UMR 5554Les recherches au sein de l’ISEM concernent l’origine et la dynamique de la biodiversité, ainsi que les modalités et les mécanismes de son évolution. Les chercheurs de cette unité s’intéressent tant à la biodiversité actuelle que passée, étudient un large éventail d’organismes et de milieux et allient des approches de terrain, expérimentales et théoriques. Ces recherches intègrent :

  • les questions fondamentales de la biologie évolutive (adaptation, contraintes, spéciation, etc.) pour  comprendre  les mécanismes à l’origine de la biodiversité, de sa structuration et de son fonctionnement ;
  • l’accélération des moyens de production de données et de la capacité à appréhender les différentes dimensions structurelles et fonctionnelles du vivant (du gène à l’écosystème), conduisant à une appréhension globale des mécanismes à l’origine de la biodiversité ;
  • le questionnement scientifique et sociétal portant sur des réponses de la biodiversité (organismes et/ou communautés) vis-à-vis des changements planétaires et anthropiques.

Label : Unité Mixte de Recherche (UMR)
Tutelles principales : CNRS, UM, IRD
Tutelles secondaires :
CIRAD, EPHE, INRAP
Département scientifique : Biologie, écologie, évolution, environnement, sciences de la terre et de l’eau
Écoles doctorales
: Information, Structures, Systèmes ; Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé ; Biodiversité, Agriculture, Alimentation, Environnement, Terre, Eau

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Université de Montpellier
Bâtiment 22 – CC065
Place Eugène Bataillon
34095 Montpellier cedex 5 France

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Publications HAL de la structure 29770

2021

Article dans une revue

titre
Fluctuating temperature regime impairs growth in giant gourami (Osphronemus goramy) larvae
auteur
Vitas Atmadi Prakoso, Simon Pouil, Wahyulia Cahyanti, Sri Sundari, Otong Zenal Arifin, Jojo Subagja, Anang Hari Kristanto, Jacques Slembrouck
article
Aquaculture, Elsevier, 2021, 539, pp.736606. ⟨10.1016/j.aquaculture.2021.736606⟩
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titre
Lost islands in the northern Lesser Antilles: possible milestones in the Cenozoic dispersal of terrestrial organisms between South-America and the Greater Antilles
auteur
Jean-Jacques Cornee, Philippe Münch, Mélody Philippon, Marcelle Boudagher-Fadel, Frédéric Quillévéré, Mihaela Melinte-Dobrinescu, Jean-Frédéric Lebrun, Aurélien Gay, Solène Meyer, Lény Montheil, Serge Lallemand, Boris Marcaillou, Muriel Laurencin, Lucie Legendre, Clément Garrocq, Milton Boucard, Marie-Odile Beslier, Mireille Laigle, Laure Schenini, Pierre-Henri Fabre, Pierre-Olivier Antoine, Laurent Marivaux
article
Earth-Science Reviews, Elsevier, 2021, 217, pp.103617. ⟨10.1016/j.earscirev.2021.103617⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03191176/file/The%20northern%20Lesser%20Antilles%20hal.pdf BibTex
titre
Establishment and functioning of the savanna marshes of the Lopé National Park in Gabon since the termination of the African humid period and the arrival of humans 2500 years ago
auteur
Laurent Bremond, Richard Oslisly, David Sebag, Ilham Bentaleb, Charly Favier, Karl Henga-Botsikabobe, Makaya Mvoubou, Alfred Ngomanda, Geoffroy de Saulieu
article
The holocene, London: Sage, 2021, pp.095968362110032. ⟨10.1177/09596836211003230⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03197824/file/Bremond%202021.pdf BibTex
titre
Outbreaks of Vector-Borne and Zoonotic Diseases Are Associated With Changes in Forest Cover and Oil Palm Expansion at Global Scale
auteur
