L’unité LSTM étudie le fonctionnement, la diversité et le rôle écologique des symbioses (bactériennes et mycorhiziennes) en milieu tropical et méditerranéen. Ce projet de recherche repose sur une forte pluridisciplinarité des chercheurs spécialisés dans divers domaines (écologie, microbiologie, biologie végétale, phylogénie, génétique, génomique, biologie cellulaire et moléculaire, physiologie, cytologie, bio-informatique) et l’utilisation d’approches innovantes comme la phytostabilisation ou le séquençage de nouvelle génération.
La finalité des travaux scientifiques consiste à développer la meilleure gestion des ressources symbiotiques pour la durabilité et la sauvegarde des écosystèmes tropicaux et méditerranéens.

Label : Unité Mixte de Recherche (UMR)
Tutelles principales : IRD, Institut Agro, INRAE, CIRAD
Tutelle secondaire :
UM
Département scientifique : Biologie agrosciences
École doctorale : Biodiversité, Agriculture, Alimentation, Environnement, Terre, Eau

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CIRAD
Campus international de Baillarguet
TA A-82/J
34398 Montpellier cedex 5 France

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Publications (extraction HAL)

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Publications HAL de la structure 12770

2020

Article dans une revue

titre
A strong east–west Mediterranean divergence supports a new phylogeographic history of the carob tree ( Ceratonia siliqua , Leguminosae) and multiple domestications from native populations
auteur
Juan Viruel, Nicolas Le Galliot, Samuel Pironon, Gonzalo Feliner, Jean-Pierre Suc, Fatma Lakhal-Mirleau, Marianick Juin, Marjorie Selva, Magda Bou, Dagher Kharrat, Lahcen Ouahmane, Stefano Malfa, Katia Diadema, Hervé Sanguin, Frédéric Médail, Alex Baumel
article
Journal of Biogeography, Wiley, 2020, 47 (2), pp.460-471. ⟨10.1111/jbi.13726⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-02305921/file/MS_Phylogeo_Carob_revised_HAL.pdf BibTex

