MARBECL’objectif général de l’UMR concerne l’étude de la biodiversité marine des écosystèmes lagunaires, côtiers et hauturiers à différents niveaux d’intégration (moléculaire, individu, population et communauté), et des usages de cette biodiversité par l’Homme.

S’appuyant sur des outils variés d’observation, d’expérimentation, d’analyse et de modélisation, l’unité répond plus spécifiquement aux objectifs suivants :

  • décrire la biodiversité marine, comprendre sa dynamique et le fonctionnement des écosystèmes marins ;
  • analyser l’impact des pressions anthropiques sur ces écosystèmes et développer des scenarii de réponses au changement global ;
  • concilier exploitation (en particulier pêche et aquaculture) et conservation et répondre aux attentes sociétales (expertise, innovation, remédiation).

Label : Unité Mixte de Recherche (UMR)
Tutelles principales : UM, IRD, CNRS, IFREMER
Département scientifique : Biologie, écologie, évolution, environnement, sciences de la terre et de l’eau
École doctorale : Biodiversité, Agriculture, Alimentation, Environnement, Terre, Eau

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Publications HAL de la structure 422717

2021

Article dans une revue

titre
Chemical contamination alters the interactions between bacteria and phytoplankton
auteur
Olivier Pringault, Marc Bouvy, Claire Carre, Kaouther Mejri, Chrystelle Bancon-Montigny, Catherine Gonzalez, Christophe Leboulanger, Asma Sakka Hlaili, Marisol Goñi
article
Chemosphere, Elsevier, 2021, 278, pp.130457. ⟨10.1016/j.chemosphere.2021.130457⟩
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titre
The impact of academic information supply and familiarity on preferences for ecosystem services
auteur
Mariam Sy, Helene Rey-Valette, Charles Figuières, Monique Simier, Rutger de Wit
article
Ecological Economics, Elsevier, 2021, 183, pp.106959. ⟨10.1016/j.ecolecon.2021.106959⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03119760/file/ECOLEC_2020_503_Sy_etaL_revised_20112020.pdf BibTex
titre
Evaluating sediment and water sampling methods for the estimation of deep-sea biodiversity using environmental DNA
auteur
Miriam Brandt, Florence Pradillon, Blandine Trouche, Nicolas Henry, Cathy Liautard-Haag, Marie-Anne Cambon-Bonavita, Valérie Cueff-Gauchard, Patrick Wincker, Caroline Belser, Julie Poulain, Sophie Arnaud-Haond, Daniela Zeppilli
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2021, 11 (1), pp.7856. ⟨10.1038/s41598-021-86396-8⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03198097/file/s41598-021-86396-8.pdf BibTex
titre
Otolith chemical fingerprints of skipjack tuna (Katsuwonus pelamis) in the Indian Ocean: First insights into stock structure delineation
auteur
Iraide Artetxe-Arrate, Igaratza Fraile, Jessica Farley, Audrey Darnaude, Naomi Clear, Naiara Rodríguez-Ezpeleta, David Dettman, Christophe Pécheyran, Iñigo Krug, Anaïs Médieu, Mohamed Ahusan, Craig Proctor, Asep Priatna, Pratiwi Lestari, Campbell Davies, Francis Marsac, Hilario Murua
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2021, 16 (3), pp.e0249327. ⟨10.1371/journal.pone.0249327⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03195755/file/journal.pone.0249327.pdf BibTex
titre
Chronic feeding exposure to virgin and spiked microplastics disrupts essential biological functions in teleost fish
auteur
