L’Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF) est un centre de recherche pluridisciplinaire.

L’activité principale de l’IGF est consacrée à la recherche fondamentale s’appuyant sur la génomique fonctionnelle pour explorer les processus normaux et pathologiques de signalisation et de communication cellulaires dans divers domaines, en particulier en neurobiologie, cardiologie, endocrinologie et oncologie.

Les principales activités vont de la pharmacologie structurale à la biologie des systèmes, du développement de modèles précliniques de maladies à la recherche translationnelle, et ce, pour étudier diverses pathologies, y compris les maladies neurologiques et psychiatriques, le dysfonctionnement cardiaque, le diabète et le cancer.

Un des principaux objectifs de l’IGF est d’identifier de nouveaux concepts en médecine moléculaire et d’évaluer de nouvelles stratégies permettant le développement d’outils diagnostiques et thérapeutiques.

Label : Unité Mixte de Recherche (UMR)
Tutelles principales : CNRS, UM, Inserm
Département scientifique : Biologie Santé
École doctorale : Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé

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CNRS
141 Rue de la Cardonille
34094 Montpellier cedex 5 France

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Publications (extraction HAL)

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Publications HAL de la structure 2001

2022

Article dans une revue

titre
Genetic control of rhizosheath formation in pearl millet
auteur
C. de la Fuente Cantó, M N Diouf, P M S Ndour, M. Debieu, A. Grondin, S. Passot, A. Champion, C. Barrachina, M. Pratlong, P. Gantet, K. Assigbetsé, N. Kane, P. Cubry, A G Diedhiou, T. Heulin, W. Achouak, Y. Vigouroux, Laurent Cournac, Laurent Laplaze
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2022, 12 (1), pp.9205. ⟨10.1038/s41598-022-13234-w⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03714569/file/de%20la%20Fuente%20Cant%C3%B3-SR-2022-CC-BY.pdf BibTex
titre
FishmiRNA: An evolutionarily supported microRNA annotation and expression database for ray-finned fishes
auteur
Thomas Desvignes, Philippe Bardou, Jérôme Montfort, Jason Sydes, Cervin Guyomar, Simon George, John H Postlethwait, Julien Bobe
article
Molecular Biology and Evolution, Oxford University Press (OUP), 2022, 39 (2), pp.msac004. ⟨10.1093/molbev/msac004⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03528022/file/desvignes_mbe_2022.pdf BibTex
titre
CRISPR/Cas9-mediated gene knockout and interallelic gene conversion in human induced pluripotent stem cells using non-integrative bacteriophage-chimeric retrovirus-like particles
auteur
Joffrey Mianné, Amel Nasri, Chloé Nguyen Van, Chloé Bourguignon, Mathieu Fieldès, Engi Ahmed, Christine Duthoit, Nicolas Martin, Hugues Parrinello, Anaïs Louis, Alexandra Iché, Régis Gayon, Florine Samain, Lucille Lamouroux, Pascale Bouillé, Arnaud Bourdin, Said Assou, John de Vos
article
BMC Biology, BioMed Central, 2022, 20 (1), pp.8. ⟨10.1186/s12915-021-01214-x⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03518180/file/2022%20Miann%C3%A9%20et%20al.%2C%20CRISPR%20et%20Cas9%20mediated.pdf BibTex

2021

Article dans une revue

titre
LIM homeobox-2 suppresses hallmarks of adult and pediatric liver cancers by inactivating MAPK/ERK and Wnt/beta-catenin pathways
auteur
Nicola Mosca, Fatma Zohra Khoubai, Sandrine Fedou, Juan Carrillo-Reixach, Stefano Caruso, Alvaro del Rio-Alvarez, Emeric Dubois, Christophe Avignon, Nathalie Dugot-Senan, Catherine Guettier, Charlotte Mussini, Jessica Zucman-Rossi, Carolina Armengol, Pierre Thiébaud, Philippe Veschambre, Christophe François Grosset
article
Liver Cancer, S. Karger, 2021, Online ahead of print. ⟨10.1159/000521595⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-03556999/file/LiveCancer521595.pdf BibTex
titre
Unraveling the genotype by environment interaction in a thermosensitive fish with a polygenic sex determination system
auteur
Benjamin Geffroy, Mathieu Besson, Núria Sánchez-Baizán, Frederic Clota, Alexander Goikoetxea, Bastien Sadoul, François Ruelle, Marie-Odile Blanc, Hugues Parrinello, Sophie Hermet, Eva Blondeau-Bidet, Marine Pratlong, Francesc Piferrer, Marc Vandeputte, François Allal
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, National Academy of Sciences, 2021, 118 (50), pp.e2112660118. ⟨10.1073/pnas.2112660118⟩
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BibTex
titre
Circulating miRNA repertoire as a biomarker of metabolic and reproductive states in rainbow trout
auteur
Emilie Cardona, Cervin Guyomar, Thomas Desvignes, Jérôme Montfort, Samia Guendouz, John H Postlethwait, Sandrine Skiba-Cassy, Julien Bobe
article
BMC Biology, BioMed Central, 2021, 19 (1), ⟨10.1186/s12915-021-01163-5⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03436712/file/2021_Cardona_BMCBiology.pdf BibTex
titre
Ensifer aridi LMR001T Symbiosis and Tolerance to Stress Do Not Require the Alternative Sigma Factor RpoE2
auteur
Meryem Belfquih, Ilham Sakrouhi, Hassan Ait-Benhassou, Emeric Dubois, Dany Severac, Abdelkarim Filali-Maltouf, Antoine Le Quere
article
Agronomy, MDPI, 2021, 11 (9), ⟨10.3390/agronomy11091787⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03443021/file/2021_Belfquih_Agronomy.pdf BibTex
titre
Concurrent BMP Signaling Maintenance and TGF-β Signaling Inhibition Is a Hallmark of Natural Resistance to Muscle Atrophy in the Hibernating Bear
auteur
Laura Cussonneau, Christian Boyer, Charlotte Brun, Christiane Deval, Emmanuelle Loizon, Emmanuelle Meugnier, Elise Gueret, Emeric Dubois, Daniel Taillandier, Cécile Polge, Daniel Béchet, Guillemette Gauquelin-Koch, Alina Evans, Jon Arnemo, Jon Swenson, Stéphane Blanc, Chantal Simon, Etienne Lefai, Fabrice Bertile, Lydie Combaret
article
Cells, MDPI, 2021, 10 (8), pp.1873. ⟨10.3390/cells10081873⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03314541/file/cells-10-01873-v2%20%281%29.pdf BibTex
titre
Ethinylestradiol (EE2) residues from birth control pills impair nervous system development and swimming behavior of zebrafish larvae
auteur
Ahmed Nasri, Ali Mezni, Pierre-André Lafon, Aymen Wahbi, Nicolas Cubedo, Philippe Clair, Abdel Halim Harrath, Hamouda Beyrem, Mireille Rossel, Véronique Perrier
article
Science of the Total Environment, Elsevier, 2021, 770, pp.145272. ⟨10.1016/j.scitotenv.2021.145272⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-03334060/file/1-s2.0-S0048969721003387-main.pdf BibTex
titre
Fra-1 regulates its target genes via binding to remote enhancers without exerting major control on chromatin architecture in triple negative breast cancers
auteur
Fabienne Bejjani, Claire Tolza, Mathias Boulanger, Damien Downes, Raphaël Romero, Muhammad Ahmad Maqbool, Amal Zine El Aabidine, Jean Christophe Andrau, Sophie Lèbre, Laurent Brehelin, Hughes Parrinello, Marine Rohmer, Tony Kaoma, Laurent Vallar, Jim r. Hughes, Kazem Zibara, Charles-Henri Lecellier, Marc Piechaczyk, Isabelle Jariel-Encontre
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2021, 49 (5), pp.2488-2508. ⟨10.1093/nar/gkab053⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03253453/file/gkab053.pdf BibTex
titre
Mutation accumulation in chromosomal inversions maintains wing pattern polymorphism in a butterfly
auteur
Paul Jay, Mathieu Chouteau, Annabel Whibley, Héloïse Bastide, Violaine Llaurens, Hugues Parrinello, Mathieu Joron
article
Nature Genetics, Nature Publishing Group, 2021, 53 (3), pp.288-293. ⟨10.1101/736504⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03425009/file/jay19biorxiv.pdf BibTex
titre
Sublethal Exposure Effects of the Neonicotinoid Clothianidin Strongly Modify the Brain Transcriptome and Proteome in the Male Moth Agrotis ipsilon
auteur
Camille Meslin, Françoise Bozzolan, Virginie Braman, Solenne Chardonnet, Cédric Pionneau, Marie-Christine François, Dany Severac, Christophe Gadenne, Sylvia Anton, Martine Maibèche, Emmanuelle Jacquin-Joly, David Siaussat
article
Insects, MDPI, 2021, 12 (2), ⟨10.3390/insects12020152⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03138710/file/Meslin%20et%20al%202021.pdf BibTex
titre
Family-effects in the epigenomic response of red blood cells to a challenge test in the European sea bass (Dicentrarchus labrax, L.)
auteur
Madoka Vera Krick, Erick Desmarais, Athanasios Samaras, Elise Guéret, Arkadios Dimitroglou, Michalis Pavlidis, Costas Tsigenopoulos, Bruno Guinand
article
BMC Genomics, BioMed Central, 2021, 22 (1), pp.111. ⟨10.1186/s12864-021-07420-9⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-03218486/file/s12864-021-07420-9.pdf BibTex
titre
Photoperiod dependent transcriptional modifications in key metabolic pathways in Coffea arabica
auteur
Doâa Djerrab, Benoit Bertrand, Jean-Christophe Breitler, Sophie Leran, Eveline Déchamp, Claudine Campa, Célia Barrachina, Genevieve Conejero, Hervé Etienne, Ronan Sulpice
article
Tree Physiology, Oxford University Press (OUP): Policy B - Oxford Open Option B, 2021, 41 (2), pp.302-316. ⟨10.1093/treephys/tpaa130⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02974057/file/tpaa130.pdf BibTex
titre
An environmentally relevant mixture of polychlorinated biphenyls (PCBs) and polybrominated diphenylethers (PBDEs) disrupts mitochondrial function, lipid metabolism and neurotransmission in the brain of exposed zebrafish and their unexposed F2 offspring
auteur
Mélanie Blanc, Sébastien Alfonso, Marie-Laure Bégout, Célia Barrachina, Tuulia Hyötyläinen, Steffen Keiter, Xavier Cousin
article
Science of the Total Environment, Elsevier, 2021, 754, pp.142097. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.142097⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03341157/file/1-s2.0-S0048969720356266-main.pdf BibTex
titre
Genetic pathways underpinning hormonal stress responses in fish exposed to short- and long-term warm ocean temperatures
auteur
Alexander Goikoetxea, Bastien Sadoul, Eva Blondeau-Bidet, Johan Aerts, Marie-Odile Blanc, Hugues Parrinello, Célia Barrachina, Marine Pratlong, Benjamin Geffroy
article
Ecological Indicators, Elsevier, 2021, 120, pp.106937. ⟨10.1016/j.ecolind.2020.106937⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03147019/file/1-s2.0-S1470160X20308761-main.pdf BibTex
titre
Convergent morphology and divergent phenology promote the coexistence of Morpho butterfly species
auteur
Camille Le Roy, Camille Roux, Elisabeth Authier, Hugues Parrinello, Héloïse Bastide, Vincent Debat, Violaine Llaurens
article
Nature Communications, Nature Publishing Group, 2021, 12 (1), pp.7248. ⟨10.1038/s41467-021-27549-1⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03655196/file/Le%20Roy%20et%20al%202021%20Nature%20Com.pdf BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
The NADPH oxidase NOX2 is a marker of adverse prognosis involved in chemoresistance of Acute Myeloid Leukemias
auteur
Paolillo Rosa, Mathias Boulanger, Gâtel Pierre, Gabellier Ludovic, Tempé Denis, Hallal Rawan, de Toledo Marion, Moreaux Jérome, Baik Hayeon, Elise Gueret, Récher Christian, Sarry Jean-Emmanuel, Cartron Guillaume, Marc Piechaczyk, Bossis Guillaume
article
2021
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https://hal.umontpellier.fr/hal-03431962/file/Paolillo%20et%20al.pdf BibTex
titre
Autoregulation dependent and independent mechanisms are responsible for the systemic control of nodule formation by the plant N demand
auteur
Marjorie Pervent, Ilana Lambert, Marc Tauzin, Alicia Karouani, Martha Nigg, Marie-Françoise Jardinaud, Dany Severac, Stefano Colella, Marie-Laure Martin-Magniette, Marc Lepetit
article
2021
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BibTex

