UMR 232

Des plantes tropicales constituent le cœur des travaux de recherche de l’unité DIADE. Ces travaux visent à comprendre la nature et le rôle des mécanismes de diversification structurale et fonctionnelle du génome des plantes tropicales. Les études portent aussi sur leur diversité et les structures de leurs populations, ainsi que les mécanismes d’adaptation aux variations naturelles ou aux modifications d’origine anthropique.
Les recherches sont fondées principalement sur la génétique, l’épigénétique, la biologie du développement, la physiologie, la systématique, l’évolution, mais intègrent aussi d’autres approches telle que la modélisation, la télédétection, l’écologie, etc. Les études s’appuient généralement sur la confrontation de plantes modèles (riz, Arabidopsis, tomate, peuplier) et d’espèces d’intérêt agronomique ou écologique (caféiers, filaos, ignames, maïs, palmiers, mils).
Les résultats de ces recherches contribuent à la production de connaissances fondamentales, mais aussi au développement de nouvelles stratégies visant à la sécurité alimentaire des communautés du Sud.

Label : Unité Mixte de Recherche (UMR)
Tutelles principales : UM, IRD, CIRAD
Département scientifique : Biologie agrosciences
École doctorale : Biodiversité, Agriculture, Alimentation, Environnement, Terre, Eau

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IRD
911 Avenue Agropolis
34394 Montpellier cedex 5 France

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Publications (extraction HAL)

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Publications HAL de la structure 168433

2021

Article dans une revue

titre
Multi-scale comparative transcriptome analysis reveals key genes and metabolic reprogramming processes associated with oil palm fruit abscission
auteur
Kim Fooyontphanich, Fabienne Morcillo, Thierry Joët, Stéphane Dussert, Julien Serret, Myriam Collin, Philippe Amblard, Sithichoke Tangphatsornruang, Peerapat Roongsattham, Chatchawan Jantasuriyarat, Jean-Luc Verdeil, Timothy Tranbarger
article
BMC Plant Biology, 2021, 21 (1), ⟨10.1186/s12870-021-02874-1⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03168980/file/2021_Fooyontphanich_BMC-Plant-Biology.pdf BibTex
titre
On-farm management of rice diversity, varietal preference criteria, and farmers' perceptions of the African (Oryza glaberrima Steud.) versus Asian rice (Oryza sativa L.) in the Republic of Benin (West Africa): implications for breeding and conservation
auteur
Loko Yêyinou, Ewedje Eben-Ezer, Orobiyi Azize, Djedatin Gustave, Toffa Joelle, Gbemavo Chalemagne, Tchakpa Cyrille, Dieudonné Gavoedo, Sedah Paulin, Francois Sabot
article
Economy Botany, Springer, 2021
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03169601/file/Yeyinou2021.pdf BibTex
titre
Multi-Approach Analysis Reveals Local Adaptation in a Widespread Forest Tree of Reunion Island
auteur
Edith Garot, Stephane Dussert, Frédéric Domergue, Thierry Joët, Isabelle Fock-Bastide, Marie-Christine Combes, Philippe Lashermes
article
Plant and Cell Physiology, Oxford University Press (OUP), In press, ⟨10.1093/pcp/pcaa160⟩
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https://hal.univ-reunion.fr/hal-03170229/file/pcaa160.pdf BibTex
titre
Tectonics, climate and the diversification of the tropical African terrestrial flora and fauna
auteur
Thomas Couvreur, Gilles Dauby, Anne Blach-Overgaard, Vincent Deblauwe, Steven Dessein, Vincent Droissart, Oliver Hardy, David Harris, Steven Janssens, Alexandra Ley, Barbara Mackinder, Bonaventure Sonké, Marc Sosef, Tariq Stévart, Jens-Christian Svenning, Jan Wieringa, Adama Faye, Alain Missoup, Krystal Tolley, Violaine Nicolas, Stéphan Ntie, Frédiéric Fluteau, Cécile Robin, Francois Guillocheau, Doris Barboni, Pierre Sepulchre
article
Biological Reviews, Wiley, 2021, 96 (1), pp.16-51. ⟨10.1111/brv.12644⟩
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https://hal-insu.archives-ouvertes.fr/insu-02940669/file/couvreur-2020.pdf BibTex
titre
Effect of the seeds provenance and treatment on the germination rate and plants growth of four forest trees species of Côte d’Ivoire
auteur
Sélastique Doffou Akaffou, Aimé Kouassi Kouame, Nestor Bi Boh Gore, Georges Yao Abessika, Perla Hamon, Sylvie-Annabel Sabatier, Jérôme Duminil
article
Journal of Forestry Research, Springer Verlag, 2021, 32, pp.161-169. ⟨10.1007/s11676-019-01064-y⟩
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BibTex
titre
Bopopia, a new monotypic genus of Gesneriaceae (Gesnerioideae, Coronanthereae) from New Caledonia
auteur
Jérémie Morel, Jérôme Duminil, Jérôme Munzinger
article
European Journal of Taxonomy, Consortium of European Natural History Museums, 2021, 736 (1), pp.82-101. ⟨10.5852/ejt.2021.736.1253⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03154807/file/Morel_etal_Euro_J_Taxonomy_2021_736-1.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
AgroLD: une base de connaissances pour l'étude du phénome des plantes cultivées
auteur
Pierre Larmande, Tagny Gildas, Manuel Ruiz
article
EGC: Extraction et Gestion des Connaissances, Jan 2021, Montpellier (virtuel), France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03107587/file/AgroLD_Demo_EGC.pdf BibTex

