichthyology, Wiley, In press, ⟨10.1111/jai.14318⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03652505/file/LWR_4_Fish_Species_Guinea_Conakry_Sadio_final_Version.pdf BibTex
titre
Les déchets plastiques dans l’océan au cœur de l’Aquathon d’Abidjan, Côte d’Ivoire
auteur
Ahou Rachel Koumi, Fatou Shcherazade Ouattara-Soro, Yves Quéré, Yann Louault, Amalatchy Jacqueline Yayo N’cho, Safiatou Coulibaly, Koffi Marcellin Yao, Boua Célestin Atsé, Yacouba Sankare, Philippe Cecchi
article
Natures Sciences Sociétés, 2022, ⟨10.1051/nss/2022004⟩
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titre
Unifying approaches to Functional Marine Connectivity for improved marine resource management: the European SEA-UNICORN COST Action
auteur
Audrey Darnaude, Sophie Arnaud-Haond, Ewan Hunter, Oscar Gaggiotti, Anna Sturrock, Maria Beger, Filip Volckaert, Angel Pérez-Ruzafa, Lucía López-López, Susanne E. Tanner, Cemal Turan, Servet Ahmet Doğdu, Stelios Katsanevakis, Federica Costantini
article
Research Ideas and Outcomes, 2022, 8, pp.e80223. ⟨10.3897/rio.8.e80223⟩
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titre
Ontogenetic Changes in Blood Osmolality During the Postembryonic Development of Zebrafish (Danio rerio)
auteur
Guy Charmantier, Mai Nguyen-Chi, Georges Lutfalla
article
Zebrafish, 2022, ⟨10.1089/zeb.2021.0075⟩
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BibTex
titre
Can We Avoid Tacit Trade-Offs between Flexibility and Efficiency in Systematic Conservation Planning? The Mediterranean Sea as a Case Study
auteur
Sabrine Drira, Frida Ben Rais Lasram, Tarek Hattab, Yunne-Jai Shin, Amel Ben Rejeb Jenhani, Francois Guilhaumon
article
DIVERSITY-BASEL, 2022, 14 (1), pp.9. ⟨10.3390/d14010009⟩
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BibTex
titre
Brownification reduces oxygen gross primary production and community respiration and changes the phytoplankton community composition: An in situ mesocosm experiment with high-frequency sensor measurements in a North Atlantic bay
auteur
Johanna Knechtel, Jens C. Nejstgaard, Ulrich Sommer, Francesca Vidussi, Behzad Mostajir, Tanguy Soulié, Herwig Stibor, Sebastien Mas, Benjamin Braun
article
Limnology and Oceanography, 2022, ⟨10.1002/lno.12041⟩
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titre
Contemporary environment and historical legacy explain functional diversity of freshwater fishes in the world rivers
auteur
Guohuan Su, Pablo A. Tedesco, Aurele Toussaint, Sébastien Villéger, Sebastien Brosse
article
Global Ecology and Biogeography, 2022, ⟨10.1111/geb.13455⟩
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BibTex
titre
Functional Stability of a Coastal Mediterranean Plankton Community During an Experimental Marine Heatwave
auteur
Tanguy Soulié, Francesca Vidussi, Sebastien Mas, Behzad Mostajir
article
Frontiers in Marine Science, 2022, 9, pp.831496. ⟨10.3389/fmars.2022.831496⟩
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BibTex
titre
Baited video reveal fish diversity in the vast inter-reef habitats of a marine tropical lagoon
auteur
Florian Baletaud, Antoine Gilbert, David Mouillot, Jean-Marie Come, Laurent Vigliola
article
Marine Biodiversity, 2022, 52 (2), pp.16. ⟨10.1007/s12526-021-01251-3⟩
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BibTex
titre
Leveraging social media and deep learning to detect rare megafauna in video surveys
auteur
Laura Mannocci, Sébastien Villon, Marc Chaumont, Nacim Guellati, Nicolas Mouquet, Corina Iovan, Laurent Vigliola, David Mouillot
article
Conservation Biology, Wiley, In press, ⟨10.1111/cobi.13798⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03405365/file/Conservation%20Biology%20-%202021%20-%20Mannocci%20-%20Leveraging%20social%20media%20and%20deep%20learning%20to%20detect%20rare%20megafauna%20in%20video.pdf BibTex
titre
A quantitative review of abundance-based species distribution models
auteur
Conor Waldock, Rick D. Stuart-Smith, Camille Albouy, William W. L. Cheung, Graham J. Edgar, David Mouillot, Jerry Tjiputra, Loic Pellissier
article
Ecography, 2022, 2022 (1), ⟨10.1111/ecog.05694⟩
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BibTex
titre
A novel method to individually track spawning females in aquaculture tanks using the European sea bass (Dicentrarchus labrax) as a model
auteur
Stephane Lallement, Allan Bengue, Benjamin Geffroy
article
Aquaculture, 2022, 551, pp.737937. ⟨10.1016/j.aquaculture.2022.737937⟩
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titre
Ecological trap for seabirds due to the contamination caused by the Fundão dam collapse, Brazil
auteur
Guilherme Tavares Nunes, Márcio Amorim Efe, Cindy Tavares Barreto, Juliana Vallim Gaiotto, Aline Barbosa Silva, Fiorella Vilela, Amédée Roy, Sophie Bertrand, Patrícia Gomes Costa, Adalto Bianchini, Leandro Bugoni
article
Science of The Total Environment, 2022, 807, pp.151486. ⟨10.1016/j.scitotenv.2021.151486⟩
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BibTex
titre
Using species distribution models only may underestimate climate change impacts on future marine biodiversity
auteur
Fabien Moullec, Nicolas Barrier, Sabrine Drira, Francois Guilhaumon, Tarek Hattab, Myron A. Peck, Yunne-Jai Shin
article
ECOLOGICAL MODELLING, 2022, 464, pp.109826. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2021.109826⟩
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titre
Uncoupled changes in phytoplankton biomass and size structure in the western tropical Atlantic
auteur
Gabriel Bittencourt Farias, Juan-Carlos Molinero, Claire Carré, Arnaud Bertrand, Beatrice Bec, Pedro Augusto Castro Melo
article
Journal of Marine Systems, 2022, 227, pp.103696. ⟨10.1016/j.jmarsys.2021.103696⟩
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titre
Ranking the biases: The choice of OTUs vs. ASVs in 16S rRNA amplicon data analysis has stronger effects on diversity measures than rarefaction and OTU identity threshold
auteur
Marlene Chiarello, Mark Mccauley, Sébastien Villéger, Colin R. Jackson
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2022, 17 (2), pp.e0264443. ⟨10.1371/journal.pone.0264443⟩
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titre
Do microbial planktonic communities reflect the ecological changes of Glorieuses coral reefs (Iles Eparses, Western Indian Ocean)?