2019

Article dans une revue

titre
Targeted amplicon sequencing of 40 nuclear genes supports a single introduction and rapid radiation of Hawaiian Metrosideros (Myrtaceae)
auteur
Julian Dupuis, Yohan Pillon, Tomoko Sakishima, Chrissen Gemmill, Srikar Chamala, W. Brad Barbazuk, Scott Geib, Elizabeth Stacy
article
Plant Systematics and Evolution, Springer Verlag (Germany), 2019, 305 (10), pp.961-974. ⟨10.1007/s00606-019-01615-0⟩
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titre
noeM, a New Nodulation Gene Involved in the Biosynthesis of Nod Factors with an Open-Chain Oxidized Terminal Residue and in the Symbiosis with Mimosa pudica
auteur
Benoit Daubech, Verena Poinsot, Agnieszka Klonowska, Delphine Capela, Clemence Chaintreuil, Lionel Moulin, Marta Marchetti, Catherine Masson-Boivin
article
Molecular Plant-Microbe Interactions, American Phytopathological Society, 2019, 32 (12), pp.MPMI-06-19-0168. ⟨10.1094/MPMI-06-19-0168-R⟩
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titre
Chitotetraose activates the fungal-dependent endosymbiotic signaling pathway in actinorhizal plant species
auteur
Mireille Chabaud, Joëlle Fournier, Lukas Brichet, Iltaf Abdou-Pavy, Leandro Imanishi, Laurent Brottier, Elodie Pirolles, Valérie Hocher, Claudine Franche, Didier Bogusz, Luis Wallid, Sergio Svistoonoff, Hassen Gherbi, David G. Barker
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2019, 14 (10), pp.e0223149. ⟨10.1371/journal.pone.0223149⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02961598/file/2019_chabaud_plos_one.pdf BibTex
titre
A leguminous species exploiting alpha- and beta-rhizobia for adaptation to ultramafic and volcano-sedimentary soils: an endemic Acacia spirorbis model from New Caledonia
auteur
Bryan Vincent, Farid Juillot, Emmanuel Fritsch, Agnieszka Klonowska, Noëmie Gerbert, Sarah Acherar, Cédric Grangeteau, Laure Hannibal, Antoine Galiana, Marc Ducousso, Philippe Jourand
article
FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2019, 95 (8), ⟨10.1093/femsec/fiz099⟩
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titre
Production of Coconut Aroma in Solid-State Cultivation: Screening and Identification of Trichoderma Strains for 6-Pentyl-Alpha-Pyrone and Conidia Production
auteur
Rayhane Hamrouni, Josiane Molinet, Lucie Miche, Quentin Carboué, Nathalie Dupuy, Ahmed Masmoudi, Sevastianos Roussos
article
Journal of Chemistry , Hindawi Publishing Corporation, 2019, 2019, pp.1-7. ⟨10.1155/2019/8562384⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02279188/file/Hal%202019%20journal%20of%20chemistry.pdf BibTex
titre
Haloarcula sebkhae sp. nov., an extremely halophilic archaeon from Algerian hypersaline environment
auteur
Hélène Barreteau, Manon Vandervennet, Laura Guedon, Vanessa Point, Stéphane Canaan, Sylvie Rebuffat, Jean Peduzzi, Alyssa Carré-Mlouka
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2019, 69 (3), ⟨10.1099/ijsem.0.003211⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01990102/file/Barreteau-2018-IJSEM-HAL.pdf BibTex
titre
Mechanistic Insights into Microsecond Time-Scale Motion of Solid Proteins Using Complementary 15 N and 1 H Relaxation Dispersion Techniques
auteur
Petra Rovó, Colin Smith, Diego Gauto, Bert de Groot, Paul Schanda, Rasmus Linser
article
Journal of the American Chemical Society, American Chemical Society, 2019, 141 (2), pp.858-869. ⟨10.1021/jacs.8b09258⟩
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titre
Twenty years after Jaffré et al. (1998), is the system of protected areas now adequate in New Caledonia?
auteur
Thomas Ibanez, Philippe Birnbaum, Gildas Gâteblé, Vanessa Hequet, Sandrine Isnard, Jérôme Munzinger, Yohan Pillon, Robin Pouteau, Hervé Vandrot, Tanguy Jaffré
article
Biodiversity and Conservation, Springer Verlag, 2019, 28 (1), pp.245-254. ⟨10.1007/s10531-018-1659-y⟩
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titre
Isolation and characterization of potential phosphate solubilizing bacteria in two regions of Senegal
auteur
C.V. Nadiéline, M.F. Ndiaye, S. Fall, Tatiana Krasova Wade, Antoine Le Quéré, D. Diouf
article
African Journal of Microbiology Research, Academic Journal, 2019, 13 (28), pp.609-618, (art. no 8F6E4DF62134). ⟨10.5897/AJMR2019.917⟩
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titre
Transcriptomic dissection of Bradyrhizobium sp. strain ORS285 in symbiosis with Aeschynomene spp. inducing different bacteroid morphotypes with contrasted symbiotic efficiency
auteur
Florian Lamouche, Djamel Gully, Anaïs Chaumeret, Nico Nouwen, Camille Verly, Olivier Pierre, Coline Sciallano, Joël Fardoux, Christian Jeudy, Attila Szücs, Samuel Mondy, Christophe Salon, István Nagy, Attila Kereszt, Yves Dessaux, Eric Giraud, Peter Mergaert, Benoît Alunni
article
Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2019, 21 (9), pp.3244-3258. ⟨10.1111/1462-2920.14292⟩
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titre
Symbiotic properties of a chimeric Nod-independent photosynthetic Bradyrhizobium strain obtained by conjugative transfer of a symbiotic plasmid
auteur
Pongpan Songwattana, Panlada Tittabutr, Jenjira Wongdee, Kamonluck Teamtisong, Dyah Wulandari, Albin Teulet, Joel Fardoux, Nantakorn Boonkerd, Eric Giraud, Neung Teaumroong
article
Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2019, 21 (9), pp.3442-3454. ⟨10.1111/1462-2920.14650⟩
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titre
Short‐term effect of 915‐MHz microwave treatments on soil physicochemical and biological properties
auteur
Géraldine Maynaud, Ezkiel Baudoin, J. Bourillon, Robin Duponnois, Jean Claude Cleyet-Marel, Brigitte Brunel
article
European Journal of Soil Science, Wiley, 2019, 70 (3), pp.443-453. ⟨10.1111/ejss.12769⟩
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titre
Ionomics suggests niche differences between sympatric heathers (Ericaceae)
auteur
Yohan Pillon, Daniel Petit, Christelle Gady, Marilyne Soubrand, Emmanuel Joussein, Gaëlle Saladin
article