Autre publication

titre
Using small fragments to discover old TE remnants: the Duster approach empowers the TE detection
auteur
Francois Sabot
article
2021, pp.100004. ⟨10.24072/pci.genomics.100004⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03146002/file/DOC.pdf BibTex

2020

Article dans une revue

titre
Transferability, development of simple sequence repeat (SSR) markers and application to the analysis of genetic diversity and population structure of the African fan palm (Borassus aethiopum Mart.) in Benin
auteur
Mariano Joly Kpatènon, Kolawolé Valère Salako, Sylvain Santoni, Leila Zekraoui, Muriel Latreille, Christine Tollon-Cordet, Cédric Mariac, Estelle Jaligot, Thierry Beulé, Kifouli Adéoti
article
BMC Genetics, 2020, 21 (1), ⟨10.1186/s12863-020-00955-y⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03105540/file/2020_Joly%20Kpatenan_BMC-Genetics.pdf BibTex
titre
Transcriptome profiling of laser-captured crown root primordia reveals new pathways activated during early stages of crown root formation in rice
auteur
Jérémy Lavarenne, Mathieu Gonin, Antony Champion, Marie Javelle, Hélène Adam, Jacques Rouster, Geneviève Conejéro, Marc Lartaud, Jean-Luc Verdeil, Laurent Laplaze, Christophe Sallaud, Mikael Lucas, Pascal Gantet
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2020, 15 (11), ⟨10.1371/journal.pone.0238736⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03117221/file/2020_Lavarenne_PlosOne.pdf BibTex
titre
Agromorphological Characterization Revealed Three Phenotypic Groups in a Region-Wide Germplasm of Fonio (Digitaria exilis (Kippist) Stapf) from West Africa
auteur
Abdou R. Ibrahim Bio Yerima, E. G. Achigan-Dako, Aissata Mamadou, Emmanuel Sekloka, Claire Billot, Charlotte O. A. Adje, Adeline Barnaud, Yacoubou Bakasso
article
Agronomy, MDPI, 2020, 10 (11), ⟨10.3390/agronomy10111653⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03126724/file/2020_Yerima_Agronomy.pdf BibTex
titre
Aquaporins are main contributors to root hydraulic conductivity in pearl millet [Pennisetum glaucum (L) R. Br.]
auteur
Alexandre Grondin, Pablo Affortit, Christine Tranchant-Dubreuil, Carla de la Fuente-Cantó, Cédric Mariac, Pascal Gantet, Vincent Vadez, Yves Vigouroux, Laurent Laplaze
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2020, ⟨10.1371/journal.pone.0233481⟩
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https://hal.ird.fr/ird-02956421/file/journal.pone.0233481.pdf BibTex
titre
COMOKIT: A Modeling Kit to Understand, Analyze, and Compare the Impacts of Mitigation Policies Against the COVID-19 Epidemic at the Scale of a City
auteur
Benoit Gaudou, Nghi Quang Huynh, Damien Philippon, Arthur Brugière, Kevin Chapuis, Patrick Taillandier, Pierre Larmande, Alexis Drogoul
article
Frontiers in Public Health, Frontiers Media S.A., 2020, 8, ⟨10.3389/fpubh.2020.563247⟩
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BibTex
titre
Fonio millet genome unlocks African orphan crop diversity for agriculture in a changing climate
auteur
Michael Abrouk, Hanin Ibrahim Ahmed, Philippe Cubry, Denisa Šimoníková, Stéphane Cauet, Yveline Pailles, Jan Bettgenhaeuser, Liubov Gapa, Nora Scarcelli, Marie Couderc, Leila Zekraoui, Nagarajan Kathiresan, Jana Čížková, Eva Hřibová, Jaroslav Doležel, Sandrine Arribat, Hélène Bergès, Jan Wieringa, Mathieu Gueye, Ndjido Kane, Christian Leclerc, Sandrine Causse, Sylvie Vancoppenolle, Claire Billot, Thomas Wicker, Yves Vigouroux, Adeline Barnaud, Simon Krattinger
article
Nature Communications, Nature Publishing Group, 2020, 11 (1), ⟨10.1038/s41467-020-18329-4⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03105377/file/2020_Abrouk_Nature-Communications.pdf BibTex
titre
Paris Climate Agreement: Promoting Interdisciplinary Science and Stakeholders’ Approaches for Multi-Scale Implementation of Continental Carbon Sequestration
auteur
