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Les travaux de l’UMR visent à contrôler les maladies des plantes : par la connaissance de la diversité et les facteurs de virulence des microorganismes pathogènes et bénéfiques associés aux plantes et des mécanismes qui sont mis en jeu lors de l’infection végétale, par la compréhension des réponses des végétaux aux stress.

Tutelles : CIRAD – IRD – Université de Montpellier
Label : UMR_D 186
Département scientifique : Biologie Agrosciences
École doctorale : GAIA
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911 avenue Agropolis
34394 Montpellier cedex 5

Publications (extraction HAL)

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Publications HAL de la structure 421268

2019

Article dans une revue

titre
CRISPR elements provide a new framework for the genealogy of the citrus canker pathogen Xanthomonas citri pv. citri
auteur
Kwanho Jeong, Alejandra Muñoz-Bodnar, Nathalia Arias Rojas, Lucie Poulin, Luis Miguel Rodriguez-R, Lionel Gagnevin, Christian Vernière, Olivier Pruvost, Ralf Koebnik
article
BMC Genomics, BioMed Central, 2019, 20 (1), pp.1-19. ⟨10.1186/s12864-019-6267-z⟩
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https://hal.univ-reunion.fr/hal-02403788/file/Jeong2019_Article_CRISPRElementsProvideANewFrame.pdf BibTex
titre
Earthworms Building Up Soil Microbiota, a Review
auteur
Regina Medina-Sauza, Marycruz Álvarez-Jiménez, Alix Delhal, Frédérique Reverchon, Manuel Blouin, José Guerrero-Analco, Carlos Cerdán, Roger Guevara, Luc Villain, Isabelle Barois
article
Frontiers in Environmental Science, Frontiers, 2019, 7 (81), pp.1-20. ⟨10.3389/fenvs.2019.00081⟩
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titre
Iron–sulfur protein NFU2 is required for branched-chain amino acid synthesis in Arabidopsis roots
auteur
Brigitte Touraine, Florence Vignols, Jonathan Przybyla-Toscano, Till Ischebeck, Tiphaine Dhalleine, Hui-Chen Wu, Cyril Magno, Nathalie Berger, Jérémy Couturier, Christian Dubos, Ivo Feussner, Stefano Caffarri, Michel Havaux, Nicolas Rouhier, Frédéric Gaymard
article
Journal of Experimental Botany, Oxford University Press (OUP), 2019, 70 (6), pp.1875-1889. ⟨10.1093/jxb/erz050⟩
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titre
On the Close Relatedness of Two Rice-Parasitic Root-Knot Nematode Species and the Recent Expansion of Meloidogyne graminicola in Southeast Asia
auteur
Guillaume Besnard, Ngan Thi-Phan, Hai Ho-Bich, Alexis Dereeper, Hieu Trang Nguyen, Patrick Quénéhervé, Jamel Aribi, Stéphane Bellafiore
article
Genes, MDPI, 2019, 10 (2), pp.175. ⟨10.3390/genes10020175⟩
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titre
A Chemosensory GPCR as a Potential Target to Control the Root-Knot Nematode Meloidogyne incognita Parasitism in Plants
auteur
Emmanuel Bresso, Diana Fernandez, Deisy Amora, Philippe Noel, Anne-Sophie Petitot, Maria-Eugênia Lisei de Sa, Erika Albuquerque, Etienne Danchin, Bernard Maigret, Natália Martins
article
Molecules, MDPI, 2019, 24 (20), pp.3798. ⟨10.3390/molecules24203798⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02324816/file/molecules-24-03798.pdf BibTex
titre
Unravelling the Metabolic and Hormonal Machinery During Key Steps of Somatic Embryogenesis: A Case Study in Coffee
auteur
Rayan Awada, Claudine Campa, Estelle Gibault, Eveline Déchamp, Frédéric Georget, Maud Lepelley, Cécile Abdallah, Alexender Erban, Frederico Martinez-Seidel, Joachim Kopka, Laurent Legendre, Sophie Léran, Geneviève Conejero, Jean-Luc Verdeil, Dominique Crouzillat, David Breton, Benoit Bertrand, Hervé Etienne
article
International Journal of Molecular Sciences, MDPI, 2019, 20 (19), pp.4665. ⟨10.3390/ijms20194665⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02352508/file/AwadaR.-et%20al-IntJ.Mol.Sci.-2019.pdf BibTex