Serge Morand, Claire Lajaunie
article
Frontiers in Veterinary Science, Frontiers Media, 2021, 8, ⟨10.3389/fvets.2021.661063⟩
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titre
Evolution of Matrix Gla and Bone Gla Protein Genes in Jawed Vertebrates
auteur
Nicolas Leurs, Camille Martinand-Mari, Stéphanie Ventéo, Tatjana Haitina, Mélanie Debiais-Thibaud
article
Frontiers in Genetics, Frontiers, 2021, 12, ⟨10.3389/fgene.2021.620659⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-03164575/file/2021%20Evolution%20of%20Matrix%20Gla%20and%20Bone%20Gla%20Protein%20Genes%20in%20Jawed%20Vertebrates.pdf BibTex
titre
High-quality carnivoran genomes from roadkill samples enable comparative species delineation in aardwolf and bat-eared fox
auteur
Rémi Allio, Marie-Ka Tilak, Celine Scornavacca, Nico Avenant, Andrew Kitchener, Erwan Corre, Benoit Nabholz, Frédéric Delsuc
article
eLife, eLife Sciences Publication, 2021, 10, ⟨10.7554/eLife.63167⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03147106/file/elife-63167-v1.pdf BibTex
titre
Cytoplasmic Incompatibility Variations in Relation with Wolbachia cid Genes Divergence in Culex pipiens
auteur
Mathieu Sicard, Alice Namias, Marco Perriat-Sanguinet, Eric Carron, Sandra Unal, Mine Altinli, Frederic Landmann, Mylène Weill
article
mBio, American Society for Microbiology, 2021, 12, pp.e02797-20. ⟨10.1128/mBio.02797-20⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-03138476/file/mBio-2021-Sicard-e02797-20.full.pdf BibTex
titre
Postcranial anatomy of the extinct terrestrial sloth Simomylodon uccasamamensis (Xenarthra, Mylodontidae) from the Pliocene of the Bolivian Altiplano, and its evolutionary implications
auteur
Alberto Boscaini, Néstor Toledo, Bernardino Mamani Quispe, Rubén Andrade Flores, Marcos Fernández‐monescillo, Laurent Marivaux, Pierre-Olivier Antoine, Philippe Münch, Timothy Gaudin, François Pujos
article
Papers in Palaeontology, Wiley, 2021, pp.Early View. ⟨10.1002/spp2.1353⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-03136053/file/Boscaini-et-al-Paper-in-Palaeontology_Bolivia-Simomylodon.pdf BibTex
titre
The Libycosaurus (Hippopotamoidea, Artiodactyla) intercontinental dispersal event at the early late Miocene revealed by new fossil remains from Kasserine area, Tunisia
auteur
Fabrice Lihoreau, El Mabrouk Essid, Hayet Khayati Ammar, Laurent Marivaux, Wissem Marzougui, Rodolphe Tabuce, Rim Temani, Monique Vianey-Liaud, Gilles Merzeraud
article
Historical Biology, Taylor & Francis, 2021, 33 (2), pp.146-158. ⟨10.1080/08912963.2019.1596088⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02082905/file/Lihoreau-et-al.merged-PDF-proofs-MS-R2-acp.pdf BibTex
titre
“Health in” and “Health of” Social-Ecological Systems: A Practical Framework for the Management of Healthy and Resilient Agricultural and Natural Ecosystems
auteur
Michel de Garine-Wichatitsky, Aurélie Binot, John Ward, Alexandre Caron, Arthur Perrotton, Helen Ross, Hoa Tran Quoc, Hugo Valls-Fox, Iain Gordon, Panomsak Promburom, Rico Ancog, Richard Kock, Serge Morand, Véronique Chevalier, Will Allen, Waraphon Phimpraphai, Raphaël Duboz, Pierre Echaubard
article
Frontiers in Public Health, Frontiers Media S.A., 2021, 8, ⟨10.3389/fpubh.2020.616328⟩
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titre
Grazing and the vanishing complexity of plant association networks in grasslands
auteur
Alexandre Génin, Thierry Dutoit, Alain Danet, Alice Le Priol, Sonia Kéfi
article
Oikos, Nordic Ecological Society, 2021, ⟨10.1111/oik.07850⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03123198/file/genin_2021_non_typeset.pdf BibTex