2020

Article dans une revue

titre
Sex chromosome and sex locus characterization in goldfish, Carassius auratus (Linnaeus, 1758)
auteur
Ming Wen, Romain Feron, Qiaowei Pan, Justine Guguin, Elodie Jouanno, Amaury Herpin, Christophe C. Klopp, Cédric Cabau, Margot Zahm, Hugues Parrinello, Laurent Journot, Shawn M Burgess, Yoshihiro Omori, John H Postlethwait, Manfred Schartl, Yann Guiguen
article
BMC Genomics, BioMed Central, 2020, 21 (1), pp.1-12. ⟨10.1186/s12864-020-06959-3⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02937875/file/2020_BMCGenomics_Wen.pdf BibTex
titre
LifeTime and improving European healthcare through cell-based interceptive medicine
auteur
Nikolaus Rajewsky, Geneviève Almouzni, Stanislaw Gorski, Stein Aerts, Ido Amit, Michela Bertero, Christoph Bock, Annelien Bredenoord, Giacomo Cavalli, Susanna Chiocca, Hans Clevers, Bart de Strooper, Angelika Eggert, Jan Ellenberg, Xosé Fernández, Marek Figlerowicz, Susan Gasser, Norbert Hubner, Jørgen Kjems, Jürgen Knoblich, Grietje Krabbe, Peter Lichter, Sten Linnarsson, Jean-Christophe Marine, John Marioni, Marc Marti-Renom, Mihai Netea, Dörthe Nickel, Marcelo Nollmann, Halina Novak, Helen Parkinson, Stefano Piccolo, Inês Pinheiro, Ana Pombo, Christian Popp, Wolf Reik, Sergio Roman-Roman, Philip Rosenstiel, Joachim Schultze, Oliver Stegle, Amos Tanay, Giuseppe Testa, Dimitris Thanos, Fabian Theis, Maria-Elena Torres-Padilla, Alfonso Valencia, Céline Vallot, Alexander van Oudenaarden, Marie Vidal, Thierry Voet, Monsef Benkirane, Laurent Journot
article
Nature, Nature Publishing Group, 2020, 587 (7834), pp.377-386. ⟨10.1038/s41586-020-2715-9⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02999344/file/LifeTime_white_paper_Revision_ACCEPTED.pdf BibTex
titre
Differential immune gene expression associated with contemporary range expansion of two invasive rodents in Senegal
auteur
Nathalie Charbonnel, Maxime Galan, Caroline Tatard, Anne Loiseau, Christophe Amidi Diagne, Ambroise Dalecky, Hugues Parrinello, Stéphanie Rialle, Dany Severac, Carine Brouat
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2020, Peer Community in Ecology, 10, pp.18257. ⟨10.1101/442160⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02790736/file/s41598-020-75060-2.pdf BibTex
titre
Quantifying Genomic Imprinting at Tissue and Cell Resolution in the Brain
auteur
Annie Varrault, Emeric Dubois, Anne Le Digarcher, Tristan Bouschet
article
Epigenomes, MDPI, 2020, 4 (3), pp.21. ⟨10.3390/epigenomes4030021⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03364539/file/epigenomes-04-00021-v2.pdf BibTex
titre
Responses of mature symbiotic nodules to the whole-plant systemic nitrogen signaling
auteur
Ilana Lambert, Marjorie Pervent, Antoine Le Quéré, Gilles Clement, Marc Tauzin, Dany Severac, Claire Benezech, Pascal Tillard, Marie-Laure Martin-Magniette, Stefano Colella, Marc Lepetit
article
Journal of Experimental Botany, Oxford University Press (OUP), 2020, 71 (16), pp.5039-5052. ⟨10.1093/jxb/eraa221⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02921428/file/eraa221.pdf BibTex
titre
In vitro shared transcriptomic responses of Aedes aegypti to arboviral infections: example of dengue and Rift Valley fever viruses
auteur
Séverine Licciardi, Etienne Loire, Eric Cardinale, Marie Gislard, Emeric Dubois, Catherine Cêtre-Sossah
article
Parasites and Vectors, BioMed Central, 2020, 13 (1), pp.395. ⟨10.1186/s13071-020-04253-5⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02914990/file/s13071-020-04253-5.pdf BibTex
titre
A transposon story : from TE content to TE dynamic invasion of Drosophila genomes using the single-molecule sequencing technology from Oxford Nanopore
auteur
Mohamed Mourdas, Nguyet Thi-Minh Dang, Yuki Ogyama, Nelly Burlet, Bruno Mugat, Matthieu Boulesteix, Vincent Mérel, Philippe Veber, Judit Salces-Ortiz, Dany Severac, Alain Pélisson, Cristina Vieira, François Sabot, Marie Fablet, Séverine Chambeyron
article
Cells, MDPI, 2020, 9 (8), pp.1776. ⟨10.3390/cells9081776⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02905128/file/cells-864342-revised.pdf BibTex
titre
TALC: Transcript-level Aware Long-read Correction
auteur
Lucile Broseus, Aubin Thomas, Andrew Oldfield, Dany Severac, Emeric Dubois, William Ritchie
article
Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2020, ⟨10.1093/bioinformatics/btaa634⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03070194/file/btaa634%281%29.pdf BibTex
titre
The role of copy-number variation in the reinforcement of sexual isolation between the two European subspecies of the house mouse
auteur
Henry North, Pierre Caminade, Dany Severac, Khalid Belkhir, Carole Smadja
article
Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, Royal Society, The, 2020, 375 (1806), pp.20190540. ⟨10.1098/rstb.2019.0540⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02565709/file/North%20et%20al._Philosophical%20Transactions%20of%20the%20Royal%20Society%20B%20Biological%20Sciences_2020.pdf BibTex
titre
Dopamine D2-Like Receptors Modulate Intrinsic Properties and Synaptic Transmission of Parvalbumin Interneurons in the Mouse Primary Motor Cortex
auteur
Jérémy Cousineau, Léa Lescouzères, Anne Taupignon, Lorena Delgado-Zabalza, Emmanuel Valjent, Jérôme Baufreton, Morgane Le Bon-Jégo
article
eNeuro, Society for Neuroscience, 2020, 7 (3), pp.ENEURO.0081-20.2020. ⟨10.1523/ENEURO.0081-20.2020⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02988866/file/Cousineau2020eNeuro.pdf BibTex
titre
Transcriptome of tambaqui Colossoma macropomum during gonad differentiation: Different molecular signals leading to sex identity
auteur
Igor Kelvyn Cavalcante Lobo, Aquila Rodrigues Do Nascimento, Michel Eduardo Beleza Yamagishi, Yann Guiguen, Gilvan Ferreira Da Silva, Dany Severac, Aldessandro da Costa Amaral, Vanessa Ribeiro Reis, Fernanda Loureiro De Almeida
article
Genomics, Elsevier, 2020, 112 (3), pp.2478-2488. ⟨10.1016/j.ygeno.2020.01.022⟩
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BibTex
titre
Lamin C Counteracts Glucose Intolerance in Aging, Obesity, and Diabetes Through β-Cell Adaptation
auteur
Marion de Toledo, Isabel C. Lopez-Mejia, Patricia Cavelier, Marine Pratlong, Célia Barrachina, Xavier Gromada, Jean-Sébastien Annicotte, Jamal Tazi, Carine Chavey
article
Diabetes, American Diabetes Association, 2020, 69 (4), pp.647-660. ⟨10.2337/db19-0377⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03065207/file/de%20Toledo%20et%20al.%20-%202020%20-%20Lamin%20C%20Counteracts%20Glucose%20Intolerance%20in%20Aging%2C%20.pdf BibTex
titre
A Sustained Immune Response Supports Long-Term Antiviral Immune Priming in the Pacific Oyster, Crassostrea gigas
auteur
Maxime Lafont, Agnès Vergnes, Jeremie Vidal-Dupiol, Julien de Lorgeril, Yannick Guéguen, Philippe Haffner, Bruno Petton, Cristian Chaparro, Célia Barrachina, Delphine Destoumieux-Garzón, Guillaume Mitta, Benjamin Gourbal, Caroline Montagnani
article
mBio, American Society for Microbiology, 2020, ⟨10.1128/mBio.02777-19⟩
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titre
Genome sequence of the euryhaline Javafish Medaka, Oryzias javanicus: A small aquarium fish model for studies on adaptation to salinity
auteur
Yusuke Takehana, Margot Zahm, Cédric Cabau, Christophe C. Klopp, Céline Roques, Olivier Bouchez, Cécile Donnadieu, Célia Barrachina, Laurent Journot, Mari Kawaguchi, Shigeki Yasumasu, Satoshi Ansai, Kiyoshi Naruse, Koji Inoue, Chuya Shinzato, Manfred Schartl, Yann Guiguen, Amaury Herpin
article
G3, Genetics Society of America, 2020, 10 (3), pp.907-915. ⟨10.1534/g3.119.400725⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02624885/file/907.full.pdf BibTex
titre
Post-production modifications of murine mesenchymal stem cell (mMSC) derived extracellular vesicles (EVs) and impact on their cellular interaction
auteur
Sarah Le Saux, Hanna Aarrass, Josephine Lai-Kee-Him, Patrick Bron, J. Armengaud, Guylaine Miotello, Justine Bertrand-Michel, Emeric Dubois, Simon George, Orestis Faklaris, Jean-Marie Devoisselle, Philippe Legrand, Joel Chopineau, Marie Morille
article
Biomaterials, Elsevier, 2020, 231, pp.119675. ⟨10.1016/j.biomaterials.2019.119675⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02414428/file/S0142961219307744.pdf BibTex
titre
TAG-RNAi overcomes off-target effects in cancer models
auteur
Julien Champagne, Laetitia K. Linares, Benjamin Maurel, Alexandre Zampieri, Maeva Moreno, Ivanna Fuentes, Emeric Dubois, Dany Severac, Adrien Decorsière, Frédéric Bienvenu
article
Oncogene, Nature Publishing Group, 2020, 39 (4), pp.935-945. ⟨10.1038/s41388-019-1020-2⟩
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BibTex
titre
The sterlet sturgeon genome sequence and the mechanisms of segmental rediploidization
auteur
Kang Du, Matthias Stöck, Susanne Kneitz, Christophe C. Klopp, Joost Woltering, Mateus Contar Adolfi, Romain Feron, Dmitry Prokopov, Alexey Makunin, Ilya Kichigin, Cornelia Schmidt, Petra Fischer, Heiner Kuhl, Sven Wuertz, Jörn Gessner, Werner Kloas, Cédric Cabau, Carole Iampietro, Hugues Parrinello, Chad Tomlinson, Laurent Journot, John Postlethwait, Ingo Braasch, Vladimir Trifonov, Wesley C Warren, Axel Meyer, Yann Guiguen, Manfred Schartl
article
Nature Ecology & Evolution, Nature, 2020, 4 (6), pp.841-852. ⟨10.1038/s41559-020-1166-x⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02640938/file/s41559-020-1166-x.pdf BibTex
titre
Near-chromosome level genome assembly of the fruit pest Drosophila suzukii using long-read sequencing
auteur
Mathilde Paris, Roxane Boyer, Rita Jaenichen, Jochen Wolf, Marianthi Karageorgi, Jack Green, Mathilde Cagnon, Hugues Parrinello, Arnaud Estoup, Mathieu Gautier, Nicolas Gompel, Benjamin Prud’homme
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2020, 10 (1), pp.11227. ⟨10.1038/s41598-020-67373-z⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02908174/file/2020_paris_scientific_report.pdf BibTex
titre
Routine CYP2C19 genotyping to adjust antiplatelet therapy
auteur
Jean-Sébastien Hulot, Bernard Chevalier, Loic Belle, Guillaume Cayla, Khalife Khalife, François Funck, Romain Berthier, Christophe Piot, Muriel Tafflet, Gilles Montalescot
article
JACC: Cardiovascular Interventions, Elsevier/American College of Cardiology, In press, ⟨10.1016/j.jcin.2020.01.219⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02474384/file/Routine%20CYP2C19%20Genotyping%20to%20Adjust%20Thienopyridine%20Treatment%20after%20primary%20PCI%20for%20STelevation.pdf BibTex
titre
A whole-genome scan for association with invasion success in the fruit fly Drosophila suzukii using contrasts of allele frequencies corrected for population structure
auteur
Laure Olazcuaga, Anne Loiseau, Hugues Parrinello, Mathilde Paris, Antoine Fraimout, Christelle Guedot, Lauren M Diepenbrock, Marc Kenis, Jinping Zhang, Xiao Chen, Nicolas Borowiec, Benoit Facon, Heidrun Vogt, Donald K Price, Heiko Vogel, Benjamin Prud’homme, Arnaud Estoup, Mathieu Gautier
article
Molecular Biology and Evolution, Oxford University Press (OUP), 2020, 37 (8), pp.2369-2385. ⟨10.1093/molbev/msaa098⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-02563272/file/2020_olazcuaga_molecular_biology_and_evolution.pdf BibTex
titre
LIX1 regulates YAP activity and controls gastrointestinal cancer cell plasticity
auteur
Amandine Guérin, Delphine Martire, Eva Trenquier, Tom Lesluyes, Sébastien Sagnol, Marine Pratlong, Elise Lefebvre, Frédéric Chibon, Pascal de Santa Barbara, Sandrine Faure
article
Journal of Cellular and Molecular Medicine, Wiley Open Access, 2020, ⟨10.1111/jcmm.15569⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02893572/file/Guerin%20et%20al%202020.pdf BibTex
titre
Seed comparative genomics in three coffee species identify desiccation tolerance mechanisms in intermediate seeds
auteur
Anna K Stavrinides, Stéphane Dussert, Marie-Christine Combes, Isabelle Fock-Bastide, Dany Severac, Jérôme Minier, Aldecinei Bastos-Siqueira, Vincent Demolombe, Sonia Hem, Philippe Lashermes, Thierry Joët
article
Journal of Experimental Botany, Oxford University Press (OUP), 2020, 71 (4), pp.1-16/erz508. ⟨10.1093/jxb/erz508⟩
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https://hal.univ-reunion.fr/hal-02403786/file/erz508.pdf BibTex

