Diversité, Génomes et Interactions Microorganismes des Insectes (DGIMI)

Diversité, Génomes et Interactions Microorganismes des Insectes (DGIMI)2018-10-19T15:49:16+00:00

Informations générales

Tutelles : Université de Montpellier, INRA
Rattachement : École doctorale GAIA
Label : UMR 1333
Disciplines : Agro-environnement
Site web : http://www6.montpellier.inra.fr/dgimi

Directrice de l’unité : Anne-Nathalie Volkoff

Composition :

Équipe 1 : Biologie intégrative des interactions hôte-parasitoïde – B2iHP (Anne-Nathalie Volkoff)
Équipe 2 : Dynamique des interactions densovirus – insectes – DIDI (Mylène Ogliastro)
Équipe 3 : Epigénétique, holocentrisme et adaptation de l’insecte – EHA (Emmanuelle d’Alençon)
Équipe 4 : Biologie intégrative des interactions bactéries – insectes – nématodes entomopathogènes – BIBINE (Alain Givaudan)

L’objectif des recherches développées dans l’unité DGIMI est de décrypter par des approches intégratives les interactions multitrophiques autour des insectes ravageurs et ainsi de contribuer à améliorer la protection des plantes vis-à-vis des ravageurs insectes. Trois thèmes transversaux, axés autour des interactions entre l’insecte, son cortège de parasites et pathogènes, et sa plante hôte, y sont actuellement développés :

  • Les mécanismes moléculaires régissant ces interactions
  • La diversité de ces interactions
  • Les mécanismes d’adaptation à l’hôte

L’unité DGIMI possède une expertise dans le domaine des mécanismes des interactions entre les insectes (modèle lépidoptère) et leurs parasites et pathogènes et d’autre part de la génomique comparative structurale et fonctionnelle (insectes, bactéries, virus).

Les travaux de recherche s’inscrivent dans 2 réseaux thématiques animés par l’unité DGIMI :

  • Réseau montpelliérain sur les interactions microorganismes – hôtes (IMH)
  • Réseau national sur l’adaptation à l’environnement biotique chez les lépidoptères (ADALEP)
  • Ecological Management of Bioagressors in Agroecosystems (EMBA)

L’UMR dispose d’une plate-forme expérimentale sur insectes correspondant à une zone de confinement constituée de 2 structures appartenant au réseau Vectopole Sud :

  • un insectarium qui permet l’élevage des espèces étudiées au laboratoire,
  • une plateforme pour insectes de quarantaine (PIQ) dédiée aux essais biologiques avec les différents entomopathogènes étudiés dans l’unité.

Publications phares :

  • Cambray, G., Guimarães, J., Arkin, A. P. (2018). Evaluation of 244,000 synthetic sequences reveals design principles to optimize translation in Escherichia coli. Nature Biotechnology. DOI : 10.1038/nbt.4238
  • Pantel, L., Florin, T., Dobosz-Bartoszek, M., Racine, Sarciaux, Serri, Houard, Campagne, J.-M., de Figueiredo, Midrier, Gaudriault, S., Givaudan, A., Lanois, A., Forst, S., Aumelas, Cotteaux-Lautard, C., Bolla, Vingsbo Lundberg, C., Huseby, D. L., Hughes, Villain-Guillot, Mankin, A. S., Polikanov, Y. S., Gualtieri, M. (2018). Odilorhabdins, antibacterial agents that cause miscoding by binding at a new ribosomal site. Molecular Cell, 70 (1), 83-94.e7. , 10.1016/j.molcel.2018.03.001
  • Cheng, T., Wu, J., Wu, Chilukuri, R. V., Huang, L., Yamamoto, K., Feng, Li, W., Chen, Guo, Liu, Li, Wang, Peng, Liu, Guo, Fu, Li, Liu, Chen, Tomar, Hilliou, F., Montagné, N., Jacquin-Joly, E., D’Alençon, E., Seth, R. K., Bhatnagar, R. K., Jouraku, A., Shiotsuki, Kadono-Okuda, Promboon, A., Smagghe, G., Arunkumar, Kishino, Goldsmith, M. R., Feng, Xia, Mita (2017). Genomic adaptation to polyphagy and insecticides in a major East Asian noctuid pest. Nature Ecology and Evolution, 1 (11), 1747-1756. , DOI : 10.1038/s41559-017-0314-4
  • Gouin, A., Bretaudeau, A. (Co-premier auteur), Nam, K., Gimenez, S., Aury, J.-M., Duvic, B., Hilliou, F., Durand, N., Montagné, N., Darboux, I., Kuwar, S., Chertemps, T., Siaussat, D., Bretschneider, A., Moné, Y., Ahn, S.-J., Hänniger, S., Grenet, A.-S. G., Neunemann, D., Maumus, F., Luyten, I., Labadie, K., Xu, W., Koutroumpa, F., Escoubas, J.-M., Llopis, A., Maïbèche-Coisne, M., Salasc, F., Tomar, A., Anderson, A. R., Khan, S. A., Dumas, P., Orsucci, M., Guy, J., Belser, C., Alberti, A., Noel, B., Couloux, A., Mercier, J., Nidelet, S., Dubois, E., Liu, N.-Y., Boulogne, I., Mirabeau, O., Le Goff, G., Gordon, K., Oakeshott, J., Consoli, F. L., Volkoff, A. N., Fescemyer, H. W., Marden, J. H., Luthe, D. S., Herrero, S., Heckel, D. G., Wincker, P., Kergoat, G. J., Amselem, J., Quesneville, H., Groot, A. T., Jacquin-Joly, E., Nègre, N., Lemaitre, C., Legeai, F., D’Alençon, E., Fournier, P. (2017). Two genomes of highly polyphagous lepidopteran pests (Spodoptera frugiperda, Noctuidae) with different host-plant ranges. Scientific Reports, 7, 1-12. , DOI : 10.1038/s41598-017-10461-4
  • Pichon, A., Bezier, A., Urbach, S., Aury, J.-M., Jouan, V., Ravallec, M., Guy, J., Cousserans, F., Theze, J., Gauthier, J., Demettre, E., Schmieder, S., Wurmser, F., Sibut, V., Poirie, M., Colinet, D., da Silva, C., Couloux, A., Barbe, V., Drezen, J.-M., Volkoff, A. N. (2015). Recurrent DNA virus domestication leading to different parasite virulence strategies. Science Advances, 1 (10), 9 p. , DOI : 10.1126/sciadv.1501150

Partenariats :

8 brevets et 3 licences

InVivo Agro-Solutions R&D ; Nosopharm SA (Nîmes, Lyon)

Coopération internationale :

  • Consortium International pour le séquençage du génome de la noctuelle, Spodoptera frugiperda.
  • Consortium International pour le séquençage des génomes de la bactérie entomopathogène du genre Xenorhabdus.

Contact

UMR 1333 « Diversité, Génomes & Interactions Microorganismes – Insectes »
Université de Montpellier
Place Eugène Bataillon
cc 54 ou 101
34095 Montpellier cedex 5

Tél. : 04 67 14 47 51