Chapitre d'ouvrage

titre
Cartographier les ressources pour gérer les priorités
auteur
Sébastien Hardy, Marie Sabrié, Thomas Mourier, Corinne Lavagne, V. Thivent, Isabelle Guérin, François Roubaud, Christophe Guilmoto, Mireille Razafindrakoto, Marc Pilon, Isabelle Léglise, Pierre Le Meur, Fatoumata Ouattara, Christian Seignobos, Pierre Chauveau, Eric Léonard, Dominique Guillaud, Alain Froment, Robin Robin, Michel Agier, Sophie Bava, Annabel Desgrées Du Loû, Flore Gubert, Eric Delaporte, Gonzague Jourdain, Alexandre Dumont, Serge Trèche, Jacques Berger, Pierre Traissac, Valérie Delaunay, Vincent Robert, Frédéric Darriet, Cheikh Sokhna, Michel Cot, Martine Peeters, Eric Leroy, Alice Desclaux, Marc Hougard, Didier Paugy, Michel Boussinesq, Philippe Solano, Dorothée Missé, Louis-Clément Gouagna, Jean Lemesre, Laure Banuls, Christophe E. Menkès, Morgan Mangeas, Benjamin Sultan, Thomas Condom, Marie Gosset, Serge Janicot, Jean Nocquet, Luc Le Pennec, Philippe Charvis, Yann Hello, Emmanuel Bonnet, Emilie Strady, David Point, Bernard Ollivier, Isabelle C. Biegala, Christian Feller, Christian Valentin, Eric Giraud, Eric Blanchart, Pierre Montoroi, Philippe Cecchi, Jean Albergel, Jean-Michel Vouillamoz, Vincent Simonneaux, Gil Boulet, Thierry Ruf, Geneviève Michon, Jean-Baptiste Boutrais, Laure Emperaire, Robin Duponnois, Philippe Boulanger, Eugénie Hébrard, Valerie Verdier, Boris Szurek, Bruno Le Ru, Paul-André Calatayud, Olivier Dangles, Frédérique Aberlenc, Sevastianos Roussos, Gauthier Dobigny, Marc Legendre, Daniel Gaertner, Pierre Chavance, Pascal Bach, Arnaud Bertrand, Jérôme Vialard, Jacques Merle, Bruno Voituriez, Bernard Bourlès, Pierrick Penven, Thierry Lebel, Gil Mahé, Luc Descroix, Pierre Chevallier, Stéphane Calmant, Bruno Turcq, Adrien Favreau, Jean-Louis Rajot, Raphaël Pelissier, Philippe Cury, Riccardo Rodolfo-Metalpa, Hervé De Tricornot, Frédéric Simard, Jean-François Etard, Bernard Taverne, Florence Fournet, Alexis Drogoul, Marc Souris, Monique Simier, Marie Bonnin, Alain Ghesquière, Serge Hamon, Yves Vigouroux, Sophie Gonzalez, Jean-François Molino, Geneviève Bourdy, Christian Moretti, Pierre Ottino Garanger, Francisco Valdez, Benoit Antheaume, Nicolas Gratiot
article
Science et développement durable : 75 ans de recherche au Sud, ⟨IRD⟩, 2019, 978-2-7099-2737-6
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Direction d'ouvrage, Proceedings, Dossier

titre
Science et développement durable : 75 ans de recherche au Sud
auteur
Marie-Lise Sabrié, Thomas Mourier, Corinne Lavagne, V. Thivent, Isabelle Guérin, François Roubaud, Christophe Guilmoto, Mireille Razafindrakoto, Marc Pilon, Isabelle Léglise, Pierre Le Meur, Fatoumata Ouattara, Christian Seignobos, Pierre Chauveau, Eric Léonard, Dominique Guillaud, Alain Froment, Robin Robin, Michel Agier, Sophie Bava, Annabel Desgrées Du Loû, Flore Gubert, Eric Delaporte, Gonzague Jourdain, Alexandre Dumont, Serge Trèche, Jacques Berger, Pierre Traissac, Valérie Delaunay, Vincent Robert, Frédéric Darriet, Cheikh Sokhna, Michel Cot, Martine Peeters, Eric Leroy, Alice Desclaux, Marc Hougard, Didier Paugy, Michel Boussinesq, Philippe Solano, Dorothée Missé, Louis-Clément Gouagna, Jean Lemesre, Laure Banuls, Christophe Menkès, Morgan Mangeas, Benjamin Sultan, Thomas Condom, Marie Gosset, Serge Janicot, Jean Nocquet, Luc Le Pennec, Sébastien Hardy, Philippe Charvis, Yann Hello, Emmanuel Bonnet, Emilie Strady, David Point, Bernard Ollivier, Isabelle C. Biegala, Christian Feller, Christian Valentin, Eric Giraud, Eric Blanchart, Pierre Montoroi, Philippe Cecchi, Jean Albergel, Jean-Michel Vouillamoz, Vincent Simonneaux, Gil Boulet, Thierry Ruf, Geneviève Michon, Jean-Baptiste Boutrais, Laure Emperaire, Robin Duponnois, Philippe Boulanger, Eugénie Hébrard, Valerie Verdier, Boris Szurek, Bruno Le Ru, Paul-André Calatayud, Olivier Dangles, Frédérique Aberlenc, Sevastianos Roussos, Gauthier Dobigny, Marc Legendre, Daniel Gaertner, Pierre Chavance, Pascal Bach, Arnaud Bertrand, Jérôme Vialard, Jacques Merle, Bruno Voituriez, Bernard Bourlès, Pierrick Penven, Thierry Lebel, Gil Mahé, Luc Descroix, Pierre Chevallier, Stéphane Calmant, Bruno Turcq, Adrien Favreau, Jean-Louis Rajot, Raphaël Pelissier, Philippe Cury, Riccardo Rodolfo-Metalpa, Hervé De Tricornot, Frédéric Simard, Jean-François Etard, Bernard Taverne, Florence Fournet, Alexis Drogoul, Marc Souris, Monique Simier, Marie Bonnin, Alain Ghesquière, Serge Hamon, Yves Vigouroux, Sophie Gonzalez, Jean-François Molino, Geneviève Bourdy, Christian Moretti, Pierre Ottino Garanger, Francisco Valdez, Benoît Antheaume, Nicolas Gratiot
article
IRD, 2019
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Rapport

titre
Caours Rapport annuel de fouille programmée 2018
auteur
Jean-Luc Locht, Julie Dabkowski, Guillaume Jamet, Pierre Antoine, Patrick Auguste, Noémie Sévêque, Gwénaëlle Moreau, Amélie Vialet, Benoît Bertrand, Nicole Limondin-Lozouet
article
[Rapport de recherche] Service régional de l'Archéologie Hauts-de-France. 2019
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2018