Thèse

titre
Réseaux de protéines associés aux récepteurs de la sérotonine : rôle et options thérapeutiques pour la Maladie d'Alzheimer
auteur
Hugo Payan
article
Médecine humaine et pathologie. Université Montpellier, 2020. Français. ⟨NNT : 2020MONTT012⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-03629349/file/2020_PAYAN_archivage.pdf BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
A genome-wide CRISPR/Cas9 knock-out screen identifies the DEAD box RNA helicase DDX42 as a broad antiviral inhibitor
auteur
Boris Bonaventure, Antoine Rebendenne, Francisco Garcia de Gracia, Marine Tauziet, Joe Mckellar, Ana Luiza Chaves Valadão, Valérie Courgnaud, Eric Bernard, Laurence Briant, Nathalie Gros, Wassila Djilli, Mary Arnaud-Arnould, Hugues Parrinello, Stéphanie Rialle, Olivier Moncorgé, Caroline Goujon
article
2020
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03017363/file/BioRXiv%20Bonaventure%20et%20al.pdf BibTex
titre
The genomic basis of colour pattern polymorphism in the harlequin ladybird
auteur
Mathieu Gautier, Junichi Yamaguchi, Julien Foucaud, Anne Loiseau, Aurélien Ausset, Benoit Facon, Bernhard Gschloessl, Jacques Lagnel, Etienne Loire, Hugues Parrinello, Dany Severac, Celine Lopez-Roques, Cecile Donnadieu, Maxime Manno, Helene Berges, Karim Gharbi, Lori Lawson-Handley, Lian-Sheng Zang, Heiko Vogel, Arnaud A Estoup, Benjamin Prud'Homme Ben
article
2020
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https://hal.inrae.fr/hal-02791082/file/publis18-pvbmt-004_genomic_foucaud_1.pdf BibTex

2019

Article dans une revue

titre
Both anti-inflammatory and antiviral properties of novel drug candidate ABX464 are mediated by modulation of RNA splicing
auteur
Audrey Vautrin, Laurent Manchon, Aude Garcel, Noëlie Campos, Laure Lapasset, Abdelhamid Mahdi Laaref, Roman Bruno, Marie Gislard, Emeric Dubois, Didier Scherrer, J Hartmut Ehrlich, Jamal Tazi
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-018-37813-y⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02867141/file/s41598-018-37813-y.pdf BibTex
titre
Postnatal Tshz3 Deletion Drives Altered Corticostriatal Function and Autism Spectrum Disorder–like Behavior
auteur
Dorian Chabbert, Xavier Caubit, Pierre L. Roubertoux, Michèle Carlier, Bianca Habermann, Bernard Jacq, Pascal Salin, Mehdi Metwaly, Christina Frahm, Ahmed Fatmi, Alistair N Garratt, Dany Severac, Emeric Dubois, Lydia Kerkerian-Le Goff, Laurent Fasano, Paolo Gubellini
article
Biological Psychiatry, Elsevier, 2019, 86 (4), pp.274-285. ⟨10.1016/j.biopsych.2019.03.974⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02323149/file/2019_Chabbert_BiolPsy_Tshz3postnat.pdf BibTex
titre
ISoLDE: a data-driven statistical method for the inference of allelic imbalance in datasets with reciprocal crosses
auteur
Christelle Reynes, Guilhem Kister, Marine Rohmer, Tristan Bouschet, Annie Varrault, Emeric Dubois, Stéphanie Rialle, Laurent Journot, Robert Sabatier
article
Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2019, 36 (2), pp.504-513. ⟨10.1093/bioinformatics/btz564⟩
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BibTex
titre
Transcriptomic Analysis With the Progress of Symbiosis in ‘Crack-Entry’ Legume Arachis hypogaea Highlights Its Contrast With ‘Infection Thread’ Adapted Legumes
auteur
Kanchan Karmakar, Anindya Kundu, Ahsan Z. Rizvi, Emeric Dubois, Dany Severac, Pierre Czernic, Fabienne Cartieaux, Maitrayee Dasgupta
article
Molecular Plant-Microbe Interactions, American Phytopathological Society, 2019, 32 (3), pp.271-285. ⟨10.1094/MPMI-06-18-0174-R⟩
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BibTex
titre
The genome of the arapaima (Arapaima gigas) provides insights into gigantism, fast growth and chromosomal sex determination system
auteur
Kang Du, Sven Wuertz, Mateus Adolfi, Susanne Kneitz, Matthias Stöck, Marcos Oliveira, Rafael Nóbrega, Jenny Ormanns, Werner Kloas, Romain Feron, Christophe C. Klopp, Hugues Parrinello, Laurent Journot, Shunping He, John Postlethwait, Axel Meyer, Yann Guiguen, Manfred Schartl
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), pp.1-11. ⟨10.1038/s41598-019-41457-x⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02090589/file/Du_2019_ScientReports.pdf BibTex
titre
Draft genome assembly and annotation of the gila topminnow Poeciliopsis occidentalis
auteur
Mariana Mateos, Du Kang, Christophe C. Klopp, Hugues Parrinello, Mateo Garcia-Olazabal, Molly Schumer, Nathaniel K. Jue, Yann Guiguen, Manfred Schartl
article
Frontiers in Ecology and Evolution, Frontiers Media S.A, 2019, 7, pp.1-7. ⟨10.3389/fevo.2019.00404⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02620825/file/Poeciliopsis%20occidentalis%20genome%20draft_1.pdf BibTex
titre
What makes a bad egg? Egg transcriptome reveals dysregulation of translational machinery and novel fertility genes important for fertilization
auteur
Caroline Cheung, Thuy Thao Vi Nguyen, Aurélie Le Cam, Amélie Patinote, Laurent Journot, Christelle Reynes, Julien Bobe
article
BMC Genomics, BioMed Central, 2019, 20:584 (1), pp.1-14. ⟨10.1186/s12864-019-5930-8⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02185873/file/2019_Cheung_BMC_Genomics.pdf BibTex
titre
Spodoptera frugiperda transcriptional response to infestation by Steinernema carpocapsae
auteur
Louise Huot, Simon George, Pierre-Alain Girard, Dany Severac, Nicolas Nègre, Bernard Duvic
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), 13 p. ⟨10.1038/s41598-019-49410-8⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02306099/file/Huot-2019-Spodoptera%20frugiperda%20transcriptiona.pdf BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
Sex chromosome and sex locus characterization in the goldfish, Carassius auratus
auteur
Ming Wen, Romain Feron, Qiaowei Pan, Justine Guguin, Elodie Jouanno, Amaury Herpin, Christophe C. Klopp, Cédric Cabau, Margot Zahm, Hugues Parrinello, Laurent Journot, Shawn M. Burgess, Yoshihiro Omori, John Postlethwait, Manfred Schartl, Yann Guiguen
article
2019
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https://hal.inrae.fr/hal-02790844/file/2019_MingWen_BioRxiv_1.pdf BibTex
titre
Genome sequence of the euryhaline Javafish medaka, Oryzias javanicus: a small aquarium fish model for studies on adaptation to salinity
auteur
Yusuke Takehana, Margot Zahm, Cédric Cabau, Christophe C. Klopp, Céline Roques, Olivier Bouchez, Cécile Donnadieu, Célia Barrachina, Laurent Journot, Mari Kawaguchi, Shigeki Yasumasu, Satoshi Ansai, Kiyoshi Naruse, Koji Inoue, Chuya Shinzato, Manfred Schartl, Yann Guiguen, Amaury Herpin
article
2019
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https://hal.inrae.fr/hal-02790965/file/2019_Takehana_BioRxiv_1.pdf BibTex