Tiphaine Chevallier, Maud Loireau, Romain Courault, Lydie Chapuis-Lardy, Thierry Desjardins, Cécile Gomez, Alexandre Grondin, Frédéric Guérin, Didier Orange, Raphaël Pelissier, Georges Serpantié, Marie-Hélène Durand, Pierre Dérioz, Goulven Gildas Laruelle, Marie-Hélène Schwoob, Nicolas Viovy, Olivier Barrière, Eric Blanchart, Vincent Blanfort, Michel Brossard, Julien Demenois, Mireille Fargette, Thierry Heulin, Gil Mahe, Raphaël J. Manlay, Pascal Podwojewski, Cornélia Rumpel, Benjamin Sultan, Jean-Luc Chotte
article
Sustainability, MDPI, 2020, 12 (17), pp.6715. ⟨10.3390/su12176715⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02920103/file/sustainability-12-06715-v2.pdf BibTex
titre
An extended root phenotype: the rhizosphere, its formation and impacts on plant fitness
auteur
Carla de la Fuente Cantó, Marie Simonin, Eoghan King, Lionel Moulin, Malcolm Bennett, Gabriel Castrillo, Laurent Laplaze
article
Plant Journal, Wiley, 2020, 14 p. ⟨10.1111/tpj.14781⟩
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BibTex
titre
Overexpression of MADS-box Gene AGAMOUS-LIKE 12 Activates Root Development in Juglans sp. and Arabidopsis thaliana
auteur
Gregory Montiel, Muriel Gaudet, Françoise Laurans, Philippe Rozenberg, Matthieu Simon, Pascal Gantet, Christian Jay-Allemand, Christian Breton
article
Plants, MDPI, 2020, 9 (4), pp.444. ⟨10.3390/plants9040444⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02559889/file/Montiel-Plants-2020-CC-BY.pdf BibTex
titre
Geospatial assessment for crop physiological and management improvements with examples using the simple simulation model
auteur
Thomas Sinclair, Afshin Soltani, Hélène Marrou, Michel Ghanem, Vincent Vadez
article
Crop Science, Crop Science Society of America, 2020, 60 (2), pp.700-708. ⟨10.1002/csc2.20106⟩
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BibTex
titre
New insights on spatial genetic structure and diversity of Coffea canephora (Rubiaceae) in Upper Guinea based on old herbaria
auteur
Jean-Pierre Labouisse, Philippe Cubry, Frédéric Austerlitz, Ronan Rivallan, Hong Anh Nguyen
article
Plant Ecology and Evolution, Botanic Garden Meise and Royal Botanical Society of Belgium, 2020, 153 (1), pp.82-100. ⟨10.5091/plecevo.2020.1584⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02546041/file/Labouisse_et_al_Final.pdf BibTex
titre
Agricultural innovation and environmental change on the floodplains of the Congo River
auteur
Marion Comptour, Ariane Cosiaux, Oliver T. Coomes, Jean-Claude Bader, Pierre-Olivier Malaterre, Joseph Yoka, Sophie Caillon, Doyle Mckey
article
Geographical Journal, Wiley, 2020, 186 (1), pp.16-30. ⟨10.1111/geoj.12314⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02424337/file/Comptour_2019.pdf BibTex
titre
Unmasking continental natal homing in goliath catfish from the upper Amazon
auteur
Marilia Hauser, Fabrice Duponchelle, Theodore Hermann, Karin Limburg, Leandro Castello, Donald Stewart, Gislene Torrente‐vilara, Aurea García‐vásquez, Carmen García‐davila, Marc Pouilly, Christophe Pécheyran, Emmanuel Ponzevera, Jean‐françois Renno, Arthur Moret, Carolina Doria
article
Freshwater Biology, Wiley, 2020, 65 (2), pp.325-336. ⟨10.1111/fwb.13427⟩
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BibTex
titre
The genome of Ectocarpus subulatus – A highly stress-tolerant brown alga
auteur
Simon Dittami, Erwan Corre, Loraine Brillet-Guéguen, Agnieszka Lipinska, Noé Pontoizeau, Meziane Aite, Komlan Avia, Christophe Caron, Chung Hyun Cho, Jonas Collen, Alexandre Cormier, Ludovic Delage, Sylvie Doubleau, Clémence Frioux, Angélique Gobet, Irene González-Navarrete, Agnès Groisillier, Cécile Herve, Didier Jollivet, Hetty Kleinjan, Catherine Leblanc, Xi Liu, Dominique Marie, Gabriel Markov, André Minoche, Misharl Monsoor, Pierre Péricard, Marie-Mathilde Perrineau, Akira Peters, Anne Siegel, Amandine Siméon, Camille Trottier, Hwan Su Yoon, Heinz Himmelbauer, Catherine Boyen, Thierry Tonon
article
Marine Genomics, Elsevier, 2020, 52, pp.100740. ⟨10.1016/j.margen.2020.100740⟩
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https://hal.inria.fr/hal-02866117/file/307165v3.full.pdf BibTex
titre
On the necessity of combining ethnobotany and genetics to assess agrobiodiversity and its evolution in crops: A case study on date palms (Phoenix dactylifera L.) in Siwa Oasis, Egypt