Article dans une revue

titre
Transcriptomic profiling of Burkholderia phymatum STM815, Cupriavidus taiwanensis LMG19424 and Rhizobium mesoamericanum STM3625 in response to Mimosa pudica root exudates illuminates the molecular basis of their nodulation competitiveness and symbiotic evolutionary history
auteur
Agnieszka Klonowska, Rémy Melkonian, Lucie Miché, Pierre Tisseyre, Lionel Moulin
article
BMC Genomics, BioMed Central, 2018, 19 (1), ⟨10.1186/s12864-018-4487-2⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01794087/file/Klonowska18_Transcriptomic%20profiling%20of%20Mimosa%20symbionts.pdf BibTex
titre
Beryllium detection in the very fast nova ASASSN-16kt (V407 Lupi)
auteur
L. Izzo, P. Molaro, P. Bonifacio, M. Della Valle, Z. Cano, A. de Ugarte Postigo, J. L. Prieto, C. Thöne, L. Vanzi, A. Zapata, D. Fernandez
article
Monthly Notices of the Royal Astronomical Society, Oxford University Press (OUP): Policy P - Oxford Open Option A, 2018, 478 (2), pp.1601-1610. ⟨10.1093/mnras/sty435⟩
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https://arxiv.org/pdf/1802.05896 BibTex
titre
Parallels between experimental and natural evolution of legume symbionts
auteur
Camille Clerissi, Marie Touchon, Delphine Capela, Mingxing Tang, Stéphane Cruveiller, Matthew Parker, Lionel Moulin, Catherine Masson-Boivin, Eduardo Rocha
article
Nature Communications, Nature Publishing Group, 2018, 9 (1), pp.2264. ⟨10.1038/s41467-018-04778-5⟩
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https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-01880286/file/s41467-018-04778-5.pdf BibTex
titre
Integrative analysis of the late maturation programme and desiccation tolerance mechanisms in intermediate coffee seeds.
auteur
Stéphane Dussert, Julien Serret, Aldecinei Bastos-Siqueira, Fabienne Morcillo, Eveline Déchamp, Valerie Rofidal, Philippe Lashermes, Hervé Etienne, Thierry Joët
article
Journal of experimental botany, 2018, ⟨10.1093/jxb/erx492⟩
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Thèse

titre
Recherche de marqueurs biochimiques et génétiques de l'adaptation des caféiers cultivés aux variations climatiques
auteur
Ialy Rojo Vestalys
article
Biologie végétale. Université Montpellier; Université d'Antananarivo, 2018. Français. ⟨NNT : 2018MONTG054⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-02010572/file/2018_VESTALYS_archivage.pdf BibTex

