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Pressure and Chemical Unfolding of an α-Helical Bundle Protein: The GH2 Domain of the Protein Adaptor GIPC1

auteur

Cécile Dubois, Vicente Planelles-Herrero, Camille Tillatte-Tripodi, Stéphane Delbecq, Léa Mammri, Elena Sirkia, Virginie Ropars, Christian Roumestand, Philippe Barthe

article

International Journal of Molecular Sciences, MDPI, 2021, 22 (7), pp.3597. ⟨10.3390/ijms22073597⟩

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Single-molecule FRET on its way to structural biology in live cells

auteur

Robert Quast, Emmanuel Margeat

article

Nature Methods, Nature Publishing Group, 2021, 18 (4), pp.344-345. ⟨10.1038/s41592-021-01084-9⟩

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Single-particle tracking photoactivated localization microscopy of membrane proteins in living plant tissues

auteur

Vincent Bayle, Jean-Bernard Fiche, Claire Burny, Matthieu Platre, Marcelo Nollmann, Alexandre Martinière, Yvon Jaillais

article

Nature Protocols, Nature Publishing Group, 2021, 16 (3), pp.1600-1628. ⟨10.1038/s41596-020-00471-4⟩

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Improved backscattering detection in photonic force microscopy near dielectric surfaces with cylindrical vector beams

auteur

Maria Grazia Donato, Francesco Patti, Rosalba Saija, Maria Antonia Iatì, Pietro Gucciardi, Francesco Pedaci, Giuseppe Strangi, Onofrio Maragò

article

Journal of Quantitative Spectroscopy and Radiative Transfer, Elsevier, 2021, 258, pp.107381. ⟨10.1016/j.jqsrt.2020.107381⟩

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An oligomeric switch controls the Mrr-induced SOS response in E. coli

auteur

Anaïs Bourges, Oscar Torres Montaguth, Wubishet Tadesse, Gilles Labesse, Abram Aertsen, Catherine Royer, Nathalie Declerck

article

DNA Repair, Elsevier, 2021, 97, pp.103009. ⟨10.1016/j.dnarep.2020.103009⟩

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Resolving the activation mechanism of the D99N antiterminator LicT protein

auteur

Yinshan Yang, Jérôme Gracy, Nathalie Declerck, Héléne Démèné

article

Journal of Structural Biology, Elsevier, In press, ⟨10.1016/j.jsb.2021.107730⟩

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Article dans une revue

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Mechanistic insights into the synergistic activation of the RXR–PXR heterodimer by endocrine disruptor mixtures

auteur

Vanessa Delfosse, Tiphaine Huet, Deborah Harrus, Meritxell Granell, Maxime Bourguet, Caroline Gardia-Parège, Barbara Chiavarina, Marina Grimaldi, Sébastien Le Mével, Pauline Blanc, David Huang, Jakub Gruszczyk, Barbara Demeneix, Sarah Cianférani, Jean-Baptiste Fini, Patrick Balaguer, William Bourguet

article

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2020, 118 (1), pp.e2020551118. ⟨10.1073/pnas.2020551118⟩

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Synchronous, Crosstalk-free Correlative AFM and Confocal Microscopies/Spectroscopies

auteur

Thales Fernandes, Oscar Saavedra, Emmanuel Margeat, Pierre-Emmanuel Milhiet, Luca Costa

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2020, 10 (1), pp.7098. ⟨10.1038/s41598-020-62529-3⟩

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New Chemical Probe Targeting Bacterial NAD Kinase

auteur

David Clément, Clarisse Leseigneur, Muriel Gelin, Dylan Coelho, Valérie Huteau, Corinne Lionne, Gilles Labesse, Olivier Dussurget, Sylvie Pochet

article

Molecules, MDPI, 2020, 25 (21), pp.4893. ⟨10.3390/molecules25214893⟩

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Speech can produce jet-like transport relevant to asymptomatic spreading of virus

auteur

Manouk Abkarian, Simon Mendez, Nan Xue, Fan Yang, Howard Stone

article

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2020, 117 (41), pp.25237-25245. ⟨10.1073/pnas.2012156117⟩

