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Cryo-EM structure of transcription termination factor Rho from Mycobacterium tuberculosis reveals bicyclomycin resistance mechanism

auteur

Emmanuel Saridakis, Rishi Vishwakarma, Josephine Lai-Kee-Him, Kevin Martin, Isabelle Simon, Martin Cohen-Gonsaud, Franck Coste, Patrick Bron, Emmanuel Margeat, Marc Boudvillain

article

Communications Biology, Nature Publishing Group, 2022, 5 (1), pp.120. ⟨10.1038/s42003-022-03069-6⟩

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New recognition specificity in a plant immune receptor by molecular engineering of its integrated domain

auteur

Stella Cesari, Yuxuan Xi, Nathalie Declerck, Véronique Chalvon, Léa Mammri, Martine Pugnière, Corinne Henriquet, Karine de Guillen, Vincent Chochois, André Padilla, Thomas Kroj

article

Nature Communications, Nature Publishing Group, 2022, 13 (1), pp.1524. ⟨10.1038/s41467-022-29196-6⟩

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Relaxation time asymmetry in stator dynamics of the bacterial flagellar motor

auteur

Ruben Perez-Carrasco, Maria-José Franco-OÑate, Jean-Charles Walter, Jerome Dorignac, Frederic Geniet, John Palmeri, Andrea Parmeggiani, Nils-Ole Walliser, Ashley Nord

article

Science Advances , American Association for the Advancement of Science (AAAS), 2022, 8 (12), pp.eabl8112. ⟨10.1126/sciadv.abl8112⟩

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Stress response in dissociation and conversion disorders: A systematic review

auteur

Charlotte Boulet, Jorge Lopez-Castroman, Stéphane Mouchabac, Emilie Olié, Philippe Courtet, Eric Thouvenot, Mocrane Abbar, Ismael Conejero

article

Neuroscience & Biobehavioral Reviews, Oxford: Elsevier Ltd., 2022, 132, pp.957-967. ⟨10.1016/j.neubiorev.2021.10.049⟩

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Article dans une revue

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Discovery of a cryptic site at the interface 2 of TEAD – Towards a new family of YAP/TAZ-TEAD inhibitors

auteur

Manon Sturbaut, Fabrice Bailly, Mathilde Coevoet, Pasquale Sileo, Martine Pugniere, Maxime Liberelle, Romain Magnez, Xavier Thuru, Marie-Christine Chartier-Harlin, Patricia Melnyk, Muriel Gelin, Frédéric Allemand, Jean-François Guichou, Philippe Cotelle

article

European Journal of Medicinal Chemistry, Elsevier, 2021, 226, pp.113835. ⟨10.1016/j.ejmech.2021.113835⟩

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Structures of the archaerhodopsin-3 transporter reveal that disordering of internal water networks underpins receptor sensitization

auteur

Juan Bada Juarez, Peter Judge, Suliman Adam, Danny Axford, Javier Vinals, James Birch, Tristan Kwan, Kin Kuan Hoi, Hsin-Yung Yen, Anthony Vial, Pierre-Emmanuel Milhiet, Carol Robinson, Igor Schapiro, Isabel Moraes, Anthony Watts

article

Nature Communications, Nature Publishing Group, 2021, 12 (1), ⟨10.1038/s41467-020-20596-0⟩

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Programmable receptors enable bacterial biosensors to detect pathological biomarkers in clinical samples

auteur

Hung-Ju Chang, Ana Zúñiga, Ismael Conejero, Peter L. Voyvodic, Jérôme Gracy, Elena Fajardo-Ruiz, Martin Cohen-Gonsaud, Guillaume Cambray, Georges-Philippe Pageaux, Magdalena Meszaros, Lucy Meunier, Jerome Bonnet

article

Nature Communications, Nature Publishing Group, 2021, 12 (1), pp.5216. ⟨10.1038/s41467-021-25538-y⟩

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Δ133p53β isoform pro-invasive activity is regulated through an aggregation-dependent mechanism in cancer cells

auteur

Nikola Arsic, Tania Slatter, Gilles Gadea, Etienne Villain, Aurelie Fournet, Marina Kazantseva, Frédéric Allemand, Nathalie Sibille, Martial Séveno, Sylvain de Rossi, Sunali Mehta, S Urbach, Jean-Christophe Bourdon, Pau Bernado, Andrey Kajava, Antony Braithwaite, Pierre Roux

article

Nature Communications, Nature Publishing Group, 2021, 12 (1), pp.5463. ⟨10.1038/s41467-021-25550-2⟩

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Functional analyses of phosphatidylserine/PI(4)P exchangers with diverse lipid species and membrane contexts reveal unanticipated rules on lipid transfer

auteur

Souade Ikhlef, Nicolas-Frédéric Lipp, Vanessa Delfosse, Nicolas Fuggetta, William Bourguet, Maud Magdeleine, Guillaume Drin

article

BMC Biology, BioMed Central, 2021, 19 (1), pp.248. ⟨10.1186/s12915-021-01183-1⟩

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The genome of the zoonotic malaria parasite Plasmodium simium reveals adaptations to host switching

auteur

Tobias Mourier, Denise de Alvarenga, Abhinav Kaushik, Anielle de Pina-Costa, Olga Douvropoulou, Qingtian Guan, Francisco Guzmán-Vega, Sarah Forrester, Filipe de Abreu, Cesare Júnior, Julio de Souza Junior, Silvia Moreira, Zelinda Hirano, Alcides Pissinatti, Maria Ferreira-Da-Cruz, Ricardo de Oliveira, Stefan Arold, Daniel Jeffares, Patrícia Brasil, Cristiana de Brito, Richard Culleton, Cláudio Daniel-Ribeiro, Arnab Pain

article

BMC Biology, BioMed Central, 2021, 19 (1), pp.219. ⟨10.1186/s12915-021-01139-5⟩

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Molecular insights into the biased signaling mechanism of the μ-opioid receptor

auteur

Xiaojing Cong, Damien Maurel, Héléne Démèné, Ieva Vasiliauskaité-Brooks, Joanna Hagelberger, Fanny Peysson, Julie Saint-Paul, Jérôme Golebiowski, Sébastien Granier, Rémy Sounier

article

Molecular Cell, Cell Press, In press, 81 (20), pp.4165-4175.e6. ⟨10.1016/j.molcel.2021.07.033⟩

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Allosteric modulators enhance agonist efficacy by increasing the residence time of a GPCR in the active state

auteur

Anne-Marinette Cao, Robert Quast, Fataneh Fatemi, Philippe Rondard, Jean-Philippe Pin, Emmanuel Margeat

article

Nature Communications, Nature Publishing Group, 2021, 12 (1), pp.5426. ⟨10.1038/s41467-021-25620-5⟩

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Misic, a general deep learning-based method for the high-throughput cell segmentation of complex bacterial communities

auteur

Swapnesh Panigrahi, Dorothée Murat, Antoine Le Gall, Eugénie Martineau, Kelly Goldlust, Jean-Bernard Fiche, Sara Rombouts, Marcelo Nollmann, Leon Espinosa, Tâm Mignot

article

eLife, eLife Sciences Publication, 2021, 10, ⟨10.7554/eLife.65151⟩

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Biology across scales: from atomic processes to bacterial communities through the lens of the microscope

auteur

Tâm Mignot, Marcelo Nollmann

article

FEMS Microbiology Reviews, Wiley-Blackwell, 2021, FEMS Microbiol Rev., 45 (5), pp.fuab009. ⟨10.1093/femsre/fuab009⟩