auteur
Marc Bouvy, Alice Belieres, Claire Carré, Patrice Got, Marc Pagano, Hélène Agogué, Beatrice Bec, Cécile Roques, Lionel Bigot, Pascale Chabanet, Christine Dupuy
article
Marine Pollution Bulletin, 2022, 174, pp.113218. ⟨10.1016/j.marpolbul.2021.113218⟩
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titre
Mercury concentrations, biomagnification and isotopic discrimination factors in two seabird species from the Humboldt Current ecosystem
auteur
Gaël Le Croizier, David Point, Marina Renedo, Jean-Marie Munaron, Pepe Espinoza, Felipe Amezcua-Martinez, Sophie Lanco Bertrand, Anne Lorrain
article
Marine Pollution Bulletin, 2022, 177, pp.113481. ⟨10.1016/j.marpolbul.2022.113481⟩
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titre
Influence of aphotic haloclines and euxinia on organic biomarkers and microbial communities in a thalassohaline and alkaline volcanic crater lake
auteur
David Sala, Vincent Grossi, Hélène Agogué, Christophe Leboulanger, Didier Jézéquel, Gérard Sarazin, Ingrid Antheaume, Cécile Bernard, Magali Ader, Mylène Hugoni
article
Geobiology, Wiley, 2022, 20 (2), pp.292-309. ⟨10.1111/gbi.12477⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03404766/file/Sala_2021_Geobiology_HAL.pdf BibTex
titre
Similar trait structure and vulnerability in pelagic fish faunas on two remote island systems
auteur
Virginie Marques, Clara Peron, Régis Hocdé, Andrea Polanco Fernandez, Loic Pellissier, Sébastien Villéger, David Mouillot, Tom B. Letessier, Madeline Steinberg, Jean-Baptiste Juhel
article
Marine Biology, 2022, 169 (1), pp.15. ⟨10.1007/s00227-021-03998-6⟩
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titre
Evaluating the Hatchery Program of a Highly Exploited Shrimp Stock (Fenneropenaeus chinensis) in a Temperate Marine Ecosystem
auteur
Lei Xing, Yong Chen, Kisei R. Tanaka, Nicolas Barrier, Yiping Ren
article
Frontiers in Marine Science, 2022, 9, pp.789805. ⟨10.3389/fmars.2022.789805⟩
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titre
Monthly anomaly database of atmospheric and oceanic parameters in the tropical Atlantic ocean
auteur
H. L. Varona, F. Hernandez, A. Bertrand, M. Araujo
article
Data in Brief, 2022, 41, pp.107969. ⟨10.1016/j.dib.2022.107969⟩
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titre
Phytoplankton dynamics and bloom events in oligotrophic Mediterranean lagoons: seasonal patterns but hazardous trends
auteur
Viviana Ligorini, Nathalie Malet, Marie Garrido, Valérie Derolez, Mathilde Amand, Béatrice Bec, Philippe Cecchi, Vanina Pasqualini
article
HYDROBIOLOGIA, 2022, ⟨10.1007/s10750-022-04874-0⟩
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titre
Global-Scale Environmental Niche and Habitat of Blue Shark (Prionace glauca) by Size and Sex: A Pivotal Step to Improving Stock Management
auteur
Humberto Hazin, Paulo Travassos, Jean-Noël Druon, Steven Campana, Frederic Vandeperre, Fábio H. V. Hazin, Heather Bowlby, Rui Coelho, Nuno Queiroz, Fabrizio Serena, Francisco Abascal, Dimitrios Damalas, Michael Musyl, Jon Lopez, Barbara Block, Pedro Afonso, Heidi Dewar, Philippe S. Sabarros, Brittany Finucci, Antonella Zanzi, Pascal Bach, Inna Senina, Fulvio Garibaldi, David W. Sims, Joan Navarro, Pablo Cermeño, Agostino Leone, Guzmán Diez, María Teresa Carreón Zapiain, Michele Deflorio, Evgeny V. Romanov, Armelle Jung, Matthieu Lapinski, Malcolm P. Francis
article
Frontiers in Marine Science, 2022, 9
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titre
Marine turtles of the African east coast: current knowledge and priorities for conservation and research
auteur
Casper H. Geer, Jérôme Bourjea, Annette C. Broderick, Mayeul Dalleau, Raquel S. Fernandes, Linda R. Harris, Gelica E. Inteca, Fikiri K. Kiponda, Cristina M. M. Louro, Jeanne A. Mortimer, Daudi Msangameno, Lily D. Mwasi, Ronel Nel, Gladys M. Okemwa, Mike Olendo, Marcos A. M. Pereira, Alan F. Rees, Isabel Silva, Sonal Singh, Lindsey West, Jessica L. Williams, Brendan J. Godley
article
Endangered Species Research, 2022, 47, pp.297--331. ⟨10.3354/esr01180⟩
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BibTex
titre
Misidentification of free school tunas in the AOTTP database: Issues to identify fish-attractive seamounts
auteur
Sosthène Akia, Ilan Perez, Loreleï Guéry, Daniel Gaertner
article
Fisheries Research, 2022, 251, pp.106324. ⟨10.1016/j.fishres.2022.106324⟩
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BibTex
titre
Tag-shedding rates for tropical tuna species in the Atlantic Ocean estimated from double-tagging data
auteur
Daniel Gaertner, Loreleï Guéry, N. Goñi, Justin Monin Amandé, P. Pascual Alayon, F. N'Gom, J. Pereira, E. Addi, L. Ailloud, D. Beare
article
Fisheries Research, 2022, 248, pp.106211. ⟨10.1016/j.fishres.2021.106211⟩
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titre
Further Record of the Deep-Sea Euphausiid, Thysanopoda Cristata G. O. Sars, 1883 (euphausiacea, Euphausiidae) from the Southwestern Atlantic: With Comments on Morphological Variations
auteur
F. A. Alves-Junior, L. F. Andrade, A. Bertrand, S. Neumann-Leitao
article
CRUSTACEANA, 2022, 95 (2), pp.137--146. ⟨10.1163/15685403-bja10185⟩
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titre
Movement Shapes the Structure of Fish Communities Along a Cross-Shore Section in the California Current
auteur
Jerome Guiet, Daniele Bianchi, Olivier Maury, Nicolas Barrier, Fayçal Kessouri
article
Frontiers in Marine Science, 2022, 9, pp.785282. ⟨10.3389/fmars.2022.785282⟩
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titre
Recovery at sea of abandoned, lost or discarded drifting fish aggregating devices
auteur
Taha Imzilen, Christophe Lett, Emmanuel Chassot, Alexandra Maufroy, Michel Goujon, David M. Kaplan
article
Nature Sustainability, 2022, pp.1--10. ⟨10.1038/s41893-022-00883-y⟩
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titre
Gene expression plasticity, genetic variation and fatty acid remodelling in divergent populations of a tropical bivalve species
auteur
Jérémy Le Luyer, Cristian Monaco, Léo Milhade, Céline Reisser, Claude Soyez, Hirohiti Raapoto, Corinne Belliard, Gilles Le Moullac, Chin‐long Ky, Fabrice Pernet
article
Journal of Animal Ecology, Wiley, In press, ⟨10.1111/1365-2656.13706⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03659480/file/LeLuyer-2022-JAnimEcol-GeneExpression-MANUSCRIT.pdf BibTex
titre
Using generative adversarial networks (GAN) to simulate central-place foraging trajectories
auteur
Amédée Roy, Ronan Fablet, Sophie Lanco Bertrand
article
Methods in Ecology and Evolution, 2022, ⟨10.1111/2041-210X.13853⟩
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titre
Long distance runners in the marine realm: New insights into genetic diversity, kin relationships and social fidelity of Indian Ocean male sperm whales
auteur
Justine Girardet, Francois Sarano, Gaëtan Richard, Paul Tixier, Christophe Guinet, Alana Alexander, Véronique Sarano, Hugues Vitry, Axel Preud’homme, René Heuzey, Ana Garcia-Cegarra, Olivier Adam, Bénédicte Madon, Jean-Luc Jung
article
