L’Institut Desbrest d’Épidémiologie et de Santé Publique (IDESP) vise à comprendre le développement et l’évolution des maladies chroniques qui touchent plus de 30% de la population et qui absorbent 80% des dépenses de soins.

Pour ce faire, l’Unité Mixte de Recherche INSERM – Université de Montpellier utilise une nouvelle approche tenant compte de l’environnement au sens large et des trajectoires de soins à travers des marqueurs multimodaux (cliniques, biologiques, comportementaux, psychologiques, sociaux, environnementaux) et s’appuyant sur la puissance des mathématiques dédiées aux données massives.

Sa finalité est de penser des parcours de soin et de prévention optimisés pour des cibles pertinentes de patients. Les maladies allergiques et respiratoires, le diabète, l’obésité, les maladies rénales, vasculaires, les rhumatismes inflammatoires et les cancers nourrissent les premières modélisations.

Label : Unité Mixte de Recherche (UMR)
Tutelles principales : UM, Inserm
Département scientifique : Biologie Santé
Écoles doctorales
: Information, Structures, Systèmes ; Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé

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Institut Universitaire de Recherche Clinique
641 Avenue du Doyen Gaston Giraud
34093 Montpellier France

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Publications HAL de la structure 1062542

2022

Article dans une revue

titre
Benchmarking missing-values approaches for predictive models on health databases
auteur
Alexandre Perez-Lebel, Gaël Varoquaux, Marine Le Morvan, Julie Josse, Jean-Baptiste Poline
article
GigaScience, BioMed Central, In press
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03526292/file/Benchmarking%20missing-values%20approaches%20for%20predictive%20models%20on%20health%20databases.pdf BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
Generalizing treatment effects with incomplete covariates
auteur
Imke Mayer, Julie Josse, Traumabase Group
article
2022
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03517373/file/main.pdf BibTex