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A nanobody activating metabotropic glutamate receptor 4 discriminates between homo- and heterodimers

auteur

Jordi Haubrich, Joan Font, Robert Quast, Anne Goupil-Lamy, Pauline Scholler, Damien Nevoltris, Francine Acher, Patrick Chames, Philippe Rondard, Laurent Prézeau, Jean-Philippe Pin

article

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2021, 118 (33), pp.e2105848118. ⟨10.1073/pnas.2105848118⟩

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Capsid Proteins Are Necessary for Replication of a Parvovirus

auteur

Thomas Labadie, Deborah Garcia, Doriane Mutuel, Mylène Ogliastro, Guillaume Cambray

article

Journal of Virology, American Society for Microbiology, 2021, 95 (17), ⟨10.1128/JVI.00523-21⟩

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Agonists and allosteric modulators promote signaling from different metabotropic glutamate receptor 5 conformations

auteur

Chady Nasrallah, Giuseppe Cannone, Julie Briot, Karine Rottier, Alice Berizzi, Chia-Ying Huang, Robert Quast, Francois Hoh, Jean-Louis Banères, Fanny Malhaire, Ludovic Berto, Anaëlle Dumazer, Joan Font-Ingles, Xavier Gómez-Santacana, Juanlo Catena, Julie Kniazeff, Cyril Goudet, Amadeu Llebaria, Jean-Philippe Pin, Kutti Vinothkumar, Guillaume Lebon

article

Cell Reports, Elsevier Inc, 2021, 36 (9), pp.109648. ⟨10.1016/j.celrep.2021.109648⟩

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Ligands and DNA in the allosteric control of retinoid receptors function

auteur

Pierre Germain, Natacha Rochel, William Bourguet

article

Essays in Biochemistry, Portland Press, 2021, ⟨10.1042/EBC20200168⟩

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The impact of space and time on the functional output of the nucleus

auteur

Marcelo Nollmann, Isma Bennabi, Markus Götz, Thomas Gregor

article

Cold Spring Harbor Perspectives in Biology, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2021, pp.a040378. ⟨10.1101/cshperspect.a040378⟩

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Proteo3Dnet: a web server for the integration of structural information with interactomics data

auteur

Guillaume Postic, Jessica Andreani, Julien Marcoux, Victor Reys, Raphaël Guerois, Julien Rey, Emmanuelle Mouton-Barbosa, Yves Vandenbrouck, Sarah Cianferani, Odile Burlet-Schiltz, Gilles Labesse, Pierre Tufféry

article

Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2021, 49 (W1), pp.W567-W572. ⟨10.1093/nar/gkab332⟩

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Comparative Assessment of NMR Probes for the Experimental Description of Protein Folding Pathways with High-Pressure NMR

auteur

Vincent van Deuren, Yin-Shan Yang, Karine de Guillen, Cécile Dubois, Catherine Anne Royer, Christian Roumestand, Philippe Barthe

article

Biology, MDPI 2021, 10 (7), pp.656. ⟨10.3390/biology10070656⟩

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Arginine multivalency stabilizes protein/RNA condensates

auteur

Matteo Paloni, Giovanni Bussi, Alessandro Barducci

article

Protein Science, Wiley, 2021, 30 (7), pp.1418-1426. ⟨10.1002/pro.4109⟩

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Mesenchymal stromal cells-derived extracellular vesicles alleviate systemic sclerosis via miR-29a-3p

auteur

Pauline Rozier, Marie Maumus, Alexandre Thibault Jacques Maria, Karine Toupet, Joséphine Lai-Kee-Him, Christian Jorgensen, Philippe Guilpain, Danièle Noël

article

Journal of Autoimmunity, Elsevier, 2021, 121, pp.102660. ⟨10.1016/j.jaut.2021.102660⟩

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Mechanical Control of Cell Migration by the Metastasis Suppressor Tetraspanin CD82/KAI1

auteur

Laura Ordas, Luca Costa, Anthony Lozano, Christopher Chevillard, Alexia Calovoulos, Diala Kantar, Laurent Fernandez, Lucie Chauvin, Patrice Dosset, Christine Doucet, Lisa Heron-Milhavet, Elena Odintsova, Fedor Berditchevski, Pierre-Emmanuel Milhiet, Christine Bénistant

article

Cells, MDPI, 2021, 10 (6), pp.1545. ⟨10.3390/cells10061545⟩

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The study of the determinants controlling Arpp19 phosphatase-inhibitory activity reveals an Arpp19/PP2A-B55 feedback loop

auteur

Jean Claude Labbé, Suzanne Vigneron, Francisca Méchali, Perle Robert, Sylvain Roque, Cindy Genoud, Perrine Goguet-Rubio, Phillipe Barthe, Gilles Labesse, Martin Cohen-Gonsaud, Anna Castro, Thierry Lorca

article

Nature Communications, Nature Publishing Group, 2021, 12 (1), ⟨10.1038/s41467-021-23657-0⟩

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The diversity of molecular interactions involving intrinsically disordered proteins: A molecular modeling perspective

auteur

Ilinka Clerc, Amin Sagar, Alessandro Barducci, Nathalie Sibille, Pau Bernadó, Juan Cortés

article

Computational and Structural Biotechnology Journal, Elsevier, 2021, 19, pp.3817-3828. ⟨10.1016/j.csbj.2021.06.031⟩

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Molecular structure of the intact bacterial flagellar basal body

auteur

Steven Johnson, Emily Furlong, Justin Deme, Ashley Nord, Joseph Caesar, Fabienne Chevance, Richard Berry, Kelly Hughes, Susan Lea

article

Nature Microbiology, Nature Publishing Group, 2021, 6 (6), pp.712-721. ⟨10.1038/s41564-021-00895-y⟩

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titre

Resolving the activation mechanism of the D99N antiterminator LicT protein

auteur

Yinshan Yang, Jérôme Gracy, Nathalie Declerck, Héléne Démèné

article

Journal of Structural Biology, Elsevier, 2021, 213 (2), pp.107730. ⟨10.1016/j.jsb.2021.107730⟩

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Cryo–electron microscopy structure of the antidiuretic hormone arginine-vasopressin V2 receptor signaling complex

auteur

Julien Bous, Hélène Orcel, Nicolas Floquet, Cedric Leyrat, Joséphine Lai-Kee-Him, Gérald Gaibelet, Aurélie Ancelin, Julie Saint-Paul, Stefano Trapani, Maxime Louet, Rémy Sounier, Héléne Démèné, Sébastien Granier, Patrick Bron, Bernard Mouillac

article

Science Advances , American Association for the Advancement of Science (AAAS), 2021, 7 (21), pp.eabg5628. ⟨10.1126/sciadv.abg5628⟩

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The Dynamic Ion Motive Force Powering the Bacterial Flagellar Motor

auteur

Anaïs Biquet-Bisquert, Gilles Labesse, Francesco Pedaci, Ashley Nord

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2021, 12, ⟨10.3389/fmicb.2021.659464⟩

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Pressure and Chemical Unfolding of an α-Helical Bundle Protein: The GH2 Domain of the Protein Adaptor GIPC1

auteur

Cécile Dubois, Vicente Planelles-Herrero, Camille Tillatte-Tripodi, Stéphane Delbecq, Léa Mammri, Elena Sirkia, Virginie Ropars, Christian Roumestand, Philippe Barthe

article

International Journal of Molecular Sciences, MDPI, 2021, 22 (7), pp.3597. ⟨10.3390/ijms22073597⟩

