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Genetic control of rhizosheath formation in pearl millet

auteur

C. de la Fuente Cantó, M N Diouf, P M S Ndour, M. Debieu, A. Grondin, S. Passot, A. Champion, C. Barrachina, M. Pratlong, P. Gantet, K. Assigbetsé, N. Kane, P. Cubry, A G Diedhiou, T. Heulin, W. Achouak, Y. Vigouroux, Laurent Cournac, Laurent Laplaze

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2022, 12 (1), pp.9205. ⟨10.1038/s41598-022-13234-w⟩

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Mesorhizobium ventifaucium sp. nov. and Mesorhizobium escarrei sp. nov., two novel root-nodulating species isolated from Anthyllis vulneraria

auteur

Roba Mohamad, Anne Willems, Antoine Le Quéré, Marjorie Pervent, Géraldine Maynaud, Maurine Bonabaud, Emeric Dubois, Jean-Claude Cleyet-Marel, Brigitte Brunel

article

Systematic and Applied Microbiology, Elsevier, 2022, 45 (5), ⟨10.1016/j.syapm.2022.126341⟩

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PUCHI represses early meristem formation in developing lateral roots of Arabidopsis thaliana

auteur

Kevin Bellande, Duy-Chi Trinh, Anne-Alicia Gonzalez, Emeric Dubois, Anne-Sophie Petitot, Mikaël Lucas, Antony Champion, Pascal Gantet, Laurent Laplaze, Soazig Guyomarc’h

article

Journal of Experimental Botany, Oxford University Press (OUP), 2022, 73 (11), pp.3496-3510. ⟨10.1093/jxb/erac079⟩

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titre

Transcriptomic profiles of consistent risk-taking behaviour across time and contexts in European sea bass

auteur

Bastien Sadoul, Sébastien Alfonso, Conor Goold, Marine Pratlong, Stéphanie Rialle, Benjamin Geffroy, Marie-Laure Bégout

article

Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, Royal Society, The, 2022, 289 (1975), pp.20220399. ⟨10.1098/rspb.2022.0399⟩

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SMAD4 TGF-β–independent function preconditions naive CD8+ T cells to prevent severe chronic intestinal inflammation

auteur

Ramdane Igalouzene, Hector Hernandez-Vargas, Nicolas Benech, Alexandre Guyennon, David Bauché, Célia Barrachina, Emeric Dubois, Julien Marie, Saïdi M’homa Soudja

article

The Journal of clinical investigation, 2022, 132 (8), ⟨10.1172/JCI151020⟩

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titre

FishmiRNA: An evolutionarily supported microRNA annotation and expression database for ray-finned fishes

auteur

Thomas Desvignes, Philippe Bardou, Jérôme Montfort, Jason Sydes, Cervin Guyomar, Simon George, John H Postlethwait, Julien Bobe

article

Molecular Biology and Evolution, Oxford University Press (OUP), 2022, 39 (2), pp.msac004. ⟨10.1093/molbev/msac004⟩

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CRISPR/Cas9-mediated gene knockout and interallelic gene conversion in human induced pluripotent stem cells using non-integrative bacteriophage-chimeric retrovirus-like particles

auteur

Joffrey Mianné, Amel Nasri, Chloé Nguyen Van, Chloé Bourguignon, Mathieu Fieldès, Engi Ahmed, Christine Duthoit, Nicolas Martin, Hugues Parrinello, Anaïs Louis, Alexandra Iché, Régis Gayon, Florine Samain, Lucille Lamouroux, Pascale Bouillé, Arnaud Bourdin, Said Assou, John de Vos

article

BMC Biology, BioMed Central, 2022, 20 (1), pp.8. ⟨10.1186/s12915-021-01214-x⟩

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titre

Single cell RNA sequencing reveals hemocyte heterogeneity in Biomphalaria glabrata: Plasticity over diversity

auteur

Remi Pichon, Silvain Pinaud, Emmanuel Vignal, Cristian Chaparro, Marine Pratlong, Anaïs Portet, David Duval, Richard Galinier, Benjamin Gourbal

article

Frontiers in Immunology, Frontiers, In press, 13, ⟨10.3389/fimmu.2022.956871⟩

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Article dans une revue

titre

LIM homeobox-2 suppresses hallmarks of adult and pediatric liver cancers by inactivating MAPK/ERK and Wnt/beta-catenin pathways

auteur

Nicola Mosca, Fatma Zohra Khoubai, Sandrine Fedou, Juan Carrillo-Reixach, Stefano Caruso, Alvaro del Rio-Alvarez, Emeric Dubois, Christophe Avignon, Nathalie Dugot-Senan, Catherine Guettier, Charlotte Mussini, Jessica Zucman-Rossi, Carolina Armengol, Pierre Thiébaud, Philippe Veschambre, Christophe François Grosset

article

Liver Cancer, S. Karger, 2021, Online ahead of print. ⟨10.1159/000521595⟩

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titre

Unraveling the genotype by environment interaction in a thermosensitive fish with a polygenic sex determination system

auteur

Benjamin Geffroy, Mathieu Besson, Núria Sánchez-Baizán, Frederic Clota, Alexander Goikoetxea, Bastien Sadoul, François Ruelle, Marie-Odile Blanc, Hugues Parrinello, Sophie Hermet, Eva Blondeau-Bidet, Marine Pratlong, Francesc Piferrer, Marc Vandeputte, François Allal

article

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, National Academy of Sciences, 2021, 118 (50), pp.e2112660118. ⟨10.1073/pnas.2112660118⟩