Plant and Soil, Springer Verlag, 2019, 434 (1-2), pp.481-489. ⟨10.1007/s11104-018-3870-8⟩
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titre
The rhizosphere microbiome: A key component of sustainable cork oak forests in trouble
auteur
Fatima Zahra Maghnia, Younes Abbas, Frédéric Mahé, Yves Prin, Naima El Ghachtouli, Robin Duponnois, Hervé Sanguin
article
Forest Ecology and Management, Elsevier, 2019, 434, pp.29-39. ⟨10.1016/j.foreco.2018.12.002⟩
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titre
International Committee on Systematics of Prokaryotes Subcommittee on the Taxonomy of Rhizobia and Agrobacteria Minutes of the meeting by video conference, 11 July 2018
auteur
Philippe de Lajudie, J. Peter W. Young
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2019, 69 (6), pp.1835-1840. ⟨10.1099/ijsem.0.003335⟩
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titre
Mutualistic co-evolution of T3SSs during the establishment of symbiotic relationships between Vigna radiata and Bradyrhizobia
auteur
Pongdet Piromyou, Pongpan Songwattana, Kamonluck Teamtisong, Panlada Tittabutr, Nantakorn Boonkerd, Piyada Alisha Tantasawat, Eric Giraud, Michael Göttfert, Neung Teaumroong
article
MicrobiologyOpen, Wiley, 2019, 8 (7), 16 p. ⟨10.1002/mbo3.781⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02617931/file/2019_Piromyou_Microbiology%20Open_1.pdf BibTex
titre
The Modification of the Flavonoid Naringenin by Bradyrhizobium sp. Strain ORS285 Changes the nod Genes Inducer Function to a Growth Stimulator
auteur
Nico Nouwen, Daniel Gargani, Eric Giraud
article
Molecular Plant-Microbe Interactions, American Phytopathological Society, 2019, 32 (11), pp.1517-1525. ⟨10.1094/MPMI-05-19-0133-R⟩
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titre
Rhizobium sophorae, Rhizobium laguerreae, and two novel Rhizobium genospecies associated with Vicia sativa L. in Northwest China
auteur
Junjie Zhang, Yimin Shang, Shanshan Peng, Wenfeng Chen, Entao Wang, Philippe de Lajudie, Benyin Li, Chen Guo, Chunzeng Liu
article
Plant and Soil, Springer Verlag, 2019, 442 (1-2), pp.113-126. ⟨10.1007/s11104-019-04168-w⟩
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titre
The plant-growth-promoting actinobacteria of the genus Nocardia induces root nodule formation in Casuarina glauca
auteur
Faten Ghodhbane-Gtari, Imen Nouioui, Karima Hezbri, Emily Lundstedt, Timothy D’angelo, Zakkary Mcnutt, Laurent Laplaze, Hassen Gherbi, Virginie Vaissayre, Sergio Svistoonoff, Hela Ben Ahmed, Abdelatif Boudabous, Louis S. Tisa
article
Antonie van Leeuwenhoek, Springer Verlag, 2019, 112 (1), pp.75-90. ⟨10.1007/s10482-018-1147-0⟩
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titre
Amborella – Bearing witness to the past ?
auteur
Valerie Poncet, Philippe Birnbaum, Valerie Burtet-Sarramegna, Alexandre de Kochko, Bruno Fogliani, Gildas Gateble, Sandrine Isnard, Tanguy Jaffré, Dominique Job, François Munoz, Jérôme Munzinger, C.P. Scutt, Rémi Tournebize, Santiago Trueba, Yohan Pillon
article
Annual Plant Reviews Online, Wiley, 2019, 3, pp.1 - 41. ⟨10.1002/9781119312994.apr0689⟩
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titre
Two new species of Quintinia (Paracryphiaceae) with notes on the species from New Caledonia and Vanuatu
auteur
Yohan Pillon, Vanessa Hequet
article
Phytotaxa, Magnolia Press 2019, 397 (1), pp.45. ⟨10.11646/phytotaxa.397.1.4⟩
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titre
Genome-wide Association Study of apanel of Vietnamese Rice Landraces Reveals New QTLs for tolerance to water deficit during the vegetative phase
auteur
- Giang Thi Hoang, - Lam van Dinh, - Thom Thi Nguyen, - Nhung Kim Ta, Floran Gathignol, - Chung Duc Mai, Stefan Jouannic, - Khanh Dang Tran, - Trung Huu Khuat, - Vinh Nang Do, Michel Lebrun, Brigitte Courtois, Pascal Gantet
article
Rice, Springer Open, 2019, 12, ⟨10.1186/s12284-018-0258-6⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02620290/file/Publis19-agap-003_1.pdf BibTex
titre
Kermadecia brinoniae (Proteaceae: Macadamieae), a new species from New Caledonia previously confused with K. elliptica
auteur
Helen H.C.F. Hopkins, Yohan Pillon
article
Candollea, 2019, 74 (1), pp.85. ⟨10.15553/c2019v741a9⟩
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titre
Transcriptomic Analysis With the Progress of Symbiosis in ‘Crack-Entry’ Legume Arachis hypogaea Highlights Its Contrast With ‘Infection Thread’ Adapted Legumes
auteur
Kanchan Karmakar, Anindya Kundu, Ahsan Z. Rizvi, Emeric Dubois, Dany Severac, Pierre Czernic, Fabienne Cartieaux, Maitrayee Dasgupta
article
Molecular Plant-Microbe Interactions, American Phytopathological Society, 2019, 32 (3), pp.271-285. ⟨10.1094/MPMI-06-18-0174-R⟩
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titre
Impact of mycorrhiza-based inoculation strategies on Ziziphus mauritiana Lam. and its native mycorrhizal communities on the route of the Great Green Wall (Senegal)
auteur
Babacar Thioye, Hervé Sanguin, Aboubacry Kane, Sergio Mania de Faria, Dioumacor Fall, Yves Prin, Diaminatou Sanogo, Cheikh Ndiaye, Robin Duponnois, Samba Ndao Sylla, Amadou Mustapha Bâ
article
Ecological Engineering, Elsevier, 2019, 128, pp.66-76. ⟨10.1016/j.ecoleng.2018.12.033⟩
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titre
Signalling in actinorhizal root nodule symbioses
auteur
Valérie Hocher, Mariama Ngom, Alyssa Carré-Mlouka, Pierre Tisseyre, Hassen Gherbi, Sergio Svistoonoff
article
Antonie van Leeuwenhoek, Springer Verlag, 2019, 112 (1), pp.23-29. ⟨10.1007/s10482-018-1182-x⟩
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titre
Multiple colonizations, hybridization and uneven diversification in Cyrtandra (Gesneriaceae) lineages on Hawai'i Island
auteur
Melissa A. Johnson, Yohan Pillon, Tomoko Sakishima, Donald K. Price, Elizabeth A. Stacy
article
Journal of Biogeography, Wiley, 2019, 46 (6), pp.1178-1196. ⟨10.1111/jbi.13567⟩
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Communication dans un congrès