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RNA imaging in bacteria

auteur

Sara Rombouts, Marcelo Nollmann

article

FEMS Microbiology Reviews, Wiley-Blackwell, 2020, ⟨10.1093/femsre/fuaa051⟩

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Robust Cell-Free Expression of Sub-Pathological and Pathological Huntingtin Exon-1 for NMR Studies. General Approaches for the Isotopic Labeling of Low-Complexity Proteins

auteur

Anna Morató, Carlos Elena-Real, Matija Popovic, Aurélie Fournet, Karen Zhang, Frédéric Allemand, Nathalie Sibille, Annika Urbanek, Pau Bernadó

article

Biomolecules, MDPI, 2020, 10 (10), pp.1458. ⟨10.3390/biom10101458⟩

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A Plasma Membrane Nanodomain Ensures Signal Specificity during Osmotic Signaling in Plants

auteur

Marija Smokvarska, Charbel Francis, Matthieu Pierre Platre, Jean-Bernard Fiche, Carine Alcon, Xavier Dumont, Philippe Nacry, Vincent Bayle, Marcelo Nollmann, Christophe Maurel, Yvon Jaillais, Alexandre Martiniere

article

Current Biology - CB, Elsevier, 2020, 30 (23), pp.4654-4664. ⟨10.1016/j.cub.2020.09.013⟩

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Rational programming of history-dependent logic in cellular populations

auteur

Ana Zúñiga, Sarah Guiziou, Pauline Mayonove, Zachary Ben Meriem, Miguel Camacho, Violaine Moreau, Luca Ciandrini, Pascal Hersen, Jerome Bonnet

article

Nature Communications, Nature Publishing Group, 2020, 11 (1), pp.4758. ⟨10.1038/s41467-020-18455-z⟩

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Predicting secondary structure propensities in IDPs using simple statistics from three-residue fragments

auteur

Alejandro Estaña, Amélie Barozet, Assia Mouhand, Marc Vaisset, Christophe Zanon, Pierre Fauret, Nathalie Sibille, Pau Bernadó, Juan Cortés

article

Journal of Molecular Biology, Elsevier, 2020, 342 (19), pp.5447-5459. ⟨10.1016/j.jmb.2020.07.026⟩

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Human and Zebrafish Nuclear Progesterone Receptors Are Differently Activated by Manifold Progestins

auteur

Clémentine Garoche, Selim Aït-Aïssa, Abdelhay Boulahtouf, Nicolas Creusot, Nathalie Hinfray, William Bourguet, Patrick Balaguer, François Brion

article

Environmental Science and Technology, American Chemical Society, 2020, 54 (15), pp.9510-9518. ⟨10.1021/acs.est.0c02056⟩

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Two Novel Cases of Resistance to Thyroid Hormone Due to THRA Mutation

auteur

Albane Le Maire, Natacha Bouhours-Nouet, Jessica Soamalala, Delphine Mirebeau-Prunier, Matteo Paloni, Laura Guee, Delphine Heron, Cyril Mignot, Frédéric Illouz, Florence Joubert, Claire Briet, Patrice Rodien, William Bourguet, Frédéric Flamant, Romain Guyot

article

Thyroid, Mary Ann Liebert, 2020, 30 (8), pp.1217-1221. ⟨10.1089/thy.2019.0602⟩

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ATP-Driven Separation of Liquid Phase Condensates in Bacteria

auteur

Baptiste Guilhas, Jean-Charles Walter, Jerome Rech, Gabriel David, Nils-Ole Walliser, John Palmeri, Céline Mathieu-Demaziere, Andrea Parmeggiani, Jean-Yves Bouet, Antoine Le Gall, Marcelo Nollmann

article

Molecular Cell, Elsevier, 2020, 79 (2), pp.293-303. ⟨10.1016/j.molcel.2020.06.034⟩