auteur
Muriel Gros-Balthazard, Vincent Battesti, Sarah Ivorra, Laure Paradis, Frédérique Aberlenc, Oumarou Zango, Salwa Zehdi-Azouzi, Souhila Moussouni, Summar Abbas Naqvi, Claire Newton, Jean-Frédéric Terral
article
Evolutionary Applications, Blackwell, 2020, 13 (8), pp.1818-1840. ⟨10.1111/eva.12930⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02375285/file/On%20the%20necessity%20of%20combining%20ethnobotany%20and%20genetics%20to%20assess%20agrobiodiversity%20and%20its%20evolution%20in%20crops%2C%20A%20case%20study%20on%20date%20palms%20%28Phoenix%20dactylifera%20L.%29%20in%20Siwa%20Oasis%2C%20Egypt%2C%20M.%20Gros-Balthazard%20%26%20V.%20Battesti%20et%20al.%20%282020%29-hal-02375285%20v2.pdf BibTex
titre
Cradles and museums of generic plant diversity across tropical Africa
auteur
Léo-Paul Dagallier, Steven Janssens, Gilles Dauby, Anne Blach-Overgaard, Barbara Mackinder, Vincent Droissart, Jens-Christian Svenning, Marc Sosef, Tariq Stévart, David Harris, Bonaventure Sonké, Jan Wieringa, Olivier J. Hardy, Thomas Couvreur
article
New Phytologist, Wiley, 2020, 225 (5), pp.2196-2213. ⟨10.1111/nph.16293⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02407084/file/Dauby_etal_New_Phytol_2019.pdf BibTex
titre
Ethnicity Differences in Uses and Management Practices of Bitter Kola Trees (Garcinia kola) in Cameroon
auteur
Boniface Tientcheu Yogom, Marie-Louise Avana-Tientcheu, Marcelle Franca Meguem Mboujda, Stephane Momo Takoudjou, Théophile Fonkou, Alain Tsobeng, Adeline Barnaud, Jérôme Duminil
article
Economic Botany, Springer Verlag, In press, ⟨10.1007/s12231-020-09508-x⟩
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BibTex
titre
Phenotypic diversity assessment wihin a major ex situ collection of coffees in Madagascar
auteur
Aurore Rimlinger, Nathalie Raharimalala, Véronique Letort, Jean-Jacques Rakotomalala, Dominique Crouzillat, Romain Guyot, Perla Hamon, Sylvie Sabatier
article
Annals of Botany, Oxford University Press (OUP), 2020, 126 (5), pp.849-863. ⟨10.1093/aob/mcaa073⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03167205/file/artfloraison-31janvier2020.pdf BibTex
titre
Environmental and trophic determinism of fruit abscission and outlook with climate change in tropical regions
auteur
Sebastien Tisné, Marie Denis, Hubert Domonhedo, Benoit Pallas, Michel Cazemajor, Timothy J. Tranbarger, Fabienne Morcillo
article
Plant-Environment Interactions, 2020, 1, pp.17 - 28. ⟨10.1002/pei3.10011⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02924529/file/pei3.10011-1.pdf BibTex
titre
Structural and Functional Annotation of Transposable Elements Revealed a Potential Regulation of Genes Involved in Rubber Biosynthesis by TE-Derived siRNA Interference in Hevea brasiliensis
auteur
Shuangyang Wu, Romain Guyot, Stéphanie Bocs, Gaëtan Droc, Fetrina Oktavia, Songnian Hu, Chaorong Tang, Pascal Montoro, Julie Leclercq
article
International Journal of Molecular Sciences, MDPI, 2020, 21 (12), pp.4220. ⟨10.3390/ijms21124220⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02923368/file/2020_wu_int_journal_molecular_sciences.pdf BibTex
titre
Palm seed and fruit lipid composition : phylogenetic and ecological perspectives
auteur
C. Guerin, Julien Serret, R. Montufar, Virgine Vaissayre, Aldecinei Bastos-Siqueira, T. Durand-Gasselin, James Tregear, F. Morcillo, Stéphane Dussert
article
Annals of Botany, Oxford University Press (OUP), 2020, 125 (1), p. 157-172. ⟨10.1093/aob/mcz175⟩
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BibTex
titre
A large-scale species level dated angiosperm phylogeny for evolutionary and ecological analyses
auteur
Steven Janssens, Thomas Couvreur, Arne Mertens, Gilles Dauby, Léo-Paul Dagallier, Samuel Vanden Abeele, Filip Vandelook, Maurizio Mascarello, Hans Beeckman, Marc Sosef, Vincent Droissart, Michelle van der Bank, Olivier Maurin, William Hawthorne, Cicely Marshall, Maxime Réjou-Méchain, Denis Beina, Fidele Baya, Vincent Merckx, Brecht Verstraete, Olivier Hardy