titre
Impact of beneficial microorganisms on strawberry growth, fruit production, nutritional quality and volatilome
auteur
G. Lingua, V. Todeschini, Nassima Ait Lahmidi, E. Mazzucco, F. Marsano, F. Gosetti, E. Robott, E. Bona, N. Massa, Laurent Bonneau, E. Marengo, Diederik van Tuinen, G. Berta, Pierre-Emmanuel Courty, Daniel Wipf
article
Microbe-assisted crop production opportunities, challenges & needs (miCROPe 2019), Dec 2019, Vienne, Austria
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titre
Long-term clinical outcome and HAVCR2 mutations in 70 patients with subcutaneous panniculitis-like T-cell lymphoma: a study from the French Cutaneous Lymphoma Group
auteur
G. Sonigo, M. Battistella, M. Beylot-Barry, S. Oro, Nicolas Franck, S. Barete, S. Boulinguez, O. Dereure, N. Bonnet, G. Socie, P. Brice, O. Boccara, C. Bodemer, H. Adamski, M. D’incan, N. Ortonne, S. Fraitag, F. Brunet-Possenti, S. Dalle, F. Suarez, A. Març Ais, F. Skowron, D. Haidar, E. Maubec, G. Bohelay, L Laroche, A. Mahe, E. Birckel, Jd. Bouaziz, I. Brochériou, R. Dubois, S. Faiz, J. Fadlallah, C. Ram-Wolff, A. Carlotti, G. Bens, B. Balme, B. Vergier, S. Laurent-Roussel, L. Deschamps, O. Carpentier, P. Moguelet, G. Herve, F. Comoz, F. Le Gall, G. Leverger, A. Finon, O. Augereau, C. Bléchet, R. Kerdraon, L. Lamant, E. Tournier, F. Franck, V. Costes Martineau, V. Szablewski, S. Taix, I. Beschet, Fabien Guérin, F. Sepulveda Garrido, M. Bagot, G. de Saint-Basile, D. Michonneau, A. de Masson
article
EORTC CLTF 2019, Sep 2019, Athens, Greece. pp.S7-S8, ⟨10.1016/S0959-8049(19)30530-1⟩
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titre
noeM, a novel nodulation gene involved in symbiosis with Mimosa pudica
auteur
Benoit Daubech, Verena Poinsot, Agnieszka Klonowska, Clemence Chaintreuil, P. Tisseyre, Lionel Moulin, Marta Marchetti, Catherine Masson-Boivin
article
18th Congress of International-Society-for-Molecular-Plant-Microbe-Interactions (IS-MPMI), International Society for Molecular Plant-Microbe Interactions, Jul 2019, Glasgow, United Kingdom. pp.193-194
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titre
The competitiveness to form nodules shapes the capacities of Rhizobium leguminosarum sv viciae communities to promote symbiosis with specific hosts
auteur
Stéphane Boivin, Nassima Ait Lahmidi, D. Sherlock, D Dijon, Karine Heulin-Gotty, Antoine Le Quere, Marjorie Pervent, Marc Tauzin, Sylvie Mazurier, M. Bonhomme, G. Carlsson, E. Jensen, Etienne-Pascal Journet, R.J Lopez-Bellido, M. Seidenglanz, J. Marinkovic, Stefano Colella, Brigitte Brunel, P. Young, Marc Lepetit
article
International Conference on Legume Genetics and Genomics ICLGG 2019, May 2019, Dijon, France
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Chapitre d'ouvrage