Bettie Cormier, Florane Le Bihanic, Mathieu Cabar, Jean-Claude Crebassa, Mélanie Blanc, Maria Larsson, Florian Dubocq, Leo Yeung, Christelle Clérandeau, Steffen Keiter, Jérôme Cachot, Marie-Laure Bégout, Xavier Cousin
article
Journal of Hazardous Materials, Elsevier, 2021, 415, pp.125626. ⟨10.1016/j.jhazmat.2021.125626⟩
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titre
Different survival of three populations of European sea bass (Dicentrarchus labrax) following challenge with two variants of nervous necrosis virus (NNV)
auteur
Sofie Barsøe, François Allal, Alain Vergnet, Marc Vandeputte, Niels Jørgen Olesen, Jacob Günther Schmidt, Cathrine Agnete Larsen, Argelia Cuenca, Niccolò Vendramin
article
Aquaculture Reports, Elsevier, 2021, 19, pp.100621. ⟨10.1016/j.aqrep.2021.100621⟩
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titre
Trophic structure of a nektobenthic community exploited by a multispecific bottom trawling fishery in Northeastern Brazil
auteur
Alex Souza Lira, Flávia Lucena-Frédou, Thierry Frédou, Frédéric Ménard, Júlio Guazzelli Gonzalez, Valdimere Ferreira, José Souto Rosa Filho, Jean-Marie Munaron, François Le Loc’h
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2021, 16 (2), pp.e0246491. ⟨10.1371/journal.pone.0246491⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03204169/file/journal.pone.0246491.pdf BibTex
titre
The Digestive Function of Pseudoplatystoma punctifer Early Juveniles Is Differentially Modulated by Dietary Protein, Lipid and Carbohydrate Content and Their Ratios
auteur
Diana Castro-Ruiz, Karl Andree, Mikhail Solovyev, Christian Fernández-Méndez, Carmen García-Dávila, Chantal Cahu, Enric Gisbert, Maria J. Darias
article
Animals, MDPI, 2021, 11 (2), pp.369. ⟨10.3390/ani11020369⟩
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https://hal.ird.fr/ird-03183819/file/50-Castro-Ruiz%20et%20al.%2721.pdf BibTex
titre
The Effects of Feed Restriction and Isolated or Group Rearing on the Measurement of Individual Feed Intake and Estimation of Feed Conversion Ratio in Juvenile Nile Tilapia (Oreochromis niloticus) for Selective Breeding Purposes
auteur
Charles Rodde, Marc Vandeputte, Trong Quoc Trinh, Vincent Douchet, Marc Canonne, John Benzie, Hugues de Verdal
article
Frontiers in Genetics, Frontiers, 2021, 11, ⟨10.3389/fgene.2020.596521⟩
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titre
Accumulation of detached kelp biomass in a subtidal temperate coastal ecosystem induces succession of epiphytic and sediment bacterial communities
auteur
Maéva Brunet, Florian de Bettignies, Nolwen Le Duff, Gwenn Tanguy, Dominique Davoult, Catherine Leblanc, Angélique Gobet, François Thomas
article
Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2021, ⟨10.1111/1462-2920.15389⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03146433/file/1462-2920.15389.pdf BibTex
titre
Genetic pathways underpinning hormonal stress responses in fish exposed to short- and long-term warm ocean temperatures
auteur
Alexander Goikoetxea, Bastien Sadoul, Eva Blondeau-Bidet, Johan Aerts, Marie-Odile Blanc, Hugues Parrinello, Célia Barrachina, Marine Pratlong, Benjamin Geffroy
article
Ecological Indicators, Elsevier, 2021, 120, pp.106937. ⟨10.1016/j.ecolind.2020.106937⟩
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titre
A comparison of behavioral and reproductive parameters between wild-type, transgenic and mutant zebrafish: Could they all be considered the same “zebrafish” for reglementary assays on endocrine disruption?