titre
Global economic costs of aquatic invasive alien species
auteur
Ross N Cuthbert, Zarah Pattison, Nigel G Taylor, Laura Verbrugge, Christophe Diagne, Danish A Ahmed, Boris Leroy, Elena Angulo, Elizabeta Briski, César Capinha, Jane A Catford, Tatenda Dalu, Franz Essl, Rodolphe E Gozlan, Phillip J Haubrock, Melina Kourantidou, Andrew M Kramer, D Renault, Ryan J Wasserman, Franck Courchamp
article
Science of the Total Environment, Elsevier, 2021, 775, pp.145238. ⟨10.1016/j.scitotenv.2021.145238⟩
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titre
The Effects of Feed Restriction and Isolated or Group Rearing on the Measurement of Individual Feed Intake and Estimation of Feed Conversion Ratio in Juvenile Nile Tilapia (Oreochromis niloticus) for Selective Breeding Purposes
auteur
Charles Rodde, Marc Vandeputte, Trong Quoc Trinh, Vincent Douchet, Marc Canonne, John Benzie, Hugues de Verdal
article
Frontiers in Genetics, Frontiers, 2021, 11, ⟨10.3389/fgene.2020.596521⟩
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titre
Endocranial Cast Anatomy of the Extinct Hipposiderid Bats Palaeophyllophora and Hipposideros (Pseudorhinolophus) (Mammalia: Chiroptera)
auteur
Jacob Maugoust, Maeva Orliac
article
Journal of Mammalian Evolution, Springer Verlag, 2021, ⟨10.1007/s10914-020-09522-9⟩
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titre
Reinterpreting Patterns of Variation in Human Thyroid Function: An Evolutionary Perspective
auteur
Sarai Keestra, Vedrana Tabor, Alexandra Alvergne
article
Evolution, Medicine, and Public Health, Oxford : Oxford University Press, 2021, ⟨10.1093/emph/eoaa043/5970476⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03092084/file/2020_Thyroid_EPH.pdf BibTex
titre
Phytoliths from soil surfaces and water reservoirs of the Brazilian semi-arid Caatinga
auteur
Francisco Rony Gomes Barroso, Vaneicia dos Santos Gomes, Carlos Eduardo Carvalho, Marie Pierre Ledru, Charly Favier, Francisca Soares Araújo, Laurent Bremond
article
Journal of South American Earth Sciences, Elsevier, 2021, pp.103180. ⟨10.1016/j.jsames.2021.103180⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03130689/file/Barroso%20et%20al.%20Phytoliths%20Caatinga%20JSAMES%202021.pdf BibTex
titre
Local domestication or diffusion? Insights into viticulture in Greece from Neolithic to Archaic times, using geometric morphometric analyses of archaeological grape seeds
auteur
Clémence Pagnoux, Laurent Bouby, Soultana Maria Valamoti, Vincent Bonhomme, Sarah Ivorra, Eugenia Gkatzogia, Angeliki Karathanou, Dimitra Kotsachristou, Helmut Kroll, Jean-Frédéric Terral
article
Journal of Archaeological Science, Elsevier, 2021, 125, pp.105263. ⟨10.1016/j.jas.2020.105263⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03040458/file/Pagnoux_etal_2021.pdf BibTex
titre
Natural infection of free-ranging mandrills (Mandrillus sphinx) by enteroviruses and astroviruses in southern Gabon
auteur
Illich Mombo, Larson Boundenga, Eloise Suquet, Barthélémy Ngoubangoye, Gaël Maganga, Eric Leroy, Marie Charpentier, Virginie Rougeron
article
Microbial Pathogenesis, Elsevier, 2021, 150, pp.104659. ⟨10.1016/j.micpath.2020.104659⟩
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titre
Banning colistin in feed additives: a small step in the right direction
auteur
Abiola Olumuyiwa Olaitan, Iman Dandachi, Sophie Alexandra Baron, Ziad Daoud, Serge Morand, Jean-Marc Rolain
article
The Lancet Infectious Diseases, New York, NY : Elsevier Science ; The Lancet Pub. Group, 2001-, 2021, 21 (1), pp.29-30. ⟨10.1016/S1473-3099(20)30915-4⟩