Frontiers in Marine Science, Frontiers Media, 2022, 9, pp.815564. ⟨10.3389/fmars.2022.815684⟩
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titre
mFD: an R package to compute and illustrate the multiple facets of functional diversity
auteur
Camille Magneville, Nicolas Loiseau, Camille Albouy, Nicolas Casajus, Thomas Claverie, Arthur Escalas, Fabien Leprieur, Eva Maire, David Mouillot, Sébastien Villéger
article
Ecography, 2022, 2022 (1), ⟨10.1111/ecog.05904⟩
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titre
Functionally distinct tree species support long-term productivity in extreme environments
auteur
Leo Delalandre, Pierre Gauzere, Wilfried Thuiller, Marc Cadotte, Nicolas Mouquet, David Mouillot, Francois Munoz, Pierre Denelle, Nicolas Loiseau, Xavier Morin, Cyrille Violle
article
Proceedings of The Royal Society B-Biological Sciences, 2022, 289 (1967), pp.20211694. ⟨10.1098/rspb.2021.1694⟩
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titre
Drivers of at-vessel mortality of the blue shark (Prionace glauca) and oceanic whitetip shark (Carcharhinus longimanus) assessed from monitored pelagic longline experiments
auteur
Yoluène Massey, Philippe Sabarros, Pascal Bach
article
CANADIAN JOURNAL OF FISHERIES AND AQUATIC SCIENCES, 2022, ⟨10.1139/cjfas-2021-0273⟩
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titre
Actions to halt biodiversity loss generally benefit the climate
auteur
Yunne-Jai Shin, Guy F. Midgley, Emma R. M. Archer, Almut Arneth, David K. A. Barnes, Lena Chan, Shizuka Hashimoto, Ove Hoegh-Guldberg, Gregory Insarov, Paul Leadley, Lisa A. Levin, Hien T. Ngo, Ram Pandit, Aliny P. F. Pires, Hans-Otto Poertner, Alex D. Rogers, Robert J. Scholes, Josef Settele, Pete Smith
article
GLOBAL CHANGE BIOLOGY, 2022, ⟨10.1111/gcb.16109⟩
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titre
Influence of phylogenetic scale on the relationships of taxonomic and phylogenetic turnovers with environment for angiosperms in China
auteur
Hong Qian, Fabien Leprieur, Yi Jin, Xianli Wang, Tao Deng
article
ECOLOGY AND EVOLUTION, 2022, 12 (2), pp.e8544. ⟨10.1002/ece3.8544⟩
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titre
Resource partitioning as a mechanism for trophic segregation in sympatric otariids from the productive upwelling Peruvian Humboldt Current System
auteur
Susana Cardenas-Alayza, Daniel A. Torres, Dimitri Gutierrez, Yann Tremblay
article
Austral Ecology, 2022, ⟨10.1111/aec.13158⟩
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titre
Diluted Seawater and Ammonia-N Tolerance of Two Mangrove Crab Species. New Insights to Understand the Vulnerability of Pristine Islands Ecosystems Organisms
auteur
Laura Megevand, Dimitri Theuerkauff, Claire l'Epine, Sophie Hermet, Emmanuel Corse, Thibaut l'Honore, Jehan-Herve Lignot, Elliott Sucre
article
Frontiers in Ecology and Evolution, 2022, 10, pp.839160. ⟨10.3389/fevo.2022.839160⟩
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titre
Quantifying killer whale depredation in the blue-eye trevalla commercial fisheries of south-east Australia
auteur
Yash Gimonkar, Mary-Anne Lea, Paul Burch, John P. Y. Arnould, Miriana Sporcic, Paul Tixier
article
Ocean & Coastal Management, 2022, 221, pp.106114. ⟨10.1016/j.ocecoaman.2022.106114⟩
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titre
Spatial-temporal variation of the Western Mediterranean Sea biodiversity along a latitudinal gradient
auteur
Maria Grazia Pennino, Encarnacion Garcia, Antonio Esteban, Cristina Garcia-Ruiz, Grégoire Certain, Sandrine Vaz, Angelique Jadaud, Marta Coll, Carlos Veloy, Manuel Hidalgo
article
Ecological Indicators, 2022, 136, pp.108674. ⟨10.1016/j.ecolind.2022.108674⟩
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titre
Patterns of microphytoplankton biomass and diversity in the southern Alboran Sea
auteur
Hajar Idmoussi, Laila Somoue, Francesc Peters, Herve Demarcq, Mohamed Laabir, Marta Estrada, Laura Arin, Ahmed Makaoui, Omar Ettahiri, Tarik Baibai, Said Charib, Karim Hilmi, Ahmed Errhif
article
Mediterranean Marine Science, 2022, 23 (1), pp.103--114. ⟨10.12681/mms.27555⟩
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titre
Is Holothuria tubulosa the golden goose of ecological aquaculture in the Mediterranean Sea?
auteur
Bastien Sadoul, Jean-Philippe Caprioli, Chloé Barrier-Loiseau, Nicolas Cimiterra, Thierry Laugier, Franck Lagarde, Killian Chary, Myriam Callier, Marine-Océane Guillermard, Emmanuelle Roque d'Orbcastel
article
Aquaculture, 2022, 554, pp.738149. ⟨10.1016/j.aquaculture.2022.738149⟩
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titre
Deep inference of seabird dives from GPS-only records: Performance and generalization properties
auteur
Amédée Roy, Sophie Lanco Bertrand, Ronan Fablet
article
PLOS Computational Biology, 2022, 18 (3), pp.e1009890. ⟨10.1371/journal.pcbi.1009890⟩
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titre
Description of a new species and first records of trombidiformes and parasitengona on the common coot and the mallard in Algeria
auteur
Aicha Beya Mammeria, Idir Bitam, Rafik Meddour, Rutger de Wit
article
Bulletin De La Societe Zoologique De France, Societe Zoologique De France, 2022, 147 (1), pp.3-7
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03662069/file/Mammeria-etal-2022-BulletinSocZoolFrance.pdf BibTex
titre
Underwater photogrammetry reveals new links between coral reefscape traits and fishes that ensure key functions
auteur
Isabel Urbina-Barreto, Simon Elise, Francois Guilhaumon, J. Henrich Bruggemann, Romain Pinel, Michel Kulbicki, Laurent Vigliola, Gerard Mou-Tham, Vincent Mahamadaly, Mathilde Facon, Sophie Bureau, Christophe Peignon, Eric Dutrieux, Remi Garnier, Lucie Penin, Mehdi Adjeroud
article
Ecosphere, 2022, 13 (2), pp.e3934. ⟨10.1002/ecs2.3934⟩
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titre
Diet Metabarcoding Reveals Extensive Dietary Overlap between Two Benthic Stream Fishes (Zingel asper and Cottus gobio) and Provides Insights into Their Coexistence
auteur
Kurt Villsen, Emmanue Cors, Gaït Archambaud-Suard, Kévin Héran, Emese Meglécz, Alexander Ereskovsky, Rémi Chappaz, Vincent Dubut
article
Diversity, MDPI, 2022, 14 (5), pp.412. ⟨10.3390/d14050412⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03676193/file/Villsen%20et_2022.pdf BibTex
titre
Lacunae rostralis: A new structure on the rostrum of sailfish Istiophorus platypterus
auteur
Jan Häge, Matthew J. Hansen, Korbinian Pacher, Félicie Dhellemmes, Paolo Domenici, John F. Steffensen, Michael Breuker, Stefan Krause, Thomas B. Hildebrandt, Guido Fritsch, Pascal Bach, Philippe S. Sabarros, Paul Zaslansky, Kristin Mahlow, Maria Schauer, Johannes Müller, Jens Krause
article
JOURNAL OF FISH BIOLOGY, 2022, ⟨10.1111/jfb.15018⟩
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titre
Once upon a time biomass burning in the western Alps: Nesting effects of climate and local drivers on long-term subalpine fires
auteur
Christopher Carcaillet, Benjamin Boulley, Frédérique Carcaillet
article
Forest Ecosystems, Springer, 2022, 9, pp.100024. ⟨10.1016/j.fecs.2022.100024⟩