2018

Article dans une revue

titre
Characterization and expression profiling of microRNAs in response to plant feeding in two host-plant strains of the lepidopteran pest Spodoptera frugiperda
auteur
Yves Moné, Sandra Nhim, Sylvie Gimenez, Fabrice Legeai, Imène Séninet, Hugues Parrinello, Nicolas Negre, Emmanuelle d'Alençon
article
BMC Genomics, BioMed Central, 2018, 19 (1), pp.1-15. ⟨10.1186/s12864-018-5119-6⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01926342/file/s12864-018-5119-6 BibTex
titre
High-salt Recovered Sequences are associated with the active chromosomal compartment and with large ribonucleoprotein complexes including nuclear bodies
auteur
Marie Baudement, Axel Cournac, Franck Court, Marie Seveno, Hugues Parrinello, Christelle Reynes, Robert Sabatier, Tristan Bouschet, Zhou Yi, Sephora Sallis, Mathilde Tancelin, Cosette Rebouissou, Guy Cathala, Annick Lesne, Julien Mozziconacci, Laurent Journot, Thierry Forné
article
Genome Research, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2018, 28 (11), pp.1733 - 1746. ⟨10.1101/gr.237073.118⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01912447/file/Baudement_et_al_2018.pdf BibTex
titre
SNAP23-Kif5 complex controls mGlu1 receptor trafficking
auteur
F. Raynaud, Vincent Homburger, Martial Séveno, Oana Vigy, Enora Moutin, Laurent Fagni, Julie Perroy
article
Journal of molecular cell biology, Oxford UP, 2018, 10, pp.423 - 436. ⟨10.1093/jmcb/mjy031⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-01816297/file/SNAP23%E2%80%93Kif5.pdf BibTex
titre
Transcriptome profiling of the honeybee parasite Varroa destructor provides new biological insights into the mite adult life cycle
auteur
Fanny Mondet, Andrea Rau, Christophe C. Klopp, Marine Rohmer, Dany Severac, Yves Le Conte, Cédric Alaux
article
BMC Genomics, BioMed Central, 2018, 19 (1), pp.328. ⟨10.1186/s12864-018-4668-z⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-02063466/file/s12864-018-4668-z.pdf BibTex
titre
Changes in chromatin state reveal ARNT2 at a node of a tumorigenic transcription factor signature driving glioblastoma cell aggressiveness
auteur
Alexandra Bogeas, Ghislaine Morvan-Dubois, Elías El-Habr, François-Xavier Lejeune, Matthieu Defrance, Ashwin Narayanan, Klaudia Kuranda, Fanny Burel-Vandenbos, Salwa Sayd, Virgile Delaunay, Luiz Dubois, Hugues Parrinello, Stéphanie Rialle, Sylvie Fabrega, Ahmed Idbaih, Jacques Haiech, Ivan Bièche, Thierry Virolle, Michele Goodhardt, Herve Chneiweiss, Marie-Pierre Junier
article
Acta Neuropathologica, Springer Verlag, 2018, 135 (2), pp.267-283. ⟨10.1007/s00401-017-1783-x⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-02368647/file/Bogeas2018_Article_ChangesInChromatinStateRevealA.pdf BibTex
titre
Lysosomal and network alterations in human mucopolysaccharidosis type VII iPSC-derived neurons
auteur
Neus Bayo-Puxan, Ana Paula Terrasso, Sophie Creyssels, Daniel Simao, Christina Begon-Pescia, Marina Lavigne, Sara Salinas, Florence F. Bernex, Assumpció Bosch, Vasiliki Kalatzis, Thierry Levade, Ana Maria Cuervo, Philippe Lory, Antonella Consiglio, Catarina Brito, Eric J. Kremer
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2018, 8, pp.16644. ⟨10.1038/s41598-018-34523-3⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02090806/file/Lysosomal%20and%20network%20alterations.pdf BibTex
titre
Transcriptomic response of female adult moths to host and non-host plants in two closely related species
auteur
Marion Orsucci, Philippe Audiot, Sabine Nidelet, Franck Dorkeld, Alexandra Pommier, Marin Vabre, Dany Severac, Marine Rohmer, Bernhard Gschloessl, Rejane Streiff
article
BMC Evolutionary Biology, BioMed Central, 2018, 18, ⟨10.1186/s12862-018-1257-3⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01918051/file/Publis18-cbgp-060_orsucci_transcriptomic_1.pdf BibTex
titre
Larval transcriptomic response to host plants in two related phytophagous lepidopteran species: implications for host specialization and species divergence
auteur
Marion Orsucci, Philippe Audiot, Franck Dorkeld, Alexandra Pommier, Marin Vabre, Bernhard Gschloessl, Stéphanie Rialle, Dany Severac, Denis Bourguet, Rejane Streiff
article
BMC Genomics, BioMed Central, 2018, 19, ⟨10.1186/s12864-018-4589-x⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01837316/file/document%286%29.pdf BibTex
titre
Enhanced brain expression of genes related to cell proliferation and neural differentiation is associated with cortisol receptor expression in fishes
auteur
Bastien Sadoul, S. Alfonso, E. Bessa, A. Bouchareb, E. Blondeau-Bidet, Philippe Clair, B. Chatain, M. L. Begout, B. Geffroy
article
General and Comparative Endocrinology, Elsevier, 2018, 267, pp.76-81. ⟨10.1016/j.ygcen.2018.06.001⟩
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BibTex
titre
The Genomic Basis of Color Pattern Polymorphism in the Harlequin Ladybird
auteur
Mathieu Gautier, Junichi Yamaguchi, Julien Foucaud, Anne Loiseau, Aurélien Ausset, Benoit Facon, Bernhard Gschloessl, Jacques Lagnel, Etienne Loire, Hugues Parrinello, Dany Severac, Celine Lopez-Roques, Cecile Donnadieu, Maxime Manno, Helene Berges, Karim Gharbi, Lori Lawson-Handley, Lian-Sheng Zang, Heiko Vogel, Arnaud Estoup, Benjamin Prud’homme
article
Current Biology - CB, Elsevier, 2018, 28 (20), pp.1-7. ⟨10.1016/j.cub.2018.08.023⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01864435/file/gautier.current.biology.2018.pdf BibTex
titre
Transcriptome Profiles of Nod Factor-independent Symbiosis in the Tropical Legume Aeschynomene evenia
auteur
Djamel Gully, Pierre Czernic, Stéphane Cruveiller, Frédéric Mahé, Cyrille Longin, David Vallenet, Philippe François, Sabine Nidelet, Stéphanie Rialle, Eric Giraud, Jean-François Arrighi, Maitrayee Dasgupta, Fabienne Cartieaux
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2018, 8 (1), pp.10934. ⟨10.1038/s41598-018-29301-0⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02506906/file/s41598-018-29301-0.pdf BibTex
titre
Parent-of-Origin Dependent Gene Expression in Male and Female Schistosome Parasites
auteur
Julien Kincaid-Smith, Marion A.-L. Picard, Celine Cosseau, Jerome Boissier, Dany Severac, Christoph Grunau, Eve Toulza
article
Genome Biology and Evolution, Society for Molecular Biology and Evolution, In press, 10 (3), pp.840-856. ⟨10.1093/gbe/evy037⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01729365/file/Kincaid-2018-GenBiolEvol-Parent.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Transcriptome profiling of the honeybee parasite Varroa destructor provides new biological insights into the mite adult life cycle
auteur
Fanny Mondet, Andrea Rau, Christophe C. Klopp, Marine Rohmer, Dany Severac, Yves Le Conte, Cédric Alaux
article
Eurbee 2018 : 8th European Conference of Apidology, Sep 2018, Gent, Belgium
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BibTex
titre
Molecular portrait of egg quality and novel maternal-effect genes
auteur
Caroline Cheung, Thuy Thao Vi Nguyen, Aurélie Le Cam, Amélie Patinote, D. Zarski, Laurent Journot, Christelle Reynes, Julien Bobe
article
11. International Symposium on Reproductive Physiology of Fish, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA). Manaus, BRA, Jun 2018, Manaus, Brazil. 251 p
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01809604/file/2018_Cheung_ISRF_1.pdf BibTex
titre
Sex determination diversity in fish
auteur
M. Adolfi, Anabel Martinez-Bengochea, A.S. Roco, V. Kottler, - Du, K., S. Kneitz, Qiaowei Pan, Romain Feron, Elodie Jouanno, Ming Wen, Boudjema Imarazene, Jennifer Anderson, Z. Wang, C. Wilson, B. Mccluskey, A. Amores, T. Desvignes, Christophe C. Klopp, Celine Lopez-Roques, O. Chabrol, Cecile Donnadieu, Hugues Parrinello, Laurent Journot, Amaury Herpin, J. Postlethwait, Yann Guiguen, M. Schartl
article
11. International Symposium on Reproductive Physiology of Fish, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA). Manaus, BRA., Jun 2018, Manaus, Brazil. 251 p
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https://hal.inrae.fr/hal-02737595/file/2018_Adolfi_ISRF_1.pdf BibTex
titre
Genome-wide approaches to elucidate evolution of sex determination systems and sex determining genes in fish
auteur
Qiaowei Pan, Romain Feron, Elodie Jouanno, Ming Wen, Boudjema Imarazene, Jennifer Anderson, Verena A. Kottler, Alvaro Santacruz Roco, Kang Du, Suzanne Kneitz, Zhongwei Wang, Mateus C. Adolfi, Catherine Wilson, Braedan M. Mccluskey, Angel Amores, Thomas Desvignes, Christophe C. Klopp, Celine Lopez-Roques, Olivier Chabrol, Cecile Donnadieu, Hugues Parrinello, Laurent Journot, Amaury Herpin, John H Postlethwait, Manfred Schartl, Yann Guiguen
article
8. International Symposium on the Biology of Vertebrate Sex Determination, Apr 2018, Kona (Hawaii), United States
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https://hal.inrae.fr/hal-02733991/file/2018_Pan_ISBVSD_Kona_1.pdf BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
Lost in translation: egg transcriptome reveals molecular signature to predict developmental success and novel maternal-effect genes
auteur
Caroline T. Cheung, Thuy Thao Vi Nguyen, Aurélie Le Cam, Amélie Patinote, Laurent Journot, Christelle Reynes, Julien Bobe
article
2018
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-03169273/file/2018_Cheung_BioXriv.pdf BibTex
titre
Transcriptional plasticity evolution in two strains of Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae) feeding on alternative host-plants
auteur
Marion Orsucci, Yves Moné, Philippe Audiot, Sylvie Gimenez, Sandra Nhim, Rima Nait-Saidi, Marie Frayssinet, Guillaume Dumont, Alexandra Pommier, Jean Paul Boudon, Marin Vabre, Stéphanie Rialle, R. Kouad, Gael Kergoat, R. N. Nagoshi, R Meagher, Emmanuelle d'Alençon, Nicolas Nègre
article
2018
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https://hal.inrae.fr/hal-02790065/file/Orsucci_2018_1.pdf BibTex