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titre
Island songbirds as windows into evolution in small populations
auteur
Thibault Leroy, Marjolaine Rousselle, Marie-Ka Tilak, Aude Caizergues, Celine Scornavacca, María Recuerda, Jérôme Fuchs, Juan Carlos Illera, Dawie de Swardt, Guillermo Blanco, Christophe Thébaud, Borja Milá, Benoit Nabholz
article
Current Biology - CB, Elsevier, 2021, ⟨10.1016/j.cub.2020.12.040⟩
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titre
Genome-wide association studies for resistance to viral nervous necrosis in three populations of European sea bass (Dicentrarchus labrax) using a novel 57k SNP array DlabChip
auteur
Ronan Griot, François Allal, Florence Phocas, Sophie Brard-Fudulea, Romain Morvezen, Anastasia Bestin, Pierrick Haffray, Yoannah François, Thierry Morin, Charles Poncet, Alain Vergnet, Sophie Cariou, Joseph Brunier, Jean-Sébastien Bruant, Bruno Peyrou, Pierre-Alexandre Gagnaire, Marc Vandeputte
article
Aquaculture, Elsevier, 2021, 530, pp.735930. ⟨10.1016/j.aquaculture.2020.735930⟩
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BibTex
titre
Latest Early-early Middle Eocene deposits of Algeria (Glib Zegdou, HGL50), yield the richest and most diverse fauna of amphibians and squamate reptiles from the Palaeogene of Africa
auteur
Jean-Claude Rage, Mohammed Adaci, Mustapha Bensalah, Mahammed Mahboubi, Laurent Marivaux, Fateh Mebrouk, Rodolphe Tabuce
article
Palaeovertebrata, Association Palaeovertebrata., 2021, 44 (1- e1), pp.1-32. ⟨10.18563/pv.44.1.e1⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-03136008/file/Rage-et-al._2021_Palaeovertebrata_Algeria-HGL50-Herpetofauna.pdf BibTex
titre
Genetic variation underlies the plastic response to shade of snapdragon plants ( Antirrhinum majus L.)
auteur
Mathilde Mousset, Sara Marin, Juliette Archambeau, Christel Blot, Vincent Bonhomme, Laura Garaud, Benoît Pujol
article
Botany Letters, Taylor & Francis, 2021, pp.1-14. ⟨10.1080/23818107.2020.1857833⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03121294/file/2020_Mousset_BotanyLetters.pdf BibTex
titre
Brown trout phylogenetics: a persistent mirage towards (too) many species
auteur
Bruno Guinand, Münevver Oral, Christelle Tougard
article
Journal of Fish Biology, Wiley, In press, ⟨10.1111/jfb.14686⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03127100/file/Guinand_JFB21.pdf BibTex
titre
Genome-wide macroevolutionary signatures of key innovations in butterflies colonizing new host plants
auteur
Rémi Allio, Benoit Nabholz, Stefan Wanke, Guillaume Chomicki, Oscar Pérez-Escobar, Adam Cotton, Anne-Laure Clamens, Gaël Kergoat, Felix Sperling, Fabien L. Condamine
article
Nature Communications, Nature Publishing Group, 2021, 12, pp.354. ⟨10.1038/s41467-020-20507-3⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03143738/file/Allio%20et%20al.%202021%20-%20Nat.%20Comm.pdf BibTex
titre
Paleoecological Inferences from Long Bone Microanatomical Specializations in Hippopotamoidea (Mammalia, Artiodactyla)
auteur
Alexandra Houssaye, Florian Martin, Jean-Renaud Boisserie, Fabrice Lihoreau
article
Journal of Mammalian Evolution, Springer Verlag, In press, ⟨10.1007/s10914-021-09536-x⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03170283/file/Houssaye_et_al_JME.pdf BibTex
titre
“Health in” and “Health of” Social-Ecological Systems: a practical framework for the management of healthy and resilient agricultural and natural ecosystems
auteur
Serge Morand
article
Frontiers in Public Health, Frontiers Media S.A., In press
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BibTex
titre