2017

Article dans une revue

titre
Identification of a hypervirulent pathotype of Rice yellow mottle virus: A threat to genetic resistance deployment in West-Central Africa
auteur
Eugénie Hébrard, Agnès Pinel-Galzi, Aderonke Oludare, Nils Poulicard, Jamel Aribi, Sandrine Fabre, Souley Issaka, Cédric Mariac, Alexis Dereeper, Laurence Albar, Drissa Silué, Denis Fargette
article
Phytopathology, American Phytopathological Society, 2017, ⟨10.1094/PHYTO-05-17-0190-R⟩
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BibTex
titre
First experimental assessment of protein intrinsic disorder involvement in an RNA virus natural adaptive process.
auteur
Eugénie Hébrard, Justine Charon, Amandine Barra, Jocelyne Walter, Pauline Millot, Benoit Moury, Thierry Michon
article
Molecular Biology and Evolution, Oxford University Press (OUP), 2017, ⟨10.1093/molbev/msx249⟩
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titre
Metagenomic-based impact study of transgenic grapevine rootstock on its associated virome and soil bacteriome
auteur
Jean-Michel Hily, Sandrine Demanèche, Nils Poulicard, Mélanie Tannières, Samia Djennane, Monique Beuve, Emmanuelle Vigne, Gérard Demangeat, Véronique Komar, Claude Gertz, Aurélie Marmonier, Caroline Hemmer, Sophie Vigneron, Armelle Marais, Thierry Candresse, Pascal Simonet, Olivier Lemaire
article
Plant Biotechnology Journal, Wiley, 2017, ⟨10.1111/pbi.12761⟩
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BibTex
titre
Juvenile coffee leaves acclimated to low light are unable to cope with a moderate light increase
auteur
Claudine Campa, Laurent Urban, Laurence Mondolot, Sandrine Roques, Yves Lizzi, Jawad Aarrouf, Sylvie Doulbeau, Jean-Christophe Breitler, Céline Letrez, Lucile Toniutti, Philippe La Fisca, Luc P. R. Bidel, Hervé Etienne, Denis Fabre, Benoît Bertrand
article
Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2017, 8, pp.1126 - 1126. ⟨10.3389/fpls.2017.01126⟩
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https://hal.ird.fr/ird-01599877/file/Juvenile_coffee_leaves.pdf BibTex
titre
Virus-Bacteria Rice Co-Infection in Africa: Field Estimation, Reciprocal Effects, Molecular Mechanisms, and Evolutionary Implications
auteur
Charlotte Tollenaere, Severine Lacombe, Issa Wonni, Mariam Barro, Cyrielle Ndougonna, Fatoumata Gnacko, Drissa Sérémé, Jonathan M. Jacobs, Eugénie Hébrard, Sebastien Cunnac, Christophe Brugidou
article
Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2017, 8, ⟨10.3389/fpls.2017.00645⟩
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BibTex
titre
Fine mapping of RYMV3: a new resistance gene to Rice yellow mottle virus from Oryza glaberrima
auteur
Hélène Pidon, Alain Ghesquière, Sophie Chéron, Souley Issaka, Eugénie Hébrard, François Sabot, Olufisayo Kolade, Drissa Silué, Laurence Albar
article
TAG Theoretical and Applied Genetics, Springer Verlag, 2017, 130 (4), pp.807 - 818. ⟨10.1007/s00122-017-2853-0⟩
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BibTex
titre
Determinants of host species range in plant viruses
auteur
Benoit Moury, Frédéric Fabre, Eugénie Hébrard, Rémy Froissart
article
Journal of General Virology, Microbiology Society, 2017, 98, pp.862-873. ⟨10.1099/jgv.0.000742 ⟩
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BibTex
titre
GhERF-IIb3 regulates the accumulation of jasmonate and leads to enhanced cotton resistance to blight disease.
auteur
Jean-Luc Cacas, Martial Pré, Maxime Pizot, Maimouna Cissoko, Issa Diedhiou, Aida Jalloul, Patrick Doumas, Michel Nicole, Antony Champion
article
Molecular Plant Pathology, Wiley, 2017, 18 (6), pp.825-836. ⟨10.1111/mpp.12445⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01354359/file/CacasJL-et%20al-PostPrint-Mol.PlantPathol.-2016_%7B8933947D-AD4E-47CA-93AD-21FE58A2FACC%7D.pdf BibTex
titre
Effector Mimics and Integrated Decoys, the Never-Ending Arms Race between Rice and Xanthomonas oryzae
auteur
Paola Zuluaga Cruz, Boris Szurek, Ralf Koebnik, Thomas Kroj, Jean-Benoit Morel
article
Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2017, 8, pp.1-4. ⟨10.3389/fpls.2017.00431⟩
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BibTex
titre
Differential accumulation of volatile organic compounds by leaves and roots of two guianese philodendron species, P.fragrantissimum kunth and P.melinonii brongn
auteur
Nina Joffard, Laurent Legendre, Marc Gibernau, Laurence Pascal
article
Chemistry and Biodiversity, Wiley, 2017, 14 (4), ⟨10.1002/cbdv.201600415⟩
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BibTex
titre
Transcriptomic and histological responses of African rice (Oryza glaberrima) to Meloidogyne graminicola provide new insights into root-knot nematode resistance in monocots
auteur
Anne-Sophie Petitot, Tina Kyndt, Rana Haidar, Alexis Dereeper, Myriam Collin, Janice de Almeida Engler, Godelieve Gheysen, Diana Fernandez
article
Annals of Botany, Oxford University Press (OUP), 2017, 119 (5), pp.885-899. ⟨10.1093/aob/mcw256⟩
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Chapitre d'ouvrage

titre
Impacts of invasive species on food webs
auteur
P. David, Elisa Thebault, Orlane Anneville, Pierre-Rançois Duyck, E. Chapuis, Nicolas Loeuille
article
Networks of Invasion: A Synthesis of Concepts, Academic Press, INC., 2017, Advances In Ecological Research, 9780128043387. ⟨10.1016/bs.aecr.2016.10.001⟩
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Poster

titre
Assessment of the viral protein VPg intrinsic disorder contribution to the Potato virus Y adaptation to eIF4E-mediated resistance of pepper (Capsicum annuum)
auteur
Justine Charon, Amandine Barra, Jocelyne Walter, Vincent Simon, Benoit Moury, Pauline Millot, Eugénie Hébrard, Thierry Michon
article
16. Rencontres de Virologie Végétale (RVV 2017), Jan 2017, Aussois, France. 137 p., 2017
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Thèse

titre
Étude de l’évolution et de la fonction des effecteurs TAL par des approches bioinformatiques
auteur
Alvaro Luis Perez Quintero
article
Biologie végétale. Université Montpellier, 2017. Français. ⟨NNT : 2017MONTT089⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01704528/file/2017_PEREZ_archivage.pdf BibTex