article
Biodiversity Data Journal, Pensoft, 2020, 8 (e39677), ⟨10.3897/BDJ.8.e39677⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02460774/file/Janssens_eta_BDJ_2020_8_39677.pdf BibTex
titre
Influence of Different Environments on Germination Parameters and Seedling Morphology in Khaya senegalensis (Desr.) A. Juss (Meliaceae)
auteur
Beda Innocent Adji, Sélastique Doffou Akaffou, Kouadio Henri Kouassi, Yao Patrice Houphouet, Jerôme Duminil, Sylvie-Annabel Sabatier
article
American Journal of Plant Sciences, Scientific Research Publishing, 2020, 11 (10), pp.1579-1600. ⟨10.4236/ajps.2020.1110114⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03141198/file/ajps_2020102314131765-2.pdf BibTex
titre
The rhizosheath: from desert plants adaptation to crop breeding
auteur
Papa Mamadou Sitor Ndour, Thierry Heulin, Wafa Achouak, Laurent Laplaze, Laurent Cournac
article
Plant and Soil, Springer Verlag, In press, ⟨10.1007/s11104-020-04700-3⟩
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BibTex
titre
Seed comparative genomics in three coffee species identify desiccation tolerance mechanisms in intermediate seeds
auteur
Anna Stavrinides, Stéphane Dussert, Marie-Christine Combes, Isabelle Fock-Bastide, Dany Severac, Jérôme Minier, Aldecinei Bastos-Siqueira, Vincent Demolombe, Sonia Hem, Philippe Lashermes, Thierry Joët
article
Journal of Experimental Botany, Oxford University Press (OUP), 2020, 71 (4), pp.1-16/erz508. ⟨10.1093/jxb/erz508⟩
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https://hal.univ-reunion.fr/hal-02403786/file/erz508.pdf BibTex
titre
A transposon story : from TE content to TE dynamic invasion of Drosophila genomes using the single-molecule sequencing technology from Oxford Nanopore
auteur
Mohamed Mourdas, Nguyet Dang, Yuki Ogyama, Nelly Burlet, Bruno Mugat, Matthieu Boulesteix, Vincent Mérel, Philippe Veber, Judit Salces-Ortiz, Dany Severac, Alain Pélisson, Cristina Vieira, François Sabot, Marie Fablet, Séverine Chambeyron
article
Cells, MDPI, In press, ⟨10.3390/cells9081776⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02905128/file/cells-864342-revised.pdf BibTex
titre
Complex evolutionary history of coffees revealed by full plastid genomes and 28,800 nuclear SNP analyses, with particular emphasis on Coffea canephora (Robusta coffee)
auteur
Jean-Claude Charr, Andrea Garavito, Christophe Guyeux, Dominique Crouzillat, Patrick Descombes, Coralie Fournier, Serigne Ly, Eva Raharimalala, Jean-Jacques Rakotomalala, Piet Stoffelen, Steven Janssens, Perla Hamon, Romain Guyot
article
Molecular Phylogenetics and Evolution, Elsevier, 2020, 151, ⟨10.1016/j.ympev.2020.106906⟩
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BibTex
titre
Le report de la COP15 : une opportunité pour repenser le mécanisme d'accès aux ressources génétiques et de partage des avantages
auteur
Catherine Aubertin, Jean-Louis Pham
article
Écologie & politique : sciences, culture, société, Le bord de l'eau éditions / Presses de Sciences Po / Syllepses / Ecopresse, 2020, 61, pp.163-170. ⟨10.3917/ecopo1.061.0163⟩
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BibTex
titre
Large tandem duplications affect gene expression, 3D organization, and plant–pathogen response
auteur
Ariadna Picart-Picolo, Stefan Grob, Nathalie Picault, Michal Franek, Christel Llauro, Thierry Halter, Tom Maier, Edouard Jobet, Julie Descombin, Panpan Zhang, Vijayapalani Paramasivan, Thomas Baum, Lionel Navarro, Martina Dvořáčková, Marie Mirouze, Frédéric Pontvianne
article
Genome Research, Cold Spring Harbor Laboratory Press, In press, ⟨10.1101/gr.261586.120⟩
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https://hal-univ-perp.archives-ouvertes.fr/hal-02962580/file/Genome%20Res.-2020-Picart-Picolo-gr.261586.120.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Candidate gene prioritization using graph embedding
auteur
Quan Do, Pierre Larmande
article
IEEE-RIVF 2020, Apr 2020, Ho Chi Minh City, Vietnam
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02461886/file/ConvKB_paper.pdf BibTex