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titre

Single-molecule FRET on its way to structural biology in live cells

auteur

Robert Quast, Emmanuel Margeat

article

Nature Methods, Nature Publishing Group, 2021, 18 (4), pp.344-345. ⟨10.1038/s41592-021-01084-9⟩

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titre

FRET-based dynamic structural biology: Challenges, perspectives and an appeal for open-science practices

auteur

Eitan Lerner, Anders Barth, Jelle Hendrix, Benjamin Ambrose, Victoria Birkedal, Scott Blanchard, Richard Börner, Hoi Sung Chung, Thorben Cordes, Timothy Craggs, Ashok Deniz, Jiajia Diao, Jingyi Fei, Ruben Gonzalez, Irina Gopich, Taekjip Ha, Christian Hanke, Gilad Haran, Nikos Hatzakis, Sungchul Hohng, Seok-Cheol Hong, Thorsten Hugel, Antonino Ingargiola, Chirlmin Joo, Achillefs Kapanidis, Harold Kim, Ted Laurence, Nam Ki Lee, Tae-Hee Lee, Edward Lemke, Emmanuel Margeat, Jens Michaelis, Xavier Michalet, Sua Myong, Daniel Nettels, Thomas-Otavio Peulen, Evelyn Ploetz, Yair Razvag, Nicole Robb, Benjamin Schuler, Hamid Soleimaninejad, Chun Tang, Reza Vafabakhsh, Don Lamb, Claus Am Seidel, Shimon Weiss

article

eLife, eLife Sciences Publication, 2021, 10, ⟨10.7554/elife.60416⟩

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titre

Flavin-Conjugated Nanobombs: Key Structural Requirements Governing Their Self-Assemblies’ Morphologies

auteur

Nada Taib, Jonathan Ribes, Nataliia Beztsinna, Remy Bailly, Sabine Castano, Estelle Rascol, Nada Taib-Maamar, Eduard Badarau, Isabelle Bestel

article

Bioconjugate Chemistry, American Chemical Society, 2021, 32 (3), pp.553-562. ⟨10.1021/acs.bioconjchem.1c00028⟩

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titre

Single-particle tracking photoactivated localization microscopy of membrane proteins in living plant tissues

auteur

Vincent Bayle, Jean-Bernard Fiche, Claire Burny, Matthieu Platre, Marcelo Nollmann, Alexandre Martinière, Yvon Jaillais

article

Nature Protocols, Nature Publishing Group, 2021, 16 (3), pp.1600-1628. ⟨10.1038/s41596-020-00471-4⟩

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titre

Improved backscattering detection in photonic force microscopy near dielectric surfaces with cylindrical vector beams

auteur

Maria Grazia Donato, Francesco Patti, Rosalba Saija, Maria Antonia Iatì, Pietro Gucciardi, Francesco Pedaci, Giuseppe Strangi, Onofrio Maragò

article

Journal of Quantitative Spectroscopy and Radiative Transfer, Elsevier, 2021, 258, pp.107381. ⟨10.1016/j.jqsrt.2020.107381⟩

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titre

MAGI1 inhibits the AMOTL2/p38 stress pathway and prevents luminal breast tumorigenesis

auteur

Diala Kantar, Emilie Bousquet Mur, Maicol Mancini, Vera Slaninova, Yezza Ben Salah, Luca Costa, Elodie Forest, Patrice Lassus, Charles Géminard, Florence Boissière-Michot, Béatrice Orsetti, Charles Theillet, Jacques Colinge, Christine Benistant, Antonio Maraver, Lisa Heron-Milhavet, Alexandre Djiane

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2021, 11, pp.5752. ⟨10.1038/s41598-021-85056-1⟩

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titre

Paracrine Behaviors Arbitrate Parasite-Like Interactions Between Tumor Subclones

auteur

Robert Noble, Viola Walther, Christian Roumestand, Michael Hochberg, Urszula Hibner, Patrice Lassus

article

Frontiers in Ecology and Evolution, Frontiers Media S.A, 2021, 9, pp.675638. ⟨10.3389/fevo.2021.675638⟩

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Differentially optimized cell-free buffer enables robust expression from unprotected linear DNA in exonuclease-deficient extracts

auteur

Angelo Cardoso Batista, Antoine Levrier, Paul Soudier, Peter Voyvodic, Tatjana Achmedov, Tristan Reif-Trauttmansdorff, Angelique Devisch, Martin Cohen-Gonsaud, Jean-Loup Faulon, Chase Beisel, Jerome Bonnet, Manish Kushwaha

article

ACS Synthetic Biology, American Chemical Society, 2021, pp.acssynbio.1c00448. ⟨10.1101/2021.09.07.459228⟩

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titre

Correlative AFM and fluorescence imaging demonstrate nanoscale membrane remodeling and ring-like and tubular structure formation by septins

auteur

Anthony Vial, Cyntia Taveneau, Luca Costa, Brieuc Chauvin, Hussein Nasrallah, Cédric Godefroy, Patrice Dosset, Hervé Isambert, Kien Ngo, Stéphanie Mangenot, Daniel Levy, Aurélie Bertin, Pierre-Emmanuel Milhiet

article

Nanoscale, Royal Society of Chemistry, In press, ⟨10.1039/D1NR01978C⟩

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titre

An oligomeric switch controls the Mrr-induced SOS response in E. coli

auteur

Anaïs Bourges, Oscar Torres Montaguth, Wubishet Tadesse, Gilles Labesse, Abram Aertsen, Catherine Royer, Nathalie Declerck

article

DNA Repair, Elsevier, 2021, 97, pp.103009. ⟨10.1016/j.dnarep.2020.103009⟩

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titre

A Novel Approach to the Facile Growth and Organization of Photothermal Prussian Blue Nanocrystals on Different Surfaces

auteur

Giang Ngo, Gautier FÉlix, Christophe Dorandeu, Jean-Marie Devoisselle, Luca Costa, P.E. Milhiet, Yannick Guari, Joulia Larionova, Joel Chopineau

article

Nanomaterials, MDPI, 2021, 11 (7), pp.1749. ⟨10.3390/nano11071749⟩

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titre

CD82 and Gangliosides Tune CD81 Membrane Behavior

auteur

Laurent Fernandez, Morgane Malrieu, Christine Bénistant, Patrice Dosset, Eric Rubinstein, Elena Odintsova, Fedor Berditchevski, Pierre-Emmanuel Milhiet

article

International Journal of Molecular Sciences, MDPI, 2021, 22 (16), pp.8459. ⟨10.3390/ijms22168459⟩

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titre

Melanotransferrin is efficiently sorted on the surface of exosomes secreted by melanoma cells

auteur

Anne Bonhoure, Laurent Henry, Marie Morille, Nesrine Aissaoui, Gaëtan Bellot, Pierre-Emmanuel Stoebner, Michel Vidal

article

Melanoma Research, Lippincott, Williams & Wilkins, 2021, 31, pp.338-351. ⟨10.1097/CMR.0000000000000741⟩

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Article dans une revue

titre

Mechanistic insights into the synergistic activation of the RXR–PXR heterodimer by endocrine disruptor mixtures

auteur

Vanessa Delfosse, Tiphaine Huet, Deborah Harrus, Meritxell Granell, Maxime Bourguet, Caroline Gardia-Parège, Barbara Chiavarina, Marina Grimaldi, Sébastien Le Mével, Pauline Blanc, David Huang, Jakub Gruszczyk, Barbara Demeneix, Sarah Cianférani, Jean-Baptiste Fini, Patrick Balaguer, William Bourguet

article

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2020, 118 (1), pp.e2020551118. ⟨10.1073/pnas.2020551118⟩