The rise of novelty in marine ecosystems: the Baltic Sea case
auteur
Yosr Ammar, Susa Niiranen, Saskia A. Otto, Christian Möllmann, Walter Finsinger, Thorsten Blenckner
article
Global Change Biology, Wiley, In press, ⟨10.1111/gcb.15503⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03110097/file/gcb.15503.pdf BibTex
titre
Women and Global South strikingly underrepresented among top-publishing ecologists
auteur
Bea Maas, Robin J. Pakeman, L. Godet, Linnea Smith, Vincent Devictor, Richard Primack
article
Conservation Letters, Wiley, In press, ⟨10.1111/conl.12797⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03188785/file/Maas%20et%20al.%202021%20%5BCons%20Lett%5D%20Gender%20and%20geographic%20biases.pdf BibTex
titre
A genome-wide investigation of the effect of farming and human-mediated introduction on the ubiquitous seaweed Undaria pinnatifida
auteur
Louis Graf, Younhee Shin, Ji Hyun Yang, Ji Won Choi, Il Ki Hwang, Wendy Nelson, Debashish Bhattacharya, Frédérique Viard, Hwan Su Yoon
article
Nature Ecology & Evolution, Nature, In press, ⟨10.1038/s41559-020-01378-9⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03123153/file/s41559-020-01378-9.pdf BibTex
titre
Application of the FTA elute card coupled with visual colorimetric loop-mediated isothermal amplification for the rapid diagnosis of Streptococcus agalactiae in farmed tilapia (Oreochromis niloticus)
auteur
E. Pepey, T. Taukhid, N. Keck, A. Lusiastuti, Jean-Christophe Avarre, G. Sundari, S. Sarter, Domenico Caruso
article
Journal of Fish Diseases, Wiley, 2021, [Early access], [8 p.]. ⟨10.1111/jfd.13337⟩
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BibTex
titre
DILS: Demographic inferences with linked selection by using ABC
auteur
Christelle Fraïsse, Iva Popovic, Clément Mazoyer, Bruno Spataro, Stephane Delmotte, Jonathan Romiguier, Etienne Loire, Alexis Simon, Nicolas Galtier, Laurent Duret, Nicolas Bierne, Xavier Vekemans, Camille Roux
article
Molecular Ecology Resources, Wiley/Blackwell, 2021, ⟨10.1111/1755-0998.13323⟩
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BibTex
titre
Intra-host diversity of SARS-Cov-2 should not be neglected : case of the State of Victoria, Australia
auteur
A. Armero, N. Berthet, Jean-Christophe Avarre
article
Viruses, MDPI, 2021, 13 (1), 133 [15 p.]. ⟨10.3390/v13010133⟩
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BibTex
titre
The SgLasso and its cousins for selective genotyping and extreme sampling: application to association studies and genomic selection
auteur
Charles-Elie Rabier, Céline Delmas
article
Statistics, Taylor & Francis: STM, Behavioural Science and Public Health Titles, In press
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02123295/file/SgLassoRabierDelmasFinalForHalWithSuppMat.pdf BibTex
titre
Reconstructing Holocene landscape and environmental changes at Lago Rogaguado, Bolivian Amazon
auteur
Alena Giesche, Umberto Lombardo, Walter Finsinger, Heinz Veit
article
Journal of Paleolimnology, Springer Verlag, 2021, 65, pp.235-253. ⟨10.1007/s10933-020-00164-8⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03032720/file/Giesche_et_al-2020_JOPL.pdf BibTex
titre
New insights into agriculture in northwestern France from the Bronze Age to the Late Iron Age: a weed ecological approach
auteur
Elsa Neveu, Véronique Zech-Matterne, Cécile Brunet-Cartier, Marie-France Dietsch-Sellami, Frédérique Durand, Francoise Toulemonde
article
Vegetation History and Archaeobotany, Springer Verlag, 2021, 30 (1), pp.47-61. ⟨10.1007/s00334-020-00817-8⟩
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BibTex