titre
Molecular Methods for Research on Actinorhiza
auteur
Gherbi Hassen, Hocher Valérie, Ngom Mariama, Diagne Nathalie, Joëlle Fournier, Carre-Mlouka Alyssa, Wall Luis G., Tisa Louis S., Svistoonoff Sergio
article
Methods in Rhizosphere Biology Research, Reinhardt D., Sharma A., pp.35-59, 2019, Rhizosphere Biology, ⟨10.1007/978-981-13-5767-1_4⟩
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titre
Cartographier les ressources pour gérer les priorités
auteur
Marie-Lise Sabrié, Thomas Mourier, Corinne Lavagne, V. Thivent, Isabelle Guérin, François Roubaud, Christophe Guilmoto, Mireille Razafindrakoto, Marc Pilon, Isabelle Léglise, Pierre Le Meur, Fatoumata Ouattara, Christian Seignobos, Pierre Chauveau, Eric Léonard, Dominique Guillaud, Alain Froment, Nelly Robin, Michel Agier, Sophie Bava, Annabel Desgrées Du Loû, Flore Gubert, Eric Delaporte, Gonzague Jourdain, Alexandre Dumont, Serge Trèche, Jacques Berger, Pierre Traissac, Valérie Delaunay, Vincent Robert, Frédéric Darriet, Cheikh Sokhna, Michel Cot, Martine Peeters, Eric Leroy, Alice Desclaux, Marc Hougard, Didier Paugy, Michel Boussinesq, Philippe Solano, Dorothée Missé, Louis-Clément Gouagna, Jean Lemesre, Anne-Laure Bañuls, Christophe E. Menkès, Morgan Mangeas, Benjamin Sultan, Thomas Condom, Marie Gosset, Serge Janicot, Jean Nocquet, Luc Le Pennec, Sébastien Hardy, Philippe Charvis, Yann Hello, Emmanuel Bonnet, Emilie Strady, David Point, Bernard Ollivier, Isabelle C. Biegala, Christian Feller, Christian Valentin, Eric Giraud, Eric Blanchart, Pierre Montoroi, Philippe Cecchi, Jean Albergel, Jean-Michel Vouillamoz, Vincent Simonneaux, Gil Boulet, Thierry Ruf, Geneviève Michon, Jean-Baptiste Boutrais, Laure Emperaire, Robin Duponnois, Philippe Boulanger, Eugénie Hébrard, Valerie Verdier, Boris Szurek, Bruno Le Ru, Paul-André Calatayud, Olivier Dangles, Frédérique Aberlenc, Sevastianos Roussos, Gauthier Dobigny, Marc Legendre, Daniel Gaertner, Pierre Chavance, Pascal Bach, Arnaud Bertrand, Jérôme Vialard, Jacques Merle, Bruno Voituriez, Bernard Bourlès, Pierrick Penven, Gil Mahe, Thierry Lebel, Luc Descroix, Pierre Chevallier, Stéphane Calmant, Bruno Turcq, Adrien Favreau, Jean-Louis Rajot, Raphaël Pelissier, Philippe Cury, Riccardo Rodolfo-Metalpa, Hervé De Tricornot, Frédéric Simard, Jean-François Etard, Bernard Taverne, Florence Fournet, Alexis Drogoul, Marc Souris, Monique Simier, Marie Bonnin, Alain Ghesquière, Serge Hamon, Yves Vigouroux, Sophie Gonzalez, Jean-François Molino, Geneviève Bourdy, Christian Moretti, Pierre Ottino Garanger, Francisco Valdez, Benoît Antheaume, Nicolas Gratiot
article
Science et développement durable : 75 ans de recherche au Sud, IRD, 2019, 978-2-7099-2737-6
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Poster