2016

Article dans une revue

titre
Genetic diversity, linkage disequilibrium and power of a large grapevine (Vitis vinifera L) diversity panel newly designed for association studies
auteur
Stéphane Nicolas, Jean-Pierre Péros, Thierry Lacombe, Amandine Launay, Marie-Christine Le Paslier, Aurélie Bérard, Brigitte Mangin, Sophie Valière, Frédéric Martins, Loïc Le Cunff, Valérie Laucou, Roberto Bacilieri, Alexis Dereeper, Philippe Chatelet, Patrice This, Agnès Doligez
article
BMC Plant Biology, BioMed Central, 2016, 16 (1), pp.74. ⟨10.1186/s12870-016-0754-z⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-01322529/file/12870_2016_Article_754.pdf https://www.hal.inserm.fr/inserm-01322529/file/12870_2016_754_MOESM10_ESM.pdf https://www.hal.inserm.fr/inserm-01322529/file/12870_2016_754_MOESM12_ESM.pdf https://www.hal.inserm.fr/inserm-01322529/file/12870_2016_754_MOESM14_ESM.pdf https://www.hal.inserm.fr/inserm-01322529/file/12870_2016_754_MOESM15_ESM.pdf https://www.hal.inserm.fr/inserm-01322529/file/12870_2016_754_MOESM16_ESM.pdf https://www.hal.inserm.fr/inserm-01322529/file/12870_2016_754_MOESM17_ESM.pdf https://www.hal.inserm.fr/inserm-01322529/file/12870_2016_754_MOESM18_ESM.pdf https://www.hal.inserm.fr/inserm-01322529/file/12870_2016_754_MOESM19_ESM.pdf https://www.hal.inserm.fr/inserm-01322529/file/12870_2016_754_MOESM6_ESM.pdf https://www.hal.inserm.fr/inserm-01322529/file/12870_2016_754_MOESM9_ESM.pdf BibTex
titre
Mutations in Rice yellow mottle virus Polyprotein P2a Involved in RYMV2 Gene Resistance Breakdown
auteur
Agnès Pinel-Galzi, Christine Dubreuil-Tranchant, Eugénie Hébrard, Cédric Mariac, Alain Ghesquière, Laurence Albar
article
Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2016, 7, ⟨10.3389/fpls.2016.01779⟩
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BibTex
titre
Transcriptome Changes in Hirschfeldia incana in Response to Lead Exposure
auteur
Florence Auguy, Mouna Fahr, Patricia Moulin, Mohamed El Mzibri, Abdelaziz Smouni, Abdelkarim Filali-Maltouf, Gilles Béna, Patrick Doumas
article
Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2016, 6, pp.1231. ⟨10.3389/fpls.2015.01231⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01354256/file/AuguyF.-et%20al%20-Front.Plant.Sci-2016_%7BC9C186C0-482E-466A-830F-4245B251FEB6%7D.pdf BibTex
titre
Characterization of Root-Nodule Bacteria Isolated from Hedysarum spinosissimum L, Growing in Mining Sites of Northeastern Region of Morocco
auteur
Laila Sbabou, Yassir Idir, Odile Bruneel, Antoine Le Quéré, Jamal Aurag, Gilles Béna, Abdelkarim Filali-Maltouf
article
SOJ Microbiology & Infectious Diseases., 2016, 4, pp.1--8. ⟨10.15226/sojmid/4/3/00156⟩
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BibTex
titre
Le riz, une plante modèle à croquer
auteur
Sebastien Cunnac, Pascal Gantet, Alain Ghesquière, Emmanuel Guiderdoni, Doan Luu
article
Biofutur, Elsevier - Cachan : Lavoisier, 2016, 380, pp.30-34
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BibTex
titre
Using Ecology, Physiology, and Genomics to Understand Host Specificity inXanthomonas: French Network on Xanthomonads (FNX)
auteur
Marie Agnes Jacques, Matthieu Arlat, Alice Boulanger, Tristan Boureau, Sebastien Carrere, Sophie Cesbron, Nicolas W.G. Chen, Stéphane Cociancich, Armelle Darrasse, Nicolas Denance, Marion Le Saux, Lionel Gagnevin, Ralf Koebnik, Emmanuelle Lauber, Laurent Noel, Isabelle Pieretti, Perrine Portier, Olivier Pruvost, Adrian Rieux, Isabelle Robene-Soustrade, Monique Royer, Boris Szurek, Valérie Verdier, Christian Vernière
article
Annual Review of Phytopathology, Annual Reviews, 2016, 54 (1), pp.163-187. ⟨10.1146/annurev-phyto-080615-100147⟩
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Communication dans un congrès

titre
Surveillance and control of cassava diseases in Africa - International meeting results in Pan-African cassava disease network
auteur
Jean-Michel Lett, Michel Roux-Cuvelier, Abdou Azali Hamza, H. Atta Diallo, Larry Beach, Henri Brouchoud, Christophe Brugidou, W. Cuellar, Hélène Delatte, Jacques Dintinger, Apollinaire Djikeng, Marie-France Duval, Malika Ethel, Maruthi Gowda, Emmanuel Jouen, Ralf Koebnik, Ousmane Koita, Daouda Koné, K. Nazaire Kouassi, Kossi Kpemoua, Peter Kulakow, P. Lava Kumar, James Legg, Kouame Offei, Emmanuel Okogbenin, Joseph Onyeka, Stéphane Poussier, D. Marian Quain, Jacqueline Rakotoarisoa, Isabelle Robene-Soustrade, A. Rwomushanalvan, B. Sankung Sagnia, Abdourahamane Sangare, Peter Sseruwagi, Fidèle Tiendrébéogo, Philippe Vernier, Christian Vernière, Stephan Winter, Anabela Zacarias, Innocent Zinga, Valerie Verdier, Bernard Reynaud, Claude Fauquet
article
World Congress on Root and Tuber Crops, Jan 2016, Guangxi, China
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titre
Nfu2 and Nfu3 act with HCF101 to transfer 4Fe- 4S clusters to PSI
auteur
Brigitte Touraine, Cyril Magno, Patrice Rey, Hui-Chen Wu, Jérémy Couturier, Saravanan Subramanian, Sunil G. Naik, Thierry Lamant, Boi Hanh Huynh, Jean-Francois Briat, Florence Vignols, Frederic Gaymard, Michael K Johnson
article
XVIII International Symposium on Iron Nutrition and Interactions in Plants, May 2016, Madrid, Spain
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2015