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titre

TAT-RasGAP 317-326 kills cells by targeting inner-leaflet–enriched phospholipids

auteur

Marc Serulla, Gabriel Ichim, Filip Stojceski, Gianvito Grasso, Sergii Afonin, Mathieu Heulot, Tim Schober, Robyn Roth, Cédric Godefroy, Pierre-Emmanuel Milhiet, Kushal Das, Ana García-Sáez, Andrea Danani, Christian Widmann

article

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2020, 117 (50), pp.31871-31881. ⟨10.1073/pnas.2014108117⟩

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titre

Conformational maps of human 20S proteasomes reveal PA28- and immuno-dependent inter-ring crosstalks

auteur

Jean Lesne, Marie Locard-Paulet, Julien Parra, Dušan Zivković, Thomas Menneteau, Marie-Pierre Bousquet, Odile Burlet-Schiltz, Julien Marcoux

article

Nature Communications, Nature Publishing Group, 2020, ⟨10.1038/s41467-020-19934-z⟩

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titre

Combining High-Pressure Perturbation with NMR Spectroscopy for a Structural and Dynamical Characterization of Protein Folding Pathways

auteur

Cécile Dubois, Isaline Herrada, Philippe Barthe, Christian Roumestand

article

Molecules, MDPI, 2020, 25 (23), pp.5551. ⟨10.3390/molecules25235551⟩

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titre

Towards improved social distancing guidelines: Space and time dependence of virus transmission from speech-driven aerosol transport between two individuals

auteur

Fan Yang, Amir Pahlavan, Simon Mendez, Manouk Abkarian, Howard Stone

article

Physical Review Fluids, American Physical Society, 2020, 5 (12), ⟨10.1103/PhysRevFluids.5.122501⟩

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titre

Synchronous, Crosstalk-free Correlative AFM and Confocal Microscopies/Spectroscopies

auteur

Thales Fernandes, Oscar Saavedra, Emmanuel Margeat, Pierre-Emmanuel Milhiet, Luca Costa

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2020, 10 (1), pp.7098. ⟨10.1038/s41598-020-62529-3⟩

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titre

New Chemical Probe Targeting Bacterial NAD Kinase

auteur

David Clément, Clarisse Leseigneur, Muriel Gelin, Dylan Coelho, Valérie Huteau, Corinne Lionne, Gilles Labesse, Olivier Dussurget, Sylvie Pochet

article

Molecules, MDPI, 2020, 25 (21), pp.4893. ⟨10.3390/molecules25214893⟩

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titre

Unraveling Molecular Interactions in Liquid–Liquid Phase Separation of Disordered Proteins by Atomistic Simulations

auteur

Matteo Paloni, Rémy Bailly, Luca Ciandrini, Alessandro Barducci

article

Journal of Physical Chemistry B, American Chemical Society, 2020, 124 (41), pp.9009-9016. ⟨10.1021/acs.jpcb.0c06288⟩

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titre

Speech can produce jet-like transport relevant to asymptomatic spreading of virus

auteur

Manouk Abkarian, Simon Mendez, Nan Xue, Fan Yang, Howard Stone

article

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2020, 117 (41), pp.25237-25245. ⟨10.1073/pnas.2012156117⟩

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titre

RNA imaging in bacteria

auteur

Sara Rombouts, Marcelo Nollmann

article

FEMS Microbiology Reviews, Wiley-Blackwell, 2020, 45 (2), ⟨10.1093/femsre/fuaa051⟩

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titre

Robust Cell-Free Expression of Sub-Pathological and Pathological Huntingtin Exon-1 for NMR Studies. General Approaches for the Isotopic Labeling of Low-Complexity Proteins

auteur

Anna Morató, Carlos Elena-Real, Matija Popovic, Aurélie Fournet, Karen Zhang, Frédéric Allemand, Nathalie Sibille, Annika Urbanek, Pau Bernadó

article

Biomolecules, MDPI, 2020, 10 (10), pp.1458. ⟨10.3390/biom10101458⟩

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A Plasma Membrane Nanodomain Ensures Signal Specificity during Osmotic Signaling in Plants

auteur

Marija Smokvarska, Charbel Francis, Matthieu Pierre Platre, Jean-Bernard Fiche, Carine Alcon, Xavier Dumont, Philippe Nacry, Vincent Bayle, Marcelo Nollmann, Christophe Maurel, Yvon Jaillais, Alexandre Martiniere

article

Current Biology - CB, Elsevier, 2020, 30 (23), pp.4654-4664. ⟨10.1016/j.cub.2020.09.013⟩

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titre

Rational programming of history-dependent logic in cellular populations

auteur

Ana Zúñiga, Sarah Guiziou, Pauline Mayonove, Zachary Ben Meriem, Miguel Camacho, Violaine Moreau, Luca Ciandrini, Pascal Hersen, Jerome Bonnet

article

Nature Communications, Nature Publishing Group, 2020, 11 (1), pp.4758. ⟨10.1038/s41467-020-18455-z⟩

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titre

Predicting secondary structure propensities in IDPs using simple statistics from three-residue fragments

auteur

Alejandro Estaña, Amélie Barozet, Assia Mouhand, Marc Vaisset, Christophe Zanon, Pierre Fauret, Nathalie Sibille, Pau Bernadó, Juan Cortés

article

Journal of Molecular Biology, Elsevier, 2020, 342 (19), pp.5447-5459. ⟨10.1016/j.jmb.2020.07.026⟩

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titre

Human and Zebrafish Nuclear Progesterone Receptors Are Differently Activated by Manifold Progestins

auteur

Clémentine Garoche, Selim Aït-Aïssa, Abdelhay Boulahtouf, Nicolas Creusot, Nathalie Hinfray, William Bourguet, Patrick Balaguer, François Brion

article

Environmental Science and Technology, American Chemical Society, 2020, 54 (15), pp.9510-9518. ⟨10.1021/acs.est.0c02056⟩

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titre

Two Novel Cases of Resistance to Thyroid Hormone Due to THRA Mutation

auteur

Albane Le Maire, Natacha Bouhours-Nouet, Jessica Soamalala, Delphine Mirebeau-Prunier, Matteo Paloni, Laura Guee, Delphine Heron, Cyril Mignot, Frédéric Illouz, Florence Joubert, Claire Briet, Patrice Rodien, William Bourguet, Frederic Flamant, Romain Guyot

article

Thyroid, Mary Ann Liebert, 2020, 30 (8), pp.1217-1221. ⟨10.1089/thy.2019.0602⟩

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titre

ATP-Driven Separation of Liquid Phase Condensates in Bacteria

auteur

Baptiste Guilhas, Jean-Charles Walter, Jerome Rech, Gabriel David, Nils-Ole Walliser, John Palmeri, Céline Mathieu-Demaziere, Andrea Parmeggiani, Jean-Yves Bouet, Antoine Le Gall, Marcelo Nollmann

article

Molecular Cell, Cell Press, 2020, 79 (2), pp.293-303. ⟨10.1016/j.molcel.2020.06.034⟩