auteur
Julie de Oliveira, Edith Chadili, Cyril Turies, François Brion, Xavier Cousin, Nathalie Hinfray
article
Comparative Biochemistry and Physiology Part C: Toxicology & Pharmacology, 2021, 239, pp.108879. ⟨10.1016/j.cbpc.2020.108879⟩
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titre
Genome-wide association studies for resistance to viral nervous necrosis in three populations of European sea bass (Dicentrarchus labrax) using a novel 57k SNP array DlabChip
auteur
Ronan Griot, François Allal, Florence Phocas, Sophie Brard-Fudulea, Romain Morvezen, Anastasia Bestin, Pierrick Haffray, Yoannah François, Thierry Morin, Charles Poncet, Alain Vergnet, Sophie Cariou, Joseph Brunier, Jean-Sébastien Bruant, Bruno Peyrou, Pierre-Alexandre Gagnaire, Marc Vandeputte
article
Aquaculture, Elsevier, 2021, 530, pp.735930. ⟨10.1016/j.aquaculture.2020.735930⟩
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titre
Chemicals sorbed to environmental microplastics are toxic to early life stages of aquatic organisms
auteur
Bettie Cormier, Chiara Gambardella, Tania Tato, Quentin Perdriat, Elisa Costa, Cloé Veclin, Florane Le Bihanic, Bruno Grassl, Florian Dubocq, Anna Kärrman, Kim van Arkel, Soazig Lemoine, Fabienne Lagarde, Bénédicte Morin, Francesca Garaventa, Marco Faimali, Xavier Cousin, Marie-Laure Bégout, Ricardo Beiras, Jérôme Cachot
article
Ecotoxicology and Environmental Safety, Elsevier, 2021, 208, pp.111665. ⟨10.1016/j.ecoenv.2020.111665⟩
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https://hal-univ-pau.archives-ouvertes.fr/hal-03176074/file/1-s2.0-S0147651320315025-main.pdf BibTex
titre
In situ characterisation of pathogen dynamics during a Pacific Oyster Mortality Syndrome episode
auteur
Marion Richard, Jean Luc Rolland, Yannick Gueguen, Julien de Lorgeril, Juliette Pouzadoux, Behzad Mostajir, Beatrice Bec, Sébastien Mas, David Parin, Patrik Le Gall, Serge Mortreux, Annie Fiandrino, Franck Lagarde, Grégory Messiaen, Martine Fortune, Emmanuelle Roque D’orbcastel
article
Marine Environmental Research, Elsevier, 2021, pp.105251. ⟨10.1016/j.marenvres.2020.105251⟩
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titre
Fish skin pigmentation in aquaculture: The influence of rearing conditions and its neuroendocrine regulation
auteur
Paula Vissio, Maria J. Darias, María Di Yorio, Daniela Pérez Sirkin, Tomás Delgadin
article
General and Comparative Endocrinology, Elsevier, 2021, General and Comparative Endocrinology, 301, pp.113662. ⟨10.1016/j.ygcen.2020.113662⟩
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https://hal.ird.fr/ird-03183177/file/Vissio%20et%20al-2021-Fish%20pigmentation%20in%20aquaculture.pdf BibTex
titre
Effects of nickel oxide nanoparticles on survival, reproduction, and oxidative stress biomarkers in the marine calanoid copepod Centropages ponticus under short-term exposure
auteur
Emna Djebbi, Delphine Bonnet, Olivier Pringault, Khawla Tlili, Mohamed Néjib Daly Yahia
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2021, ⟨10.1007/s11356-020-11781-1⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03159234/file/Revised%20manuscript%20%28clean%20copy%29.pdf BibTex
titre
Geochemistry of an endorheic thalassohaline ecosystem: the Dziani Dzaha crater lake (Mayotte Archipelago, Indian Ocean)
auteur
Gérard Sarazin, Didier Jezequel, Christophe Leboulanger, Eric Fouilland, Emilie Le Floc'H, Marc Bouvy, Emmanuelle Gérard, Hélène Agogué, Cécile Bernard, Mylène Hugoni, Vincent Grossi, Marc Troussellier, Magali Ader
article
Comptes Rendus Géoscience, Elsevier Masson, In press, ⟨10.5802/crgeos.43⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03094368/file/crgeos20201153%20%281%29.pdf BibTex
titre
Local Ecological Knowledge on Mangroves in Mayotte Island (Indian Ocean) and Influencing Factors