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Flanking regions determine the structure of the poly-glutamine homo- repeat in huntingtin through mechanisms common among glutamine-rich human proteins

auteur

Annika Urbanek, Matija Popovic, Anna Morató, Alejandro Estaña, Carlos Elena-Real, Pablo Mier, Aurélie Fournet, Frédéric Allemand, Stéphane Delbecq, Miguel Andrade-Navarro, Juan Cortés, Nathalie Sibille, Pau Bernadó

article

Structure, Elsevier (Cell Press), 2020, 28 (7), pp.733-746.e5. ⟨10.1016/j.str.2020.04.008⟩

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Fragment Linking Strategies for Structure-Based Drug Design

auteur

Alexandre Bancet, Claire Raingeval, Thierry Lomberget, Marc Le Borgne, Jean-François Guichou, Isabelle Krimm

article

Journal of Medicinal Chemistry, American Chemical Society, 2020, 63 (20), pp.11420-11435. ⟨10.1021/acs.jmedchem.0c00242⟩

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The Brownian and Flow‐Driven Rotational Dynamics of a Multicomponent DNA Origami‐Based Rotor

auteur

Yasaman Ahmadi, Ashley Nord, Amanda Wilson, Christiane Hütter, Fabian Schroeder, Morgan Beeby, Ivan Barišić

article

Small, Wiley-VCH Verlag, 2020, 16 (22), pp.2001855. ⟨10.1002/smll.202001855⟩

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Quantitative High-Resolution Imaging of Live Microbial Cells at High Hydrostatic Pressure

auteur

Anais Bourges, Alexander Lazarev, Nathalie Declerck, Karyn Rogers, Catherine Royer

article

Biophysical Journal, Biophysical Society, 2020, 118 (11), pp.2670-2679. ⟨10.1016/j.bpj.2020.04.017⟩

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High Content Screening Using New U2OS Reporter Cell Models Identifies Harmol Hydrochloride as a Selective and Competitive Antagonist of the Androgen Receptor

auteur

Hadjer Dellal, Abdelhay Boulahtouf, Elina Alaterre, Alice Cuenant, Marina Grimaldi, William Bourguet, Céline Gongora, Patrick Balaguer, Philippe Pourquier

article

Cells, MDPI, 2020, 9 (6), pp.1469. ⟨10.3390/cells9061469⟩

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Structural basis of nanobody recognition of grapevine fanleaf virus and of virus resistance loss

auteur

Igor Orlov, Caroline Hemmer, Léa Ackerer, Bernard Lorber, Ahmed Ghannam, Vianney Poignavent, Kamal Hleibieh, Claude Sauter, Corinne Schmitt-Keichinger, Lorène Belval, Jean-Michel Hily, Aurélie Marmonier, Véronique Komar, Sophie Gersch, Pascale Schellenberger, Patrick Bron, Emmanuelle Vigne, Serge Muyldermans, Olivier Lemaire, Gérard Demangeat, Christophe Ritzenthaler, Bruno Klaholz

article

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2020, 117 (20), pp.10848-10855. ⟨10.1073/pnas.1913681117⟩

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The GOLIATH Project: Towards an Internationally Harmonised Approach for Testing Metabolism Disrupting Compounds

auteur

Juliette Legler, Daniel Zalko, Fabien Jourdan, Miriam Jacobs, Bernard Fromenty, Patrick Balaguer, William Bourguet, Vesna Kos, Angel Nadal, Claire Beausoleil, Susana Cristobal, Sylvie Rémy, Sibylle Ermler, Luigi Margiotta-Casaluci, Julian Griffin, Bruce Blumberg, Christophe Chesné, Sebastian Hoffmann, Patrik Andersson, Jorke Kamstra

article

International Journal of Molecular Sciences, MDPI, 2020, 21 (10), pp.3480. ⟨10.3390/ijms21103480⟩

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Evidence of the reduced abundance of proline cis conformation in protein poly-proline tracts

auteur

Annika Urbanek, Matija Popovic, Carlos Elena-Real, Anna Morató, Alejandro Estaña, Aurélie Fournet, Frédéric Allemand, Ana Gil, Carlos Cativiela, Juan Cortés, Ana Jiménez, Nathalie Sibille, Pau Bernadó

article

Journal of the American Chemical Society, American Chemical Society, 2020, 142 (17), pp.7976-7986. ⟨10.1021/jacs.0c02263⟩