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Flanking regions determine the structure of the poly-glutamine homo- repeat in huntingtin through mechanisms common among glutamine-rich human proteins

auteur

Annika Urbanek, Matija Popovic, Anna Morató, Alejandro Estaña, Carlos Elena-Real, Pablo Mier, Aurélie Fournet, Frédéric Allemand, Stéphane Delbecq, Miguel Andrade-Navarro, Juan Cortés, Nathalie Sibille, Pau Bernadó

article

Structure, Elsevier (Cell Press), 2020, 28 (7), pp.733-746.e5. ⟨10.1016/j.str.2020.04.008⟩

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Peroxisome proliferator‐activated receptor gamma‐ligand‐binding domain mutations associated with familial partial lipodystrophy type 3 disrupt human trophoblast fusion and fibroblast migration

auteur

Hussein Shoaito, Sabine Chauveau, Camille Gosseaume, William Bourguet, Corinne Vigouroux, Camille Vatier, Catherine Pienkowski, Thierry Fournier, Séverine Degrelle

article

Journal of Cellular and Molecular Medicine, Wiley Open Access, 2020, 24 (13), pp.7660-7669. ⟨10.1111/jcmm.15401⟩

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Fragment Linking Strategies for Structure-Based Drug Design

auteur

Alexandre Bancet, Claire Raingeval, Thierry Lomberget, Marc Le Borgne, Jean-François Guichou, Isabelle Krimm

article

Journal of Medicinal Chemistry, American Chemical Society, 2020, 63 (20), pp.11420-11435. ⟨10.1021/acs.jmedchem.0c00242⟩

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High Content Screening Using New U2OS Reporter Cell Models Identifies Harmol Hydrochloride as a Selective and Competitive Antagonist of the Androgen Receptor

auteur

Hadjer Dellal, Abdelhay Boulahtouf, Elina Alaterre, Alice Cuenant, Marina Grimaldi, William Bourguet, Céline Gongora, Patrick Balaguer, Philippe Pourquier

article

Cells, MDPI, 2020, 9 (6), pp.1469. ⟨10.3390/cells9061469⟩

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titre

The Brownian and Flow‐Driven Rotational Dynamics of a Multicomponent DNA Origami‐Based Rotor

auteur

Yasaman Ahmadi, Ashley Nord, Amanda Wilson, Christiane Hütter, Fabian Schroeder, Morgan Beeby, Ivan Barišić

article

Small, Wiley-VCH Verlag, 2020, 16 (22), pp.2001855. ⟨10.1002/smll.202001855⟩

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Quantitative High-Resolution Imaging of Live Microbial Cells at High Hydrostatic Pressure

auteur

Anais Bourges, Alexander Lazarev, Nathalie Declerck, Karyn Rogers, Catherine Royer

article

Biophysical Journal, Biophysical Society, 2020, 118 (11), pp.2670-2679. ⟨10.1016/j.bpj.2020.04.017⟩

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Structural basis of nanobody recognition of grapevine fanleaf virus and of virus resistance loss

auteur

Igor Orlov, Caroline Hemmer, Léa Ackerer, Bernard Lorber, Ahmed Ghannam, Vianney Poignavent, Kamal Hleibieh, Claude Sauter, Corinne Schmitt-Keichinger, Lorène Belval, Jean-Michel Hily, Aurélie Marmonier, Véronique Komar, Sophie Gersch, Pascale Schellenberger, Patrick Bron, Emmanuelle Vigne, Serge Muyldermans, Olivier Lemaire, Gérard Demangeat, Christophe Ritzenthaler, Bruno Klaholz

article

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2020, 117 (20), pp.10848-10855. ⟨10.1073/pnas.1913681117⟩

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titre

The GOLIATH Project: Towards an Internationally Harmonised Approach for Testing Metabolism Disrupting Compounds

auteur

Juliette Legler, Daniel Zalko, Fabien Jourdan, Miriam Jacobs, Bernard Fromenty, Patrick Balaguer, William Bourguet, Vesna Kos, Angel Nadal, Claire Beausoleil, Susana Cristobal, Sylvie Rémy, Sibylle Ermler, Luigi Margiotta-Casaluci, Julian Griffin, Bruce Blumberg, Christophe Chesné, Sebastian Hoffmann, Patrik Andersson, Jorke Kamstra

article

International Journal of Molecular Sciences, MDPI, 2020, 21 (10), pp.3480. ⟨10.3390/ijms21103480⟩

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Evidence of the reduced abundance of proline cis conformation in protein poly-proline tracts

auteur

Annika Urbanek, Matija Popovic, Carlos Elena-Real, Anna Morató, Alejandro Estaña, Aurélie Fournet, Frédéric Allemand, Ana Gil, Carlos Cativiela, Juan Cortés, Ana Jiménez, Nathalie Sibille, Pau Bernadó

article

Journal of the American Chemical Society, American Chemical Society, 2020, 142 (17), pp.7976-7986. ⟨10.1021/jacs.0c02263⟩

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NMR chemical shift assignment of a constitutively active fragment of the antitermination protein LicT

auteur

Yinshan Yang, Nathalie Declerck, Héléne Démèné

article

Biomolecular NMR Assignments, Springer, 2020, 14, pp.19-22. ⟨10.1007/s12104-019-09914-w⟩

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titre

Cell-free biosensors for biomedical applications

auteur

Peter L. Voyvodic, Jerome Bonnet

article

Current Opinion in Biomedical Engineering, Elsevier, 2020, 13, pp.9 - 15. ⟨10.1016/j.cobme.2019.08.005⟩

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titre

A Plant-Specific N-terminal Extension Reveals Evolutionary Functional Divergence within Translocator Proteins

auteur

Pawel Jurkiewicz, Lucile Senicourt, Haitham Ayeb, Olivier Lequin, Jean-Jacques Lacapere, Henri Batoko

article

iScience, Elsevier, 2020, 23 (3), pp.100889. ⟨10.1016/j.isci.2020.100889⟩

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titre

Disentangling the complexity of low complexity proteins

auteur

Pablo Mier, Lisanna Paladin, Stella Tamana, Sophia Petrosian, Borbála Hajdu-Soltész, Annika Urbanek, Aleksandra Gruca, Dariusz Plewczynski, Marcin Grynberg, Pau Bernadó, Zoltán Gáspári, Christos Ouzounis, Vasilis Promponas, Andrey Kajava, John Hancock, Silvio Tosatto, Zsuzsanna Dosztanyi, Miguel Andrade-Navarro

article

Briefings in Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2020, 21 (2), pp.458-472. ⟨10.1093/bib/bbz007⟩

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titre

Direct and simultaneous observation of transcription and chromosome architecture in single cells with Hi-M

auteur

Andrés M Cardozo Gizzi, Sergio Espinola, Julian Gurgo, Christophe Houbron, Jean-Bernard Fiche, Diego Cattoni, Marcelo Nollmann

article

Nature Protocols, Nature Publishing Group, 2020, 15 (3), pp.840-876. ⟨10.1038/s41596-019-0269-9⟩

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titre

Perspectives on Chromosome Organization

auteur

Marcelo Nollmann, Romain Koszul

article

Journal of Molecular Biology, Elsevier, 2020, 432 (3), pp.635-637. ⟨10.1016/j.jmb.2019.12.021⟩

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titre

From Substrate to Fragments to Inhibitor Active In Vivo against Staphylococcus aureus

auteur

Muriel Gelin, Julie Paoletti, Marie-Anne Nahori, Valeŕie Huteau, Clarisse Leseigneur, Greǵory Jouvion, Laurence Dugué, David Clément, Jean-Luc Pons, Liliane Assairi, Sylvie Pochet, Gilles Labesse, Olivier Dussurget

article

ACS Infectious Diseases, American Chemical Society, 2020, 6 (3), ⟨10.1021/acsinfecdis.9b00368⟩