auteur
Esméralda Longépée, Anliati Ahmed Abdallah, Matthieu Jeanson, Claire Golléty
article
Forests, MDPI, 2021, 12 (1), pp.53. ⟨10.3390/f12010053⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03162787/file/longepee_2021_LEK_mangroves_mayotte_influencing_factors.pdf BibTex
titre
Can we identify wild-born salmon from parentage assignment data? A case study in the Garonne-Dordogne rivers salmon restoration programme in France
auteur
Marc Vandeputte, Anastasia Bestin, Louarn Fauchet, Jean-Michel Allamellou, Stéphane Bosc, Olivier Menchi, Pierrick Haffray
article
Aquatic Living Resources, EDP Sciences, 2021, 34, pp.1-10. ⟨10.1051/alr/2021008⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03188874/file/alr200143.pdf BibTex
titre
The insecticide permethrin induces transgenerational behavioral changes linked to transcriptomic and epigenetic alterations in zebrafish (Danio rerio)
auteur
Mélanie Blanc, Philipp Antczak, Xavier Cousin, Christoph Grunau, Nikolai Scherbak, Joëlle Rüegg, Steffen Keiter
article
Science of the Total Environment, Elsevier, 2021, 779, pp.146404. ⟨10.1016/j.scitotenv.2021.146404⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03175988/file/Blanc-2021-SciTotEnv-Insecticide-MANUSCRIT.pdf BibTex
titre
Molecular Pathways and Pigments Underlying the Colors of the Pearl Oyster Pinctada margaritifera var. cumingii (Linnaeus 1758)
auteur
Pierre-Louis Stenger, Chin-Long Ky, Céline Reisser, Julien Duboisset, Hamadou Dicko, Patrick Durand, Laure Quintric, Serge Planes, Jérémie Vidal-Dupiol
article
Genes, MDPI, 2021, 12 (3), pp.421. ⟨10.3390/genes12030421⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03178866/file/Stenger-2021-Genes-Molecular.pdf BibTex
titre
A community perspective on the concept of marine holobionts: current status, challenges, and future directions
auteur
Simon Dittami, Enrique Arboleda, Jean-Christophe Auguet, Arite Bigalke, Enora Briand, Paco Cárdenas, Ulisse Cardini, Johan Decelle, Aschwin Engelen, Damien Eveillard, Claire Gachon, Sarah Griffiths, Tilmann Harder, Ehsan Kayal, Elena Kazamia, François Lallier, Mónica Medina, Ezequiel Marzinelli, Teresa Maria Morganti, Laura Núñez Pons, Soizic Prado, José Pintado, Mahasweta Saha, Marc-André Selosse, Derek Skillings, Willem Stock, Shinichi Sunagawa, Eve Toulza, Alexey Vorobev, Catherine Leblanc, Fabrice Not
article
PeerJ, PeerJ, 2021, 9, pp.e10911. ⟨10.7717/peerj.10911⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03166872/file/Dittami-2021-PeerJ-Community.pdf BibTex
titre
Marine spatial planning and the risk of ocean grabbing in the tropical Atlantic
auteur
Betty Queffelec, Marie Bonnin, Beatrice Ferreira, Sophie Bertrand, Solange Teles da Silva, Fatou Diouf, Brice Trouillet, Annie Cudennec, Adrien Brunel, Odeline Billant, Hilde Toonen
article
ICES Journal of Marine Science, Oxford University Press (OUP), 2021, ⟨10.1093/icesjms/fsab006.⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03156514/file/Queffelec%20et%20al%202021.pdf BibTex
titre
Length-weight relationships of 19 fish species from two tropical artificial reservoirs (Manantali and Selingue) in Mali, West Africa
auteur
O. Sadio, Monique Simier, François Le Loc'H, Luis Tito de Morais
article
Cybium : Revue Internationale d’Ichtyologie, Paris : Muséum national d'histoire naturelle, 2021, 45 (1), pp.59-62. ⟨10.26028/cybium/2021-451-007⟩
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BibTex
titre
On the robustness of an eastern boundary upwelling ecosystem exposed to multiple stressors
auteur
N. Diogoul, Patrice Brehmer, Hervé Demarcq, S. El Ayoubi, A. Thiam, A. Sarre, Anne Mouget, Yannick Perrot
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2021, 11, 1908 [12 p.]. ⟨10.1038/s41598-021-81549-1⟩