titre
Synergistic impacts of anthropogenic fires and aridity on plant diversity in the Western Ghats: Implications for management of ancient social-ecological systems
auteur
Charuta Kulkarni, Walter Finsinger, Pallavi Anand, Sandra Nogué, Shonil Bhagwat
article
Journal of Environmental Management, Elsevier, 2021, 283, pp.111957. ⟨10.1016/j.jenvman.2021.111957⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03119233/file/Kulkarni%20et%20al.%20Manuscript_Submitted_PlusSuppMat.pdf BibTex
titre
Comparing sterile male releases and other methods for integrated control of the tiger mosquito in temperate and tropical climates
auteur
Léa Douchet, Marion Haramboure, Thierry Baldet, Gregory L’ambert, David Damiens, Louis Gouagna, Jérémy Bouyer, Pierrick Labbé, Annelise Tran
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2021, 11, pp.7354. ⟨10.1038/s41598-021-86798-8⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03188096/file/Douchet_2021_SciReports_ModelSITIPMMosq.pdf BibTex
titre
Late Quaternary vegetation and climate of SE Europe - NW Asia according to pollen records in three offshore cores from the Black and Marmara seas
auteur
Speranta - Maria Popescu, Gonzalo Jimenez-Moreno, Stefan Klotz, Gilles Lericolais, François Guichard, M. Namik Cagatay, Liviu Giosan, Michel Calleja, Séverine Fauquette, Jean-Pierre Suc
article
Palaeobiodiversity and Palaeoenvironments, Springer Verlag, In press
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03104560/file/Popescu%20et%20al.%2C%202020%2C%20Palaeobiodiversity%20and%20Palaeoenvironments.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Disentangling human-fire-climate linkages at mid-elevations in the Šumava Mountains of central Europe
auteur
Vachel Carter, Alice Moravcová, Petr Kuneš, Dagmar Dreslerová, Walter Finsinger, Andrei-Cosmin Diaconu, Willy Tinner, Gabriela Florescu, Daniel Nývlt, Martin Kladlec, Marco Heurich
article
EGU General Assembly 2021, Apr 2021, Vienna, Austria
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titre
Holocene spatio-temporal patterns of biomass burning in the Bohemian-Bavarian Forest Mountains (Central Europe)
auteur
Gabriela Florescu, Petr Kuneš, Willy Tinner, Marco Heurich, Walter Finsinger, Alice Moravcová, Dagmar Dreslerová, Gunther Kletetschka, Daniel Vondrak, Vachel Carter
article
EGU General Assembly 2021, Apr 2021, Vienna, Austria
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BibTex
titre
Genome wide association studies revealed one strong effect QTLfor viral nervous necrosis resistance in European sea bass (Dicentrarchus labrax)
auteur
Ronan Griot, François Allal, F. Phocas, Sophie Brard-Fudulea, Romain Morvezen, Pierrick Haffray, Anastasia Bestin, Yoannah François, Thierry Morin, Charles Poncet, Alain Vergnet, Sophie Cariou, Joseph Brunier, Jean-Sebastien Bruant, Bruno Peyrou, Pierre-Alexandre Gagnaire, Marc Vandeputte
article
Aquaculture Europe 2020, Apr 2021, Cork, Ireland
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Chapitre d'ouvrage

titre
Staining and Tracking Methods for Studying Sponge Cell Dynamics
auteur
Carole Borchiellini, Sandie Degnan, Emilie Le Goff, Caroline Rocher, Amélie Vernale, Stephen Baghdiguian, Nina Séjourné, Florent Marschal, André Le Bivic, Nelly Godefroy, Bernard Degnan, Emmanuelle Renard
article
Developmental Biology of the Sea Urchin and Other Marine Invertebrates, pp.81-97, 2021, ⟨10.1007/978-1-0716-0974-3_5⟩
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Autre publication

titre
Dispersal: from “neutral” to a state- and context-dependent view
auteur
Emanuel A Fronhofer
article