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titre

Circulating miRNA repertoire as a biomarker of metabolic and reproductive states in rainbow trout

auteur

Emilie Cardona, Cervin Guyomar, Thomas Desvignes, Jérôme Montfort, Samia Guendouz, John H Postlethwait, Sandrine Skiba-Cassy, Julien Bobe

article

BMC Biology, BioMed Central, 2021, 19 (1), ⟨10.1186/s12915-021-01163-5⟩

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titre

Ensifer aridi LMR001T Symbiosis and Tolerance to Stress Do Not Require the Alternative Sigma Factor RpoE2

auteur

Meryem Belfquih, Ilham Sakrouhi, Hassan Ait-Benhassou, Emeric Dubois, Dany Severac, Abdelkarim Filali-Maltouf, Antoine Le Quere

article

Agronomy, MDPI, 2021, 11 (9), ⟨10.3390/agronomy11091787⟩

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titre

Concurrent BMP Signaling Maintenance and TGF-β Signaling Inhibition Is a Hallmark of Natural Resistance to Muscle Atrophy in the Hibernating Bear

auteur

Laura Cussonneau, Christian Boyer, Charlotte Brun, Christiane Deval, Emmanuelle Loizon, Emmanuelle Meugnier, Elise Gueret, Emeric Dubois, Daniel Taillandier, Cécile Polge, Daniel Béchet, Guillemette Gauquelin-Koch, Alina Evans, Jon Arnemo, Jon Swenson, Stéphane Blanc, Chantal Simon, Etienne Lefai, Fabrice Bertile, Lydie Combaret

article

Cells, MDPI, 2021, 10 (8), pp.1873. ⟨10.3390/cells10081873⟩

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titre

Ethinylestradiol (EE2) residues from birth control pills impair nervous system development and swimming behavior of zebrafish larvae

auteur

Ahmed Nasri, Ali Mezni, Pierre-André Lafon, Aymen Wahbi, Nicolas Cubedo, Philippe Clair, Abdel Halim Harrath, Hamouda Beyrem, Mireille Rossel, Véronique Perrier

article

Science of the Total Environment, Elsevier, 2021, 770, pp.145272. ⟨10.1016/j.scitotenv.2021.145272⟩

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titre

Fra-1 regulates its target genes via binding to remote enhancers without exerting major control on chromatin architecture in triple negative breast cancers

auteur

Fabienne Bejjani, Claire Tolza, Mathias Boulanger, Damien Downes, Raphaël Romero, Muhammad Ahmad Maqbool, Amal Zine El Aabidine, Jean Christophe Andrau, Sophie Lèbre, Laurent Brehelin, Hughes Parrinello, Marine Rohmer, Tony Kaoma, Laurent Vallar, Jim r. Hughes, Kazem Zibara, Charles-Henri Lecellier, Marc Piechaczyk, Isabelle Jariel-Encontre

article

Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2021, 49 (5), pp.2488-2508. ⟨10.1093/nar/gkab053⟩

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titre

Mutation accumulation in chromosomal inversions maintains wing pattern polymorphism in a butterfly

auteur

Paul Jay, Mathieu Chouteau, Annabel Whibley, Héloïse Bastide, Violaine Llaurens, Hugues Parrinello, Mathieu Joron

article

Nature Genetics, Nature Publishing Group, 2021, 53 (3), pp.288-293. ⟨10.1101/736504⟩

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titre

Sublethal Exposure Effects of the Neonicotinoid Clothianidin Strongly Modify the Brain Transcriptome and Proteome in the Male Moth Agrotis ipsilon

auteur

Camille Meslin, Françoise Bozzolan, Virginie Braman, Solenne Chardonnet, Cédric Pionneau, Marie-Christine François, Dany Severac, Christophe Gadenne, Sylvia Anton, Martine Maibèche, Emmanuelle Jacquin-Joly, David Siaussat

article

Insects, MDPI, 2021, 12 (2), ⟨10.3390/insects12020152⟩

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titre

Family-effects in the epigenomic response of red blood cells to a challenge test in the European sea bass (Dicentrarchus labrax, L.)

auteur

Madoka Vera Krick, Erick Desmarais, Athanasios Samaras, Elise Guéret, Arkadios Dimitroglou, Michalis Pavlidis, Costas Tsigenopoulos, Bruno Guinand

article

BMC Genomics, BioMed Central, 2021, 22 (1), pp.111. ⟨10.1186/s12864-021-07420-9⟩

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titre

Photoperiod dependent transcriptional modifications in key metabolic pathways in Coffea arabica

auteur

Doâa Djerrab, Benoit Bertrand, Jean-Christophe Breitler, Sophie Leran, Eveline Déchamp, Claudine Campa, Célia Barrachina, Genevieve Conejero, Hervé Etienne, Ronan Sulpice

article

Tree Physiology, Oxford University Press (OUP), 2021, 41 (2), pp.302-316. ⟨10.1093/treephys/tpaa130⟩

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titre

An environmentally relevant mixture of polychlorinated biphenyls (PCBs) and polybrominated diphenylethers (PBDEs) disrupts mitochondrial function, lipid metabolism and neurotransmission in the brain of exposed zebrafish and their unexposed F2 offspring

auteur

Mélanie Blanc, Sébastien Alfonso, Marie-Laure Bégout, Célia Barrachina, Tuulia Hyötyläinen, Steffen Keiter, Xavier Cousin

article

Science of the Total Environment, Elsevier, 2021, 754, pp.142097. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.142097⟩

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titre

Genetic pathways underpinning hormonal stress responses in fish exposed to short- and long-term warm ocean temperatures

auteur

Alexander Goikoetxea, Bastien Sadoul, Eva Blondeau-Bidet, Johan Aerts, Marie-Odile Blanc, Hugues Parrinello, Célia Barrachina, Marine Pratlong, Benjamin Geffroy

article

Ecological Indicators, Elsevier, 2021, 120, pp.106937. ⟨10.1016/j.ecolind.2020.106937⟩

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Circulating Tumor Cell Lines: an Innovative Tool for Fundamental and Translational Research

auteur

Guillaume Belthier, Zeinab Homayed, Céline Bouclier, Muriel Asari, Julie Pannequin

article

Journal of visualized experiments : JoVE, JoVE, 2021, 178, ⟨10.3791/62329⟩

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titre

Convergent morphology and divergent phenology promote the coexistence of Morpho butterfly species

auteur

Camille Le Roy, Camille Roux, Elisabeth Authier, Hugues Parrinello, Héloïse Bastide, Vincent Debat, Violaine Llaurens

article

Nature Communications, Nature Publishing Group, 2021, 12 (1), pp.7248. ⟨10.1038/s41467-021-27549-1⟩