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titre
Genetic parameters of caviar yield, color, size and firmness using parentage assignment in an octoploid fish species, the Siberian sturgeon Acipenser baerii
auteur
Anastasia Bestin, Olivier Brunel, Arnaud Malledant, Bastien Debeuf, Philippe Benoit, Rachid Mahla, Herve Chapuis, D. GuÉmÉnÉ, M. Vandeputte, Pierrick Haffray
article
Aquaculture, Elsevier, 2021, 540, pp.1-7. ⟨10.1016/j.aquaculture.2021.736725⟩
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BibTex
titre
Environmentally Driven Color Variation in the Pearl Oyster Pinctada margaritifera var. cumingii (Linnaeus, 1758) Is Associated With Differential Methylation of CpGs in Pigment- and Biomineralization-Related Genes
auteur
Pierre-Louis Stenger, Chin-Long Ky, Céline Reisser, Céline Cosseau, Christoph Grunau, Mickaël Mege, Serge Planes, Jérémie Vidal-Dupiol
article
Frontiers in Genetics, Frontiers, 2021, 12, pp.630290. ⟨10.3389/fgene.2021.630290⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03178846/file/Stenger-2021-FrontGenet-Environmentally.pdf BibTex
titre
Diversity of property regimes of Mediterranean coastal lagoons in S. France; implications for coastal zone management
auteur
Rutger de Wit, Pénélope Chaubron-Couturier, Florence Galletti
article
Ocean and Coastal Management, Elsevier, 2021, 207, pp.105579. ⟨10.1016/j.ocecoaman.2021.105579⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03168221/file/DeWit_Diversity_of_property-regimes-resubmission.pdf BibTex
titre
Histology of Tritia mutabilis gonads: using reproductive biology to support sustainable fishery management
auteur
Alicia Mallet, Jean-Yves Jouvenel, Morgane Broyon, Nelly Pirot, Benjamin Geffroy
article
Aquatic Living Resources, EDP Sciences, 2021, 34, pp.6. ⟨10.1051/alr/2021006⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03178601/file/alr200124.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Genome wide association studies revealed one strong effect QTLfor viral nervous necrosis resistance in European sea bass (Dicentrarchus labrax)
auteur
Ronan Griot, François Allal, F. Phocas, Sophie Brard-Fudulea, Romain Morvezen, Pierrick Haffray, Anastasia Bestin, Yoannah François, Thierry Morin, Charles Poncet, Alain Vergnet, Sophie Cariou, Joseph Brunier, Jean-Sebastien Bruant, Bruno Peyrou, Pierre-Alexandre Gagnaire, Marc Vandeputte
article
Aquaculture Europe 2020, Apr 2021, Cork, Ireland
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BibTex
titre
Combining data from successive cohorts to increase the accuracy of estimated breeding values: a case study in a gilthead sea bream (Sparus aurata) commercial line
auteur
Anastasia Bestin, Sophie Cariou, Jean-Sébastien Bruant, Marc Vandeputte, Florian Enez, Pierrick Haffray
article
Aquaculture Europe 2020 online, Apr 2021, Cork, Ireland
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BibTex
titre
Evaluation of genetic gain in rainbow trout fed standard of “future” diet after 10 generations of multi-trait selection in the Aqualande selective breeding program
auteur
Marc Vandeputte, Geneviève Corraze, Jérôme Doerflinger, Florian Enez, Frédéric Clota, Frédéric Terrier, Mathilde Horat, Laurence Larroquet, Nicolas Dechamp, Vincent Petit, Pierrick Haffray, Sandrine Skiba-Cassy, Mathilde Dupont-Nivet
article
Aquaculture Europe 2020 Online, Apr 2021, Cork, Ireland
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BibTex
titre
Sex dimorphism in European sea bass (Dicentrarchus labrax L.) : new insights into sex-related growth patterns during very early life stages
auteur
Sara Faggion, Marc Vandeputte, Alain Vergnet, Frédéric Clota, Marie‐odile Blanc, Pierre Sanchez, François Ruelle, François Allal
article
Aquaculture Europe 2020 online, Apr 2021, Cork, Ireland