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NMR chemical shift assignment of a constitutively active fragment of the antitermination protein LicT

auteur

Yinshan Yang, Nathalie Declerck, Héléne Démèné

article

Biomolecular NMR Assignments, Springer, 2020, 14, pp.19-22. ⟨10.1007/s12104-019-09914-w⟩

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A Plant-Specific N-terminal Extension Reveals Evolutionary Functional Divergence within Translocator Proteins

auteur

Pawel Jurkiewicz, Lucile Senicourt, Haitham Ayeb, Olivier Lequin, Jean-Jacques Lacapere, Henri Batoko

article

iScience, Elsevier, 2020, ⟨10.1016/j.isci⟩

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Direct and simultaneous observation of transcription and chromosome architecture in single cells with Hi-M

auteur

Andrés M Cardozo Gizzi, Sergio Espinola, Julian Gurgo, Christophe Houbron, Jean-Bernard Fiche, Diego Cattoni, Marcelo Nollmann

article

Nature Protocols, Nature Publishing Group, 2020, 15 (3), pp.840-876. ⟨10.1038/s41596-019-0269-9⟩

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Perspectives on Chromosome Organization

auteur

Marcelo Nollmann, Romain Koszul

article

Journal of Molecular Biology, Elsevier, 2020, 432 (3), pp.635-637. ⟨10.1016/j.jmb.2019.12.021⟩

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From Substrate to Fragments to Inhibitor Active In Vivo against Staphylococcus aureus

auteur

Muriel Gelin, Julie Paoletti, Marie-Anne Nahori, Valeŕie Huteau, Clarisse Leseigneur, Greǵory Jouvion, Laurence Dugué, David Clément, Jean-Luc Pons, Liliane Assairi, Sylvie Pochet, Gilles Labesse, Olivier Dussurget

article

ACS Infectious Diseases, American Chemical Society, 2020, 6 (3), ⟨10.1021/acsinfecdis.9b00368⟩

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Post-production modifications of murine mesenchymal stem cell (mMSC) derived extracellular vesicles (EVs) and impact on their cellular interaction

auteur

Sarah Le Saux, Hanna Aarrass, Josephine Lai-Kee-Him, Patrick Bron, J. Armengaud, Guylaine Miotello, Justine Bertrand-Michel, Emeric Dubois, Simon George, Orestis Faklaris, Jean-Marie Devoisselle, Philippe Legrand, Joel Chopineau, Marie Morille

article

Biomaterials, Elsevier, 2020, 231, pp.119675. ⟨10.1016/j.biomaterials.2019.119675⟩

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Structure Structural insights into the allosteric activation of the LicT antiterminator by PTS- mediated phosphorylation

auteur

Yinshan Yang, André Padilla, Karine de Guillen, Léa Mammri, Jérôme Gracy, Nathalie Declerck, Héléne Démèné

article

Structure, Elsevier (Cell Press), 2020, 28 (2), pp.244-251.e3. ⟨10.1016/j.str.2019.10.017⟩

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Structural and Functional Specialization of OSBP-Related Proteins

auteur

Vanessa Delfosse, William Bourguet, Guillaume Drin

article

Contact, Institute of Ophthalmology, University College London, UK, 2020, 3, pp.251525642094662. ⟨10.1177/2515256420946627⟩

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Compression, Rupture, and Puncture of Model Membranes at the Molecular Scale

auteur

Oscar Saavedra V., Thales Fernandes, Pierre-Emmanuel Milhiet, Luca Costa

article

Langmuir, American Chemical Society, In press, ⟨10.1021/acs.langmuir.0c00247⟩

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Probing Protein Interaction Networks by Combining MS-Based Proteomics and Structural Data Integration

auteur

Guillaume Postic, Julien Marcoux, Victor Reys, Jessica Andreani, Yves Vandenbrouck, Marie-Pierre Bousquet, Emmanuelle Mouton-Barbosa, Sarah Cianférani, Odile Burlet-Schiltz, Raphael Guerois, Gilles Labesse, Pierre Tufféry

article

Journal of Proteome Research, American Chemical Society, 2020, 19 (7), pp.2807-2820. ⟨10.1021/acs.jproteome.0c00066⟩