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titre
Cross-ocean patterns and processes in fish biodiversity on coral reefs through the lens of eDNA metabarcoding
auteur
Laetitia Mathon, Virginie Marques, David Mouillot, Camille Albouy, Marco Andrello, Florian Baletaud, Giomar H. Borrero-Pérez, Tony Dejean, Graham J. Edgar, Jonathan Grondin, Pierre-Edouard Guerin, Régis Hocdé, Jean-Baptiste Juhel, Null Kadarusman, Eva Maire, Gael Mariani, Matthew Mclean, Andrea Polanco F., Laurent Pouyaud, Rick D. Stuart-Smith, Hagi Yulia Sugeha, Alice Valentini, Laurent Vigliola, Indra B. Vimono, Loic Pellissier, Stephanie Manel
article
Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 2022, 289 (1973), pp.20220162. ⟨10.1098/rspb.2022.0162⟩
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titre
New technologies can support data collection on endangered shark species in the Mediterranean Sea
auteur
Filippo Bargnesi, Stefano Moro, Agostino Leone, Ioannis Giovos, Francesco Ferretti
article
MARINE ECOLOGY PROGRESS SERIES, 2022, 689, pp.57--76. ⟨10.3354/meps14030⟩
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titre
Assessing the effectiveness of dFADs fishing moratorium in the Eastern Atlantic Ocean for conservation of juvenile tunas from AOTTP data
auteur
Ilan Perez, Loreleï Guéry, Matthieu Authier, Daniel Gaertner
article
Fisheries Research, 2022, 253, pp.106360. ⟨10.1016/j.fishres.2022.106360⟩
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titre
Mediterranean Temporary Lagoon: Proposal for a definition of this endangered habitat to improve its conservation
auteur
Mathilde Latron, Aubin Allies, Olivier Argagnon, Nadine Bosc, Karine Faure, Hugo Fontes, Patrick Grillas, James Molina, Rutger Wit, Guillaume Papuga
article
Journal for Nature Conservation, 2022, 68, pp.126193. ⟨10.1016/j.jnc.2022.126193⟩
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titre
Potential for genomic selection on feed efficiency in gilthead sea bream (Sparus aurata), based on individual feed conversion ratio, carcass and lipid traits
auteur
François Allal, Marc Vandeputte, Mathieu Besson, Nicky Rombout, Germain Salou, Alain Vergnet, Sophie Cariou, Jean-Sébastien Bruant, Marisol Izquierdo, Anastasia Bestin, Frédéric Clota, Pierrick Haffray
article
Aquaculture Reports, 2022, 24, pp.101132. ⟨10.1016/j.aqrep.2022.101132⟩
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titre
Extreme variability in European eel growth revealed by an extended mark and recapture experiment in southern France and implications for management
auteur
Jacques Panfili, Clarisse Boulenger, Camille Musseau, Alain J. Crivelli
article
CANADIAN JOURNAL OF FISHERIES AND AQUATIC SCIENCES, 2022, 79 (4), pp.631--641. ⟨10.1139/cjfas-2020-0419⟩
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Communication dans un congrès

titre
Risk-averse optimisation for the marine reserve site selection: chance constraint by sampling approximation approach
auteur
Adrien Brunel, Jérémy Omer, Sophie Bertrand
article
23ème congrès annuel de la Société Française de Recherche Opérationnelle et d'Aide à la Décision, INSA Lyon, Feb 2022, Villeurbanne - Lyon, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03595408/file/abstract_ROADEF2022_BRUNEL.pdf BibTex

Chapitre d'ouvrage

titre
Genomic Selection in AquacultureAquaculture Species
auteur
François Allal, Nguyen Hong Nguyen
article
Ahmadi, Nourollah and Bartholomé, Jérôme. Complex Trait Prediction: Methods and Protocols, Springer US, pp.469--491, 2022, Methods in Molecular Biology, 978-1-07-162205-6. ⟨10.1007/978-1-0716-2205-6_17⟩
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Autre publication

titre
Investigating natal origins and trans-oceanic migrations in albacore tuna (Thunnus alalunga) from the southwest Indian Ocean using otolith chemistry
auteur
Maylis Labonne, Audrey Darnaude, Theotime Fily, Cécile Petit, Anais Médieu, Marianne Pernak, Natacha Nikolic, Naomi Clear, Jessica Farley, Paige Eveson, Campbell Davies, Francis Marsac
article
IOTC 8th Working Party on Temperate Tuna (WPTmT), 2022
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03649484/file/WPTmT08%28DP%29-18.pdf BibTex

Ouvrage (y compris édition critique et traduction)

titre
Guide pour le suivi de la qualité du milieu marin en Nouvelle-Calédonie
auteur
Grégory Lasne, Jean-Michel Fernandez, Thierry Laugier, Yves Letourneur, Claude Élisabeth Payri, Benoit Soulard, Emmanuel Tessier, Simon Van Wynsberge
article
CNRT Nickel et son environnement. A paraître, Programme Guide du milieu marin 2. [Tome Nickel et Environnement], ⟨10.34928/9722-vb95⟩
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Rapport

titre
MaOre fishermen's social rePresentAtionS on the evolutioNs of the coastline and climAte change
auteur
Arnaud Banos, Nicolas Becu, Thomas Claverie, Philippe Charpentier, Matthieu Jeanson, Gaëlle Lefer Sauvage, Matthieu Le Duff, Esméralda Longépée, Miki Mori, Damienne Provitolo, Georgeta Stoica
article
[Research Report] CUFR de Mayotte. 2022
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03634770/file/PANORAMA-rapport-scientifique-avril22.pdf BibTex

Thèse

titre
Traits écophysiologiques et comportementaux de trois espèces de crabes soumis à différents niveaux de stress anthropique dans les mangroves insulaires du Canal du Mozambique
auteur
Laura Mégevand
article
Sciences agricoles. Université Montpellier, 2022. Français. ⟨NNT : 2022MONTG005⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-03664705/file/2022_MEGEVAND_archivage.pdf BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
The potential impacts of climate change on agriculture and fisheries production in 72 tropical coastal communities
auteur
Joshua Eli Cinner, Iain Caldwell, Lauric Thiault, John Ben, Julia Blanchard, Marta Coll, Amy Diedrich, Tyler Eddy, Jason Everett, Christian Folberth, Didier Gascuel, Jerome Guiet, Georgina Gurney, Ryan Heneghan, Jonas Jägermeyr, Narriman Jiddawi, Rachael Lahari, John Kuange, Wenfeng Liu, Olivier Maury, Christoph Müller, Camilla Novaglio, Juliano Palacios-Abrantes, Colleen Petrik, Ando Rabearisoa, Derek Tittensor, Andrew Wamukota, Richard Pollnac
article
2022
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https://hal-agrocampus-ouest.archives-ouvertes.fr/hal-03670105/file/Gascuel_2022.pdf BibTex
titre
Map portfolio of Octopus vulgaris off Mauritania
auteur
Dedah Ahmed-Babou, Hervé Demarcq, Beyah Meissa, Nicolas Bez
article
2022
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03649730/file/MapPortfolioOfOctopusVulgarisOffMauritania.pdf BibTex
titre
Graphlet correlation distance to compare small graphs
auteur
Jérôme Roux, Nicolas Bez, Paul Rochet, Rocío Joo, Stéphanie Mahévas
article
2022
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03635934/file/ARTICLE_SMALL_GRAPHS_COMPARISON%20%281%29.pdf BibTex
titre
Linking the effects of plant protection products on biodiversity and ecological processes to potential impairment of ecosystem functions and services—A multidisciplinary conceptual framework.