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Sex chromosome and sex locus characterization in goldfish, Carassius auratus (Linnaeus, 1758)

auteur

Ming Wen, Romain Feron, Qiaowei Pan, Justine Guguin, Elodie Jouanno, Amaury Herpin, Christophe C. Klopp, Cédric Cabau, Margot Zahm, Hugues Parrinello, Laurent Journot, Shawn M Burgess, Yoshihiro Omori, John H Postlethwait, Manfred Schartl, Yann Guiguen

article

BMC Genomics, BioMed Central, 2020, 21 (1), pp.1-12. ⟨10.1186/s12864-020-06959-3⟩

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titre

LifeTime and improving European healthcare through cell-based interceptive medicine

auteur

Nikolaus Rajewsky, Geneviève Almouzni, Stanislaw Gorski, Stein Aerts, Ido Amit, Michela Bertero, Christoph Bock, Annelien Bredenoord, Giacomo Cavalli, Susanna Chiocca, Hans Clevers, Bart de Strooper, Angelika Eggert, Jan Ellenberg, Xosé Fernández, Marek Figlerowicz, Susan Gasser, Norbert Hubner, Jørgen Kjems, Jürgen Knoblich, Grietje Krabbe, Peter Lichter, Sten Linnarsson, Jean-Christophe Marine, John Marioni, Marc Marti-Renom, Mihai Netea, Dörthe Nickel, Marcelo Nollmann, Halina Novak, Helen Parkinson, Stefano Piccolo, Inês Pinheiro, Ana Pombo, Christian Popp, Wolf Reik, Sergio Roman-Roman, Philip Rosenstiel, Joachim Schultze, Oliver Stegle, Amos Tanay, Giuseppe Testa, Dimitris Thanos, Fabian Theis, Maria-Elena Torres-Padilla, Alfonso Valencia, Céline Vallot, Alexander van Oudenaarden, Marie Vidal, Thierry Voet, Monsef Benkirane, Laurent Journot

article

Nature, Nature Publishing Group, 2020, 587 (7834), pp.377-386. ⟨10.1038/s41586-020-2715-9⟩

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titre

Differential immune gene expression associated with contemporary range expansion of two invasive rodents in Senegal

auteur

Nathalie Charbonnel, Maxime Galan, Caroline Tatard, Anne Loiseau, Christophe Amidi Diagne, Ambroise Dalecky, Hugues Parrinello, Stéphanie Rialle, Dany Severac, Carine Brouat

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2020, Peer Community in Ecology, 10, pp.18257. ⟨10.1101/442160⟩

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titre

Quantifying Genomic Imprinting at Tissue and Cell Resolution in the Brain

auteur

Annie Varrault, Emeric Dubois, Anne Le Digarcher, Tristan Bouschet

article

Epigenomes, MDPI, 2020, 4 (3), pp.21. ⟨10.3390/epigenomes4030021⟩

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titre

Responses of mature symbiotic nodules to the whole-plant systemic nitrogen signaling

auteur

Ilana Lambert, Marjorie Pervent, Antoine Le Quéré, Gilles Clement, Marc Tauzin, Dany Severac, Claire Benezech, Pascal Tillard, Marie-Laure Martin-Magniette, Stefano Colella, Marc Lepetit

article

Journal of Experimental Botany, Oxford University Press (OUP), 2020, 71 (16), pp.5039-5052. ⟨10.1093/jxb/eraa221⟩

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In vitro shared transcriptomic responses of Aedes aegypti to arboviral infections: example of dengue and Rift Valley fever viruses

auteur

Séverine Licciardi, Etienne Loire, Eric Cardinale, Marie Gislard, Emeric Dubois, Catherine Cêtre-Sossah

article

Parasites and Vectors, BioMed Central, 2020, 13 (1), pp.395. ⟨10.1186/s13071-020-04253-5⟩

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titre

A transposon story : from TE content to TE dynamic invasion of Drosophila genomes using the single-molecule sequencing technology from Oxford Nanopore

auteur

Mohamed Mourdas, Nguyet Thi-Minh Dang, Yuki Ogyama, Nelly Burlet, Bruno Mugat, Matthieu Boulesteix, Vincent Mérel, Philippe Veber, Judit Salces-Ortiz, Dany Severac, Alain Pélisson, Cristina Vieira, François Sabot, Marie Fablet, Séverine Chambeyron

article

Cells, MDPI, 2020, 9 (8), pp.1776. ⟨10.3390/cells9081776⟩

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titre

TALC: Transcript-level Aware Long-read Correction

auteur

Lucile Broseus, Aubin Thomas, Andrew Oldfield, Dany Severac, Emeric Dubois, William Ritchie

article

Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2020, ⟨10.1093/bioinformatics/btaa634⟩

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titre

The role of copy-number variation in the reinforcement of sexual isolation between the two European subspecies of the house mouse

auteur

Henry North, Pierre Caminade, Dany Severac, Khalid Belkhir, Carole Smadja

article

Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, Royal Society, The, 2020, 375 (1806), pp.20190540. ⟨10.1098/rstb.2019.0540⟩

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titre

Dopamine D2-Like Receptors Modulate Intrinsic Properties and Synaptic Transmission of Parvalbumin Interneurons in the Mouse Primary Motor Cortex

auteur

Jérémy Cousineau, Léa Lescouzères, Anne Taupignon, Lorena Delgado-Zabalza, Emmanuel Valjent, Jérôme Baufreton, Morgane Le Bon-Jégo

article

eNeuro, Society for Neuroscience, 2020, 7 (3), pp.ENEURO.0081-20.2020. ⟨10.1523/ENEURO.0081-20.2020⟩