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TADs or no TADS: Lessons From Single-cell Imaging of Chromosome Architecture

auteur

Andrés M Cardozo Gizzi, Diego I Cattoni, Marcelo Nollmann

article

Journal of Molecular Biology, Elsevier, 2020, 432 (3), pp.682-693. ⟨10.1016/j.jmb.2019.12.034⟩

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Article dans une revue

titre

Benchmarking the PEPOP methods for mimicking discontinuous epitopes

auteur

Vincent Demolombe, Alexandre de Brevern, Franck Molina, Géraldine Lavigne, Claude Granier, Violaine Moreau

article

BMC Bioinformatics, BioMed Central, 2019, 20 (1), pp.738. ⟨10.1186/s12859-019-3189-3⟩

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CRISPR directed evolution of the spliceosome for resistance to splicing inhibitors

auteur

Haroon Butt, Ayman Eid, Afaque Momin, Jérémie Bazin, Martin Crespi, Stefan Arold, Magdy Mahfouz

article

Genome Biology, BioMed Central, 2019, 20 (1), ⟨10.1186/s13059-019-1680-9⟩

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titre

Plasmodium myosin A drives parasite invasion by an atypical force generating mechanism

auteur

Julien Robert-Paganin, James Robblee, Daniel Auguin, Thomas Blake, Carol Bookwalter, Elena Krementsova, Dihia Moussaoui, Michael Previs, Guillaume Jousset, Jake Baum, Kathleen Trybus, Anne Houdusse

article

Nature Communications, Nature Publishing Group, 2019, 10 (1), ⟨10.1038/s41467-019-11120-0⟩

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Molecular Dynamics Simulations of the Allosteric Modulation of the Adenosine A2a Receptor by a Mini-G Protein

auteur

Pedro Renault, Maxime Louet, Jacky Marie, Gilles Labesse, Nicolas Floquet

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-41980-x⟩

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Structural basis for chemically-induced homodimerization of a single domain antibody

auteur

Jean Lesné, Hung-Ju Chang, Angelique de Visch, Matteo Paloni, Philippe Barthe, Jean-François Guichou, Pauline Mayonove, Alessandro Barducci, Gilles Labesse, Jérome Bônnet, Martin Cohen-Gonsaud

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-38752-y⟩

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A Complex Interplay of Anionic Phospholipid Binding Regulates 3′-Phosphoinositide-Dependent-Kinase-1 Homodimer Activation

auteur

Gloria De las Heras-Martínez, Véronique Calleja, Rémy Bailly, Jean Dessolin, Banafshé Larijani, Jose Requejo-Isidro

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-50742-8⟩

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Plug-and-play metabolic transducers expand the chemical detection space of cell-free biosensors

auteur

Peter Voyvodic, Amir Pandi, Mathilde Koch, Ismael Conejero, Emmanuel Valjent, Philippe Courtet, Eric Renard, Jean-Loup Faulon, Jérôme Bonnet

article

Nature Communications, Nature Publishing Group, 2019, 10 (1), ⟨10.1038/s41467-019-09722-9⟩

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titre

MglA functions as a three-state GTPase to control movement reversals of Myxococcus xanthus

auteur

Christian Galicia, Sebastien Lhospice, Paloma Fernández Varela, Stefano Trapani, Wenhua Zhang, Jorge Navaza, Julien Herrou, Tam Mignot, Jacqueline Cherfils

article

Nature Communications, Nature Publishing Group, 2019, 10 (1), pp.5300. ⟨10.1038/s41467-019-13274-3⟩

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titre

Site‐Specific Isotopic Labeling (SSIL) – Access to High‐Resolution Str