2021

Article dans une revue

titre
Vitamin D deficiency during late pregnancy mediates placenta-associated complications
auteur
Tiphaine Raia-Barjat, Camille Sarkis, Florence Rancon, Lise Thibaudin, Jean-Christophe Gris, Nadia Alfaidy, Céline Chauleur
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-021-00250-5⟩
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titre
A multivariate model for successful publication of intensive care medicine randomized controlled trials in the highest impact factor journals: the SCOTI score
auteur
Joris Pensier, Audrey de Jong, Gerald Chanques, Emmanuel Futier, Elie Azoulay, Nicolas Molinari, Samir Jaber
article
Annals of Intensive Care, SpringerOpen, 2021, 11 (1), ⟨10.1186/s13613-021-00954-x⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03453658/file/2021%20Pensier%20et%20al.%2C%20A%20Multivariane%20model.pdf BibTex
titre
2022 French Society for Rheumatology (SFR) recommendations on the everyday management of patients with spondyloarthritis, including psoriatic arthritis
auteur
Daniel Wendling, Sophie Hecquet, Olivier Fogel, Jean-Guillaume Letarouilly, Frank Verhoeven, Thao Pham, Clément Prati, Anna Molto, Philippe Goupille, Emmanuelle Dernis, Alain Saraux, Adeline Ruyssen-Witrand, Cédric Lukas, Corinne Miceli-Richard, Christophe Hudry, Pascal Richette, Maxime Breban, Laure Gossec, Maxime Dougados, Pascal Claudepierre
article
Joint Bone Spine, Elsevier Masson, 2021, pp.105344. ⟨10.1016/j.jbspin.2022.105344⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03533071/file/1-s2.0-S1297319X22000033-main.pdf BibTex
titre
Non-pharmalogical interventions and breast cancer: What benefit in addition to radiotherapy?
auteur
Béatrice Lognos, Murielle Glondu, Pierre Senesse, Marian Gutowski, William Jacot, Claire Lemanski, Michel Amouyal, David Azria, Estelle Guerdoux, Céline Bourgier
article
Cancer Radiothérapie, Elsevier Masson, In press, ⟨10.1016/j.canrad.2021.09.011⟩
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titre
The Role of the Adhesion Receptor CD146 and Its Soluble Form in Human Embryo Implantation and Pregnancy
auteur
Sylvie Bouvier, Elise Kaspi, Ahmad Joshkon, Odile Paulmyer-Lacroix, Marie-Dominique Piercecchi-Marti, Akshita Sharma, Aurelie Leroyer, Alexandrine Bertaud, Jean-Christophe Gris, Françoise Dignat-George, Marcel Blot-Chabaud, Nathalie Bardin
article
Frontiers in Immunology, Frontiers, 2021, 12, ⟨10.3389/fimmu.2021.711394⟩
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BibTex
titre
Experimental Evidence of 2,3,7,8-Tetrachlordibenzo-p-Dioxin (TCDD) Transgenerational Effects on Reproductive Health
auteur
Laura Gaspari, Françoise Paris, Nicolas Kalfa, Marie-Odile Soyer-Gobillard, Charles Sultan, Samir Hamamah
article
International Journal of Molecular Sciences, MDPI, 2021, 22 (16), pp.9091. ⟨10.3390/ijms22169091⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03338906/file/gaspari%202021%20review%20souris.pdf BibTex
titre
Impact of Rain Precipitation on Urban Atmospheric Particle Matter Measured at Three Locations in France between 2013 and 2019
auteur
Neal Mcmullen, Isabella Annesi-Maesano, Jean-Baptiste Renard
article
Atmosphere, MDPI 2021, 12 (6), pp.769. ⟨10.3390/atmos12060769⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03265829/file/atmosphere-12-00769.pdf BibTex
titre
COVID-19-Related National Re-confinement: Recommendations From the National French Observatory for Physical Activity and Sedentary Behaviors (ONAPS)
auteur
David Thivel, Michele Tardieu, Pauline Genin, Alicia Fillon, Benjamin Larras, Pierre Melsens, Julien Bois, Frederic Dutheil, Francois Carre, Gregory Ninot, Jean-François Toussaint, Daniel Riviere, Yves Boirie, Bruno Pereira, Angelo Tremblay, Martine Duclos
article
Journal of Physical Activity and Health, Human Kinetics, 2021, 18 (5), pp.474-476. ⟨10.1123/jpah.2020-0735⟩
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titre
Tonnerre de Brest ! Des Journées de Recherche Respiratoires 2020 pas comme les autres…
auteur
I. Annesi-Maesano, P. Bonniaud, G. Bouchaud, L. Boyer, N. Frossard, S. Gazzeri, P. Gosset, D. Gras, C. Guibert, C. Guignabert, B. Mari, Stefan Matecki, C. Morelot, C. Pilette, C. Planes, L. Plantier, M. Polette, M. Si-Tahar, C. Taillé, I. Vachier