Article dans une revue

titre
High-Quality Draft Genome Sequence of the Xanthomonas translucens pv. cerealis Pathotype Strain CFBP 2541.
auteur
Céline Pesce, Stéphanie Bolot, Sébastien Cunnac, Perrine Portier, Marion Le Saux, Marie Agnes Jacques, Lionel Gagnevin, Matthieu Arlat, Laurent Noel, Sebastien Carrere, Claude Bragard, Ralf Koebnik
article
Genome Announcements, American Society for Microbiology, 2015, 3 (1), ⟨10.1128/genomeA.01574-14⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01209993/file/High_quality_draft_genome_sequence_xanthomonas_translucens.pdf BibTex
titre
Draft Genome Sequence ofXanthomonas translucenspv. graminis Pathotype Strain CFBP 2053
auteur
Céline Pesce, Stéphanie Bolot, Edwige Berthelot, Claude Bragard, Sebastien Cunnac, Marion Le Saux, Perrine Portier, Matthieu Arlat, Lionel Gagnevin, Marie Agnes Jacques, Laurent Noel, Sebastien Carrere, Ralf Koebnik
article
Genome Announcements, American Society for Microbiology, 2015, 3 (5), pp.e01174-15. ⟨10.1128/genomeA.01174-15⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01594261/file/Pesce-2015-GA%20e01174-15_%7B7E5E022C-EBDB-4486-A1CE-24AB93E9C932%7D.pdf BibTex
titre
Terminal-repeat Retrotransposons with GAG domain (TR-GAG) in plant genomes: A new testimony on the complex world of transposable elements
auteur
Cristian Chaparro, T. Gayraud, R.F. de Souza, D.S. Domingues, S. Akaffou, A.L. Laforga Vanzela, A. de Kohcko, M. Rigoreau, D. Crouzillat, S. Hamon, P. Hamon, R. Guyot
article
Genome Biology and Evolution, Society for Molecular Biology and Evolution, 2015, 7 (2), pp.493-504. ⟨10.1093/gbe/evv001⟩
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BibTex
titre
SNiPlay3: a web-based application for exploration and large scale analyses of genomic variations
auteur
Alexis Dereeper, Felix Homa, Gwendoline Andres, Guilhem Sempere, Gautier Sarah, Yann Hueber, Jean-François Dufayard, Manuel Ruiz
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2015, 43 (W1), pp.W295-W300. ⟨10.1093/nar/gkv351⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01279141/file/Nucl.%20Acids%20Res.-2015-Dereeper-W295-300.pdf BibTex
titre
Large distribution and high sequence identity of a Copia‑type retrotransposon in angiosperm families
auteur
Elaine Silva Dias, Clémence Hatt, Perla Hamon, Serge Hamon, M. Rigoreau, D. Crouzillat, C.M.A. Carareto, Alexandre De Kochko, Romain Guyot
article
Plant Molecular Biology, Springer Verlag (Germany), 2015, 89 (1-2), pp.83-97
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https://hal.ird.fr/ird-01225496/file/Dias%20et%20al%20PMB%202015.pdf BibTex
titre
Genomics and transcriptomics of Xanthomonas campestris species challenge the concept of core type III effectome.
auteur
Brice Roux, Stéphanie Bolot, Endrick Guy, Nicolas Denance, Martine Lautier, Marie-Françoise Jardinaud, Marion Le Saux, Perrine Portier, Marie Agnes Jacques, Lionel Gagnevin, Olivier Pruvost, Emmanuelle Lauber, Matthieu Arlat, Sebastien Carrere, Ralf Koebnik, Laurent Noel
article
BMC Genomics, BioMed Central, 2015, 16 (1), pp.975. ⟨10.1186/s12864-015-2190-0⟩
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titre
Identification of CROWN ROOTLESS1-regulated genes in rice reveals specific and conserved elements of postembryonic root formation
auteur
Y Coudert, Thi van Anh Le, H Adam, M Bes, Florence Vignols, Stéphane Jouannic, Emmanuel Guiderdoni, Pascal Gantet
article
New Phytologist, Wiley, 2015, 206, pp.243-254
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Communication dans un congrès

titre
Tandem repeats as genotyping tools for understanding the genetic structure and epidemiology of #Xanthomonas citri# pv. #citri#
auteur
Alice Leduc, Yaya Nadia Traoré, Karine Boyer, Maxime Magne, Pierre Grygiel, Jonathan Gordon, Claudine Boyer, Fabien Guérin, Issa Wonni, Léonard Ouédraogo, Ralf Koebnik, Valerie Verdier, Lionel Gagnevin, Christian Vernière, Virginie Ravigné, Olivier Pruvost
article
Xanthomonas Genomics Conference 2015, Jul 2015, Bogota, Colombia
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2014