2017

Article dans une revue

titre
Initiation of DNA replication requires actin dynamics and formin activity
auteur
Nikolaos Parisis, Liliana Krasinska, Bethany Harker, Serge Urbach, Michel Rossignol, Alain Camasses, James Dewar, Nathalie Morin, Daniel Fisher
article
EMBO Journal, EMBO Press, 2017, 36 (21), pp.3212--3231. ⟨10.15252/embj.201796585⟩
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BibTex
titre
Characterization of microRNAs from Arabidopsis galls highlights a role for miR159 in the plant response to the root-knot nematode Meloidogyne incognita
auteur
Clémence Medina, Martine da Rocha, Marc Magliano, Alizée Ratpopoulo, Benoît Revel, Nathalie Marteu, Virginie Magnone, Kevin Lebrigand, Javier Cabrera, Marta Barcala, Ana Cláudia Silva, Anthony Millar, Carolina Escobar, Pierre Abad, Bruno Favery, Stéphanie Jaubert-Possamai
article
New Phytologist, Wiley, 2017, 216 (3), pp.882-896. ⟨10.1111/nph.14717⟩
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BibTex
titre
Do changes in gene expression contribute to sexual isolation and reinforcement in the house mouse?
auteur
Etienne Loire, Sergio Tusso, Pierre Caminade, Dany Severac, Pierre Boursot, Guila Ganem, Carole Smadja
article
Molecular Ecology, Wiley, 2017, 26 (19), pp.5189 - 5202. ⟨10.1111/mec.14212⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-01815471/file/Loire_et_al_2017_Molecular-Ecology_HAL.pdf BibTex
titre
Targeting the Wnt Pathway and Cancer Stem Cells with Anti-progastrin Humanized Antibodies as a Potential Treatment for K-RAS-Mutated Colorectal Cancer
auteur
Alexandre Prieur, Monica Cappellini, Guillaume Habif, Marie-Paule Lefranc, Thibault Mazard, Eric Morency, Jean-Marc Pascussi, Maud Flacelière, Nathalie Cahuzac, Bérengère Vire, Benjamin Dubuc, Amandine Durochat, Pierre Liaud, Jérémy Ollier, Caroline Pfeiffer, Sophie Poupeau, Véronique Saywell, Chris Planque, Eric Assenat, Frédéric Bibeau, Jean-François Bourgaux, Pascal Pujol, Alain Sézeur, Marc Ychou, Dominique Joubert
article
Clinical Cancer Research, American Association for Cancer Research, 2017, 23 (17), pp.5267--5280. ⟨10.1158/1078-0432.CCR-17-0533⟩
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BibTex
titre
Dynamics of H3K4me3 Chromatin Marks Prevails over H3K27me3 for Gene Regulation during Flower Morphogenesis in Arabidopsis thaliana
auteur
Julia Engelhorn, Robert Blanvillain, Christian Kröner, Hugues Parrinello, Marine Rohmer, David Posé, Felix Ott, Markus Schmid, Cristel Carles
article
Epigenomes, MDPI, 2017, 1 (2), pp.8. ⟨10.3390/epigenomes1020008⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01744808/file/epigenomes-01-00008-v2.pdf BibTex
titre
Transcriptome and proteome analysis reveal new insight into proximal and distal responses of wheat to foliar infection by Xanthomonas translucens
auteur
Daniel Garçia Seco, Marco Chiapello, Marcella Bracale, Céline Pesce, Paolo Bagnaresi, Emeric Dubois, Lionel Moulin, Candida Vannini, Ralf Koebnik
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2017, 7 (1), pp.10157. ⟨10.1038/s41598-017-10568-8⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03626122/file/s41598-017-10568-8.pdf BibTex
titre
HEXIM1 and NEAT1 Long Non-coding RNA Form a Multi-subunit Complex that Regulates DNA-Mediated Innate Immune Response
auteur
Mehdi Morchikh, Alexandra Cribier, Raoul Raffel, Sonia Amraoui, Julien Cau, Dany Severac, Emeric Dubois, Olivier Schwartz, Yamina Bennasser, Monsef Benkirane
article
Molecular Cell, Cell Press, 2017, 67 (3), pp.387-399. ⟨10.1016/j.molcel.2017.06.020⟩
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BibTex
titre
Native metabotropic glutamate receptor 4 depresses synaptic transmission through an unusual Gαq transduction pathway.
auteur
Solenne Chardonnet, Thomas Bessiron, Cathy Isaura Ramos, Raoudha Dammak, Marie-Ange Richard, Céline Boursier, Christelle Cadilhac, Frédéric M Coquelle, Simon Bossi, Fabrice Ango, Pierre Le Maréchal, Paulette Decottignies, Catherine Berrier, Heather Mclean, Hervé Daniel
article
Neuropharmacology, Elsevier, 2017, 121, pp.247-260. ⟨10.1016/j.neuropharm.2017.04.036⟩
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BibTex
titre
In mammalian foetal testes, SOX9 regulates expression of its target genes by binding to genomic regions with conserved signatures
auteur
Massilva Rahmoun, Rowena Lavery, Sabine Laurent-Chaballier, Nicolas Bellora, Gayle K. Philip, Moïra Rossitto, Aleisha Symon, Eric Pailhoux, Florence Cammas, Jessica Chung, Stefan Bagheri-Fam, Mark Murphy, Vivian Bardwell, David Zarkower, Brigitte Boizet-Bonhoure, Philippe Clair, Vincent R. Harley, Francis Poulat
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2017, 45 (12), pp.7191 - 7211. ⟨10.1093/nar/gkx328⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01596005/file/2017_Rahmoun_AcidNucleicRes_1.pdf BibTex
titre
PEGylation rate influences peptide-based nanoparticles mediated siRNA delivery in vitro and in vivo
auteur
Gudrun Aldrian, Anaïs Vaissière, Karidia Konate, Quentin Seisel, Eric Vivès, Frédéric Fernandez, Véronique Viguier, Coralie Genevois, Franck Couillaud, Hélène Déméné, Dina Aggad, Aurélie Covinhes, Stéphanie Barrère-Lemaire, Sebastien Deshayes, Prisca Boisguerin
article
Journal of Controlled Release, Elsevier, 2017, 256, pp.79-91. ⟨10.1016/j.jconrel.2017.04.012⟩
Accès au bibtex
BibTex
titre
Argonaute proteins regulate HIV-1 multiply spliced RNA and viral production in a Dicer independent manner
auteur
Agathe Eckenfelder, Emmanuel Ségéral, Natalia Pinzón, Damien Ulveling, Céline Amadori, Marine Charpentier, Sabine Nidelet, Jean-Paul Concordet, Jean-François Zagury, Jc Paillart, Clarisse Berlioz-Torrent, Hervé Seitz, Stéphane Emiliani, Sarah Gallois-Montbrun
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2017, 45 (7), pp.4158-4173. ⟨10.1093/nar/gkw1289⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01539171/file/gkw1289.pdf BibTex
titre
In Vitro Corticogenesis from Embryonic Stem Cells Recapitulates the In Vivo Epigenetic Control of Imprinted Gene Expression
auteur
Tristan Bouschet, Emeric Dubois, Christelle Reynes, Satya Kota, Stéphanie Rialle, Stéphanie Maupetit-Méhouas, Mikaël Pezet, Anne Le Digarcher, Sabine Nidelet, Vincent Demolombe, Patricia Cavelier, Céline Meusnier, Chloé Maurizy, Robert Sabatier, Robert Feil, Philippe P. Arnaud, Laurent Journot, Annie Varrault
article
Cerebral Cortex, Oxford University Press (OUP), 2017, ⟨10.1093/cercor/bhw102⟩
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titre
IGF-1 Induces GHRH Neuronal Axon Elongation during Early Postnatal Life in Mice
auteur
Lyvianne Decourtye, Erik Mire, Maud Clemessy, Victor Heurtier, Tatiana Ledent, Iain C. Robinson, Patrice Mollard, Jacques Epelbaum, Michael J. Meaney, Sonia Garel, Yves Le Bouc, Laurent Kappeler
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2017, 12 (1), pp.e0170083. ⟨10.1371/journal.pone.0170083⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01438813/file/journal.pone.0170083.pdf BibTex
titre
De Novo Assemblies of Three Oryza glaberrima Accessions Provide First Insights about Pan-Genome of African Rices
auteur
Cécile Monat, Bérengère Pera, Marie-Noelle Ndjiondjop, Mounirou Sow, Christine Tranchant-Dubreuil, Leila Bastianelli, Alain Ghesquière, Francois Sabot