titre
The Edaphic Environment: Impact of Olive Trees on the soil beneficial interaction between Durum Wheat roots and Am Fungi
auteur
A. Panozzo, Dominique Desclaux, H. Huang, Robin Duponnois, Yves Prin
article
4. World Congress on Agroforestry, May 2019, Montpellier, France. 933 p., 2019, Book of abstracts. 4th World Congress on Agroforestry 2019
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titre
Genetic diversity of nodulated root structure in a very diverse pea collection
auteur
Valentin Delefortrie, Amira Laroussi, Chantal Martin, Damien Ollivier, Aurélien Barbe, Mickaël Lamboeuf, Karine Heulin-Gotty, Stéphane Boivin, Marc Lepetit, H. Duborjal, M. Leveugle, Jonathan Kreplak, Gregoire Aubert, Virginie Bourion
article
9. International Conference on Legume Genetics and Genomics (ICLGG 2019), Let's harness the potential of legumes, May 2019, Dijon, France. 2019
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BibTex
titre
GRaSP project Genetics of Rhizobia Selection by Pea
auteur
Estelle Amilhastre, Damien Pujos, Valentin Delefortrie, Stéphane Boivin, Solène Mazeau, Chantal Martin, Damien Ollivier, Julie Vera Cullimore, Clare Gough, Karine Heulin-Gotty, Marjorie Pervent, Emilie Vieille, Karen Boucherot, Véronique Biarnès, Anthony Klein, Jonathan Kreplak, Gregoire Aubert, Frederic Debellé, Marc Lepetit, Marion Dalmais, Xavier Pinochet, Virginie Bourion
article
9. International Conference on Legume Genetics and Genomics (ICLGG 2019), Let's harness the potential of legumes, May 2019, Dijon, France. 2019
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2018

