Équipe de direction :

Agnès Mignot (DU) ; Sébastien Gibert (DA) ; Pierre-Olivier Antoine (DUAdj) ; Nicolas Galtier (DUAdj) ; Jean-Christophe Avarre ; Christelle Hély – Alleaume (DUAdj).

Composition :

Département 1 : Génome (Nicolas Bierne)
Département 2 : Diversité (Ophélie Ronce)
Département 3 : Forme (Julien Claude)
Département 4 : Conservation-Domestication (Jean-François Agnèse)
Département 5 : Paléoenvironnements (Christelle Hély-Alleaume)

Plateformes & Services Communs :

• Plateforme de Génomique Environnementale (PGE labellisée CeMEB)
• Séquençage-Génotypage (labellisée CeMEB)
• ADN dégradé (labellisée CeMEB)
• CytoGénomique (labellisée CeMEB)
• Calcul et Bioinformatique (MBB labellisée CeMEB)
• Microtomographie (labellisée CeMEB et IbiZA)
• Communication Scientifique Visuelle – Collections – Aquaculture – Morphométrie – Bio-indicateurs – Géomatique – Systèmes et Réseau Informatiques (Sr2i) – Librairies à façon pour séquençage haut débit

Les recherches au sein de l’ISEM concernent l’origine et la dynamique de la biodiversité, ainsi que les modalités et les mécanismes de son évolution. Les chercheurs de cette unité s’intéressent tant à la biodiversité actuelle que passée, étudient un large éventail d’organismes et de milieux et allient des approches de terrain, expérimentales et théoriques. Ces recherches intègrent :

• les questions fondamentales de la biologie évolutive (adaptation, contraintes, spéciation, etc.) pour comprendre les mécanismes à l’origine de la biodiversité, de sa structuration et de son fonctionnement ;
• l’accélération des moyens de production de données et de la capacité à appréhender les différentes dimensions structurelles et fonctionnelles du vivant (du gène à l’écosystème), conduisant à une appréhension globale des mécanismes à l’origine de la biodiversité ;
• le questionnement scientifique et sociétal portant sur des réponses de la biodiversité (organismes et/ou communautés) vis-à-vis des changements planétaires et anthropiques.

Publications phares :

• Hochberg, M. E. & Noble, R., 2017. A framework for how environment contributes to cancer risk. Ecology Letters. 20(2): 117-134.
• Darhuddin, H., Hutama, A., Busson, F., Sauri, S., Hanner, R., Keith, P., Hadiaty, R. & Hubert, N., 2017. Revisiting the ichthyodiversity of Java and Bali through DNA barcodes: taxonomic coverage, identifications accuracy, cryptic diversity and identification of alien species. Molecular Ecology Resources. 17(2): 288-299.
• Gros-Balthazard, M., Galimberti, M., Kousathanas, A., Newton, C., Ivorra, S., Paradis, L., Vigouroux, Y., Carter, R., Tengberg, M., Battesti, V., Santoni, S., Falquet, L., Pintaud, J.-C., Terral, J.-F. & Wegmann, D., 2017. The discovery of wild date palms reveals a complex domestication history involving centers in the Middle East and Africa. Current Biology. 27(14): 2211-2218.
• Mourlam, M. J. & Orliac, M. J., 2017. Infrasonic and ultrasonic hearing evolved after the emergence of modern whales. Current Biology. 27(12): 1776-+.
• Duranton, M., Allal, F., Fraïsse, C., Bierne, N., Bonhomme, F. & Gagnaire, P.-A., 2018. The origin and remolding of genomic islands of differentiation in the European sea bass. Nature Communications. 9(1): Article Number: 3022.

Partenariats :

LabEX CeMEB, IBC, LabEx NUMEV, LabEx EpiGenMed, LabEx CEBA, OSU OREME, CIRAD, INRAP.

Coopération internationale :

• Nombreux projets européens (ERC Advanced, Marie Sklodowska-Curie…)
• Partenariats institutionnels au Sud en Indonésie et au Cameroun (IRD).
• Programmes de coopération avec l’Espagne, le Portugal, le Maroc, l’Algérie, la Tunisie, le Sénégal, le Togo, l’Afrique du Sud, Madagascar, le Chili, l’Argentine, le Brésil, le Pérou, la Bolivie, la Thaïlande, l’Indonésie…