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titre

Transcriptome of tambaqui Colossoma macropomum during gonad differentiation: Different molecular signals leading to sex identity

auteur

Igor Kelvyn Cavalcante Lobo, Aquila Rodrigues Do Nascimento, Michel Eduardo Beleza Yamagishi, Yann Guiguen, Gilvan Ferreira Da Silva, Dany Severac, Aldessandro da Costa Amaral, Vanessa Ribeiro Reis, Fernanda Loureiro De Almeida

article

Genomics, Elsevier, 2020, 112 (3), pp.2478-2488. ⟨10.1016/j.ygeno.2020.01.022⟩

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titre

Lamin C Counteracts Glucose Intolerance in Aging, Obesity, and Diabetes Through β-Cell Adaptation

auteur

Marion de Toledo, Isabel C. Lopez-Mejia, Patricia Cavelier, Marine Pratlong, Célia Barrachina, Xavier Gromada, Jean-Sébastien Annicotte, Jamal Tazi, Carine Chavey

article

Diabetes, American Diabetes Association, 2020, 69 (4), pp.647-660. ⟨10.2337/db19-0377⟩

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titre

A Sustained Immune Response Supports Long-Term Antiviral Immune Priming in the Pacific Oyster, Crassostrea gigas

auteur

Maxime Lafont, Agnès Vergnes, Jeremie Vidal-Dupiol, Julien de Lorgeril, Yannick Guéguen, Philippe Haffner, Bruno Petton, Cristian Chaparro, Célia Barrachina, Delphine Destoumieux-Garzón, Guillaume Mitta, Benjamin Gourbal, Caroline Montagnani

article

mBio, 2020, ⟨10.1128/mBio.02777-19⟩

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titre

Genome sequence of the euryhaline Javafish Medaka, Oryzias javanicus: A small aquarium fish model for studies on adaptation to salinity

auteur

Yusuke Takehana, Margot Zahm, Cédric Cabau, Christophe C. Klopp, Céline Roques, Olivier Bouchez, Cécile Donnadieu, Célia Barrachina, Laurent Journot, Mari Kawaguchi, Shigeki Yasumasu, Satoshi Ansai, Kiyoshi Naruse, Koji Inoue, Chuya Shinzato, Manfred Schartl, Yann Guiguen, Amaury Herpin

article

G3, Genetics Society of America, 2020, 10 (3), pp.907-915. ⟨10.1534/g3.119.400725⟩

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titre

Post-production modifications of murine mesenchymal stem cell (mMSC) derived extracellular vesicles (EVs) and impact on their cellular interaction

auteur

Sarah Le Saux, Hanna Aarrass, Josephine Lai-Kee-Him, Patrick Bron, J. Armengaud, Guylaine Miotello, Justine Bertrand-Michel, Emeric Dubois, Simon George, Orestis Faklaris, Jean-Marie Devoisselle, Philippe Legrand, Joel Chopineau, Marie Morille

article

Biomaterials, Elsevier, 2020, 231, pp.119675. ⟨10.1016/j.biomaterials.2019.119675⟩

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titre

TAG-RNAi overcomes off-target effects in cancer models

auteur

Julien Champagne, Laetitia K. Linares, Benjamin Maurel, Alexandre Zampieri, Maeva Moreno, Ivanna Fuentes, Emeric Dubois, Dany Severac, Adrien Decorsière, Frédéric Bienvenu

article

Oncogene, Nature Publishing Group, 2020, 39 (4), pp.935-945. ⟨10.1038/s41388-019-1020-2⟩

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titre

Near-chromosome level genome assembly of the fruit pest Drosophila suzukii using long-read sequencing

auteur

Mathilde Paris, Roxane Boyer, Rita Jaenichen, Jochen Wolf, Marianthi Karageorgi, Jack Green, Mathilde Cagnon, Hugues Parrinello, Arnaud Estoup, Mathieu Gautier, Nicolas Gompel, Benjamin Prud’homme

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2020, 10 (1), pp.11227. ⟨10.1038/s41598-020-67373-z⟩

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titre

The sterlet sturgeon genome sequence and the mechanisms of segmental rediploidization

auteur

Kang Du, Matthias Stöck, Susanne Kneitz, Christophe C. Klopp, Joost Woltering, Mateus Contar Adolfi, Romain Feron, Dmitry Prokopov, Alexey Makunin, Ilya Kichigin, Cornelia Schmidt, Petra Fischer, Heiner Kuhl, Sven Wuertz, Jörn Gessner, Werner Kloas, Cédric Cabau, Carole Iampietro, Hugues Parrinello, Chad Tomlinson, Laurent Journot, John Postlethwait, Ingo Braasch, Vladimir Trifonov, Wesley C Warren, Axel Meyer, Yann Guiguen, Manfred Schartl

article

Nature Ecology & Evolution, Nature, 2020, 4 (6), pp.841-852. ⟨10.1038/s41559-020-1166-x⟩

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titre

Routine CYP2C19 genotyping to adjust antiplatelet therapy

auteur

Jean-Sébastien Hulot, Bernard Chevalier, Loic Belle, Guillaume Cayla, Khalife Khalife, François Funck, Romain Berthier, Christophe Piot, Muriel Tafflet, Gilles Montalescot

article

JACC: Cardiovascular Interventions, Elsevier/American College of Cardiology, In press, ⟨10.1016/j.jcin.2020.01.219⟩

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A whole-genome scan for association with invasion success in the fruit fly Drosophila suzukii using contrasts of allele frequencies corrected for population structure

auteur

Laure Olazcuaga, Anne Loiseau, Hugues Parrinello, Mathilde Paris, Antoine Fraimout, Christelle Guedot, Lauren M Diepenbrock, Marc Kenis, Jinping Zhang, Xiao Chen, Nicolas Borowiec, Benoit Facon, Heidrun Vogt, Donald K Price, Heiko Vogel, Benjamin Prud’homme, Arnaud Estoup, Mathieu Gautier

article

Molecular Biology and Evolution, Oxford University Press (OUP), 2020, 37 (8), pp.2369-2385. ⟨10.1093/molbev/msaa098⟩

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titre

LIX1 regulates YAP activity and controls gastrointestinal cancer cell plasticity

auteur

Amandine Guérin, Delphine Martire, Eva Trenquier, Tom Lesluyes, Sébastien Sagnol, Marine Pratlong, Elise Lefebvre, Frédéric Chibon, Pascal de Santa Barbara, Sandrine Faure

article

Journal of Cellular and Molecular Medicine, Wiley Open Access, 2020, ⟨10.1111/jcmm.15569⟩