article
Genome Biology and Evolution, Society for Molecular Biology and Evolution, 2017, 9 (1), pp.1-6. ⟨10.1093/gbe/evw253⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03208675/file/evw253.pdf BibTex
titre
Acute and long-term cardioprotective effects of the Traditional Chinese Medicine MLC901 against myocardial ischemia-reperfusion injury in mice
auteur
Anne Vincent, Aurélie Covinhes, Christian Barrère, Laura Gallot, Soulit Thoumala, Christophe Piot, Catherine Heurteaux, Michel Lazdunski, Joël Nargeot, Stéphanie Barrère-Lemaire
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2017, 7 (1), pp.14701. ⟨10.1038/s41598-017-14822-x⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02506308/file/s41598-017-14822-x.pdf BibTex
titre
An antimicrobial peptide-resistant minor subpopulation of Photorhabdus luminescens is responsible for virulence
auteur
Annabelle Mouammine, Sylvie Pages, Anne Lanois-Nouri, Sophie Gaudriault, Grégory Jubelin, Maurine Bonabaud, Stéphane Cruveiller, Emeric Dubois, David Roche, Ludovic Legrand, Julien Brillard, Alain Givaudan
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2017, 7, pp.43670. ⟨10.1038/srep43670⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01606548/file/2017_Mouammine_Sci_Rep_1.pdf BibTex
titre
Control of nerve cord formation by Engrailed and Gooseberry-Neuro: A multi-step, coordinated process
auteur
Nathalie Bonneaud, Sophie Layalle, Sophie Colomb, Christophe Jourdan, Alain Ghysen, Dany Severac, Christelle Dantec, Nicolas Negre, Florence Maschat
article
Developmental Biology, Elsevier, 2017, 432 (2), pp.273-285. ⟨10.1016/j.ydbio.2017.10.018⟩
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BibTex
titre
Cell Type-Specific mRNA Dysregulation in Hippocampal CA1 Pyramidal Neurons of the Fragile X Syndrome Mouse Model
auteur
Laura Ceolin, Nathalie Bouquier, Jihane Boubaker-Vitre, Stéphanie Rialle, Dany Severac, Emmanuel Valjent, Julie Perroy, Emma Puighermanal
article
Frontiers in Molecular Neuroscience, Frontiers Media, 2017, 10, pp.340. ⟨10.3389/fnmol.2017.00340⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02506581/file/fnmol-10-00340.pdf BibTex
titre
Mesorhizobium delmotii and Mesorhizobium prunaredense are two new species containing rhizobial strains within the symbiovar anthyllidis
auteur
Roba Mohamad, Anne Willems, Antoine Le Quere, Géraldine Maynaud, Marjorie Pervent, Maurine Bonabaud, Emeric Dubois, Jean Claude Cleyet-Marel, Brigitte Brunel
article
Systematic and Applied Microbiology, Elsevier, 2017, 40 (3), pp.135-143. ⟨10.1016/j.syapm.2017.01.004⟩
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BibTex
titre
A multistrain approach to studying the mechanisms underlying compatibility in the interaction between Biomphalaria glabrata and Schistosoma mansoni
auteur
Richard Galinier, Emmanuel Roger, Yves Moné, David Duval, Anaïs Portet, Silvain Pinaud, Cristian Chaparro, Christoph Grunau, Clémence Genthon, Emeric Dubois, Anne Rognon, Nathalie Arancibia, Bernard Dejean, André Théron, Benjamin Gourbal, Guillaume Mitta
article
PLoS Neglected Tropical Diseases, Public Library of Science, 2017, 11 (3), pp.e0005398. ⟨10.1371/journal.pntd.0005398.s005⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01511153/file/Galinier-2017-PlosNTD-Multistrain.pdf BibTex
titre
Identification of Plagl1/Zac1 binding sites and target genes establishes its role in the regulation of extracellular matrix genes and the imprinted gene network
auteur
Annie Varrault, Christelle Dantec, Anne Le Digarcher, Laetitia Chotard, Benoit Bilanges, Hugues Parrinello, Emeric Dubois, Stéphanie Rialle, Dany Severac, Tristan Bouschet, Laurent Journot
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2017, 45 (18), pp.10466 - 10480. ⟨10.1093/nar/gkx672⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-01788661/file/gkx672.pdf BibTex
titre
DNA Adenine Methyltransferase (Dam) Overexpression Impairs Photorhabdus luminescens Motility and Virulence
auteur
Amaury Payelleville, Anne Lanois-Nouri, Marie Gislard, Emeric Dubois, David Roche, Stéphane Cruveiller, Alain Givaudan, Julien Brillard
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2017, 8, 14 p. ⟨10.3389/fmicb.2017.01671⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01628662/file/Payelleville%202017_%7B3AE875A1-39E8-4676-A750-8A19053D6606%7D.pdf BibTex
titre
Genomic characterization of Ensifer aridi, a proposed new species of nitrogen-fixing rhizobium recovered from Asian, African and American deserts
auteur
Antoine Le Quere, Nisha Tak, Hukam Singh Gehlot, Céline Lavire, Thibault Meyer, David Chapulliot, Sonam Rathi, Ilham Sakrouhi, Guadalupe Rocha, Marine Rohmer, Dany Severac, Abdelkarim Filali-Maltouf, José-Antonio Munive
article
BMC Genomics, BioMed Central, 2017, 18, pp.24. ⟨10.1186/s12864-016-3447-y⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01606971/file/2017_Le%20Quere_BMC%20Genomics_1.pdf BibTex
titre
Comparative Genomics of Glossina palpalis gambiensis and G. morsitans morsitans to Reveal Gene Orthologs Involved in Infection by Trypanosoma brucei gambiense
auteur
Illiassou Hamidou Soumana, Bernadette Tchicaya, Stéphanie Rialle, Hugues Parrinello, Anne Geiger
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2017, 8, pp.540. ⟨10.3389/fmicb.2017.00540⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02506528/file/fmicb-08-00540.pdf BibTex
titre
Characterization of a nuclear pore protein sheds light on the roles and composition of the Toxoplasma gondii nuclear pore complex
auteur
Flavie Courjol, Thomas Mouveaux, Kevin Lesage, Jean-Michel Saliou, Elisabeth Werkmeister, Maurine Bonabaud, Marine Rohmer, Christian Slomianny, Franck Lafont, Mathieu Gissot
article
Cellular and Molecular Life Sciences, Springer Verlag, 2017, 74 (11), pp.2107-2125. ⟨10.1007/s00018-017-2459-3⟩
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Communication dans un congrès

titre
Identification of the master sex determining gene in Northern pike (Esox lucius, Esociformes, Teleosts) and the dynamic evolution of sex determination system within esociformes
auteur
Qiaowei Pan, Ayaka Yano, Jennifer Anderson, Julien Bobe, Elodie Dupin-De-Beyssat, Estelle Vigouroux, Aline Hug, Hughes Parrinello, Laurent Journot, John H. Postlethwait, Manfred Schartl, Christophe C. Klopp, Amaury Herpin, Yann Guiguen
article
1. European Symposium on Sex Determination in Vertebrates, Mar 2017, Dinard, France
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titre
Evolution of gene expression in fish: The PhyloFish database
auteur
Jérémy Pasquier, Cédric Cabau, Thuy Thao Vi Nguyen, Elodie Dupin-De-Beyssat, Dany Severac, Ingo Braasch, Laurent Journot, Christophe C. Klopp, John H Postlethwait, Yann Guiguen, Julien Bobe
article
8. Aquatic Models of Human Disease Conference, Jan 2017, Birmingham, United States
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BibTex

Thèse

titre
Identification d'un nouveau bloqueur peptidique spécifique du canal sodique Nav1.7 avec des propriétés analgésiques
auteur
Pierre Lesport
article
Médecine humaine et pathologie. Université Montpellier, 2017. Français. ⟨NNT : 2017MONTT004⟩
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2016