Article dans une revue

titre
Transcriptomic profiling of Burkholderia phymatum STM815, Cupriavidus taiwanensis LMG19424 and Rhizobium mesoamericanum STM3625 in response to Mimosa pudica root exudates illuminates the molecular basis of their nodulation competitiveness and symbiotic evolutionary history
auteur
Agnieszka Klonowska, Rémy Melkonian, Lucie Miché, Pierre Tisseyre, Lionel Moulin
article
BMC Genomics, BioMed Central, 2018, 19 (1), ⟨10.1186/s12864-018-4487-2⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01794087/file/Klonowska18_Transcriptomic%20profiling%20of%20Mimosa%20symbionts.pdf BibTex
titre
A phylogenetic framework of the legume genus Aeschynomene for comparative genetic analysis of the Nod-dependent and Nod-independent symbioses
auteur
Laurent Brottier, Clémence Chaintreuil, Paul Simion, Celine Scornavacca, Ronan Rivallan, Pierre Mournet, Lionel Moulin, Gwilym Lewis, Joël Fardoux, Spencer Brown, Mario Gomez-Pacheco, Mickaël Bourges, Catherine Hervouet, Mathieu Gueye, Robin Duponnois, Heriniaina Ramanankierana, Herizo Randriambanona, Hervé Vandrot, Maria Zabaleta, Maitrayee Dasgupta, Angélique D’hont, Eric Giraud, Jean-François Arrighi
article
BMC Plant Biology, BioMed Central, 2018, 18 (1), ⟨10.1186/s12870-018-1567-z⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-01961745/file/Brottier_etal_BMC_Pl_Biol_2018_18.pdf BibTex
titre
Genetic diversity of rhizobia and plant growth promoting rhizobacteria of soil under the influence of Piliostigma reticulatum (DC.) Hochst and their impact on shrub growth
auteur
Nogaye Niang, Sandrine Demanèche, Ibrahima Ndoye, Elisabeth Navarro, Saliou Fall
article
African Journal of Agricultural Research, Academic Journals, 2018, ⟨10.5897/AJAR2018.13494⟩
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https://hal.ird.fr/ird-02497476/file/D9A4E3859299.pdf BibTex
titre
Worldwide Occurrence and Activity of the Reef-Building Coral Symbiont Symbiodinium in the Open Ocean
auteur
Johan Decelle, Quentin Carradec, Xavier Pochon, Nicolas Henry, Sarah Romac, Frédéric Mahé, Micah Dunthorn, Artem Kourlaiev, Christian Voolstra, Patrick Wincker, Colomban de Vargas
article
Current Biology - CB, Elsevier, 2018, 28 (22), pp.3625-3633.e3. ⟨10.1016/j.cub.2018.09.024⟩
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BibTex
titre
Cell remodeling and subtilase gene expression in the actinorhizal plant Discaria trinervis highlight host orchestration of intercellular Frankia colonization
auteur
Joëlle Fournier, Leandro Imanishi, Mireille Chabaud, Iltaf Abdou-Pavy, Andrea Genre, Lukas Brichet, Hernán Ramiro Lascano, Nacira Muñoz, Alice Vayssières, Elodie Pirolles, Laurent Brottier, Hassen Gherbi, Valerie Hocher, Sergio Svistoonoff, David Barker, Luis Wall
article
New Phytologist, Wiley, 2018, 219 (3), pp.1018-1030. ⟨10.1111/nph.15216⟩
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BibTex
titre
Mediterranean forests, land use and climate change : a social-ecological perspective
auteur
Thierry Gauquelin, Geneviève Michon, Richard Joffre, Robin Duponnois, Didier Genin, Bruno Fady, Magda Bou Dagher-Kharrat, Arezki Derridj, Said Slimani, Wadi Badri, Mohamed Alifriqui, Laurent Auclair, Romain Simenel, Mohamed Aderghal, Ezekiel Baudoin, Antoine Galiana, Yves Prin, Hervé Sanguin, Catherine Fernandez, Virginie Baldy
article
Regional Environmental Change, Springer Verlag, 2018, 18 (3), pp.623-636. ⟨10.1007/s10113-016-0994-3⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01594954/file/Hal%20Gauquelin%20et%20al%20revised%20manuscript%20-%20REEC%20-24-02.pdf BibTex
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Selection of arbuscular mycorrhizal fungal strains to improve Casuarina equisetifolia L. and Casuarina glauca Sieb. tolerance to salinity
auteur
Pape Ibrahima Djighaly, Nathalie Diagne, Mariama Ngom, Daouda Ngom, Valérie Hocher, Dioumacor Fall, Diégane Diouf, Laurent Laplaze, Sergio Svistoonoff, Antony Champion
article
Annals of Forest Science, Springer Nature (since 2011)/EDP Science (until 2010), 2018, 75 (3), 11 p. ⟨10.1007/s13595-018-0747-1⟩
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Mesorhizobium wenxiniae sp. nov., isolated from chickpea (Cicer arietinum L.) in China
auteur
Junjie Zhang, Chen Guo, Wenfeng Chen, Philippe de Lajudie, Zhiyan Zhang, Yimin Shang, En Tao Wang
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2018, 68 (6), pp.1930-1936. ⟨10.1099/ijsem.0.002770⟩
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Dynamics of ethylene production in response to compatible Nod factor
auteur
Dugald Reid, Huijun Liu, Simon Kelly, Yasuyuki Kawaharada, Terry Mun, Stig U. Andersen, Guilhem Desbrosses, Jens Stougaard
article
Plant Physiology, American Society of Plant Biologists, 2018, 176 (2), pp.1764-1772. ⟨10.1104/pp.17.01371⟩
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Molecular identification of arbuscular mycorrhizal fungal spores associated to the rhizosphere of Retama raetam in Tunisia
auteur
Mosbah Mahdi, Philippe de Lajudie, Mohamed Mars
article
Soil Science and Plant Nutrition, Taylor & Francis, 2018, 64 (3), pp.335-341. ⟨10.1080/00380768.2018.1431012⟩
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Rhodopseudomonas palustris Strain CGA009 Produces an O-Antigen Built up by a C-4-Branched Monosaccharide: Structural and Conformational Studies
auteur
Roberta Marchetti, Emiliano Bedini, Djamel Gully, Rosa Lanzetta, Eric Giraud, Antonio Molinaro, Alba Silipo
article
Organic Letters, American Chemical Society, 2018, 20 (12), pp.3656-3660. ⟨10.1021/acs.orglett.8b01439⟩
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Vicia faba L. in the Bejaia region of Algeria is nodulated by Rhizobium leguminosarum sv. viciae, Rhizobium laguerreae and two new genospecies
auteur
Djellali Belhadi, Philippe de Lajudie, Nacer Ramdani, Christine Le Roux, Farida Boulila, Pierre Tisseyre, Abdelghani Boulila, Amar Benguedouar, Yahia Kaci, Gisele Laguerre
article
Systematic and Applied Microbiology, Elsevier, 2018, 41 (2), pp.122-130. ⟨10.1016/j.syapm.2017.10.004⟩
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Interdependency of efficient nodulation and arbuscular mycorrhization in Piptadenia gonoacantha, a Brazilian legume tree
auteur
Caroline Bournaud, Euan K. James, Sergio M. de Faria, Michel Lebrun, Remy Melkonian, Robin Duponnois, Pierre Tisseyre, Lionel Moulin, Yves Prin