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titre

Post-production modifications of murine mesenchymal stem cell (mMSC) derived extracellular vesicles (EVs) and impact on their cellular interaction

auteur

Sarah Le Saux, Hanna Aarrass, Josephine Lai-Kee-Him, Patrick Bron, J. Armengaud, Guylaine Miotello, Justine Bertrand-Michel, Emeric Dubois, Simon George, Orestis Faklaris, Jean-Marie Devoisselle, Philippe Legrand, Joel Chopineau, Marie Morille

article

Biomaterials, Elsevier, 2020, 231, pp.119675. ⟨10.1016/j.biomaterials.2019.119675⟩

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titre

Structure Structural insights into the allosteric activation of the LicT antiterminator by PTS- mediated phosphorylation

auteur

Yinshan Yang, André Padilla, Karine de Guillen, Léa Mammri, Jérôme Gracy, Nathalie Declerck, Héléne Démèné

article

Structure, Elsevier (Cell Press), 2020, 28 (2), pp.244-251.e3. ⟨10.1016/j.str.2019.10.017⟩

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titre

Structural and Functional Specialization of OSBP-Related Proteins

auteur

Vanessa Delfosse, William Bourguet, Guillaume Drin

article

Contact, Institute of Ophthalmology, University College London, UK, 2020, 3, pp.251525642094662. ⟨10.1177/2515256420946627⟩

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titre

Probing Protein Interaction Networks by Combining MS-Based Proteomics and Structural Data Integration

auteur

Guillaume Postic, Julien Marcoux, Victor Reys, Jessica Andreani, Yves Vandenbrouck, Marie-Pierre Bousquet, Emmanuelle Mouton-Barbosa, Sarah Cianférani, Odile Burlet-Schiltz, Raphael Guerois, Gilles Labesse, Pierre Tufféry

article

Journal of Proteome Research, American Chemical Society, 2020, 19 (7), pp.2807-2820. ⟨10.1021/acs.jproteome.0c00066⟩

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titre

TADs or no TADS: Lessons From Single-cell Imaging of Chromosome Architecture

auteur

Andrés M Cardozo Gizzi, Diego I Cattoni, Marcelo Nollmann

article

Journal of Molecular Biology, Elsevier, 2020, 432 (3), pp.682-693. ⟨10.1016/j.jmb.2019.12.034⟩

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titre

Compression, Rupture, and Puncture of Model Membranes at the Molecular Scale

auteur

Oscar Saavedra V., Thales Fernandes, P.E. Milhiet, Luca Costa

article

Langmuir, American Chemical Society, In press, ⟨10.1021/acs.langmuir.0c00247⟩

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Article dans une revue

titre

Benchmarking the PEPOP methods for mimicking discontinuous epitopes

auteur

Vincent Demolombe, Alexandre de Brevern, Franck Molina, Géraldine Lavigne, Claude Granier, Violaine Moreau

article

BMC Bioinformatics, BioMed Central, 2019, 20 (1), pp.738. ⟨10.1186/s12859-019-3189-3⟩

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titre

Efficient conversion of chemical energy into mechanical work by Hsp70 chaperones

auteur

Salvatore Assenza, Alberto Stefano Sassi, Ruth Kellner, Benjamin Schuler, Paolo de los Rios, Alessandro Barducci

article

eLife, eLife Sciences Publication, 2019, 8, ⟨10.7554/eLife.48491⟩

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titre

Plug-and-play metabolic transducers expand the chemical detection space of cell-free biosensors

auteur

Peter Voyvodic, Amir Pandi, Mathilde Koch, Ismael Conejero, Emmanuel Valjent, Philippe Courtet, Eric Renard, Jean-Loup Faulon, Jérôme Bonnet

article

Nature Communications, Nature Publishing Group, 2019, 10 (1), ⟨10.1038/s41467-019-09722-9⟩

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titre

Molecular Dynamics Simulations of the Allosteric Modulation of the Adenosine A2a Receptor by a Mini-G Protein

auteur

Pedro Renault, Maxime Louet, Jacky Marie, Gilles Labesse, Nicolas Floquet

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-41980-x⟩

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titre

MglA functions as a three-state GTPase to control movement reversals of Myxococcus xanthus

auteur

Christian Galicia, Sebastien Lhospice, Paloma Fernández Varela, Stefano Trapani, Wenhua Zhang, Jorge Navaza, Julien Herrou, Tam Mignot, Jacqueline Cherfils

article

Nature Communications, Nature Publishing Group, 2019, 10 (1), pp.5300. ⟨10.1038/s41467-019-13274-3⟩

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titre

A Complex Interplay of Anionic Phospholipid Binding Regulates 3′-Phosphoinositide-Dependent-Kinase-1 Homodimer Activation

auteur

Gloria De las Heras-Martínez, Véronique Calleja, Rémy Bailly, Jean Dessolin, Banafshé Larijani, Jose Requejo-Isidro

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-50742-8⟩

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titre

Plasmodium myosin A drives parasite invasion by an atypical force generating mechanism

auteur

Julien Robert-Paganin, James Robblee, Daniel Auguin, Thomas Blake, Carol Bookwalter, Elena Krementsova, Dihia Moussaoui, Michael Previs, Guillaume Jousset, Jake Baum, Kathleen Trybus, Anne Houdusse

article

Nature Communications, Nature Publishing Group, 2019, 10 (1), ⟨10.1038/s41467-019-11120-0⟩

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titre

Structural basis for chemically-induced homodimerization of a single domain antibody

auteur

Jean Lesné, Hung-Ju Chang, Angelique de Visch, Matteo Paloni, Philippe Barthe, Jean-François Guichou, Pauline Mayonove, Alessandro Barducci, Gilles Labesse, Jérome Bônnet, Martin Cohen-Gonsaud

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-38752-y⟩

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titre

Site‐Specific Isotopic Labeling (SSIL) – Access to High‐Resolution Structural and Dynamic Information in Low Complexity Proteins

auteur

Annika Urbanek, Carlos Elena-Real, Matija Popovic, Anna Morató, Aurélie Fournet, Frédéric Allemand, Stéphane Delbecq, Nathalie Sibille, Pau Bernadó

article

ChemBioChem, Wiley-VCH Verlag, 2019, ⟨10.1002/cbic.201900583⟩

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titre

Regulation of RXR-RAR Heterodimers by RXR- and RAR-Specific Ligands and Their Combinations

auteur

Albane Le Maire, Catherine Teyssier, Patrick Balaguer, William Bourguet, Pierre Germain

article

Cells, MDPI, 2019, 8 (11), pii: E1392. ⟨10.3390/cells8111392⟩

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titre

Coevolutionary Analysis of Protein Subfamilies by Sequence Reweighting

auteur

Duccio Malinverni, Alessandro Barducci

article

Entropy, MDPI, 2019, 21 (11), pp.1127. ⟨10.3390/e21111127⟩

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titre

Load-dependent adaptation near zero load in the bacterial flagellar motor

auteur

Jasmine Nirody, Ashley Nord, Richard Berry

article

Journal of the Royal Society Interface, the Royal Society, 2019, 16 (159), pp.20190300. ⟨10.1098/rsif.2019.0300⟩