Article dans une revue

titre
Caffeine-Based Gold(I) N -Heterocyclic Carbenes as Possible Anticancer Agents: Synthesis and Biological Properties
auteur
Benoît Bertrand, Loïc Stefan, Marc Pirrotta, David Monchaud, Ewen Bodio, Philippe Richard, Pierre Le Gendre, Elena Warmerdam, Marina de Jager, Geny M.M. Groothuis, Michel Picquet, Angela Casini
article
Inorganic Chemistry, American Chemical Society, 2014, 53 (4), pp.2296-2303. ⟨10.1021/ic403011h⟩
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titre
Draft Genome Sequence of Xanthomonas axonopodis pv. allii Strain CFBP 6369.
auteur
Lionel Gagnevin, Stéphanie Bolot, J L Gordon, Olivier Pruvost, Christian Vernière, Isabelle Robene-Soustrade, Matthieu Arlat, Laurent Noel, Sebastien Carrere, Marie Agnes Jacques, Ralf Koebnik
article
Genome Announcements, American Society for Microbiology, 2014, 2 (4), ⟨10.1128/genomeA.00727-14⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01209994/file/Draft_genome_sequence_Xanthomonas_axonopodis.pdf BibTex
titre
Overview of the functional virulent genome of the coffee leaf rust pathogen Hemileia vastatrix with an emphasis on early stages of infection
auteur
Pedro Talhinhas, Helena G. Azinheira, Bruno Vieira, Andreia Loureiro, Silvia Tavares, Dora Batista, Emmanuelle Morin, Anne-Sophie Petitot, Octavio S. Paulo, Julie Poulain, Corinne da Silva, Sébastien Duplessis, Maria Do Ceu Silva, Diana Fernandez
article
Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2014, 5, ⟨10.3389/fpls.2014.00088⟩
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titre
Meloidogyne incognita - rice (Oryza sativa) interaction: a new model system to study plant–root-knot nematode interactions in monocotyledons
auteur
Phong Vũ Nguyễn, Stéphane Bellafiore, Anne-Sophie Petitot, Rana Haidar, Aurélie Bak, Amina Abed, Pascal Gantet, Itamara Mezzalira, Janice de Almeida, Diana Fernandez
article
Rice, Springer Open, 2014, 7, 13 p. ⟨10.1186/s12284-014-0023-4⟩
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titre
A MLVA genotyping scheme for global surveillance of the citrus pathogen Xanthomonas citri pv. citri suggests a worldwide geographical expansion of a single genetic lineage
auteur
Olivier Pruvost, Maxime Magne, Karine Boyer, Alice Leduc, Christophe Tourterel, Christine Drevet, Virginie Ravigné, Lionel Gagnevin, Fabien Guérin, Frédéric Chiroleu, Ralf Koebnik, Valerie Verdier, Christian Vernière
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2014, 9 (6), ⟨10.1371/journal.pone.0098129⟩
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Communication dans un congrès

titre
Comparative genomics and transcriptomics of #Xanthomonas campestris# : Session 3- Physiologie, génétique et génomique des bactéries
auteur
Stéphanie Bolot, Brice Roux, Endrick Guy, Nicolas Denance, Martine Lautier, Emmanuelle Lauber, Marie-Françoise Jardinaud, Ralf Koebnik, Lionel Gagnevin, Stéphane Poussier, Sebastien Carrere, Mathieu Arlat, Laurent D. Noël
article
11èmes Rencontres Plantes-Bactéries, Feb 2014, Aussoies, France. pp.40
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titre
Learning from olive evolution and cultivation to understand the diversity of associated plant-parasitic nematodes communities in Morocco
auteur
Nadine Ali, Elodie Chapuis, Johannes Tavoillot, M. Ait Hamza, A. El Mousadik, A. El Oualkadi, Guillaume Besnard, A. El Bakkali, A. Moukhli, Bouchaib Khadari, C. El Modafar, M. Ater, Z. Ferji, Thierry Mateille
article
5. International Conference Olivebioteq 2014, Nov 2014, Amman, Jordan
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Poster

titre
Surveillance and control of cassava diseases in Africa
auteur
Jean-Michel Lett, Michel Roux-Cuvelier, Abdou Azali Hamza, H. Atta Diallo, Larry Beach, Henri Brouchoud, Christophe Brugidou, W. Cuellar, Hélène Delatte, Jacques Dintinger, Apollinaire Djikeng, Marie-France Duval, Malika Ethel, Maruthi Gowda, Emmanuel Jouen, Ralf Koebnik, Ousmane Koita, Daouda Koné, K. Nazaire Kouassi, Kossi Kpemoua, Peter Kulakow, P. Lava Kumar, James Legg, Kouame Offei, Emmanuel Okogbenin, Joseph Onyeka, Stéphane Poussier, D. Marian Quain, Jacqueline Rakotoarisoa, Isabelle Robene-Soustrade, A. Rwomushanalvan, B. Sankung Sagnia, Abdourahamane Sangare, Peter Sseruwagi, Fidèle Tiendrébéogo, Philippe Vernier, Christian Vernière, Stephan Winter, Anabela Zacarias, Innocent Zinga, Valerie Verdier, Bernard Reynaud, Claude Fauquet
article
International workshop : Surveillance and control of cassava diseases in Africa, Jun 2014, Saint-Pierre, Réunion. 2014
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2013

Article dans une revue

titre
Arabidopsis thaliana Nfu2 Accommodates [2Fe-2S] or [4Fe-4S] Clusters and Is Competent for in Vitro Maturation of Chloroplast [2Fe-2S] and [4Fe-4S] Cluster-Containing Proteins
auteur
Huanyao Gao, Sowmya Subramanian, Jérémy Couturier, Sunil G. Naik, Sung-Kun Kim, Thomas Leustek, David B. Knaff, Hui-Chen Wu, Florence Vignols, Boi Hanh Huynh, Nicolas Rouhier, Michael K. Johnson
article
Biochemistry, American Chemical Society, 2013, 52 (38), pp.6633 - 6645. ⟨10.1021/bi4007622⟩
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titre
Lead tolerance and accumulation in Hirschfeldia incana, a Mediterranean Brassicaceae from metalliferous mine spoils.
auteur
Florence Auguy, Mouna Fahr, Patricia Moulin, Anaïs Brugel, Laurent Laplaze, Mohamed El Mzibri, Abdelkarim Filali-Maltouf, Patrick Doumas, Abdelaziz Smouni
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (5), pp.e61932. ⟨10.1371/journal.pone.0061932⟩
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Communication dans un congrès

titre
Genome and transcriptome analysis to reveal adaptation to new environments and hosts
auteur
L. Gagnevin, Brice Roux, Stéphanie Bolot, Sebastien Carrere, Erika Charbit, S. Cunnac, Marie Agnes Jacques, L. D. Noël, M. Arlat, R. Koebnik
article
APS-MSA Joint Meeting, Aug 2013, Austin, Texas, United States
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2012