auteur
Stéphane Pesce, Annette Bérard, Marie-Agnès Coutellec, Alexandra Langlais-Hesse, Mickael Hedde, Floriane Larras, Sophie Leenhardt, Rémi Mongruel, Dominique Munaron, Sergi Sabater, Nicola Gallai
article
2022
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2021

Article dans une revue

titre
Temperature strongly correlates with regional patterns of body size variation in Mediterranean small pelagic fish species
auteur
Tarek Hattab, Ali Gucu, Ana Ventero, Andrea de Felice, Athanassios Machias, Claire Saraux, Denis Gašparević, Gualtiero Basilone, Ilaria Costantini, Iole Leonori, Jean-Hervé Bourdeix, Magdalena Iglesias, Marco Barra, Marianna Giannoulaki, Rosalia Ferreri, Salah El Ayoubi, Sara Malavolti, Simona Genovese, Stelios Somarakis, Tea JuretiĆ, Vjekoslav Tičina, Grégoire Certain
article
Mediterranean Marine Science, Athens : National Centre for Marine Research, 2021, 22 (4), pp.800. ⟨10.12681/mms.26525⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03607874/file/Saraux_Hattab_Tarek_Research%20Article_Revised_forHAL.pdf BibTex
titre
Nitrogen Isotope Discrepancy Between Primary Producers and Sediments in an Anoxic and Alkaline Lake
auteur
Pierre Cadeau, Magali Ader, Didier Jézéquel, Carine Chaduteau, Gérard Sarazin, Cécile Bernard, Christophe Leboulanger
article
Frontiers in Earth Science, Frontiers Media, 2021, 9, ⟨10.3389/feart.2021.787386⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03536896/file/2021_Cadeau_Front_Earth_Sci.pdf BibTex
titre
From Settlers to Subspecies: Genetic Differentiation in Commerson’s Dolphins Between South America and the Kerguelen Islands
auteur
Sebastián Kraft, Mjosé Pérez-Alvarez, Carlos Olavarría, Rodrigo Moraga, C. Scott Baker, Debbie Steel, Paul Tixier, Christophe Guinet, Amelia Viricel, Paul Brickle, Marina Costa, Enrique Crespo, Cristian Durante, Rocio Loizaga, Elie Poulin
article
Frontiers in Marine Science, Frontiers Media, 2021, 8 (782512), ⟨10.3389/fmars.2021.782512⟩
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titre
Unraveling the genotype by environment interaction in a thermosensitive fish with a polygenic sex determination system
auteur
Benjamin Geffroy, Mathieu Besson, Núria Sánchez-Baizán, Frederic Clota, Alexander Goikoetxea, Bastien Sadoul, François Ruelle, Marie-Odile Blanc, Hugues Parrinello, Sophie Hermet, Eva Blondeau-Bidet, Marine Pratlong, Francesc Piferrer, Marc Vandeputte, François Allal
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2021, 118 (50), pp.e2112660118. ⟨10.1073/pnas.2112660118⟩
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titre
Chemodiversity of Brevetoxins and Other Potentially Toxic Metabolites Produced by Karenia spp. and Their Metabolic Products in Marine Organisms
auteur
Vincent Hort, Eric Abadie, Nathalie Arnich, Marie-Yasmine Dechraoui Bottein, Zouher Amzil
article
Marine drugs, MDPI, 2021, 19 (12), pp.656. ⟨10.3390/md19120656⟩
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titre
Parental selection for growth and early-life low stocking density increase the female-to-male ratio in European sea bass
auteur
Benjamin Geffroy, Manuel Gesto, Frédéric Clota, Johan Aerts, Maria J. Darias, Marie-Odile Blanc, François Ruelle, François Allal, Marc Vandeputte
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-021-93116-9⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03360565/file/s41598-021-93116-9.pdf BibTex
titre
Whale depredation in the South Georgia Patagonian toothfish (Dissostichus eleginoides) fishery in the South Atlantic: a comparison of estimation methods
auteur
Timothy Earl, Eleanor Macleod, Marta Söffker, Nico Gasco, Félix Massiot-Granier, Paul Tixier, Christopher Darby
article
ICES Journal of Marine Science, Oxford University Press (OUP), 2021, 78 (10), pp.3817 - 3833. ⟨10.1093/icesjms/fsab212⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03554372/file/fsab212.pdf BibTex
titre
Comparing the performance of 12S mitochondrial primers for fish environmental DNA across ecosystems
auteur
Andrea Polanco F., Eilísh Richards, Benjamin Flück, Alice Valentini, Florian Altermatt, Sébastien Brosse, Jean‐claude Walser, David Eme, Virginie Marques, Stéphanie Manel, Camille Albouy, Tony Dejean, Loïc Pellissier
article
Environmental DNA, John Wiley & Sons Inc., 2021, 3 (6), pp.1113-1127. ⟨10.1002/edn3.232⟩
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titre
Disentangling diverse responses to climate change among global marine ecosystem models
auteur
Ryan Heneghan, Eric Galbraith, Julia Blanchard, Cheryl Harrison, Nicolas Barrier, Catherine Bulman, William Cheung, Marta Coll, Tyler Eddy, Maite Erauskin-Extramiana, Jason Everett, Jose Fernandes-Salvador, Didier Gascuel, Jerome Guiet, Olivier Maury, Juliano Palacios-Abrantes, Colleen Petrik, Hubert Du Pontavice, Anthony Richardson, Jeroen Steenbeek, Travis Tai, Jan Volkholz, Phoebe Woodworth-Jefcoats, Derek Tittensor
article
Progress in Oceanography, Elsevier, 2021, 198, pp.102659. ⟨10.1016/j.pocean.2021.102659⟩
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titre
An integrated approach to estimate aesthetic and ecological values of coralligenous reefs
auteur
Juliette Langlois, François Guilhaumon, Thomas Bockel, Pierre Boissery, Cédric de Almeida Braga, Julie Deter, Florian Holon, Guilhem Marre, Anne-Sophie Tribot, Nicolas Mouquet
article
Ecological Indicators, Elsevier, 2021, 129, pp.107935. ⟨10.1016/j.ecolind.2021.107935⟩
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titre
Decadal climate variability in the tropical Pacific: Characteristics, causes, predictability, and prospects
auteur
Scott Power, Matthieu Lengaigne, Antonietta Capotondi, Myriam Khodri, Jérôme Vialard, Beyrem Jebri, Éric Guilyardi, Shayne Mcgregor, Jong-Seong Kug, Matthew Newman, Michael J. Mcphaden, Gerald Meehl, Doug Smith, Julia Cole, Julien Emile-Geay, Daniel Vimont, Andrew T. Wittenberg, Mat Collins, Geon-Il Kim, Wenju Cai, Yuko Okumura, Christine Chung, Kim Cobb, François Delage, Yann Planton, Aaron Levine, Feng Zhu, Janet Sprintall, Emanuele Di Lorenzo, Xuebin Zhang, Jing-Jia Luo, Xiaopei Lin, Magdalena Balmaseda, Guojian Wang, Benjamin Henley
article
Science, American Association for the Advancement of Science (AAAS), 2021, 374 (6563), ⟨10.1126/science.aay9165⟩
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titre
Dynamic use of coastal areas by bull sharks and the conciliation of conservation and management of negative human–wildlife interactions
auteur
Johann Mourier, Marc Soria, Antonin Blaison, Monique Simier, Grégoire Certain, Angélique Demichelis, Tarek Hattab
article
Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems, Wiley, 2021, 31 (10), pp.2926-2937. ⟨10.1002/aqc.3674⟩
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titre
Redistribution of riverine and rainfall freshwater by the Bay of Bengal circulation
auteur
Akurathi Venkata Sai Chaitanya, Jérôme Vialard, Matthieu Lengaigne, Francesco d'Ovidio, Jean Riotte, Fabrice Papa, Rathinam Arthur James
article
Ocean Dynamics, Springer Verlag, 2021, ⟨10.1007/s10236-021-01486-5⟩
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titre
Use of complex physiological traits as ecotoxicological biomarkers in tropical freshwater fishes
auteur
Diana Monteiro, Ana Kalinin, F Rantin, David Mckenzie
article
Journal of Experimental Zoology Part A: Ecological and Integrative Physiology, Wiley, 2021, 335 (9-10), pp.745 - 760. ⟨10.1002/jez.2540⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03438296/file/Ms%20Monteiro%20et%20al_Final.pdf BibTex
titre
Guidelines for reporting methods to estimate metabolic rates by aquatic intermittent-flow respirometry
auteur