article
Revue des Maladies Respiratoires, Elsevier Masson, 2021, 38 (6), pp.565-566. ⟨10.1016/j.rmr.2021.05.002⟩
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titre
Cardiovascular events and change in cholesterol levels in patients with rheumatoid arthritis treated with tocilizumab: data from the REGATE Registry.
auteur
Cédric Lukas, Manon Redondin, Isabelle Pane, Martin Soubrier, Eric Houvenagel, Jean Sibilia, Bernard Combe, Jacques Morel
article
Clinical and experimental rheumatology, Clinical and Experimental Rheumatology Sas, 2021, 39 (3), pp.501-507
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titre
Hemangiol® in infantile haemangioma: A paediatric post‐marketing surveillance drug study
auteur
Floriane Socchi, Michele Bigorre, Marion Normandin, Guillaume Captier, Didier Bessis, Michel Mondain, Catherine Blanchet, Mohamed Akkari, Pascal Amedro, Arthur Gavotto
article
British Journal of Clinical Pharmacology, Wiley, 2021, 87 (4), pp.1970-1980. ⟨10.1111/bcp.14593⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02983121/file/2020%20Socchi%20et%20al.%2C%20Hemangiol%20in.pdf BibTex
titre
Hypersensitivity to gadolinium-based contrast agents: A single-center retrospective analysis over 7 years
auteur
Farid Mankouri, Amélie Gauthier, Witchaya Srisuwatchari, Aurélie Moutou, Anna Borushko, Lidia Popa, Yohan Ehrhardt, Pascal Demoly, Anca Mirela Chiriac
article
Journal of Allergy and Clinical Immunology: In Practice, Elsevier, 2021, 9 (4), pp.1746-1749.e2. ⟨10.1016/j.jaip.2020.11.023⟩
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titre
Pros and cons for the role of air pollution on COVID‐19 development
auteur
Isabella Annesi‐maesano, Cara Nichole Maesano, Maria D’amato, Gennaro D’amato
article
Allergy, Wiley, 2021, ⟨10.1111/all.14818⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03263452/file/Annesi%E2%80%90Maesano%20et%20al.%20-%20Pros%20and%20cons%20for%20the%20role%20of%20air%20pollution%20on%20COV.pdf BibTex
titre
Le cancer du rein dans le département de L’Hérault : résultats de 30 ans d’enregistrement
auteur
M. Hutin, B. Trétarre, C. Gras, F. Bessaoud, J.-P. Daurès, O. Delbos, J.-P. Bringer, D. Ayuso, R. Thuret, D. Azria, I. Serre, D. Brel, R. Reis Borges, F. Iborra, X. Rébillard
article
Progrès en Urologie, Elsevier Masson, 2021, 31 (3), pp.175-182. ⟨10.1016/j.purol.2020.10.001⟩
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titre
Delayed positive drug provocation tests to beta‐lactams with flare‐up reactions of skin tests sites
auteur
Sabela Pérez-Codesido, Jean-Luc Bourrain, Pascal Demoly, Anca-Mirela Chiriac
article
Clinical and Experimental Allergy, Wiley, 2021, 51 (3), pp.499-502. ⟨10.1111/cea.13810⟩
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titre
Optimal biological dose: a systematic review in cancer phase I clinical trials
auteur
J Fraisse, D Dinart, D Tosi, C Bellera, C Mollevi
article
BMC Cancer, BioMed Central, 2021, 21 (1), pp.60. ⟨10.1186/s12885-021-07782-z⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-03217931/file/s12885-021-07782-z.pdf BibTex
titre
Time to initiation of biologic disease-modifying antirheumatic drugs in the French cohort ESPOIR
auteur
Joanna Kedra, Benjamin Granger, Stéphanie Emilie, Cécile Gaujoux-Viala, Anne-Christine Rat, Bernard Combe, Bruno Fautrel
article
Joint Bone Spine, Elsevier Masson, 2021, 88 (1), pp.105060. ⟨10.1016/j.jbspin.2020.07.009⟩
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titre
Breath acetone concentration: too heterogeneous to constitute a diagnosis or prognosis biomarker in heart failure? A systematic review and meta-analysis
auteur
Fares Gouzi, Diba Ayache, Christophe Hédon, Nicolas Molinari, Aurore Vicet
article
Journal of Breath Research, IOP Science, In press, ⟨10.1088/1752-7163/ac356d⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03414215/file/2021%20Gouzi%20et%20al.%2C%20Breath%20acetone.pdf BibTex
titre
A Critical Review of Statistical Methods for Twin Studies Relating Exposure to Early Life Health Conditions
auteur