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titre

Imaging Artificial Membranes Using High-Speed Atomic Force Microscopy

auteur

Hussein Nasrallah, Anthony Vial, Nicolas Pocholle, Jérémy Soulier, Luca Costa, Cédric Godefroy, Eric Bourillot, Eric Lesniewska, Pierre-Emmanuel Milhiet

article

Methods in Molecular Biology, Humana Press/Springer Imprint, 2019, pp.45-59. ⟨10.1007/978-1-4939-8894-5_3⟩

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titre

A basin-free spherical shape as an outcome of a giant impact on asteroid Hygiea

auteur

P. Vernazza, L. Jorda, P Ševeček, M. Brož, M. Viikinkoski, J. Hanuš, B. Carry, A. Drouard, M. Ferrais, M. Marsset, F. Marchis, M. Birlan, E. Podlewska-Gaca, E. Jehin, P. Bartczak, G Dudzinski, J. Berthier, J. Castillo-Rogez, F. Cipriani, F Colas, F Demeo, C. Dumas, J Durech, R Fetick, T Fusco, J Grice, M Kaasalainen, A. Kryszczynska, P Lamy, H Le Coroller, A. Marciniak, T. Michalowski, Patrick Michel, N. Rambaux, T. Santana-Ros, P Tanga, F. Vachier, A Vigan, O. Witasse, B Yang, M Gillon, Z. Benkhaldoun, R Szakats, R. Hirsch, R. Duffard, A Chapman, J Maestre

article

Nature Astronomy, Nature Publishing Group, 2019, 4, pp.136-141. ⟨10.1038/s41550-019-0915-8⟩

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titre

Combination of photodynamic therapy and gene silencing achieved through the hierarchical self-assembly of porphyrin-siRNA complexes

auteur

Nabila Laroui, Maëva Coste, Laure Lichon, Yannick Bessin, Magali Gary-Bobo, Geneviève Pratviel, Colin Bonduelle, Nadir Bettache, Sébastien Ulrich

article

International Journal of Pharmaceutics, Elsevier, 2019, 569, pp.118585. ⟨10.1016/j.ijpharm.2019.118585⟩

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titre

NMR chemical shift backbone assignment of the viral protein P1 encoded by the African Rice Yellow Mottle Virus

auteur

Yinshan Yang, Vianney Poignavent, François-Xavier Gillet, Florence Vignols, Héléne Démèné

article

Biomolecular NMR Assignments, Springer, 2019, 13 (2), pp.345-348. ⟨10.1007/s12104-019-09903-z⟩

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titre

Data mining and visualisation: general discussion

auteur

Carlos Afonso, Mark Barrow, Antony n. Davies, Marc-André Delsuc, Timothy Ebbels, Francisco Fernandez-Lima, Caroline Gauchotte-Lindsay, Pierre Giusti, Royston Goodacre, Norbert Hertkorn, Jeroen Jansen, Donald Jones, William Kew, Stefan Kuhn, Adrien Le Guennec, Anneke Lubben, John Parkinson, Ljiljana Paša-Tolić, Simon Rogers, Timothy Rudd, Peter Schoenmakers, Philip Sidebottom, Stephen Summerfield, Gerjen Tinnevelt, Gianluca Trifirò, Johan Trygg, Justin van der Hooft

article

Faraday Discussions, Royal Society of Chemistry, 2019, 218, pp.354-371. ⟨10.1039/C9FD90044F⟩

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titre

Automatised pharmacophoric deconvolution of plant extracts – application to Cinchona bark crude extract

auteur

Laure Margueritte, Laura Duciel, Mélanie Bourjot, Catherine Vonthron-Sénécheau, Marc-André Delsuc

article

Faraday Discussions, Royal Society of Chemistry, 2019, 218, pp.441-458. ⟨10.1039/C8FD00242H⟩

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titre

Comprehensive classification of the plant non-specific lipid transfer protein superfamily towards its sequence–structure–function analysis

auteur

Cécile Fleury, Jérôme Gracy, Marie-Françoise Gautier, Jean-Luc Pons, Jean-François Dufayard, Gilles Labesse, Manuel Ruiz, Frédéric de Lamotte

article

PeerJ, PeerJ, 2019, 7, pp.e7504. ⟨10.7717/peerj.7504⟩

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Interplay of Protein Disorder in Retinoic Acid Receptor Heterodimer and Its Corepressor Regulates Gene Expression

auteur

Tiago Cordeiro, Nathalie Sibille, Pierre Germain, Philippe Barthe, Abdelhay Boulahtouf, Frédéric Allemand, Rémy Bailly, Valérie Vivat, Christine Ebel, Alessandro Barducci, William Bourguet, Albane Le Maire, Pau Bernadó

article

Structure, Elsevier (Cell Press), 2019, 27 (8), pp.1270-1285.e6. ⟨10.1016/j.str.2019.05.001⟩

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titre

The Ellagitannin Metabolite Urolithin C is a Glucose‐Dependent Regulator of Insulin Secretion through activation of L‐type Calcium Channels

auteur

Morgane Bayle, Jeremie Neasta, Margherita Dall'Asta, Guillaume Gautheron, Anne Virsolvy, Jean-François Quignard, Estelle Youl, Richard Magous, Jean-François Guichou, Alan Crozier, Daniele del Rio, Gérard Cros, Catherine Oiry

article

British Journal of Pharmacology, Wiley, 2019, ⟨10.1111/bph.14821⟩

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titre

Folding of the Ig-Like Domain of the Dengue Virus Envelope Protein Analyzed by High-Hydrostatic-Pressure NMR at a Residue-Level Resolution

auteur

Tomonori Saotome, Maxime Doret, Manjiri Kulkarni, Yin-Shan Yang, Philippe Barthe, Philippe Barthe, Yutaka Kuroda, Christian Roumestand

article

Biomolecules, MDPI, 2019, 9 (8), pp.309. ⟨10.3390/biom9080309⟩

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titre

Promoting transparency and reproducibility in enhanced molecular simulations

auteur

Massimiliano Bonomi, Giovanni Bussi, Carlo Camilloni, Gareth A. Tribello, Pavel Banáš, Alessandro Barducci, Mattia Bernetti, Peter G. Bolhuis, Sandro Bottaro, Davide Branduardi, Riccardo Capelli, Paolo Carloni, Michele Ceriotti, Andrea Cesari, Haochuan Chen, Wei Chen, Francesco Colizzi, Sandip De, Marco de La Pierre, Davide Donadio, Viktor Drobot, Bernd Ensing, Andrew L. Ferguson, Marta Filizola, James S. Fraser, Haohao Fu, Piero Gasparotto, Francesco Luigi Gervasio, Federico Giberti, Alejandro Gil-Ley, Toni Giorgino, Gabriella T. Heller, Glen M. Hocky, Marcella Iannuzzi, Michele Invernizzi, Kim E. Jelfs, Alexander Jussupow, Evgeny Kirilin, Alessandro Laio, Vittorio Limongelli, Kresten Lindorff-Larsen, Thomas Löhr, Fabrizio Marinelli, Layla Martin-Samos, Matteo Masetti, Ralf Meyer, Angelos Michaelides, Carla Molteni, Tetsuya Morishita, Marco Nava, Cristina Paissoni, Elena Papaleo, Michele Parrinello, Jim Pfaendtner, Pablo Piaggi, Giovannimaria Piccini, Adriana Pietropaolo, Fabio Pietrucci, Silvio Pipolo, Davide Provasi, David Quigley, Paolo Raiteri, Stefano Raniolo, Jakub Rydzewski, Matteo Salvalaglio, Gabriele Cesare Sosso, Vojtěch Spiwok, Jiří Šponer, David W. H. Swenson, Pratyush Tiwary, Omar Valsson, Michele Vendruscolo, Gregory Voth, Andrew White, The Plumed Consortium

article

Nature Methods, Nature Publishing Group, 2019, 16 (8), pp.670-673. ⟨10.1038/s41592-019-0506-8⟩