article
Plant, Cell and Environment, Wiley, 2018, 41 (9), pp.2008-2020. ⟨10.1111/pce.13095⟩
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Bradyrhizobium Lipid A: Immunological Properties and Molecular Basis of Its Binding to the Myeloid Differentiation Protein-2/Toll-Like Receptor 4 Complex
auteur
Luigi Lembo-Fazio, Jean-Marc Billod, Flaviana Di Lorenzo, Ida Paciello, Mateusz Pallach, Sara Vaz-Francisco, Aurora Holgado, Rudi Beyaert, Manuel Fresno, Atsushi Shimoyama, Rosa Lanzetta, Koichi Fukase, Djamel Gully, Eric Giraud, Sonsoles Martin-Santamaria, Maria-Lina Bernardini, Alba Silipo
article
Frontiers in Immunology, Frontiers, 2018, 9, 14 p. ⟨10.3389/fimmu.2018.01888⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02621527/file/2018_Lembo-Fazio_Frontiers%20in%20Immunology_1.pdf BibTex
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Co-inoculation of a Pea Core-Collection with Diverse Rhizobial Strains Shows Competitiveness for Nodulation and Efficiency of Nitrogen Fixation Are Distinct traits in the Interaction
auteur
Virginie Bourion, Karine Heulin-Gotty, Véronique Aubert, Pierre Tisseyre, Marianne Chabert-Martinello, Marjorie Pervent, Catherine Delaitre, Denis Vile, Mathieu Siol, Gérard Duc, Brigitte Brunel, Judith Burstin, Marc Lepetit
article
Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2018, 8, ⟨10.3389/fpls.2017.02249⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02621629/file/Bourion-FPS-2018-OA_1.pdf BibTex
titre
Biochemical characterization and efficacy of Pleurotus, Lentinus and Ganoderma parent and hybrid mushroom strains as biofertilizers of attapulgite for wheat and tomato growth
auteur
Deborah L. Narh Mensah, Robin Duponnois, Julie Bourillon, Frédéric Gressent, Yves Prin
article
Biocatalysis and Agricultural Biotechnology, 2018, 16, pp.63-72. ⟨10.1016/j.bcab.2018.07.021⟩
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Nomenclature and typification in Polyosma (Escalloniaceae) from New Caledonia, with the description of a new species
auteur
Yohan Pillon
article
Phytotaxa, Magnolia Press 2018, 371 (4), pp.267. ⟨10.11646/phytotaxa.371.4.4⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01956102/file/2018_Pillon_Phytotaxa.pdf BibTex
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Structure and inflammatory activity of the LPS isolated from Acetobacter pasteurianus CIP103108
auteur
Mateusz Pallach, Flaviana Di Lorenzo, Fabio Alessandro Facchini, Djamel Gully, Eric Giraud, Francesco Peri, Katarzyna A. Duda, Antonio Molinaro, Alba Silipo
article
International Journal of Biological Macromolecules, Elsevier, 2018, 119, pp.1027-1035. ⟨10.1016/j.ijbiomac.2018.08.035⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01956104/file/2018_Pallach_International%20Journal%20of%20Biological%20Macromolecules.pdf BibTex
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Zymomonas mobilis exopolysaccharide structure and role in high ethanol tolerance
auteur
Mateusz Pallach, Roberta Marchetti, Flaviana Di Lorenzo, Antonio Fabozzi, Eric Giraud, Djamel Gully, Luigi Paduano, Antonio Molinaro, Gerardino D’errico, Alba Silipo
article
Carbohydrate Polymers, Elsevier, 2018, 201, pp.293-299. ⟨10.1016/j.carbpol.2018.08.072⟩
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Phylogenetic diversity of Bradyrhizobium strains nodulating Calicotome spinosa in the Northeast of Algeria
auteur
Adouda Salmi, Farida Boulila, Yasmina Bourebaba, Christine Le Roux, Djellali Belhadi, Philippe de Lajudie
article
Systematic and Applied Microbiology, Elsevier, 2018, 41 (5), pp.452-459. ⟨10.1016/j.syapm.2018.05.005⟩
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Assessment of plant species diversity associated with the carob tree ( Ceratonia siliqua, Fabaceae) at the Mediterranean scales
auteur
Alex Baumel, Pascal Mirleau, Juan Viruel, Magda Bou Dagher Kharrat, Stefano La Malfa, Lahcen Ouahmane, Katia Diadema, Marwa Moakhar, Hervé Sanguin, Frédéric Médail
article
Plant Ecology and Evolution, Botanic Garden Meise and Royal Botanical Society of Belgium, 2018, 151 (2), pp.185-193. ⟨10.5091/plecevo.2018.1423⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01868445/file/Baumel_text_revised_HAL.pdf BibTex
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Phosphorus deficiency increases nodule phytase activity of faba bean–rhizobia symbiosis
auteur
Bouchra Makoudi, Ablaa Kabbadj, Mohammed Mouradi, Laurie Amenc, Odile Domergue, Matthew Blair, Jean-Jacques Drevon, Cherki Ghoulam
article
Acta Physiologiae Plantarum, Springer Verlag, 2018, 40, ⟨10.1007/s11738-018-2619-6⟩
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Hopanoid lipids: from membranes to plant–bacteria interactions
auteur
Brittany J. Belin, Nicolas Busset, Eric Giraud, Antonio Molinaro, Alba Silipo, Dianne K. Newman
article
Nature Reviews Microbiology, Nature Publishing Group, 2018, 16 (5), pp.304-315. ⟨10.1038/nrmicro.2017.173⟩
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Surface ocean metabarcoding confirms limited diversity in planktonic foraminifera but reveals unknown hyper-abundant lineages
auteur
Raphael Morard, Marie-José Garet-Delmas, Frédéric Mahé, Sarah Romac, Julie Poulain, Michal Kucera, Colomban de Vargas
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2018, 8, pp.2539. ⟨10.1038/s41598-018-20833-z⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01718031/file/s41598-018-20833-z.pdf BibTex
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Actinorhizal signaling molecules : Frankia root hair deforming factor shares properties with NIN inducing factor
auteur
Maimouna Cissoko, Valérie Hocher, Hassen Gherbi, Djamel Gully, Alyssa Carré-Mlouka, Seyni Sane, Sarah Pignoly, Antony Champion, Mariama Ngom, Petar Pujic, Pascale Fournier, Maher Gtari, Erik Swanson, Céline Pesce, Louis S. Tisa, Mame Oureye Sy, Sergio Svistoonoff
article
Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2018, 9, 12 p. ⟨10.3389/fpls.2018.01494⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01956101/file/2018_Cissoko_Frontiers%20in%20Plant%20Science.pdf BibTex
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Regulation of nitrogen fixation in Bradyrhizobium sp. strain DOA9 involves two distinct nifA regulatory proteins that are functionally redundant during symbiosis but not during free-living growth