Salvatore Fasola, Laura Montalbano, Giovanna Cilluffo, Benjamin Cuer, Velia Malizia, Giuliana Ferrante, Isabella Annesi-Maesano, Stefania La Grutta
article
International Journal of Environmental Research and Public Health, MDPI, 2021, 18 (23), pp.12696. ⟨10.3390/ijerph182312696⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-03467936/file/Fasola%20et%20al_2021_A%20Critical%20Review%20of%20Statistical%20Methods%20for%20Twin%20Studies%20Relating%20Exposure%20to.pdf BibTex
titre
Pre-exposure prophylaxis makes it possible to better live one’s sexuality and guide men who have sex with men towards a responsible approach to their health: a phenomenological qualitative study about primary motivations for PrEP
auteur
Marie Bistoquet, Alain Makinson, Vincent Tribout, Cyril Perrollaz, Gérard Bourrel, Jacques Reynes, Agnès Oude Engberink
article
AIDS Research and Therapy, BioMed Central, 2021, 18, pp.2. ⟨10.1186/s12981-020-00327-7⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03468816/file/BITSOQUET%20BMC%20ART.pdf BibTex
titre
Reply to Zhongzhong Chen, Hua Xie, and Fang Chen’s Letter to the Editor re: Vuthy Ea, Anne Bergougnoux, Pascal Philibert, et al. How Far Should We Explore Hypospadias? Next-generation Sequencing Applied to a Large Cohort of Hypospadiac Patients. Eur Urol 2021;79:507–15
auteur
Anne Bergougnoux, Vuthy Ea, Françoise Paris, Nicolas Kalfa
article
European Urology, Elsevier, In press, ⟨10.1016/j.eururo.2021.03.033⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03198202/file/2021%20Bergougnoux%20et%20alLetter%20reply.pdf BibTex
titre
Endocrine-Disrupting Chemicals and Disorders of Penile Development in Humans
auteur
Laura Gaspari, Benoit Tessier, Françoise Paris, Anne Bergougnoux, Samir Hamamah, Charles Sultan, Nicolas Kalfa
article
Sexual Development, Karger, 2021, ⟨10.1159/000517157⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03328260/file/2021%20Gaspari%20et%20al.%2C%20Endocrine.pdf BibTex
titre
Joint modelling with competing risks of dropout for longitudinal analysis of health-related quality of life in cancer clinical trials
auteur
Benjamin Cuer, Thierry Conroy, Beata Juzyna, Sophie Gourgou, Caroline Mollevi, Célia Touraine
article
Quality of Life Research, Springer Verlag, In press, ⟨10.1007/s11136-021-03040-8⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-03467977/file/MANUSCRIPT_postprint_all.pdf BibTex
titre
Recommendations for risk management and better living with epilepsy. Phenomenological study of the experience of patients, relatives, and bereaved families
auteur
Agnès Oude Engberink, Marie Faucanié, Myriam Boulais, Laurence Nègre-Pages, Gérard Bourrel, Audrey Jaussent, Arielle Crespel, François Carbonnel, Marie-Christine Picot
article
Epilepsy & Behavior, [San Diego CA]: Elsevier B.V., 2021, 125, pp.108412. ⟨10.1016/j.yebeh.2021.108412⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03461231/file/Epilepsy-Behaviour_main%20manuscript_suppl-dataREVISEDVclean-1.pdf BibTex
titre
Low performance of prognostic tools for predicting death before dialysis in older patients with advanced CKD
auteur
Julien Prouvot, Emilie Pambrun, Valery Antoine, Cécile Couchoud, Cécile Vigneau, Sophie Roche, Maud Francois, Christophe Mariat, Daniela Babici, Camelia Prelipcean, Olivier Moranne
article
Journal of Nephrology, Italian Society of Nephrology/Springer, 2021, ⟨10.1007/s40620-021-01180-1⟩
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BibTex
titre
Low income and outcome in idiopathic pulmonary fibrosis: An association to uncover
auteur
Lucile Sesé, Julien Caliez, Isabella Annesi-Maesano, Vincent Cottin, Giancarlo Pesce, Morgane Didier, Zohra Carton, Dominique Israel-Biet, Bruno Crestani, Stéphanie Guillot Dudoret, Jacques Cadranel, Benoit Wallaert, Abdellatif Tazi, Bernard Maître, Grégoire Prévot, Sylvain Marchand-Adam, Sandrine Hirschi, Sandra Dury, Violaine Giraud, Anne Gondouin, Philippe Bonniaud, Julie Traclet, Karine Juvin, Raphael Borie, Jean-François Bernaudin, Dominique Valeyre, Catherine Cavalin, Hilario Nunes, C. Cofi Collaborators
article
Respiratory Medicine, Elsevier, 2021, 183, ⟨10.1016/j.rmed.2021.106415⟩
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Communication dans un congrès