Article dans une revue

titre
Genome-wide nucleotide diversity of hatchery-reared Atlantic and Mediterranean strains of brown trout Salmo trutta compared to wild Mediterranean populations
auteur
M. Leitwein, P. Gagnaire, E. Desmarais, S. Guendouz, Marine Rohmer, P. Berrebi, Bruno Guinand
article
Journal of Fish Biology, Wiley, 2016, 89 (6), pp.2717 - 2734. ⟨10.1111/jfb.13131⟩
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BibTex
titre
TSHZ3 deletion causes an autism syndrome and defects in cortical projection neurons
auteur
Xavier Caubit, Paolo Gubellini, Joris Andrieux, Pierre L. Roubertoux, Mehdi Metwaly, Bernard Jacq, Ahmed Fatmi, Laurence Had-Aissouni, Kenneth Y. Kwan, Pascal Salin, Michèle Carlier, Agne Liedén, Eva Rudd, Marwan Shinawi, Catherine Vincent-Delorme, Jean-Marie Cuisset, Marie-Pierre Lemaitre, Fatimetou Abderrehamane, Benedicte Duban, Jean-François Lemaître, Adrian S. Woolf, Detlef Bockenhauer, Dany Severac, Emeric Dubois, Ying Zhu, Nenad Sestan, Alistair N. Garratt, Lydia Kerkerian-Le Goff, Laurent Fasano
article
Nature Genetics, Nature Publishing Group, 2016, 48 (11), pp.1359-1369. ⟨10.1038/ng.3681⟩
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BibTex
titre
Using melanopsin to study G protein signaling in cortical neurons
auteur
K. M. Mcgregor, Carine Becamel, Philippe Marin, R. Andrade
article
Journal of Neurophysiology, American Physiological Society, 2016, 116 (3), pp.1082--1092. ⟨10.1152/jn.00406.2016⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01942453/file/jn.00406.2016.pdf BibTex
titre
A gene-based map of the Nod factor-independent Aeschynomene evenia sheds new light on the evolution of nodulation and legume genomes
auteur
Clémence Chaintreuil, Ronan Rivallan, David Bertioli, Christophe C. Klopp, Jerome Gouzy, Brigitte Courtois, Philippe Leleux, Jean-Francois Rami, Djamel Gully, Hugues Parrinello, Dany Severac, Delphine Patrel, Joël Fardoux, William Ribière, Marc Boursot, Fabienne Cartieaux, Pierre Czernic, Pascal Ratet, Pierre Mournet, Eric Giraud, Jean-François Arrighi, Guillaume Martin
article
DNA Research, Oxford University Press (OUP), 2016, 23 (4), pp.365-376. ⟨10.1093/dnares/dsw020⟩
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https://hal-cnrs.archives-ouvertes.fr/hal-02410329/file/dsw020.pdf BibTex
titre
Identification of Nucleolus-Associated Chromatin Domains Reveals a Role for the Nucleolus in 3D Organization of the A. thaliana Genome
auteur
Frederic Pontvianne, Marie-Christine Carpentier, Nathalie Durut, Veronika Pavlištová, Karin Jaške, Šárka Schořová, Hugues Parrinello, Marine Rohmer, Craig Pikaard, Miloslava Fojtová, Jiří Fajkus, Julio Sáez-Vasquez
article
Cell Reports, Elsevier Inc, 2016, 16 (6), pp.1574-1587. ⟨10.1016/j.celrep.2016.07.016⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02115369/file/PIIS2211124716309020.pdf BibTex
titre
A replicated climate change field experiment reveals rapid evolutionary response in an ecologically important soil invertebrate
auteur
Thomas Bataillon, Nicolas Galtier, Aurélien Bernard, Nicolai Cryer, Nicolas Faivre, Sylvain S. Santoni, Dany Severac, Teis Mikkelsen, Klaus Larsen, Claus Beier, Jesper Sørensen, Martin Holmstrup, Bodil Ehlers
article
Global Change Biology, Wiley, 2016, 22 (7), pp.2370 - 2379. ⟨10.1111/gcb.13293⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01900642/file/Bataillon2016.pdf BibTex
titre
Gene evolution and gene expression after whole genome duplication in fish: the PhyloFish database.
auteur
Jérémy Pasquier, Cédric Cabau, Thuy Thao Vi Nguyen, Elodie Jouanno, Dany Severac, Ingo Braasch, Laurent Journot, Pierre Pontarotti, Christophe C. Klopp, John H Postlethwait, Yann Guiguen, Julien Bobe
article
BMC Genomics, BioMed Central, 2016, 17 (1), pp.368. ⟨10.1186/s12864-016-2709-z⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01487023/file/BMC%20Genomics%20%2017%20%20%20368%20%20%20%20PAsquier%20%20Non%20pagin%C3%A9%20Online_%7BCD0042A2-9DCC-48A0-9ECE-117F9159833F%7D.pdf BibTex
titre
Frequency and mitotic heritability of epimutations in Schistosoma mansoni
auteur
David Roquis, Anne Rognon, Cristian Chaparro, Jérôme Boissier, Nathalie Arancibia, Céline Cosseau, Hugues Parrinello, Christoph Grunau
article
Molecular Ecology, Wiley, 2016, EPIGENETIC STUDIES IN ECOLOGY AND EVOLUTION, 25 (8), pp.1741-1758. ⟨10.1111/mec.13555⟩
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https://hal-sde.archives-ouvertes.fr/hal-01311089/file/Roquis-2016-MolEcol-frequency-Manuscrit2.pdf BibTex
titre
Gene coexpression network analysis of oil biosynthesis in an interspecific backcross of oil palm
auteur
Chloé Guerin, Thierry Joët, Julien Serret, Philippe Lashermes, Virginie Vaissayre, Mawussé D T Agbessi, Thierry Beulé, Dany Severac, Philippe Amblard, James Tregear, Tristan Durand‐gasselin, Fabienne Morcillo, Stéphane Dussert
article
Plant Journal, Wiley, 2016, 87, pp.423 - 441. ⟨10.1111/tpj.13208⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03200450/file/tpj.13208.pdf BibTex
titre
Neural stem cell-encoded temporal patterning delineates an early window of malignant susceptibility in Drosophila
auteur
K Narbonne-Reveau, E Lanet, C Dillard, S Foppolo, Ching-Huan Chen, Hugues Parrinello, Stéphanie Rialle, Nicholas S. Sokol, C Maurange
article
eLife, eLife Sciences Publication, 2016, 5, pp.e13463. ⟨10.7554/eLife.13463⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01446113/file/elife-13463-v2.pdf BibTex
titre
Deciphering the Wisent Demographic and Adaptive Histories from Individual Whole-Genome Sequences
auteur
Mathieu Gautier, Katayoun Moazami-Goudarzi, Hubert H. Levéziel, Hugues Parrinello, Cécile Grohs, Stéphanie Rialle, Rafał Kowalczyk, Laurence Flori
article
Molecular Biology and Evolution, Oxford University Press (OUP), 2016, 33 (11), pp.2801-2814. ⟨10.1093/molbev/msw144⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02506852/file/msw144.pdf BibTex
titre
Sex-biased transcriptome of Schistosoma mansoni: host-parasite interaction, genetic determinants and epigenetic regulators are associated with sexual differentiation
auteur
Marion R Picard, Jérôme Boissier, David R Roquis, Christoph Grunau, Jean-François Allienne, David R Duval, Eve R Toulza, Nathalie R Arancibia, Conor R Caffrey, Thavy Long, Sabine Nidelet, Marine Rohmer, Céline Cosseau
article
PLoS Neglected Tropical Diseases, Public Library of Science, 2016, 10 (9), pp.e0004930. ⟨10.1371/journal.pntd.0004930.s010⟩
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https://hal-sde.archives-ouvertes.fr/hal-01387886/file/Picard-2016-PlosNTD-sexbiased.pdf BibTex
titre
Neurotoxicity of a Biopesticide Analog on Zebrafish Larvae at Nanomolar Concentrations
auteur
Ahmed Nasri, Audrey Valverde, Daniel Barry Roche, Catherine Desrumaux, Philippe Clair, Hamouda Beyrem, Laurent Chaloin, Alain Ghysen, Véronique Perrier
article
International Journal of Molecular Sciences, MDPI, 2016, 17 (12), pp.2137. ⟨10.3390/ijms17122137⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01868356/file/Neurotoxicity%20of%20a%20Biopesticide%20Analog%20on%20Zebrafish%20Larvae%20at%20Nanomolar%20Concentrations.pdf BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
Estimating travel mode choice, including rail in regional area, based on a new family of regression models
auteur
Hélène Bouscasse, Iragaël Joly, Jean Peyhardi
article
2016
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01847227/file/gael2016-04.pdf BibTex