2021, pp.100074. ⟨10.24072/pci.ecology.100074⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03168993/file/DOC.pdf BibTex

Rapport

titre
SARS-CoV-2 Through the Lens of Computational Biology: How bioinformatics is playing a key role in the study of the virus and its origins
auteur
Samuel Alizon, Frédéric Cazals, Stéphane Guindon, Claire Lemaitre, Tristan Mary-Huard, Anna Niarakis, Mikaël Salson, Celine Scornavacca, Hélène Touzet
article
[Research Report] CNRS. 2021
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https://hal-cnrs.archives-ouvertes.fr/hal-03170023/file/bioinfocov.pdf BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
Adaptation in a heterogeneous environment. I: Persistence versus extinction
auteur
François Hamel, Florian Lavigne, Lionel Roques
article
2021
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02612415/file/hlr2.pdf BibTex
titre
Statistical interpretations and new findings on Variation in Cancer Risk Among Tissues
auteur
Robert Noble, Oliver Kaltz, Michael Hochberg
article
2021
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https://arxiv.org/pdf/1502.01061 BibTex
titre
The accelerated infectious disease risk in the Anthropocene: more outbreaks and wider global spread
auteur
Serge Morand, Bruno Walther
article
2021
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BibTex
titre
Why does COVID-19 case fatality rate vary among countries?
auteur
Gabriele Sorci, Bruno Faivre, Serge Morand
article
2021
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BibTex
titre
Evolutionary responses to codon usage of horizontally transferred genes in Pseudomonas aeruginosa
auteur
Martijn Callens, Celine Scornavacca, Stéphanie Bedhomme
article
2021
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BibTex
titre
PlasForest: a homology-based random forest classifier for plasmid detection in genomic datasets
auteur
Léa Pradier, Anna-Sophie Fiston-Lavier, Stéphanie Bedhomme, Tazzio Tissot
article
2021
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BibTex
titre
Relaxation of purifying selection suggests low effective population size in eusocial Hymenoptera and solitary pollinating bees
auteur
Arthur Weyna, Jonathan Romiguier
article
2021
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BibTex
titre
Anaemic women are more at risk of injectable contraceptive discontinuation due to side-effects in Ethiopia
auteur
Rose Stevens, Blandine Malbos, Eshetu Gurmu, Jeremie Riou, Alexandra Alvergne
article
2021
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03092095/file/2020_preprint_AnemiaDSE.pdf BibTex

2020

Article dans une revue

titre
L’évolution du couvert forestier et son exploitation mésolithique et néolithique à La Font-aux-Pigeons (Châteauneuf-les-Martigues, Bouches-du-Rhône) : apports de l’anthracologie
auteur
Janet Battentier, Stéphanie Thiébault, Didier Binder, Jean Courtin, Ingrid Sénépart, Laurent Bouby, Isabelle Théry-Parisot, Claire Delhon
article
Quaternaire, AFEQ-CNF INQUA, 2020, pp.263-280. ⟨10.4000/quaternaire.14308⟩
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titre
An ancient tropical origin, dispersals via land bridges and Miocene diversification explain the subcosmopolitan disjunctions of the liverwort genus Lejeunea
auteur
Gaik Ee Lee, Fabien L. Condamine, Julia Bechteler, Oscar Alejandro Pérez‑escobar, Armin Scheben, Alfons Schäfer‑verwimp, Tamas Pocs, Jochen Heinrichs
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2020, 10 (1), pp.14123. ⟨10.1038/s41598-020-71039-1⟩
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titre