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BibTex
titre
Monitoring of coral reefs on contrasting sites (Mayotte and Iles Eparses) in the Mozambique Channel, Indian Ocean: Application to management
auteur
Pascale Chabanet, Serge Andréfouet, Lionel Bigot, Marc Bouvy, Chloé A.-F. Bourmaud, Estelle Crochelet, Patrick Durville, Pauline Gélin, Francois Guilhaumon, Hélène Magalon, Jean-Benoit Nicet, Natacha Nikolic, David Obura, Gwenaëlle Pennober, Melita Samoilys, Michael H. Schleyer, M. Sere
article
WIOMSA 11 th Scientific Symposium, Feb 2021, Réduit, Maurice
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03127199/file/12CHAB1.pdf BibTex

Chapitre d'ouvrage

titre
Effets du changement climatique sur l’écosystème pélagique de la mer Ligure : réponse des prédateurs pélagiques supérieurs
auteur
Maurizio Würtz, Jean Marc Fromentin
article
Chistophe Migon; Antoine Sciandra; Paul Nival. La mer Méditerranée face au changement global 2. Dynamique biologique et évolution de la mer Ligure, ISTE Editions Ltd, pp.155-182, 2021, 978-1-78405-733-6
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Pré-publication, Document de travail

titre
VTAM: A robust pipeline for validating metabarcoding data using internal controls
auteur
Aitor Gonzalez, Vincent Dubut, Emmanuel Corse, Reda Mekdad, Thomas Dechatre, Emese Meglécz
article
2021
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-03144831/file/2020.11.06.371187v3.full.pdf BibTex
titre
Intraspecific variation in thermal tolerance differs between tropical and temperate fishes
auteur
J.J.H. Nati, M.B.S. Svendsen, S. Marras, S.S. Killen, J.F. Steffensen, D.J. Mckenzie, P. Domenici
article
2021
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03097397/file/Nati%20et%20al%20CTmax.pdf BibTex
titre
Tolerance of an acute warming challenge declines with body mass in Nile tilapia: evidence of a link to capacity for oxygen uptake
auteur
F.R. Blasco, E.W. Taylor, C.A.C. Leite, D.A. Monteiro, F.T. Rantin, D.J. Mckenzie
article
2021
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03097440/file/2020.12.03.409870v1.full.pdf BibTex
titre
Valuation of Ecosystem Services and Social Choice: The Impact of Deliberation in the context of two different Aggregation Rules
auteur
Mariam Sy, Charles Figuières, Helene Rey-Valette, Richard Howarth, Rutger de Wit
article
2021
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https://halshs.archives-ouvertes.fr/halshs-03145117/file/WP%202021%20-%20Nr%2007.pdf BibTex

2020

Article dans une revue

titre
LPJmL-Med – Modelling the dynamics of the land-sea nutrient transfer over the Mediterranean region–version 1: Model description and evaluation
auteur
Mohamed Ayache, Alberte Bondeau, Rémi Pagès, Nicolas Barrier, Sebastian Ostberg, Melika Baklouti
article
Geoscientific Model Development Discussions, Copernicus Publ, 2020, ⟨10.5194/gmd-2020-342⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-03093154/file/Ayache%20et%20al%20Geoscientific%20Model%20Development%20EGU%202020.pdf BibTex
titre
Alterins Produced by Oyster-Associated Pseudoalteromonas are Antibacterial Cyclolipopeptides with LPS-Binding Activity
auteur
Florie Desriac, Abderrafek El Harras, Matthieu Simon, Arnaud Bondon, Benjamin Brillet, Patrick Le Chevalier, Martine Pugnière, Patrice Got, Delphine Destoumieux-Garzon, Yannick Fleury
article
Marine drugs, MDPI, 2020, 18 (12), ⟨10.3390/md18120630⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03053494/file/Desriac-2020-MarDrug-Alterins.pdf BibTex
titre
The Celtic Sea Through Time and Space: Ecosystem Modeling to Unravel Fishing and Climate Change Impacts on Food-Web Structure and Dynamics
auteur
Pierre-Yves Hernvann, Didier Gascuel, Arnaud Grüss, Jean-Noël Druon, Dorothée Kopp, Ilan Perez, Chiara Piroddi, Marianne Robert