2015

Article dans une revue

titre
Translational Control of Autophagy by Orb in the Drosophila Germline
auteur
Patricia Rojas-Ríos, Aymeric Chartier, Stéphanie Pierson, Dany Séverac, Christelle Dantec, Isabelle Busseau, Martine Simonelig
article
Developmental Cell, Elsevier, 2015, 35 (5), pp.622-631. ⟨10.1016/j.devcel.2015.11.003⟩
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BibTex
titre
RNA-seq de novo assembly reveals differential gene expression in Glossina palpalis gambiensis infected with Trypanosoma brucei gambiense vs. non-infected and self-cured flies
auteur
Illiassou Hamidou Soumana, Christophe C. Klopp, Sophie Ravel, Ibouniyamine Nabihoudine, Bernadette Tchicaya, Hugues Parrinello, Luc Abate, Stéphanie Rialle, Anne Geiger
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2015, 6, ⟨10.3389/fmicb.2015.01259⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02067248/file/fmicb-06-01259.pdf BibTex
titre
AMPK/HuR-Driven IL-20 Post-Transcriptional Regulation in Psoriatic Skin
auteur
Geneviève Garcin, Isabelle Guiraud, Matthieu Lacroix, Clémence Genthon, Stéphanie Rialle, Jean-Marie Joujoux, Laurent Meunier, Thierry Lavabre-Bertrand, Pierre-Emmanuel Stoebner, Lionel Le Gallic
article
Journal of Investigative Dermatology, Nature Publishing Group, 2015, 135 (11), pp.2732 - 2741. ⟨10.1038/jid.2015.282⟩
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BibTex
titre
Le site de référence du Partenariat européen d’innovation pour un vieillissement actif et en bonne santé MACVIA-LR (contre les maladies chroniques pour un vieillissement en bonne santé en Languedoc-Roussillon)
auteur
Jean Bousquet, Rodolphe Bourret, Thierry Camuzat, Philippe Augé, Philippe Domy, Jacques Bringer, Nicolas Nicolas, Olivier Jonquet, Jean-Emmanuel de La Coussaye, Michel Noguès, Jm Robine, Antoine Avignon, Hubert Blain, Bernard Bernard, Gérard Dray, Vincent Dufour, Mireille Fouletier, Didier Hève, Jean Jeandel, Isabel Laffont, Dominique Larrey, Daniel Laune, Laurent Laurent, Pierre Marès, Marion Marion, Eric Pastor, Jacques-Yvon Pélissier, François Radier-Pontal, Jacques Reynes, Emilie Royère, Marc Ychou, Anna Bedbrook, Sophie Granier, Frédéric Abécassis, Sylvie Albert, Paule Adnet, Michel Amouyal, Sylvie Arnavieilhe, Trias Asteriou, Vincent Attalin, Pierre Aubas, Christine Azevedo Coste, Mélanie Badin, Karima Bakhti, Gregory Baptista, Benoit Bardy, Pierre Battesti, Olivier Bénézet, Pierre-Louis Bernard, Claudine Berr, Jacquie Berthe, Xavier Bobia, Joël Bockaert, Catherine Boegner, Sylvie Boichot, Huei-Yune Bonnin, Philippe Boulet, Stéphane Bouly, Chokri Boubakri, Arnaud Bourdin, Jean-Luc Bourrain, Gérard Bourrel, Vincent Bouix, Cyril Breuker, Valérie Bruguière, Jacques Burille, Stéphane Cade, David David, Marie-Virginie Calmels, William Camu, Gérard Canovas, Véronique Carre, Giacomo Cavalli, Guillaume Cayla, Raphaël Chiron, Pierre-Geraud Claret, Pauline Coignard, Flavia-Oana Coroian, Pierre Costa, Jérôme Cottalorda, Bertrand Coulet, Anne Coupet, Christine Courrouy-Michel, Philippe Courtet, Jean-Paul Cristol, Valérie Cros, Frédéric Cuisinier, Claire Daien, Marianna Danko, Philippe Dauenhauer, Michel Dauzat, Jean Davy, Didier Delignières, Pascal Demoly, Matthieu Desplan, Henriette Dhivert-Donnadieu, Pierre Dujol, Arnaud Dupeyron, Gérard Dupeyron, Oude Engberink, Michel Enjalbert, Charles Fattal, Jérôme Fernandes, Pierre Fesler, Philippe Fraisse, Jérôme Froger, Philippe Gabrion, Emilie Galano, Marion Gellerat-Rogier, Anthony Gellis, Arnaud-Yves Goucham, Fares Gouzi, Florence Gressard, Jean-Christophe Gris, Bernard Guillot, David Guiraud, Valérie Handweiler, Olivier Hantkié, Maurice Hayot, Christian Herisson, Cherif Heroum, Didier Hoa, Sylvain Jacquemin, Samir Jaber, Dominique Jakovenko, Christophe Jorgensen, Laurent Journot, Michel Kaczorek, Pascal Kouyoumdjian, Pierre Labauge, Liliane Landreau, Martine Lapierre, Catherine Leblond, Marie-Suzanne Léglise, Jean Lemaitre, Vincent Le Moing, Alain Le Quellec, François Leclercq, Sylvain Lehmann, Béatrice Lognos, Jean Lussert, Alain Makinson, Kevin Mandrick, Vincent Marmelat, Pierre Martin-Gousset, Amélie Matheron, Gwen Mathieu, Marc Meissonnier, Grégoire Mercier, Patrick Messner, Cyril Meunier, Michel Mondain, Raul Punta-Morales, Jacques Morel, David Morquin, Denis Mottet, Philippe Nerin, Pierre Nicolas, Gregory Ninot, Fabrice Nouvel, Jean Ortiz, Delphine Paccard, Guillaume Pandraud, Pierre Pasdelou, Jean-Luc Pasquié, Karine Patte, Stéphane Perrey, Yves-Marie Pers, Christine Picot, Philippe Pin, Nathalie Pinto, Emilie Porte, Fabienne Portejoie, Jean Pujol, Xavier Quantin, Isabelle Quéré, Nathalie Raffort, Sofiane Ramdani, Jean Ribstein, Martine Rédini-Martinez, Sylvain Richard, Karen Ritchie, Pierre Riso, Francois Rivier, Christine Rolland, François Roubille, Denis Sablot, Jean-Luc Savy, Laurent Schifano, Pierre Senesse, Roland Sicard, Baya Soua, Yannick Stephan, Denise Strubel, Ariane Sultan, Roxana Taddei-Ologeanu, Guillaume Tallon, Michel Tanfin, Hervé Tassery, Isabel Tavares, Kjerstin Torre, Jacques Touchon, Vincent Tribout, Alain Uziel, Philippe van de Perre, Xavier Vasquez, Jean-Michel Verdier, Céline Vergne-Richard, Grégoire Vergotte, Laurence Vian, Christine Viarouge-Reunier, François Vialla, Frédéric Viart, Max Villain, Maxime Villiet, Emilie Viollet, Anne Wojtusciszyn, Martine Aoustin, Christian Bourquin, Jacques Mercier
article
La Presse Médicale, Elsevier Masson, 2015, 44 (1), pp.S6-S22. ⟨10.1016/j.lpm.2015.07.013⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-01756022/file/Bousquet%20et%20al-2015.pdf BibTex
titre
The Greater Phenotypic Homeostasis of the Allopolyploid Coffea arabica Improved the Transcriptional Homeostasis Over that of Both Diploid Parents
auteur
Benoît Bertrand, Amélie Bardil, Hélène Baraille, Stéphane Dussert, Sylvie Doulbeau, Emeric Dubois, Dany Severac, Alexis Dereeper, Hervé Etienne
article
Plant and Cell Physiology, Oxford University Press (OUP), 2015, 56 (10), pp.2035-2051. ⟨10.1093/pcp/pcv117⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-03387905/file/The_Greater_Phenotypic_Homeostasis_of_the_Allopoly.pdf BibTex
titre
Identification of genes regulating TRAIL-induced apoptosis in rheumatoid arthritis fibroblasts-like synoviocytes
auteur
R. Audo, A. Hegglin, Dany Severac, Christelle Dantec, Bernard Combe, M. Hahne, Jacques Morel
article
Genes and Immunity, Nature Publishing Group: Open Access Hybrid Model Option B, 2015, 16 (7), pp.462-469. ⟨10.1038/gene.2015.31⟩
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BibTex
titre
A Recurrent Mutation in CACNA1G Alters Cav3.1 T-Type Calcium-Channel Conduction and Causes Autosomal-Dominant Cerebellar Ataxia
auteur
Marie Coutelier, Iulia Blesneac, Arnaud Monteil, Marie-Lorraine Monin, Kunie Ando, Emeline Mundwiller, Alfredo Brusco, Isabelle Le ber, Mathieu Anheim, Anna Castrioto, Charles Duyckaerts, Alexis Brice, Alexandra Durr, Philippe Lory, Giovanni Stevanin
article
American Journal of Human Genetics, Elsevier (Cell Press), 2015, 97 (5), pp.726-737. ⟨10.1016/j.ajhg.2015.09.007⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01223815/file/Coutelier_A_Recurrent.pdf BibTex
titre
The Transcription Factor E4F1 Coordinates CHK1-Dependent Checkpoint and Mitochondrial Functions
auteur
Geneviève Rodier, Olivier Kirsh, Martín Baraibar, Thibault Houlès, Matthieu Lacroix, Hélène Delpech, Elodie Hatchi, Stéphanie Arnould, Dany Severac, Emeric Dubois, Julie Caramel, Eric Julien, Bertrand Friguet, Laurent Le cam, Claude Sardet
article
Cell Reports, Elsevier Inc, 2015, 11 (2), pp.220-233. ⟨10.1016/j.celrep.2015.03.024⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01213872/file/1-s2.0-S2211124715002934-main.pdf BibTex
titre
A systems-level approach to parental genomic imprinting: the imprinted gene network includes extracellular matrix genes and regulates cell cycle exit and differentiation
auteur
Hala Al Adhami, Brendan Evano, Anne Le Digarcher, Charlotte Gueydan, Emeric Dubois, Hugues Parrinello, Christelle Dantec, Tristan Bouschet, Annie Varrault, Laurent Journot
article
Genome Research, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2015, 25 (3), pp.353 - 367. ⟨10.1101/gr.175919.114⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-01788711/file/Genome%20Res.-2015-Al%20Adhami-353-67.pdf BibTex
titre
Regulatory Divergence between Parental Alleles Determines Gene Expression Patterns in Hybrids
auteur
Marie-Christine Combes, Yann Hueber, Alexis Dereeper, Stéphanie Rialle, Juan-Carlos Herrera, Philippe Lashermes
article
Genome Biology and Evolution, Society for Molecular Biology and Evolution, 2015, 7 (4), pp.1110-1121. ⟨10.1093/gbe/evv057⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02506764/file/evv057.pdf BibTex
titre
Who is the puppet master? Replication of a parasitic wasp-associated virus correlates with host behaviour manipulation
auteur
Nolwenn M. Dheilly, Fanny Maure, Marc Ravallec, Richard Galinier, Josée Doyon, David Duval, Lucas Leger, Anne-Nathalie Volkoff, Dorothée Missé, Sabine Nidelet, Vincent Demolombe, Jacques Brodeur, Benjamin Gourbal, Frédéric Thomas, Guillaume Mitta
article
Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, Royal Society, The, 2015, 282 (1803), pp.20142773. ⟨10.1098/rspb.2014.2773⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01141139/file/Dheilly-2015-ProcRSocB-Who.pdf BibTex
titre
A family of variable immunoglobulin and lectin domain containing molecules in the snail Biomphalaria glabrata
auteur
Nolwenn M. Dheilly, David Duval, Gabriel Mouahid, Rémi Emans, Jean-François J. F. Allienne, Richard Galinier, Clémence Genthon, Emeric Dubois, Louis Du Pasquier, Coen M. Adema, Christoph Grunau, Guillaume Mitta, Benjamin Gourbal
article
Developmental and Comparative Immunology, Elsevier, 2015, 48 (1), pp.234-243. ⟨10.1016/j.dci.2014.10.009⟩
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https://hal-sde.archives-ouvertes.fr/hal-01082870/file/Dheilly-2015-DevCompImmunol-Family.pdf BibTex
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Rho1- and Pkc1-dependent phosphorylation of the F-BAR protein Syp1 contributes to septin ring assembly
auteur
Laura Merlini, Alessio Bolognesi, Maria Angeles Juanes, Franck Vandermoere, Thibault Courtellemont, Roberta Pascolutti, Martial Séveno, Yves Barral, Simonetta Piatti
article
Molecular Biology of the Cell, American Society for Cell Biology, 2015, 26 (18), pp.3245-3262. ⟨10.1091/mbc.e15-06-0366⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01883492/file/MS-2015-Merlini.pdf BibTex
titre
The Epigenome of Schistosoma mansoni Provides Insight about How Cercariae Poise Transcription until Infection
auteur
David Roquis, Julie Mireille Lepesant, Marion A.L. Picard, M. Freitag, Hugues Parrinello, Marco Groth, Rémi Emans, Céline Cosseau, Christoph Grunau
article
PLoS Neglected Tropical Diseases, Public Library of Science, 2015, 9 (8), pp.e0003853. ⟨10.1371/journal.pntd.0003853⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01259820/file/Roquis-2015-PlosNTD-Epigenome.pdf BibTex
titre
The p53 Isoform Δ133p53β Promotes Cancer Stem Cell Potential
auteur
Nikola Arsic, Gilles Gadea, Ebba Louise Lagerqvist, Muriel Busson, Nathalie Cahuzac, Carsten Brock, Frédéric Hollande, Véronique Gire, Julie Pannequin, Pierre Roux
article
Current Stem Cell Reports, Springer, 2015, 4 (4), pp.531-540. ⟨10.1016/j.stemcr.2015.02.001⟩
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https://hal.univ-reunion.fr/hal-01703033/file/1-s2.0-S2213671115000430-main.pdf BibTex
titre
YES oncogenic activity is specified by its SH4 domain and regulates RAS/MAPK signaling in colon carcinoma cells
auteur