Evolutionary superscaffolding and chromosome anchoring to improve Anopheles genome assemblies
auteur
Robert Waterhouse, Sergey Aganezov, Yoann Anselmetti, Jiyoung Lee, Livio Ruzzante, Maarten Reijnders, Romain Feron, Sèverine Bérard, Phillip George, Matthew Hahn, Paul Howell, Maryam Kamali, Sergey Koren, Daniel Lawson, Gareth Maslen, Ashley Peery, Adam Phillippy, Maria Sharakhova, Eric Tannier, Maria Unger, Simo Zhang, Max Alekseyev, Nora Besansky, Cedric Chauve, Scott Emrich, Igor Sharakhov
article
BMC Biology, BioMed Central, 2020, 18 (1), pp.1-20. ⟨10.1186/s12915-019-0728-3⟩
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Seasonality and interindividual variation in mandrill feeding ecology revealed by stable isotope analyses of hair and blood
auteur
Vicky Oelze, Alice Percher, Gontran Nsi Akoué, Nory El Ksabi, Eric Willaume, Marie Charpentier
article
American Journal of Primatology, Wiley, 2020, ⟨10.1002/ajp.23206⟩
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titre
Les interactions entre les densovirus et leurs hôtes moustiques
auteur
Christophe Boëte
article
Les cahiers de la Recherche. Santé, Environnement, Travail, ANSES, 2020, La lutte antivectorielle, pp.34-35
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titre
Probability of myopia in children with high refined carbohydrates consumption in France
auteur
Claire Berticat, Sonia Mamouni, Angelique Ciais, Max Villain, Michel Raymond, Vincent Daien
article
BMC Ophthalmology, BioMed Central, 2020, 20 (1), ⟨10.1186/s12886-020-01602-x⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02942970/file/RiskFactors_Myopia_HAL.pdf BibTex
titre
The geometry and genetics of hybridization
auteur
Hilde Schneemann, Bianca de Sanctis, Denis Roze, Nicolas Bierne, John Welch
article
Evolution (International Journal of Organic Evolution), MOHAMED A. NOOR, Editor-in-Chief, 2020, ⟨10.1101/862235⟩
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titre
Variations in isotope incorporation rates and trophic discrimination factors of carbon and nitrogen stable isotopes in scales from three European sea bass (Dicentrarchus labrax) populations
auteur
Charles Rodde, Hugues de Verdal, Sébastien Lefebvre, Christophe Menniti, Marc Vandeputte, Frédéric Clota, François Allal, David Mckenzie, John A.H. Benzie, Sarah Nahon
article
Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, Elsevier, 2020, 533, pp.151468. ⟨10.1016/j.jembe.2020.151468⟩
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titre
InvaCost, a public database of the economic costs of biological invasions worldwide
auteur
C. Diagne, B. Leroy, R. Gozlan, A.-C. Vaissière, C. Assailly, L. Nuninger, David Roiz, F. Jourdain, I. Jarić, F. Courchamp
article
Scientific Data , Nature Publishing Group, 2020, 7 (1), ⟨10.1038/s41597-020-00586-z⟩
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titre
A global database of Holocene paleotemperature records
auteur
Darrell Kaufman, Nicholas Mckay, Cody Routson, Michael Erb, Basil Davis, Oliver Heiri, Samuel Jaccard, Jessica Tierney, Christoph Dätwyler, Yarrow Axford, Thomas Brussel, Olivier Cartapanis, Brian Chase, Andria Dawson, Anne de Vernal, Stefan Engels, Lukas Jonkers, Jeremiah Marsicek, Paola Moffa-Sánchez, Carrie Morrill, Anais Orsi, Kira Rehfeld, Krystyna Saunders, Philipp Sommer, Elizabeth Thomas, Marcela Tonello, Mónika Tóth, Richard Vachula, Andrei Andreev, Sébastien Bertrand, Boris Biskaborn, Manuel Bringué, Stephen Brooks, Magaly Caniupán, Manuel Chevalier, Les Cwynar, Julien Emile-Geay, John Fegyveresi, Angelica Feurdean, Walter Finsinger, Marie-Claude Fortin, Louise Foster, Mathew Fox, Konrad Gajewski,