Shaun Killen, Emil Christensen, Daphne Cortese, Libor Závorka, Tommy Norin, Lucy Cotgrove, Amélie Crespel, Amelia Munson, Julie Nati, Magdalene Papatheodoulou, David J Mckenzie
article
Journal of Experimental Biology, The Company of Biologists, 2021, 224, ⟨10.1242/jeb.242522⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03438324/file/methods%20paper%20killen%20etal.pdf BibTex
titre
Surface habitat modification through industrial tuna fishery practices
auteur
Amaël Dupaix, Manuela Capello, Christophe Lett, Marco Andrello, Nicolas Barrier, Gaëlle Viennois, Laurent Dagorn
article
ICES Journal of Marine Science, Oxford University Press (OUP), 2021, 78 (9), pp.3075-3088. ⟨10.1093/icesjms/fsab175⟩
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titre
The influence of phylogeny and life history on telomere lengths and telomere rate of change among bird species: A meta‐analysis
auteur
François Criscuolo, F. Stephen Dobson, Quentin Schull
article
Ecology and Evolution, Wiley Open Access, 2021, ⟨10.1002/ece3.7931⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03364072/file/ece3.7931.pdf BibTex
titre
Co-occurrence networks reveal the central role of temperature in structuring the plankton community of the Thau Lagoon
auteur
Thomas Trombetta, Francesca Vidussi, Cécile Roques, Sébastien Mas, Marco Scotti, Behzad Mostajir
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2021, 11, pp.17675. ⟨10.1038/s41598-021-97173-y⟩
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https://hal-cnrs.archives-ouvertes.fr/hal-03402789/file/Trombetta%20et%20al.%202021%20Scientific%20Report.pdf BibTex
titre
Disentangling tropicalization and deborealization in marine ecosystems under climate change
auteur
Matthew Mclean, David Mouillot, Aurore Maureaud, Tarek Hattab, M. Aaron Macneil, Eric Goberville, Martin Lindegren, Georg Engelhard, Malin Pinsky, Arnaud Auber
article
Current Biology - CB, Elsevier, 2021, ⟨10.1016/j.cub.2021.08.034⟩
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titre
Impacts of climate change on the Bay of Seine ecosystem: Forcing a spatio‐temporal trophic model with predictions from an ecological niche model
auteur
Pierre Bourdaud, Frida Ben Rais Lasram, Emma Araignous, Juliette Champagnat, Samantha Grusd, Ghassen Halouani, Tarek Hattab, Boris Leroy, Quentin Noguès, Aurore Raoux, Georges Safi, Nathalie Niquil
article
Fisheries Oceanography, Wiley, 2021, 30 (5), pp.471-489. ⟨10.1111/fog.12531⟩
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titre
The Mediterranean fishery management: A call for shifting the current paradigm from duplication to synergy
auteur
Massimiliano Cardinale, Francesco Colloca, Angelo Bonanno, Giuseppe Scarcella, Enrico Arneri, Angélique Jadaud, Claire Saraux, Salvatore Aronica, Simona Genovese, Marco Barra, Gualtiero Basilone, Silvia Angelini, Fabio Falsone, Vita Gancitano, Alberto Santojanni, Fabio Fiorentino, Giacomo Milisenda, Matteo Murenu, Tommaso Russo, Piera Carpi, Beatriz Guijarro, José Luis Pérez Gil, María González, Pedro Torres, Ana Giráldez, Cristina García, Antonio Esteban, Encarnación García, Miguel Vivas, Enric Massutí, Francesc Ordines, Antoni Quetglas, Juan Gil Herrera
article
Marine Policy, Elsevier, 2021, 131, pp.104612. ⟨10.1016/j.marpol.2021.104612⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03256962/file/Cardinale%20et%20al.%20Mediterranean_Manuscript_3revision.pdf BibTex
titre
Maintaining momentum for collaborative working groups in a post-pandemic world
auteur
Diane Srivastava, Marten Winter, Louis Gross, Jean Paul Metzger, Jill Baron, Nicolas Mouquet, Thomas Meagher, Benjamin Halpern, Valério Pillar
article
Nature Ecology & Evolution, Nature, 2021, 5 (9), pp.1188-1189. ⟨10.1038/s41559-021-01521-0⟩
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titre
Chemical contamination alters the interactions between bacteria and phytoplankton
auteur
Olivier Pringault, Marc Bouvy, Claire Carré, Kaouther Mejri, Chrystelle Bancon-Montigny, Catherine Gonzalez, Christophe Leboulanger, Asma Sakka Hlaili, Marisol Goñi
article
Chemosphere, Elsevier, 2021, 278, pp.130457. ⟨10.1016/j.chemosphere.2021.130457⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03369101/file/Pringault%20et%20al%20Chemosphere%20Phytoplankton%20Bacterioplankton%20interactions.pdf BibTex
titre
The dimensionality and structure of species trait spaces
auteur
David Mouillot, Nicolas Loiseau, Matthias Grenié, Adam Algar, Michele Allegra, Marc Cadotte, Nicolas Casajus, Pierre Denelle, Maya Guéguen, Anthony Maire, Brian Maitner, Brian Mcgill, Matthew Mclean, Nicolas Mouquet, François Munoz, Wilfried Thuiller, Sébastien Villéger, Cyrille Violle, Arnaud Auber
article
Ecology Letters, Wiley, 2021, 24 (9), pp.1988-2009. ⟨10.1111/ele.13778⟩
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titre
Microbial Shift in the Enteric Bacteriome of Coral Reef Fish Following Climate-Driven Regime Shifts
auteur
Marie-Charlotte Cheutin, Sébastien Villéger, Christina Hicks, James Robinson, Nicholas Graham, Clémence Marconnet, Claudia Ximena, Ortiz Restrepo, Yvan Bettarel, Thierry Bouvier, J.-C. Auguet
article
Microorganisms, MDPI, 2021, ⟨10.3390/microorganisms9081711⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03357775/file/Cheutin%20et%20al.%20-%202021%20-%20Microbial%20Shift%20in%20the%20Enteric%20Bacteriome%20of%20Coral.pdf BibTex
titre
Identifying partners at sea from joint movement metrics of pelagic pair trawlers
auteur
Rocío Joo, Nicolas Bez, Marie-Pierre Etienne, Pablo Marin, Nicolas Goascoz, Jérôme Roux, Stéphanie Mahévas
article
ICES Journal of Marine Science, Oxford University Press (OUP), 2021, 78 (5), pp.1758-1768. ⟨10.1093/icesjms/fsab068⟩
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titre
Is starvation a cause of overmortality of the Mediterranean sardine?
auteur
Quentin Queiros, Claire Saraux, Gilbert Dutto, Eric Gasset, Amandine Marguerite, Pablo Brosset, Jean-Marc Fromentin, David J Mckenzie
article
Marine Environmental Research, Elsevier science, 2021, 170, pp.105441. ⟨10.1016/j.marenvres.2021.105441⟩
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https://hal.univ-brest.fr/hal-03341961/file/Saraux_Paper_starvation_last.pdf BibTex
titre
The Collaborative Process in Environmental Projects, a Place-Based Coevolution Perspective
auteur
Kevin Daudin, Christiane Weber, François Colin, Flavie Cernesson, Pierre Maurel, Valérie Derolez
article
Sustainability, MDPI, 2021, 13 (15), pp.8526. ⟨10.3390/su13158526⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03321821/file/Daudin_2021_sustanaibility.pdf BibTex
titre
The role of energy reserves in common carp performance inferred from phenotypic and genetic parameters
auteur
Jinfeng Zhao, Martin Prchal, Antti Kause, Marc Vandeputte, David Gela, Hana Kocour Kroupová, Veronika Piačková, Pavel Šauer, Christoph Steinbach, Jean-Michel Allamellou, Christos Palaiokostas, Ross Houston, Martin Kocour
article
Aquaculture, 2021, 541, pp.736799. ⟨10.1016/j.aquaculture.2021.736799⟩
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titre
Antibiotic susceptibility of four Enterobacteriaceae strains (Enterobacter cloacae, Citrobacter freundii, Salmonella typhi and Shigella sonnei) isolated from wastewater, surface water and groundwater in the equatorial zone of Cameroon (Central Africa)
auteur
Awawou Manouore Manouore, Yves Poutoum Yogne, Jean Samuel Eheth, Edith Brunelle Mouafo Tamnou, Claire Stéphane Metsopkeng, Olive Vivien Noah Ewoti, Antoine Tamsa Arfao, Luciane Marlyse Moungang, Paul Alain Nana, Sylvie Chinche Belengfe, Estelle Masseret, Télesphore Sime-Ngando, Moïse Nola
article