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titre

DNA-segment-capture model for loop extrusion by structural maintenance of chromosome (SMC) protein complexes

auteur

John Marko, Paolo De los rios, Alessandro Barducci, Stephan Gruber

article

Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2019, 47 (13), pp.6956-6972. ⟨10.1093/nar/gkz497⟩

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titre

Novel and Selective TLR7 Antagonists among the Imidazo[1,2-a]pyrazines, Imidazo[1,5-a]quinoxalines, and Pyrazolo[1,5-a]quinoxalines Series.

auteur

Nour Bou Karroum, Georges Moarbess, Jean-François Guichou, Pierre-Antoine Bonnet, Cindy Patinote, Hasnaa Bouharoun-Tayoun, Soulaima Chamat, Pierre Cuq, Mona Diab-Assaf, Issam Kassab, Carine Deleuze-Masquéfa

article

Journal of Medicinal Chemistry, American Chemical Society, 2019, 62 (15), pp.7015-7031. ⟨10.1021/acs.jmedchem.9b00411⟩

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titre

Non-classical ligand-independent regulation of Go protein by an orphan Class C GPCR

auteur

Mariana Hajj, Teresa de Vita, Claire Vol, Charlotte Renassia, Jean-Charles Bologna, Isabelle Brabet, Magali Cazade, Manuela Pastore, Jaroslav Blahos, Gilles Labesse, Jean-Philippe Pin, Laurent Prézeau

article

Molecular Pharmacology, American Society for Pharmacology and Experimental Therapeutics, 2019, 96 (2), pp.233-246. ⟨10.1124/mol.118.113019⟩

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titre

Microfluidic blood vasculature replicas using backside lithography

auteur

Benoît Charlot, Marianne Fenech, Vincent Girod, Viviana Claveria, Sébastien Méance, Manouk Abkarian

article

Lab on a Chip, Royal Society of Chemistry, 2019, 19 (12), pp.2096-2106. ⟨10.1039/C9LC00254E⟩

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titre

Driven transport on a flexible polymer with particle recycling: A model inspired by transcription and translation

auteur

Lucas Dias Fernandes, Luca Ciandrini

article

Physical Review E , American Physical Society (APS), 2019, 99 (5), pp.052409. ⟨10.1103/PhysRevE.99.052409⟩

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titre

Developmental control of plant Rho GTPase nano-organization by the lipid phosphatidylserine

auteur

Matthieu Pierre Platre, Vincent Bayle, Laia Armengot, Joseph Bareille, Maria del Mar Marquès-Bueno, Audrey Creff, Lilly Maneta-Peyret, Jean-Bernard Fiche, Marcelo Nollmann, Christine Miege, Patrick Moreau, Alexandre Martinière, Yvon Jaillais

article

Science, American Association for the Advancement of Science (AAAS), 2019, 364 (6435), pp.57-62. ⟨10.1126/science.aav9959⟩

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titre

Osmotic Stress Activates Two Reactive Oxygen Species Pathways with Distinct Effects on Protein Nanodomains and Diffusion

auteur

Alexandre Martiniere, Jean Fiche, Marija Smokvarska, Stephane Mari, Carine Alcon, Xavier Dumont, Kian Hématy, Yvon Jaillais, Marcelo Nollmann, Christophe Maurel

article

Plant Physiology, American Society of Plant Biologists, 2019, 179 (4), pp.1581-1593. ⟨10.1104/pp.18.01065⟩

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titre

First-in-class allosteric inhibitors of bacterial IMPDHs

auteur

Thomas Alexandre, Alexandru Lupan, Olivier Helynck, Sophie Vichier-Guerre, Laurence Dugué, Muriel Gelin, Ahmed Haouz, Gilles Labesse, Hélène Munier-Lehmann

article

European Journal of Medicinal Chemistry, Elsevier, 2019, 167, pp.124-132. ⟨10.1016/j.ejmech.2019.01.064⟩

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titre

Two-dimensional mass spectrometry: new perspectives for tandem mass spectrometry

auteur

Maria van Agthoven, Yuko Lam, Peter O’connor, Christian Rolando, Marc-André Delsuc

article

European Biophysics Journal, Springer Verlag (Germany), 2019, 48 (3), pp.213-229. ⟨10.1007/s00249-019-01348-5⟩

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Nanoscale Organization of Tetraspanins during HIV-1 budding by correlative dSTORM/AFM

auteur

Selma Dahmane, Christine Doucet, Antoine Le Gall, Célia Chamontin, Patrice Dosset, Florent Murcy, Laurent Fernandez, Desirée Salas, Eric Rubinstein, Marylène Mougel, Marcelo Nollmann, Pierre-Emmanuel Milhiet

article

Nanoscale, Royal Society of Chemistry, 2019, 11 (13), pp.6036-6044. ⟨10.1039/c8nr07269h⟩

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An NAD+ Phosphorylase Toxin Triggers Mycobacterium tuberculosis Cell Death

auteur

Diana Mendes Freire, Claude Gutierrez, Acely Garza-Garcia, Anna Grabowska, Ambre Sala, Kanchiyaphat Ariyachaokun, Terezie Panikova, Katherine S.H. Beckham, André Colom, Vivian Pogenberg, Michele Cianci, Anne Tuukkanen, Yves-Marie Boudehen, Antonio Peixoto, Laure Botella, Dmitri Svergun, Dirk Schnappinger, Thomas Schneider, Pierre Genevaux, Luiz Pedro Sorio de Carvalho, Matthias Wilmanns, Annabel H.A. Parret, Olivier Neyrolles

article

Molecular Cell, Cell Press, 2019, 73 (6), pp.1282-1291.e8. ⟨10.1016/j.molcel.2019.01.028⟩

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The HslV Protease from Leishmania major and Its Activation by C-terminal HslU Peptides

auteur

Ndeye Kebe, Krishnananda Samanta, Priyanka Singh, Josephine Lai-Kee-Him, Viviana Apicella, Nadine Payrot, Noémie Lauraire, Baptiste Legrand, Vincent Lisowski, Diane-Ethna Mbang-Benet, Michel Pagès, Patrick Bastien, Andrey Kajava, Patrick Bron, Jean-François Hernandez, Olivier Coux

article

International Journal of Molecular Sciences, MDPI, 2019, 20 (5), pp.1021. ⟨10.3390/ijms20051021⟩

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Investigating the Formation of Structural Elements in Proteins Using Local Sequence-Dependent Information and a Heuristic Search Algorithm

auteur

Alejandro Estaña, Malik Ghallab, Pau Bernadó, Juan Cortés

article

Molecules, MDPI, 2019, 24 (6), pp.1150. ⟨10.3390/molecules24061150⟩

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Peptide-Based Nanoparticles to Rapidly and Efficiently “Wrap ’n Roll” siRNA into Cells

auteur

Karidia Konate, Marion Dussot, Gudrun Aldrian, Anaïs Vaissière, Véronique Viguier, Isabel Ferreiro Neira, Franck Couillaud, Eric Vivès, Prisca Boisguerin, Sebastien Deshayes

article

Bioconjugate Chemistry, American Chemical Society, 2019, 30 (3), pp.592-603. ⟨10.1021/acs.bioconjchem.8b00776⟩

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