Article dans une revue

titre
Assessing the Differential Affinity of Small Molecules for Noncanonical DNA Structures
auteur
Loïc Stefan, Benoît Bertrand, Philippe Richard, Pierre Le Gendre, Franck Denat, Michel Picquet, David Monchaud
article
ChemBioChem, Wiley-VCH Verlag, 2012, 13 (13), pp.1905-1912. ⟨10.1002/cbic.201200396⟩
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titre
Proteome of Aedes aegypti in response to infection and coinfection with microsporidian parasites
auteur
Alison Duncan, Philip Agnew, Valérie Noël, Edith Demettre, Martial Séveno, Jean-Paul Brizard, Yannis Michalakis
article
Ecology and Evolution, Wiley Open Access, 2012, 2 (4), pp.681 - 694. ⟨10.1002/ece3.199⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-01937835/file/Duncan_et_al-2012-Ecology_and_Evolution.pdf BibTex
titre
Study on rice rootknot nematode (Meloidogyne spp.) in Vietnam
auteur
Tx Ngo, Td Nguyen, T.M.H. Nguyen, Pascal Gantet, Stéphane Bellafiore
article
Plant Protection Journal, 2012, 1
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titre
454-pyrosequencing of Coffea arabica leaves infected by the rust fungus Hemileia vastatrix reveals in planta-expressed pathogen-secreted proteins and plant functions in a late compatible plant-rust interaction.
auteur
Diana Fernandez, Emilie Tisserant, Pedro Talhinhas, Helena Azinheira, Ana Vieira, Anne-Sophie Petitot, Andreia Loureiro, Julie Poulain, Corinne da Silva, Maria Do Céu Silva, Sébastien Duplessis
article
Molecular Plant Pathology, Wiley, 2012, 13 (1), pp.17-37. ⟨10.1111/j.1364-3703.2011.00723.x⟩
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titre
Expression profiling of genes involved in the biotrophic colonisation of [i]Coffea arabica[/i] leaves by [i]Hemileia vastatrix[/i]
auteur
Ana Vieira, Pedro Talhinhas, Andreia Loureiro, Johannes Thürich, Sébastien Duplessis, Diana Fernandez, Maria Do Céu Silva, Octávio S Paulo, Helena Gil Azinheira
article
European Journal of Plant Pathology, Springer Verlag, 2012, 133 (1), pp.266-277. ⟨10.1007/s10658-011-9864-5⟩
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Communication dans un congrès

titre
Brachypodium distachyon, une graminée modèle pour l'étude des interactions plante-pathogène
auteur
Thierry Marcel, R Niks, J. C. Wang, Sébastien Antelme, Jean Baptiste Morel, M. Dufresne, Thierry Langin, D. Fernandez, S. Bellafiore, J. Chen, C. Brugidou, Richard Sibout
article
8° Colloque de la Société Française de Phytopathologie (SFP), Jun 2012, Paris, France. p. 168
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BibTex
titre
Phylogenetic analysis of Hemileia vastatrix and related taxa using a genome-scale approach
auteur
Diogo N. Silva, Ana Vieira, Pedro Talhinhas, Helena Gil Azinheira, Maria Do Ceu Silva, Diana Fernandez, Octavio S Paulo, Sébastien Duplessis, Dora Batista
article
24. International Conference on Coffee Science. ASIC 2012, Nov 2012, San Jose, Costa Rica
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2011

Article dans une revue

titre
Transcriptomics of Actinorhizal Symbioses Reveals Homologs of the Whole Common Symbiotic Signaling Cascade
auteur
Valerie Hocher, Nicole Alloisio, Florence Auguy, Pascale Fournier, Patrick Doumas, Petar Pujic, Hassen Gherbi, Clothilde Queiroux, Corinne da Silva, Patrick Wincker, Philippe Normand, Didier Bogusz
article
Plant Physiology, American Society of Plant Biologists, 2011, 156, pp.2700-2711
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titre
Transcriptomics of Actinorhizal Symbioses Reveals Homologs of the Whole Common Symbiotic Signaling Cascade1[W]
auteur
Valerie Hocher, Nicole Alloisio, Florence Auguy, Pascale Fournier, Patrick Doumas, Petar Pujic, Hassen Gherbi, Clothilde Queiroux, Corinne da Silva, Patrick Wincker, Philippe Normand, Didier Bogusz
article
Plant Physiology, American Society of Plant Biologists, 2011, 156, pp.700-711. ⟨10.1104/pp.111.174151⟩
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2008

Article dans une revue

titre
A Role for auxin during actinorhizal symbioses formation?
auteur
Benjamin Péret, Sergio Svistoonoff, Benoit Lahouze, Florence Auguy, Carole Santi, Patrick Doumas, Laurent Laplaze
article
Plant Signaling and Behavior, Taylor & Francis, 2008, 3 (1), pp.34-5
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2007

Article dans une revue

titre
Auxin influx activity is associated with Frankia infection during actinorhizal nodule formation in Casuarina glauca.
auteur
Benjamin Péret, Ranjan Swarup, Leen Jansen, Gaëlle Devos, Florence Auguy, Myriam Collin, Carole Santi, Valérie Hocher, Claudine Franche, Didier Bogusz, Malcolm Bennett, Laurent Laplaze
article
Plant Physiology, American Society of Plant Biologists, 2007, 144 (4), pp.1852-62. ⟨10.1104/pp.107.101337⟩
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