World Journal of Advanced Research and Reviews, World Journal of Advanced Research and Reviews, 2021, 11 (1), pp.120 - 137. ⟨10.30574/wjarr.2021.11.1.0303⟩
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https://hal.uca.fr/hal-03323490/file/Manouore%20Njoya%20et%20al.%2C%202021%20%28World%20J%20Adv%20Res%20Rev%29.pdf BibTex
titre
Pathways to sustaining tuna-dependent Pacific Island economies during climate change
auteur
Johann D. Bell, Inna Senina, Timothy Adams, Olivier Aumont, Beatriz Calmettes, Sangaalofa Clark, Morgane Dessert, Marion Gehlen, Thomas Gorgues, John Hampton, Quentin Hanich, Harriet Harden-Davies, Steven Hare, Glen Holmes, Patrick Lehodey, Matthieu Lengaigne, William Mansfield, Christophe Menkes, Simon Nicol, Yoshitaka Ota, Coral Pasisi, Graham Pilling, Chis Reid, Espen Ronneberg, Alex Sen Gupta, Katherine Seto, Neville Smith, Sue Taei, Martin Tsamenyi, Peter Williams
article
Nature Sustainability, Springer Nature, 2021, ⟨10.1038/s41893-021-00745-z⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03317932/file/s41893-021-00745-z.pdf BibTex
titre
Optimization of Genomic Selection to Improve Disease Resistance in Two Marine Fishes, the European Sea Bass (Dicentrarchus labrax) and the Gilthead Sea Bream (Sparus aurata)
auteur
Ronan Griot, François Allal, Florence Phocas, Sophie Brard-Fudulea, Romain Morvezen, Pierrick Haffray, Yoannah François, Thierry Morin, Anastasia Bestin, Jean-Sébastien Bruant, Sophie Cariou, Bruno Peyrou, Joseph Brunier, Marc Vandeputte
article
Frontiers in Genetics, Frontiers, 2021, 12, ⟨10.3389/fgene.2021.665920⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03360561/file/fgene-12-665920-1.pdf BibTex
titre
Recent expansion of marine protected areas matches with home range of grey reef sharks
auteur
Lucas Bonnin, David Mouillot, Germain Boussarie, William D. Robbins, Jeremy J. Kiszka, Laurent Dagorn, Laurent Vigliola
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2021, 11 (1), pp.14221. ⟨10.1038/s41598-021-93426-y⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-03411088/file/s41598-021-93426-y.pdf BibTex
titre
Trophic ecology of the juveniles of two jack species (Caranx latus and C. hippos) in contrasted tropical estuaries
auteur
Julio Guazzelli Gonzalez, Audrey M. Darnaude, Paulo J. Duarte-Neto, Francois Le Loc'H, Mayara Constantino Lima, Frédéric Ménard, Valdimere Ferreira, Flavia Lucena Fredou, Jean-Marie Munaron, Thierry Fredou
article
Estuarine, Coastal and Shelf Science, Elsevier, 2021, 255, pp.107370. ⟨10.1016/j.ecss.2021.107370⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-03413531/file/Gonzalez%20et%20al.%202021-%20preproof.pdf BibTex
titre
Predation Cues Lead to Reduced Foraging of Invasive Siganus rivulatus in the Mediterranean
auteur
Daphna Shapiro Goldberg, Gil Rilov, Sébastien Villéger, Jonathan Belmaker
article
Frontiers in Marine Science, Frontiers Media, 2021, 8, pp.678848. ⟨10.3389/fmars.2021.678848⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-03413533/file/Goldberg%202021.pdf BibTex
titre
Identifying uncertainties in scenarios and models of socio-ecological systems in support of decision-making
auteur
Mark Rounsevell, Almut Arneth, Calum Brown, William W.L. Cheung, Olivier Gimenez, Ian Holman, Paul Leadley, Criscely Luján, Stéphanie Mahevas, Isabelle Maréchaux, Raphaël Pélissier, Peter Verburg, Ghislain Vieilledent, Brendan Wintle, Yunne-Jai Shin
article
One Earth, Cell press, 2021, 4 (7), pp.967-985. ⟨10.1016/j.oneear.2021.06.003⟩
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BibTex
titre
How king penguins advertise their sexual maturity
auteur
Hannah Joy Kriesell, Thierry Aubin, Víctor Planas-Bielsa, Quentin Schull, Francesco Bonadonna, Clément Cornec, Yvon Le Maho, Laura Troudet, Céline Le Bohec
article
Animal Behaviour, Elsevier Masson, 2021, 177, pp.253-267. ⟨10.1016/j.anbehav.2021.05.015⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03409936/file/2021_Kriesell_AnimBehav.pdf BibTex
titre
Fishing for the Virome of Tropical Tuna
auteur
Elsa Gadoin, Christelle Desnues, Sonia Monteil-Bouchard, Thierry Bouvier, J.-C. Auguet, Emmanuelle Roque D’orbcastel, Yvan Bettarel
article
Viruses, MDPI, 2021, 13 (7), pp.1291. ⟨10.3390/v13071291⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-03332237/file/viruses-13-01291.pdf BibTex
titre
Automatic underwater fish species classification with limited data using few-shot learning
auteur
Sebastien Villon, Corina Iovan, Morgan Mangeas, Thomas Claverie, David Mouillot, Sébastien Villéger, Laurent Vigliola
article
Ecological Informatics, Elsevier, 2021, 63, pp.101320. ⟨10.1016/j.ecoinf.2021.101320⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-03415715/file/Villon_2021_EcoInf_manuscript_final.pdf BibTex
titre
Global assessment of the response to chronic stress in European sea bass
auteur
Bastien Sadoul, Sébastien Alfonso, Xavier Cousin, Patrick Prunet, Marie-Laure Bégout, Isabelle Leguen
article
Aquaculture, Elsevier, 2021, 544, pp.737072. ⟨10.1016/j.aquaculture.2021.737072⟩
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BibTex
titre
Length–weight relationships of 5 fish species from the Sine Saloum estuary, Senegal, West Africa
auteur
O. Sadio, Monique Simier, François Le Loc’h, Luis Tito de Morais
article
Journal of Applied Ichthyology, Wiley, 2021, ⟨10.1111/jai.14230⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03259555/file/Manuscript_LWR_5_species_Sadio_Oumar_Accepted_Version.pdf BibTex
titre
An investigation of links between metabolic rate and feed efficiency in European sea bass Dicentrarchus labrax
auteur
Charles Rodde, Hugues de Verdal, Marc Vandeputte, François Allal, Julie Nati, Mathieu Besson, Felipe Blasco, John Benzie, David J Mckenzie
article
Journal of Animal Science, American Society of Animal Science, 2021, 99 (6), pp.1-9. ⟨10.1093/jas/skab152⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03360566/file/CharlesRODDE_final.pdf BibTex
titre
Does the Composition of the Gut Bacteriome Change during the Growth of Tuna?
auteur
Elsa Gadoin, Lucile Durand, Aurélie Guillou, Sandrine Crochemore, Thierry Bouvier, Emmanuelle Roque Roque, Laurent Dagorn, J.-C. Auguet, Antoinette Adingra, Christelle Desnues, Yvan Bettarel
article
Microorganisms, MDPI, 2021, 9 (6), pp.1157. ⟨10.3390/microorganisms9061157⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-03332247/file/microorganisms-09-01157-v2.pdf BibTex
titre
Effects of global warming on fishes and fisheries
auteur
David J Mckenzie, Benjamin Geffroy, Anthony Farrell
article
Journal of Fish Biology, Wiley, 2021, 98 (6), pp.1489-1492. ⟨10.1111/jfb.14762⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03438319/file/JFB%20editorial.pdf BibTex
titre
Changes in foraging mode caused by a decline in prey size have major bioenergetic consequences for a small pelagic fish
auteur
Elisa Thoral, Quentin Queiros, Damien Roussel, Gilbert Dutto, Eric Gasset, David J Mckenzie, Caroline Romestaing, Jean‐marc Fromentin, Claire Saraux, Loïc Teulier
article
Journal of Animal Ecology, Wiley, 2021, 90, pp.2289-2301. ⟨10.1111/1365-2656.13535⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03234605/file/MS%20-%20JAE-2020-01028_Final%20Version%20%281%29.pdf BibTex
titre
The asymmetric influence of ocean heat content on ENSO predictability in the CNRM-CM5 coupled general circulation model
auteur
Yann Planton, Jérôme Vialard, Éric Guilyardi, Matthieu Lengaigne, Michael J. Mcphaden
article
Journal of Climate, American Meteorological Society, 2021, 34 (14), pp.5775-5793. ⟨10.1175/JCLI-D-20-0633.1⟩
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BibTex
titre
Dual RNAseq highlights the kinetics of skin microbiome and fish host responsiveness to bacterial infection.