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titre

Seed comparative genomics in three coffee species identify desiccation tolerance mechanisms in intermediate seeds

auteur

Anna K Stavrinides, Stéphane Dussert, Marie-Christine Combes, Isabelle Fock-Bastide, Dany Severac, Jérôme Minier, Aldecinei Bastos-Siqueira, Vincent Demolombe, Sonia Hem, Philippe Lashermes, Thierry Joët

article

Journal of Experimental Botany, Oxford University Press (OUP), 2020, 71 (4), pp.1-16/erz508. ⟨10.1093/jxb/erz508⟩

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Article dans une revue

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Both anti-inflammatory and antiviral properties of novel drug candidate ABX464 are mediated by modulation of RNA splicing

auteur

Audrey Vautrin, Laurent Manchon, Aude Garcel, Noëlie Campos, Laure Lapasset, Abdelhamid Mahdi Laaref, Roman Bruno, Marie Gislard, Emeric Dubois, Didier Scherrer, J Hartmut Ehrlich, Jamal Tazi

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-018-37813-y⟩

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titre

Postnatal Tshz3 Deletion Drives Altered Corticostriatal Function and Autism Spectrum Disorder–like Behavior

auteur

Dorian Chabbert, Xavier Caubit, Pierre L. Roubertoux, Michèle Carlier, Bianca Habermann, Bernard Jacq, Pascal Salin, Mehdi Metwaly, Christina Frahm, Ahmed Fatmi, Alistair N Garratt, Dany Severac, Emeric Dubois, Lydia Kerkerian-Le Goff, Laurent Fasano, Paolo Gubellini

article

Biological Psychiatry, Elsevier, 2019, 86 (4), pp.274-285. ⟨10.1016/j.biopsych.2019.03.974⟩

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ISoLDE: a data-driven statistical method for the inference of allelic imbalance in datasets with reciprocal crosses

auteur

Christelle Reynes, Guilhem Kister, Marine Rohmer, Tristan Bouschet, Annie Varrault, Emeric Dubois, Stéphanie Rialle, Laurent Journot, Robert Sabatier

article

Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2019, 36 (2), pp.504-513. ⟨10.1093/bioinformatics/btz564⟩

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titre

Transcriptomic Analysis With the Progress of Symbiosis in ‘Crack-Entry’ Legume Arachis hypogaea Highlights Its Contrast With ‘Infection Thread’ Adapted Legumes

auteur

Kanchan Karmakar, Anindya Kundu, Ahsan Z. Rizvi, Emeric Dubois, Dany Severac, Pierre Czernic, Fabienne Cartieaux, Maitrayee Dasgupta

article

Molecular Plant-Microbe Interactions, American Phytopathological Society, 2019, 32 (3), pp.271-285. ⟨10.1094/MPMI-06-18-0174-R⟩

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titre

The genome of the arapaima (Arapaima gigas) provides insights into gigantism, fast growth and chromosomal sex determination system

auteur

Kang Du, Sven Wuertz, Mateus Adolfi, Susanne Kneitz, Matthias Stöck, Marcos Oliveira, Rafael Nóbrega, Jenny Ormanns, Werner Kloas, Romain Feron, Christophe C. Klopp, Hugues Parrinello, Laurent Journot, Shunping He, John Postlethwait, Axel Meyer, Yann Guiguen, Manfred Schartl

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), pp.1-11. ⟨10.1038/s41598-019-41457-x⟩

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titre

Draft genome assembly and annotation of the gila topminnow Poeciliopsis occidentalis

auteur

Mariana Mateos, Du Kang, Christophe C. Klopp, Hugues Parrinello, Mateo Garcia-Olazabal, Molly Schumer, Nathaniel K. Jue, Yann Guiguen, Manfred Schartl

article

Frontiers in Ecology and Evolution, Frontiers Media S.A, 2019, 7, pp.1-7. ⟨10.3389/fevo.2019.00404⟩

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What makes a bad egg? Egg transcriptome reveals dysregulation of translational machinery and novel fertility genes important for fertilization

auteur

Caroline Cheung, Thuy Thao Vi Nguyen, Aurélie Le Cam, Amélie Patinote, Laurent Journot, Christelle Reynes, Julien Bobe

article

BMC Genomics, BioMed Central, 2019, 20:584 (1), pp.1-14. ⟨10.1186/s12864-019-5930-8⟩

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titre

Spodoptera frugiperda transcriptional response to infestation by Steinernema carpocapsae

auteur

Louise Huot, Simon George, Pierre-Alain Girard, Dany Severac, Nicolas Nègre, Bernard Duvic

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), 13 p. ⟨10.1038/s41598-019-49410-8⟩

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Article dans une revue

titre

Characterization and expression profiling of microRNAs in response to plant feeding in two host-plant strains of the lepidopteran pest Spodoptera frugiperda

auteur

Yves Moné, Sandra Nhim, Sylvie Gimenez, Fabrice Legeai, Imène Séninet, Hugues Parrinello, Nicolas Negre, Emmanuelle d'Alençon

article

BMC Genomics, BioMed Central, 2018, 19 (1), pp.1-15. ⟨10.1186/s12864-018-5119-6⟩

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titre

High-salt Recovered Sequences are associated with the active chromosomal compartment and with large ribonucleoprotein complexes including nuclear bodies

auteur

Marie Baudement, Axel Cournac, Franck Court, Marie Seveno, Hugues Parrinello, Christelle Reynes, Robert Sabatier, Tristan Bouschet, Zhou Yi, Sephora Sallis, Mathilde Tancelin, Cosette Rebouissou, Guy Cathala, Annick Lesne, Julien Mozziconacci, Laurent Journot, Thierry Forné

article

Genome Research, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2018, 28 (11), pp.1733 - 1746. ⟨10.1101/gr.237073.118⟩

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titre

SNAP23-Kif5 complex controls mGlu1 receptor trafficking

auteur

F. Raynaud, Vincent Homburger, Martial Séveno, Oana Vigy, Enora Moutin, Laurent Fagni, Julie Perroy

article

Journal of molecular cell biology, Oxford UP, 2018, 10 (5), pp.423 - 436. ⟨10.1093/jmcb/mjy031⟩