titre
What's a good imputation to predict with missing values?
auteur
Marine Le Morvan, Julie Josse, Erwan Scornet, Gaël Varoquaux
article
NeurIPS 2021 - 35th Conference on Neural Information Processing Systems, Dec 2021, Virtual, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03243931/file/LeMorvan2021_ImputeThenRegress.pdf BibTex
titre
EBBE-Text : Visualisation de la frontière de décision des réseaux de neurones en classification automatique de textes
auteur
Alexis Delaforge, Jérôme Azé, Arnaud Sallaberry, Maximilien Servajean, Sandra Bringay, Caroline Mollevi
article
EGC 2021 - 21ème Conférence Extraction et Gestion des Connaissances, Jan 2021, Montpellier, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03462925/file/1002646%20%283%29.pdf BibTex
titre
Expliquer les prédictions des réseaux de neurones par l'exploration de l'espace de représentation et de la frontière de décision à l'aide d'EBBE-Text
auteur
Alexis Delaforge, Jérôme Azé, Arnaud Sallaberry, Maximilien Servajean, Sandra Bringay, Caroline Mollevi
article
EGC 2021 - 21ème Conférence Extraction et Gestion des Connaissances, Jan 2021, Montpellier, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03462935/file/1002683.pdf BibTex

Poster

titre
Un verre de pipi tous les matins éloigne le médecin. Les pratiques informationnelles des internautes en lien avec l'urinothérapie
auteur
Marcin Trzmielewski, Evangéline Clark, Davide Caimmi
article
16e Congrès Francophone d'Allergologie, May 2021, Edition digitale, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03207501/file/Trzmielewski%20et%20al_Poster_CFA2021.pdf BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
Model-based Clustering with Missing Not At Random Data
auteur
Aude Sportisse, Christophe Biernacki, Claire Boyer, Julie Josse, Matthieu Marbac Lourdelle, Gilles Celeux, Fabien Laporte
article
2021
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03494674/file/MNARclustering.pdf BibTex
titre
Causal effect on a target population: a sensitivity analysis to handle missing covariates
auteur
Bénédicte Colnet, Julie Josse, Erwan Scornet, Gaël Varoquaux
article
2021
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03473691/file/missing-cov.pdf BibTex
titre
Machine Learning Augmented Causal Inference To Estimate The Treatment Effect of Tranexamic Acid In Traumatic Brain Injury
auteur
Imke Mayer, Jean-Denis Moyer, Aliénor Dreyfus, Boutonnet Mathieu, Pierre-Julien Cungi, Arnaud Foucrier, Anatole Harrois, Arthur James, Jean-Pierre Nadal, Julie Josse, Tobias Gauss
article
2021
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03285078/file/bb0d5b0a-2f5c-44cd-8958-67a509017b7f.pdf BibTex

2020

Pré-publication, Document de travail

titre
Causal inference methods for combining randomized trials and observational studies: a review
auteur
Bénédicte Colnet, Imke Mayer, Guanhua Chen, Awa Dieng, Ruohong Li, Gaël Varoquaux, Jean-Philippe Vert, Julie Josse, Shu Yang
article
2020
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03008276/file/main.pdf BibTex

2019

Pré-publication, Document de travail

titre
R-miss-tastic: a unified platform for missing values methods and workflows
auteur
Imke Mayer, Aude Sportisse, Julie Josse, Nicholas Tierney, Nathalie Vialaneix
article
2019
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02879337/file/R-miss-tastic_arXiv_v3.pdf BibTex