Chapitre d'ouvrage

titre
Advances in Frankia genome studies and molecular aspects of tolerance to environmental stresses
auteur
Nathalie Diagne, Pape Ibrahima Djighaly, Mariama Ngom, Céline Pesce, Antony Champion, Sergio Svistoonoff, Valérie Hocher, Louis Tisa
article
Molecular Aspects of Plant Beneficial Microbes in Agriculture, Elsevier, pp.381-389, 2020, ⟨10.1016/B978-0-12-818469-1.00031-6⟩
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BibTex
titre
Le riz comme bien commun
auteur
Alain Ghesquière
article
Agnèse, Jean-François (dir.); Dangles, Olivier (dir.); Rodary, Estienne (dir.); Verdier, Valérie (préf.); Sabrié, Marie-Lise (ed.); Mourier, Thomas (ed.); Lavagne, Corinne (ed.); Thivent, V. (rédac.). Biodiversité au Sud : recherches pour un monde durable, IRD, pp.60-61, 2020, 978-2-7099-2850-2
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BibTex
titre
Le protocole de Nagoya, entre ambition et efficacité
auteur
Jean-Louis Pham
article
Agnèse, Jean-François (dir.); Dangles, Olivier (dir.); Rodary, Estienne (dir.); Verdier, Valérie (préf.); Sabrié, Marie-Lise (ed.); Mourier, Thomas (ed.); Lavagne, Corinne (ed.); Thivent, V. (rédac.). Biodiversité au Sud : recherches pour un monde durable, IRD, pp.22-23, 2020, 978-2-7099-2850-2
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BibTex
titre
Gardiens de la diversité agronomique
auteur
Serge Hamon, Yves Vigouroux
article
Agnèse, Jean-François (dir.); Dangles, Olivier (dir.); Rodary, Estienne (dir.); Verdier, Valérie (préf.); Sabrié, Marie-Lise (ed.); Mourier, Thomas (ed.); Lavagne, Corinne (ed.); Thivent, V. (rédac.). Biodiversité au Sud : recherches pour un monde durable, IRD, pp.58-59, 2020, 978-2-7099-2850-2
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BibTex