article
Frontiers in Marine Science, Frontiers Media, 2020, 7, ⟨10.3389/fmars.2020.578717⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03136139/file/fmars-07-578717.pdf BibTex
titre
Carbon isotope evidence for large methane emissions to the Proterozoic atmosphere
auteur
Pierre Cadeau, Didier Jézéquel, Christophe Leboulanger, Éric Fouilland, Emilie Le Floc’h, Carine Chaduteau, Vincent Milesi, Julia Guélard, Gérard Sarazin, Amandine Katz, Sophie D’amore, Cécile Bernard, Magali Ader
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2020, 10 (1), ⟨10.1038/s41598-020-75100-x⟩
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https://hal-mnhn.archives-ouvertes.fr/mnhn-02978019/file/Cadeau_et_al_2020_C%20cycle%20Dziani.pdf BibTex
titre
A new method to control error rates in automated species identification with deep learning algorithms
auteur
Sébastien Villon, David Mouillot, Marc Chaumont, Gérard Subsol, Thomas Claverie, Sébastien Villéger
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2020, 10 (1), ⟨10.1038/s41598-020-67573-7⟩
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https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-03002261/file/s41598-020-67573-7.pdf BibTex
titre
A Dynamic Energy Budget simulation approach to investigate the eco-physiological factors behind the two-stanza growth of yellowfin tuna (Thunnus albacares)
auteur
E. Dortel, Laure Pecquerie, E. Chassot
article
Ecological Modelling, 2020, 437, pp.109297. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2020.109297⟩
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BibTex
titre
Variations in isotope incorporation rates and trophic discrimination factors of carbon and nitrogen stable isotopes in scales from three European sea bass (Dicentrarchus labrax) populations
auteur
Charles Rodde, Hugues de Verdal, Sébastien Lefebvre, Christophe Menniti, Marc Vandeputte, Frédéric Clota, François Allal, David Mckenzie, John A.H. Benzie, Sarah Nahon
article
Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, Elsevier, 2020, 533, pp.151468. ⟨10.1016/j.jembe.2020.151468⟩
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titre
Increasing climate‐driven taxonomic homogenization but functional differentiation among river macroinvertebrate assemblages
auteur
Théophile Mouton, Jonathan Tonkin, Fabrice Stephenson, Piet Verburg, Mathieu Floury
article
Global Change Biology, Wiley, 2020, 26 (12), pp.6904-6915. ⟨10.1111/gcb.15389⟩
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Low temperature has opposite effects on sex determination in a marine fish at the larval/postlarval and juvenile stages
auteur
Marc Vandeputte, Frédéric Clota, Bastien Sadoul, Marie‐odile Blanc, Eva Blondeau‐bidet, Marie‐laure Bégout, Xavier Cousin, Benjamin Geffroy
article
Ecology and Evolution, Wiley Open Access, 2020, 10 (24), pp.13825-13835. ⟨10.1002/ece3.6972⟩
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Global determinants of freshwater and marine fish genetic diversity
auteur
Stéphanie Manel, Pierre-Edouard Guerin, David Mouillot, Simon Blanchet, Laure Velez, Camille Albouy, Loïc Pellissier
article
Nature Communications, Nature Publishing Group, 2020, 11 (1), ⟨10.1038/s41467-020-14409-7⟩
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Oxygen uptake, heart rate and activities of locomotor muscles during a critical swimming speed protocol in the gilthead sea bream Sparus aurata
auteur
Mouniboudine Hachim, Tristan Rouyer, Gilbert Dutto, Vincent Kerzérho, Serge Bernard, Jérôme Bourjea, David Mckenzie
article
Journal of Fish Biology, Wiley, 2020, ⟨10.1111/jfb.14621⟩
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Intraspecific variation in tolerance of warming in fishes