auteur
J. Le Luyer, Q. Schull, P. Auffret, P. Lopez, M. Crusot, C. Belliard, C. Basset, Q. Carradec, J. Poulain, S. Planes, D. Saulnier
article
Animal Microbiome, 2021, 3 (1), ⟨10.1186/s42523-021-00097-1⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-03413618/file/lel1.pdf BibTex
titre
Assessment of some key indicators of the ecological status of an African freshwater lagoon (Lagoon Aghien, Ivory Coast)
auteur
Mathias Koffi Ahoutou, Rosine Yao Djeha, Eric Kouamé Yao, Catherine Quiblier, Julie Niamen-Ebrottié, Sahima Hamlaoui, Kevin Tambosco, Jean Louis Perrin, Marc Troussellier, Cécile Bernard, L. Seguis, Marc Bouvy, Jacques Pédron, Felix Koffi Konan, Jean-François Humbert, Julien Kalpy Coulibaly
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2021, 16 (5), pp.e0251065. ⟨10.1371/journal.pone.0251065⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03220796/file/journal.pone.0251065.pdf BibTex
titre
The impact of academic information supply and familiarity on preferences for ecosystem services
auteur
Mariam Sy, Helene Rey-Valette, Charles Figuières, Monique Simier, Rutger de Wit
article
Ecological Economics, Elsevier, 2021, 183, pp.106959. ⟨10.1016/j.ecolecon.2021.106959⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03119760/file/ECOLEC_2020_503_Sy_etaL_revised_20112020.pdf BibTex
titre
High nutrient loading and climatic parameters influence the dominance and dissimilarity of toxigenic cyanobacteria in northern bays of Lake Victoria
auteur
Mark Olokotum, Marc Troussellier, Arthur Escalas, Sahima Hamlaoui, William Okello, Ronald Semyalo, Jean-François Humbert, Cécile Bernard
article
Journal of Great Lakes Research, Elsevier, 2021, ⟨10.1016/j.jglr.2021.04.021⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03252336/file/Olokotum%20et%20al.%20%282021%29.%20High%20nutrient%20loading%20and%20climatic%20parameters%20influence%20the%20dominance%20and%20dissimilarity%20of%20toxigenic%20cyanobacteria%20in%20northern%20bays%20of%20Lake%20Victoria.%20Journal%20of%20Great%20Lakes%20Research%20https---doi.org-10.1016-j.jglr.2021.04.021.pdf BibTex
titre
The discernible and hidden effects of clonality on the genotypic and genetic states of populations: Improving our estimation of clonal rates
auteur
Solenn Stoeckel, Barbara Porro, Sophie Arnaud‐haond
article
Molecular Ecology Resources, Wiley/Blackwell, 2021, 21 (4), pp.1068-1084. ⟨10.1111/1755-0998.13316⟩
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https://arxiv.org/pdf/1902.09365 BibTex
titre
Capacity of the potentially toxic diatoms Pseudo-nitzschia mannii and Pseudo-nitzschia hasleana to tolerate polycyclic aromatic hydrocarbons
auteur
Sondes Melliti Ben Garali, Inès Sahraoui, Hiba Ben Othman, Abdessalem Kouki, Pablo de la Iglesia, Jorge Diogène, Céline Lafabrie, Karl Andree, Margarita Fernández-Tejedor, Kaouther Mejri, Marouan Meddeb, Olivier Pringault, Asma Sakka Hlaili
article
Ecotoxicology and Environmental Safety, Elsevier, 2021, 214, pp.112082. ⟨10.1016/j.ecoenv.2021.112082⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03184503/file/Melliti%20Ben%20Garali%20et%20al%20%28Ecotox%20and%20Environ%20Safety%29.pdf BibTex
titre
Sharks surf the slope: Current updrafts reduce energy expenditure for aggregating marine predators
auteur
Yannis Papastamatiou, Gil Iosilevskii, Valentina Di Santo, Charlie Huveneers, Tarek Hattab, Serge Planes, Laurent Ballesta, Johann Mourier
article
Journal of Animal Ecology, Wiley, 2021, ⟨10.1111/1365-2656.13536⟩
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BibTex
titre
Sex dimorphism in European sea bass (Dicentrarchus labrax L.): New insights into sex-related growth patterns during very early life stages
auteur
Sara Faggion, Marc Vandeputte, Alain Vergnet, Frédéric Clota, Marie-Odile Blanc, Pierre Sanchez, François Ruelle, François Allal
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2021, 16 (4), pp.e0239791. ⟨10.1371/journal.pone.0239791⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-03206637/file/journal.pone.0239791.pdf BibTex
titre
Evaluating sediment and water sampling methods for the estimation of deep-sea biodiversity using environmental DNA
auteur
Miriam Brandt, Florence Pradillon, Blandine Trouche, Nicolas Henry, Cathy Liautard-Haag, Marie-Anne Cambon-Bonavita, Valérie Cueff-Gauchard, Patrick Wincker, Caroline Belser, Julie Poulain, Sophie Arnaud-Haond, Daniela Zeppilli
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2021, 11 (1), pp.7856. ⟨10.1038/s41598-021-86396-8⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03198097/file/s41598-021-86396-8.pdf BibTex
titre
Human protection drives the emergence of a new coping style in animals
auteur
Bastien Sadoul, Daniel Blumstein, Sébastien Alfonso, Benjamin Geffroy
article
PLoS Biology, Public Library of Science, 2021, 19 (4), pp.e3001186. ⟨10.1371/journal.pbio.3001186⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-03279578/file/journal.pbio.3001186.pdf BibTex
titre
Otolith chemical fingerprints of skipjack tuna (Katsuwonus pelamis) in the Indian Ocean: First insights into stock structure delineation
auteur
Iraide Artetxe-Arrate, Igaratza Fraile, Jessica Farley, Audrey Darnaude, Naomi Clear, Naiara Rodríguez-Ezpeleta, David Dettman, Christophe Pécheyran, Iñigo Krug, Anaïs Médieu, Mohamed Ahusan, Craig Proctor, Asep Priatna, Pratiwi Lestari, Campbell Davies, Francis Marsac, Hilario Murua
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2021, 16 (3), pp.e0249327. ⟨10.1371/journal.pone.0249327⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03195755/file/journal.pone.0249327.pdf BibTex
titre
Effects of experimental warming on small phytoplankton, bacteria and viruses in autumn in the Mediterranean coastal Thau Lagoon
auteur
Justine Courboulès, Vidussi Francesca, Soulié Tanguy, Mas Sébastien, Pecqueur David, Behzad Mostajir
article
Aquatic Ecology, Springer Verlag, 2021, ⟨10.1007/s10452-021-09852-7⟩
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https://hal-cnrs.archives-ouvertes.fr/hal-03402796/file/Courboul%C3%A8s%20et%20al.%202021.pdf BibTex
titre
A new method to estimate planktonic oxygen metabolism using high‐frequency sensor measurements in mesocosm experiments and considering daytime and nighttime respirations
auteur
Tanguy Soulié, Sébastien Mas, David Parin, Francesca Vidussi, Behzad Mostajir
article
Limnology and Oceanography: Methods, Association for the Sciences of Limnology and Oceanography, 2021, 19 (5), pp.303-316. ⟨10.1002/lom3.10424⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal-cnrs.archives-ouvertes.fr/hal-03402798/file/Souli%C3%A9%20et%20al.%202021.pdf BibTex
titre
Trait similarity in reef fish faunas across the world’s oceans
auteur
Matthew Mclean, Rick Stuart-Smith, Sébastien Villéger, Arnaud Auber, Graham Edgar, M. Aaron Macneil, Nicolas Loiseau, Fabien Leprieur, David Mouillot
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2021, 118 (12), pp.e2012318118. ⟨10.1073/pnas.2012318118⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03435832/file/82292.pdf BibTex
titre
Chronic feeding exposure to virgin and spiked microplastics disrupts essential biological functions in teleost fish
auteur
Bettie Cormier, Florane Le Bihanic, Mathieu Cabar, Jean-Claude Crebassa, Mélanie Blanc, Maria Larsson, Florian Dubocq, Leo Yeung, Christelle Clérandeau, Steffen Keiter, Jérôme Cachot, Marie-Laure Bégout, Xavier Cousin
article
Journal of Hazardous Materials, Elsevier, 2021, 415, pp.125626. ⟨10.1016/j.jhazmat.2021.125626⟩
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titre
Global data set for nitrogen and carbon stable isotopes of tunas
auteur
Nathalie Bodin, Heidi Pethybridge, Leanne Duffy, Anne Lorrain, Valérie Allain, John Logan, Brittany Graham, Frédéric Ménard, C. Anela Choy, Christopher Somes, Robert Olson, Jock Young
article
Ecology, Ecological Society of America, 2021, 102 (3), ⟨10.1002/ecy.3265⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03203941/file/ecy.3265.pdf BibTex
titre
Phylogenetic and functional diversity of aldehyde-alcohol dehydrogenases in microalgae
auteur
Robert van Lis, Yohann Couté, Sabine Brugière, Nicolas Tourasse, Benoist Laurent, Wolfgang Nitschke, Olivier Vallon, Ariane Atteia
article
Plant Molecular Biology, Springer Verlag (Germany), 2021, 105 (4-5), pp.497-511. ⟨10.1007/s11103-020-01105-9⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03404235/file/van%20Lis%20et%20al_PMB2021_accepted%20manuscript.pdf