HDR

titre
Intégration de données multi-échelles et extraction de connaissances en agronomie : exemples et perspectives
auteur
Pierre Larmande
article
Bio-informatique [q-bio.QM]. Universite Montpellier, 2020
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https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-02105913/file/hdr_manuscript_final.pdf BibTex

Autre publication

titre
Designing social simulation to (seriously) support decision-making: COMOKIT, an agent-based modelling toolkit to analyse and compare the impacts of public health interventions against COVID-19
auteur
Alexis Drogoul, Patrick Taillandier, Benoit Gaudou, Marc Choisy, Kevin Chapuis, Nghi Huynh Quang, Doanh Nguyen-Ngoc, Damien Philippon, Arthur Brugière, Pierre Larmande
article
2020
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02968321/file/DesigningSocialSimulation%20to%20%28seriously%29%20support%20decision-making.pdf BibTex

Thèse

titre
Effets de la symbiose endomycorhizienne sur la tolérance au stress hydrique chez le riz
auteur
Branly Wilfried Effa Effa
article
Sciences agricoles. Université Montpellier, 2020. Français. ⟨NNT : 2020MONTG035⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-03197839/file/2020_EFFA_EFFA_archivage.pdf BibTex

2019

Article dans une revue

titre
Chitotetraose activates the fungal-dependent endosymbiotic signaling pathway in actinorhizal plant species
auteur
Mireille Chabaud, Joëlle Fournier, Lukas Brichet, Iltaf Abdou-Pavy, Leandro Imanishi, Laurent Brottier, Elodie Pirolles, Valérie Hocher, Claudine Franche, Didier Bogusz, Luis Wallid, Sergio Svistoonoff, Hassen Gherbi, David G. Barker
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2019, 14 (10), pp.e0223149. ⟨10.1371/journal.pone.0223149⟩
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titre
Species delimitation in the genus Greenwayodendron based on morphological and genetic markers reveals new species
auteur
Brandet‐j. Lissambou, Thomas l.P. Couvreur, Christiane Atteke, Tariq Stévart, Rosalía Piñeiro, Gilles Dauby, Franck k. Monthe, Davy u. Ikabanga, Bonaventure Sonké, Bertrand M’batchi, Olivier j. Hardy
article
Taxon, Botanischer Garten und Botanisches Museum, 2019, 68 (3), pp.455-470. ⟨10.1002/tax.12064⟩
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titre
PUCHI regulates very long chain fatty acid biosynthesis during lateral root and callus formation
auteur
Duy-Chi Trinh, Julien Lavenus, Tatsuaki Goh, Yohann Boutté, Quentin Drogue, Virginie Vaissayre, Frederique Tellier, Mikael Lucas, Ute Voß, Pascal Gantet, Jean-Denis Faure, Stéphane Dussert, Hidehiro Fukaki, Malcolm Bennett, Laurent Laplaze, Soazig Guyomarc’h
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2019, 116 (28), pp.14325-14330. ⟨10.1073/pnas.1906300116⟩
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titre
MooSciTIC: Training of trainers in West African research and higher education
auteur
Ménonvè Atindehou, Kifouli Adeoti, Laura Estelle Yêyinou Loko, Thierry Beulé, Emmanuel Paradis, Gustave Djedatin, Christine Tranchant-Dubreuil, Francois Sabot, Latifou Lagnika, Estelle Jaligot
article
PLoS Biology, Public Library of Science, 2019, 17 (6), pp.e3000312. ⟨10.1371/journal.pbio.3000312⟩
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titre
Plant Pangenome: Impacts On Phenotypes And Evolution
auteur
Christine Tranchant-Dubreuil, Mathieu Rouard, Francois Sabot
article
Annual Plant Reviews, Wiley Online Library 2019, ⟨10.1002/9781119312994.apr0664⟩
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titre
The genome sequence of segmental allotetraploid peanut Arachis hypogaea