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Transcriptome profiling of the honeybee parasite Varroa destructor provides new biological insights into the mite adult life cycle

auteur

Fanny Mondet, Andrea Rau, Christophe C. Klopp, Marine Rohmer, Dany Severac, Yves Le Conte, Cédric Alaux

article

BMC Genomics, BioMed Central, 2018, 19 (1), pp.328. ⟨10.1186/s12864-018-4668-z⟩

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Changes in chromatin state reveal ARNT2 at a node of a tumorigenic transcription factor signature driving glioblastoma cell aggressiveness

auteur

Alexandra Bogeas, Ghislaine Morvan-Dubois, Elías El-Habr, François-Xavier Lejeune, Matthieu Defrance, Ashwin Narayanan, Klaudia Kuranda, Fanny Burel-Vandenbos, Salwa Sayd, Virgile Delaunay, Luiz Dubois, Hugues Parrinello, Stéphanie Rialle, Sylvie Fabrega, Ahmed Idbaih, Jacques Haiech, Ivan Bièche, Thierry Virolle, Michele Goodhardt, Herve Chneiweiss, Marie-Pierre Junier

article

Acta Neuropathologica, Springer Verlag, 2018, 135 (2), pp.267-283. ⟨10.1007/s00401-017-1783-x⟩

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titre

Transcriptomic response of female adult moths to host and non-host plants in two closely related species

auteur

Marion Orsucci, Philippe Audiot, Sabine Nidelet, Franck Dorkeld, Alexandra Pommier, Marin Vabre, Dany Severac, Marine Rohmer, Bernhard Gschloessl, Rejane Streiff

article

BMC Evolutionary Biology, BioMed Central, 2018, 18, ⟨10.1186/s12862-018-1257-3⟩

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Larval transcriptomic response to host plants in two related phytophagous lepidopteran species: implications for host specialization and species divergence

auteur

Marion Orsucci, Philippe Audiot, Franck Dorkeld, Alexandra Pommier, Marin Vabre, Bernhard Gschloessl, Stéphanie Rialle, Dany Severac, Denis Bourguet, Rejane Streiff

article

BMC Genomics, BioMed Central, 2018, 19, ⟨10.1186/s12864-018-4589-x⟩

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titre

Lysosomal and network alterations in human mucopolysaccharidosis type VII iPSC-derived neurons

auteur

Neus Bayo-Puxan, Ana Paula Terrasso, Sophie Creyssels, Daniel Simao, Christina Begon-Pescia, Marina Lavigne, Sara Salinas, Florence F. Bernex, Assumpció Bosch, Vasiliki Kalatzis, Thierry Levade, Ana Maria Cuervo, Philippe Lory, Antonella Consiglio, Catarina Brito, Eric J. Kremer

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2018, 8, pp.16644. ⟨10.1038/s41598-018-34523-3⟩

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titre

Enhanced brain expression of genes related to cell proliferation and neural differentiation is associated with cortisol receptor expression in fishes

auteur

Bastien Sadoul, S. Alfonso, E. Bessa, A. Bouchareb, E. Blondeau-Bidet, Philippe Clair, B. Chatain, M. L. Begout, B. Geffroy

article

General and Comparative Endocrinology, Elsevier, 2018, 267, pp.76-81. ⟨10.1016/j.ygcen.2018.06.001⟩

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titre

The Genomic Basis of Color Pattern Polymorphism in the Harlequin Ladybird

auteur

Mathieu Gautier, Junichi Yamaguchi, Julien Foucaud, Anne Loiseau, Aurélien Ausset, Benoit Facon, Bernhard Gschloessl, Jacques Lagnel, Etienne Loire, Hugues Parrinello, Dany Severac, Celine Lopez-Roques, Cecile Donnadieu, Maxime Manno, Helene Berges, Karim Gharbi, Lori Lawson-Handley, Lian-Sheng Zang, Heiko Vogel, Arnaud Estoup, Benjamin Prud’homme

article

Current Biology - CB, Elsevier, 2018, 28 (20), pp.1-7. ⟨10.1016/j.cub.2018.08.023⟩

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titre

Transcriptome Profiles of Nod Factor-independent Symbiosis in the Tropical Legume Aeschynomene evenia

auteur

Djamel Gully, Pierre Czernic, Stéphane Cruveiller, Frédéric Mahé, Cyrille Longin, David Vallenet, Philippe François, Sabine Nidelet, Stéphanie Rialle, Eric Giraud, Jean-François Arrighi, Maitrayee Dasgupta, Fabienne Cartieaux

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2018, 8 (1), pp.10934. ⟨10.1038/s41598-018-29301-0⟩

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titre

Parent-of-Origin Dependent Gene Expression in Male and Female Schistosome Parasites

auteur

Julien Kincaid-Smith, Marion A.-L. Picard, Celine Cosseau, Jerome Boissier, Dany Severac, Christoph Grunau, Eve Toulza

article

Genome Biology and Evolution, In press, 10 (3), pp.840-856. ⟨10.1093/gbe/evy037⟩

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Article dans une revue

titre

Initiation of DNA replication requires actin dynamics and formin activity

auteur

Nikolaos Parisis, Liliana Krasinska, Bethany Harker, Serge Urbach, Michel Rossignol, Alain Camasses, James Dewar, Nathalie Morin, Daniel Fisher

article

EMBO Journal, EMBO Press, 2017, 36 (21), pp.3212--3231. ⟨10.15252/embj.201796585⟩

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titre

Characterization of microRNAs from Arabidopsis galls highlights a role for miR159 in the plant response to the root-knot nematode Meloidogyne incognita

auteur

Clémence Medina, Martine da Rocha, Marc Magliano, Alizée Ratpopoulo, Benoît Revel, Nathalie Marteu, Virginie Magnone, Kevin Lebrigand, Javier Cabrera, Marta Barcala, Ana Cláudia Silva, Anthony Millar, Carolina Escobar, Pierre Abad, Bruno Favery, Stéphanie Jaubert-Possamai

article

New Phytologist, Wiley, 2017, 216 (3), pp.882-896. ⟨10.1111/nph.14717⟩

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titre

Do changes in gene expression contribute to sexual isolation and reinforcement in the house mouse?