auteur
David Mckenzie, Yangfan Zhang, Erika Eliason, Patricia Schulte, Guy Claireaux, Felipe Blasco, Julie J.H Nati, Anthony Farrell
article
Journal of Fish Biology, Wiley, 2020, ⟨10.1111/jfb.14620⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03097312/file/McKenzieetal.2020.pdf BibTex
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Projected Effects of Climate-Induced Changes in Hydrodynamics on the Biogeochemistry of the Mediterranean Sea Under the RCP 8.5 Regional Climate Scenario
auteur
Rémi Pagès, Melika Baklouti, Nicolas Barrier, Mohamed Ayache, Florence Sevault, Samuel Somot, Thierry Moutin
article
Frontiers in Marine Science, Frontiers Media, 2020, 7, ⟨10.3389/fmars.2020.563615⟩
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https://hal-univ-tln.archives-ouvertes.fr/hal-03064361/file/pages_frontiers_2020.pdf BibTex
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An iron cycle cascade governs the response of equatorial Pacific ecosystems to climate change
auteur
Alessandro Tagliabue, Nicolas Barrier, Hubert Du Pontavice, Lester Kwiatkowski, Olivier Aumont, Laurent Bopp, William Cheung, Didier Gascuel
article
Global Change Biology, Wiley, 2020, 26 (11), pp.6168-6179. ⟨10.1111/gcb.15316⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02999064/file/Tagliabue%20et%20al.pdf BibTex
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Social dynamics obscure the effect of temperature on air breathing in Corydoras catfish
auteur
Mar Pineda, Isabel Aragao, David Mckenzie, Shaun Killen
article
Journal of Experimental Biology, Cambridge University Press, 2020, 223, ⟨10.1242/jeb.222133⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03097340/file/jeb222133.full.pdf BibTex
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Marine Microbial Food Web Networks During Phytoplankton Bloom and Non-bloom Periods: Warming Favors Smaller Organism Interactions and Intensifies Trophic Cascade
auteur
Thomas Trombetta, Francesca Vidussi, Cécile Roques, Marco Scotti, Behzad Mostajir
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2020, 11, ⟨10.3389/fmicb.2020.502336⟩
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https://hal-cnrs.archives-ouvertes.fr/hal-03091194/file/Trombetta%20et%20al.%202020.pdf BibTex
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Morphology and Ecology of Two New Amoebae, Isolated From a Thalassohaline Lake, Dziani Dzaha
auteur
Willy Aucher, Vincent Delafont, Elodie Ponlaitiac, Aurélien Alafaci, Hélène Agogué, Christophe Leboulanger, Marc Bouvy, Yann Héchard
article
Protist, Elsevier, 2020, 171 (6), pp.125770. ⟨10.1016/j.protis.2020.125770⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03024315/file/Mayotte%20format%20Protist_HAL_final.pdf BibTex
titre
Population, Temperature and Feeding Rate Effects on Individual Feed Efficiency in European Sea Bass (Dicentrarchus labrax)
auteur
Charles Rodde, Marc Vandeputte, François Allal, Mathieu Besson, Frédéric Clota, Alain Vergnet, John Benzie, Hugues de Verdal
article
Frontiers in Marine Science, Frontiers Media, 2020, 7, ⟨10.3389/fmars.2020.578976⟩
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Alterocin, an Antibiofilm Protein Secreted by Pseudoalteromonas sp. Strain 3J6
auteur
Albane Jouault, Angélique Gobet, Marjolaine Simon, Emilie Portier, Morgan Perennou, Erwan Corre, Fanny Gaillard, David Vallenet, Gurvan Michel, Yannick Fleury, Alexis Bazire, Alain Dufour
article
Applied and Environmental Microbiology, American Society for Microbiology, 2020, 86 (20), ⟨10.1128/AEM.00893-20⟩
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Bay of Bengal Sea surface salinity variability using a decade of improved SMOS re-processing
auteur
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