auteur
David Bertioli, Jerry Jenkins, Josh Clevenger, Olga Dudchenko, Dongying Gao, Guillermo Seijo, Soraya Bertioli, Longhui Ren, Andrew Farmer, Manish Pandey, Sergio Samoluk, Brian Abernathy, Gaurav Agarwal, Carolina Ballén-Taborda, Connor Cameron, Jacqueline Campbell, Carolina Chavarro, Annapurna Chitikineni, Ye Chu, Sudhansu Dash, Moaine El Baidouri, Baozhu Guo, Wei Huang, Kyung Do Kim, Walid Korani, Sophie Lanciano, Christopher Lui, Marie Mirouze, Márcio Moretzsohn, Melanie Pham, Jin Hee Shin, Kenta Shirasawa, Senjuti Sinharoy, Avinash Sreedasyam, Nathan Weeks, Xinyou Zhang, Zheng Zheng, Ziqi Sun, Lutz Froenicke, Erez Aiden, Richard Michelmore, Rajeev Varshney, C. Corley Holbrook, Ethalinda Cannon, Brian Scheffler, Jane Grimwood, Peggy Ozias-Akins, Steven Cannon, Scott Jackson, Jeremy Schmutz
article
Nature Genetics, Nature Publishing Group, 2019, 51 (5), pp.877-884. ⟨10.1038/s41588-019-0405-z⟩
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titre
Which frugivory‐related traits facilitated historical long‐distance dispersal in the custard apple family (Annonaceae) ?
auteur
Renske Onstein, W. Daniel Kissling, Lars Chatrou, Thomas Couvreur, Hélène Morlon, Hervé Sauquet
article
Journal of Biogeography, Wiley, 2019, 46 (8), pp.1874-1888. ⟨10.1111/jbi.13552⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02408808/file/OnsteinetalJBI2019.pdf BibTex
titre
Regulation of FUSCA3 Expression During Seed Development in Arabidopsis
auteur
Thomas James Roscoe, Virginie Vaissayre, Gaël Paszkiewicz, Fernando Clavijo, Zsolt Kelemen, Caroline Michaud, Loic Lepiniec, Bertrand Dubreucq, Dao-Xiu Zhou, Martine Devic
article
Plant and Cell Physiology, Oxford University Press (OUP), 2019, 60 (2), pp.476-487. ⟨10.1093/pcp/pcy224⟩
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titre
A single amino acid substitution (H451Y) in Leishmania calcium-dependent kinase SCAMK confers high tolerance and resistance to antimony
auteur
Baptiste Vergnes, Elodie Gazanion, Cédric Mariac, Miléna Du Manoir, Lauriane Sollelis, Jose-Juan Lopez-Rubio, Yvon Sterkers, Anne-Laure Bañuls
article
Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Oxford University Press (OUP), 2019, 74 (11), pp.3231-3239. ⟨10.1093/jac/dkz334⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02494096/file/Sterkers_30.pdf BibTex
titre
Cross-species hybridization and the origin of North African date palms
auteur
Jonathan Flowers, Khaled Hazzouri, Muriel Gros-Balthazard, Ziyi Mo, Konstantina Koutroumpa, Andreas Perrakis, Sylvie Ferrand, Hussam Khierallah, Dorian Fuller, Frederique Aberlenc, Christini Fournaraki, Michael Purugganan
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2019, 116 (5), pp.1651-1658. ⟨10.1073/pnas.1817453116⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03202324/file/1651.full.pdf BibTex
titre
Diversity, ecology and ethnobotany of the palms of the Yasuni national park (Ecuador)
auteur
R. Montufar, Thomas Couvreur, S. Espinosa, S. Escobar, Timothy Tranbarger
article
Palms, International Palm Society, 2019, 63 (1), p. 11-22
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titre
A third of the tropical African flora is potentially threatened with extinction
auteur
Tariq Stévart, Gilles Dauby, P Lowry Ii, A. Blach-Overgaard, Vincent Droissart, D Harris, B Mackinder, G. Schatz, Bonaventure Sonké, M.S.M. Sosef, J.-C Svenning, J Wieringa, T Couvreur
article
Science Advances , American Association for the Advancement of Science (AAAS), 2019, 5 (11), pp.eaax9444. ⟨10.1126/sciadv.aax9444⟩
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