auteur

Etienne Loire, Sergio Tusso, Pierre Caminade, Dany Severac, Pierre Boursot, Guila Ganem, Carole Smadja

article

Molecular Ecology, Wiley, 2017, 26 (19), pp.5189 - 5202. ⟨10.1111/mec.14212⟩

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titre

Targeting the Wnt Pathway and Cancer Stem Cells with Anti-progastrin Humanized Antibodies as a Potential Treatment for K-RAS-Mutated Colorectal Cancer

auteur

Alexandre Prieur, Monica Cappellini, Guillaume Habif, Marie-Paule Lefranc, Thibault Mazard, Eric Morency, Jean-Marc Pascussi, Maud Flacelière, Nathalie Cahuzac, Bérengère Vire, Benjamin Dubuc, Amandine Durochat, Pierre Liaud, Jérémy Ollier, Caroline Pfeiffer, Sophie Poupeau, Véronique Saywell, Chris Planque, Eric Assenat, Frédéric Bibeau, Jean-François Bourgaux, Pascal Pujol, Alain Sézeur, Marc Ychou, Dominique Joubert

article

Clinical Cancer Research, American Association for Cancer Research, 2017, 23 (17), pp.5267--5280. ⟨10.1158/1078-0432.CCR-17-0533⟩

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titre

Dynamics of H3K4me3 Chromatin Marks Prevails over H3K27me3 for Gene Regulation during Flower Morphogenesis in Arabidopsis thaliana

auteur

Julia Engelhorn, Robert Blanvillain, Christian Kröner, Hugues Parrinello, Marine Rohmer, David Posé, Felix Ott, Markus Schmid, Cristel Carles

article

Epigenomes, MDPI, 2017, 1 (2), pp.8. ⟨10.3390/epigenomes1020008⟩

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titre

Transcriptome and proteome analysis reveal new insight into proximal and distal responses of wheat to foliar infection by Xanthomonas translucens

auteur

Daniel Garçia Seco, Marco Chiapello, Marcella Bracale, Céline Pesce, Paolo Bagnaresi, Emeric Dubois, Lionel Moulin, Candida Vannini, Ralf Koebnik

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2017, 7 (1), pp.10157. ⟨10.1038/s41598-017-10568-8⟩

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titre

HEXIM1 and NEAT1 Long Non-coding RNA Form a Multi-subunit Complex that Regulates DNA-Mediated Innate Immune Response

auteur

Mehdi Morchikh, Alexandra Cribier, Raoul Raffel, Sonia Amraoui, Julien Cau, Dany Severac, Emeric Dubois, Olivier Schwartz, Yamina Bennasser, Monsef Benkirane

article

Molecular Cell, Cell Press, 2017, 67 (3), pp.387-399. ⟨10.1016/j.molcel.2017.06.020⟩

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titre

Native metabotropic glutamate receptor 4 depresses synaptic transmission through an unusual Gαq transduction pathway.

auteur

Solenne Chardonnet, Thomas Bessiron, Cathy Isaura Ramos, Raoudha Dammak, Marie-Ange Richard, Céline Boursier, Christelle Cadilhac, Frédéric M Coquelle, Simon Bossi, Fabrice Ango, Pierre Le Maréchal, Paulette Decottignies, Catherine Berrier, Heather Mclean, Hervé Daniel

article

Neuropharmacology, Elsevier, 2017, 121, pp.247-260. ⟨10.1016/j.neuropharm.2017.04.036⟩

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titre

In mammalian foetal testes, SOX9 regulates expression of its target genes by binding to genomic regions with conserved signatures

auteur

Massilva Rahmoun, Rowena Lavery, Sabine Laurent-Chaballier, Nicolas Bellora, Gayle K. Philip, Moïra Rossitto, Aleisha Symon, Eric Pailhoux, Florence Cammas, Jessica Chung, Stefan Bagheri-Fam, Mark Murphy, Vivian Bardwell, David Zarkower, Brigitte Boizet-Bonhoure, Philippe Clair, Vincent R. Harley, Francis Poulat

article

Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2017, 45 (12), pp.7191 - 7211. ⟨10.1093/nar/gkx328⟩

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titre

PEGylation rate influences peptide-based nanoparticles mediated siRNA delivery in vitro and in vivo

auteur

Gudrun Aldrian, Anaïs Vaissière, Karidia Konate, Quentin Seisel, Eric Vivès, Frédéric Fernandez, Véronique Viguier, Coralie Genevois, Franck Couillaud, Hélène Déméné, Dina Aggad, Aurélie Covinhes, Stéphanie Barrère-Lemaire, Sebastien Deshayes, Prisca Boisguerin

article

Journal of Controlled Release, Elsevier, 2017, 256, pp.79-91. ⟨10.1016/j.jconrel.2017.04.012⟩

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titre

Argonaute proteins regulate HIV-1 multiply spliced RNA and viral production in a Dicer independent manner

auteur

Agathe Eckenfelder, Emmanuel Ségéral, Natalia Pinzón, Damien Ulveling, Céline Amadori, Marine Charpentier, Sabine Nidelet, Jean-Paul Concordet, Jean-François Zagury, Jc Paillart, Clarisse Berlioz-Torrent, Hervé Seitz, Stéphane Emiliani, Sarah Gallois-Montbrun

article

Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2017, 45 (7), pp.4158-4173. ⟨10.1093/nar/gkw1289⟩

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titre

In Vitro Corticogenesis from Embryonic Stem Cells Recapitulates the In Vivo Epigenetic Control of Imprinted Gene Expression

auteur

Tristan Bouschet, Emeric Dubois, Christelle Reynes, Satya Kota, Stéphanie Rialle, Stéphanie Maupetit-Méhouas, Mikaël Pezet, Anne Le Digarcher, Sabine Nidelet, Vincent Demolombe, Patricia Cavelier, Céline Meusnier, Chloé Maurizy, Robert Sabatier, Robert Feil, Philippe P. Arnaud, Laurent Journot, Annie Varrault

article

Cerebral Cortex, Oxford University Press (OUP), 2017, ⟨10.1093/cercor/bhw102⟩

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titre

IGF-1 Induces GHRH Neuronal Axon Elongation during Early Postnatal Life in Mice

auteur

Lyvianne Decourtye, Erik Mire, Maud Clemessy, Victor Heurtier, Tatiana Ledent, Iain C. Robinson, Patrice Mollard, Jacques Epelbaum, Michael J. Meaney, Sonia Garel, Yves Le Bouc, Laurent Kappeler

article

PLoS ONE, Public Library of Science, 2017, 12 (1), pp.e0170083. ⟨10.1371/journal.pone.0170083⟩

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An antimicrobial peptide-resistant minor subpopulation of Photorhabdus luminescens is responsible for virulence

auteur

Annabelle Mouammine, Sylvie Pages, Anne Lanois-Nouri, Sophie Gaudriault, Grégory Jubelin, Maurine Bonabaud, Stéphane Cruveiller, Emeric Dubois, David Roche, Ludovic Legrand, Julien Brillard, Alain Givaudan

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2017, 7, pp.43670. ⟨10.1038/srep43670⟩

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De Novo Assemblies of Three Oryza glaberrima Accessions Provide First Insights about Pan-Genome of African Rices

auteur

Cécile Monat, Bérengère Pera, Marie-Noelle Ndjiondjop, Mounirou Sow, Christine Tranchant-Dubreuil, Leila Bastianelli, Alain Ghesquière, Francois Sabot

article

Genome Biology and Evolution, Society for Molecular Biology and Evolution, 2017, 9 (1), pp.1-6. ⟨10.1093/gbe/evw253⟩

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titre

Acute and long-term cardioprotective effects of the Traditional Chinese Medicine MLC901 against myocardial ischemia-reperfusion injury in mice

auteur

Anne Vincent, Aurélie Covinhes, Christian Barrère, Laura Gallot, Soulit Thoumala, Christophe Piot, Catherine Heurteaux, Michel Lazdunski, Joël Nargeot, Stéphanie Barrère-Lemaire

article

Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2017, 7 (1), pp.14701. ⟨10.1038/s41598-017-14822-x⟩

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titre

Control of nerve cord formation by Engrailed and Gooseberry-Neuro: A multi-step, coordinated process

auteur

Nathalie Bonneaud, Sophie Layalle, Sophie Colomb, Christophe Jourdan, Alain Ghysen, Dany Severac, Christelle Dantec, Nicolas Negre, Florence Maschat

article

Developmental Biology, Elsevier, 2017, 432 (2), pp.273-285. ⟨10.1016/j.ydbio.2017.10.018⟩

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titre

Cell Type-Specific mRNA Dysregulation in Hippocampal CA1 Pyramidal Neurons of the Fragile X Syndrome Mouse Model

auteur

Laura Ceolin, Nathalie Bouquier, Jihane Boubaker-Vitre, Stéphanie Rialle, Dany Severac, Emmanuel Valjent, Julie Perroy, Emma Puighermanal

article

Frontiers in Molecular Neuroscience, Frontiers Media, 2017, 10, pp.340. ⟨10.3389/fnmol.2017.00340⟩

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titre

Identification of Plagl1/Zac1 binding sites and target genes establishes its role in the regulation of extracellular matrix genes and the imprinted gene network

auteur

Annie Varrault, Christelle Dantec, Anne Le Digarcher, Laetitia Chotard, Benoit Bilanges, Hugues Parrinello, Emeric Dubois, Stéphanie Rialle, Dany Severac, Tristan Bouschet, Laurent Journot

article

Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2017, 45 (18), pp.10466 - 10480. ⟨10.1093/nar/gkx672⟩

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titre

Mesorhizobium delmotii and Mesorhizobium prunaredense are two new species containing rhizobial strains within the symbiovar anthyllidis

auteur

Roba Mohamad, Anne Willems, Antoine Le Quere, Géraldine Maynaud, Marjorie Pervent, Maurine Bonabaud, Emeric Dubois, Jean Claude Cleyet-Marel, Brigitte Brunel

article

Systematic and Applied Microbiology, Elsevier, 2017, 40 (3), pp.135-143. ⟨10.1016/j.syapm.2017.01.004⟩

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A multistrain approach to studying the mechanisms underlying compatibility in the interaction between Biomphalaria glabrata and Schistosoma mansoni

auteur

Richard Galinier, Emmanuel Roger, Yves Moné, David Duval, Anaïs Portet, Silvain Pinaud, Cristian Chaparro, Christoph Grunau, Clémence Genthon, Emeric Dubois, Anne Rognon, Nathalie Arancibia, Bernard Dejean, André Théron, Benjamin Gourbal, Guillaume Mitta

article

PLoS Neglected Tropical Diseases, 2017, 11 (3), pp.e0005398. ⟨10.1371/journal.pntd.0005398.s005⟩

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titre

DNA Adenine Methyltransferase (Dam) Overexpression Impairs Photorhabdus luminescens Motility and Virulence

auteur

Amaury Payelleville, Anne Lanois-Nouri, Marie Gislard, Emeric Dubois, David Roche, Stéphane Cruveiller, Alain Givaudan, Julien Brillard

article

Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2017, 8, 14 p. ⟨10.3389/fmicb.2017.01671⟩

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Genomic characterization of Ensifer aridi, a proposed new species of nitrogen-fixing rhizobium recovered from Asian, African and American deserts

auteur

Antoine Le Quere, Nisha Tak, Hukam Singh Gehlot, Céline Lavire, Thibault Meyer, David Chapulliot, Sonam Rathi, Ilham Sakrouhi, Guadalupe Rocha, Marine Rohmer, Dany Severac, Abdelkarim Filali-Maltouf, José-Antonio Munive

article

BMC Genomics, BioMed Central, 2017, 18, pp.24. ⟨10.1186/s12864-016-3447-y⟩

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