L’unité LSTM étudie le fonctionnement, la diversité et le rôle écologique des symbioses (bactériennes et mycorhiziennes) en milieu tropical et méditerranéen. Ce projet de recherche repose sur une forte pluridisciplinarité des chercheurs spécialisés dans divers domaines (écologie, microbiologie, biologie végétale, phylogénie, génétique, génomique, biologie cellulaire et moléculaire, physiologie, cytologie, bio-informatique) et l’utilisation d’approches innovantes comme la phytostabilisation ou le séquençage de nouvelle génération.
La finalité des travaux scientifiques consiste à développer la meilleure gestion des ressources symbiotiques pour la durabilité et la sauvegarde des écosystèmes tropicaux et méditerranéens.

Label : Unité Mixte de Recherche (UMR)
Tutelles principales : IRD, Institut Agro, INRAE, CIRAD
Tutelle secondaire :
UM
Département scientifique : Biologie agrosciences
École doctorale : Biodiversité, Agriculture, Alimentation, Environnement, Terre, Eau

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CIRAD
Campus international de Baillarguet
TA A-82/J
34398 Montpellier cedex 5 France

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Publications (extraction HAL)

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Publications HAL de la structure 12770;1001926

2022

Article dans une revue

titre
Contrasting nickel and manganese accumulation and localization in New Caledonian Cunoniaceae
auteur
Antony van der Ent, Yohan Pillon, Bruno Fogliani, Vidiro Gei, Tanguy Jaffré, Peter Damian Erskine, Guillaume Echevarria, Kathryn Spiers, Adrian L. D. Paul, Sandrine Isnard
article
Plant and Soil, Springer Verlag, In press, ⟨10.1007/s11104-022-05388-3⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03639816/file/Ent2022_Article_ContrastingNickelAndManganeseA.pdf BibTex
titre
Effects of ultramafic topsoil stockpiling during mine activities on its microbial diversity and other microbiological and physicochemical characteristics
auteur
Laurent Bordez, Yvon Cavaloc, Philippe Jourand, Marc Ducousso, Farid Juillot, Hamid Amir
article
Ecological Engineering, Elsevier, 2022, 177, pp.106563. ⟨10.1016/j.ecoleng.2022.106563⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03581999/file/ECOLENG-S-21-00868.pdf BibTex

2021

Article dans une revue

titre
Systemic control of nodule formation by plant nitrogen demand requires autoregulation-dependent and independent mechanisms
auteur
Marjorie Pervent, Ilana Lambert, Marc Tauzin, Alicia Karouani, Martha Nigg, Marie-Françoise Jardinaud, Dany Severac, Stefano Colella, Marie-Laure Martin-Magniette, Marc Lepetit
article
Journal of Experimental Botany, Oxford University Press (OUP), 2021, 72 (22), pp.7942-7956. ⟨10.1093/jxb/erab374⟩
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titre
Variability in symbiotic efficiency with respect to the growth of pea and lentil inoculated with various rhizobial genotypes originating from sub-humid and semi-arid regions of eastern Algeria
auteur
Nassira Riah, Philippe de Lajudie, Gilles Béna, Karine Heulin, Abdelhamid Djekoun
article
Symbiosis, Springer Verlag, 2021, 85 (3), pp.371-384. ⟨10.1007/s13199-021-00821-0⟩
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titre
Identification of type III effectors modulating the symbiotic properties of Bradyrhizobium vignae strain ORS3257 with various Vigna species
auteur
Pongpan Songwattana, Clémence Chaintreuil, Jenjira Wongdee, Albin Teulet, Mamadou Mbaye, Pongdet Piromyou, Djamel Gully, Joel Fardoux, Alexandre Mahougnon Aurel Zoumman, Alicia Camuel, Panlada Tittabutr, Neung Teaumroong, Eric Giraud
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-021-84205-w⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03274397/file/2021_Songwattana_Scientific-Reports.pdf BibTex
titre
A glutamate synthase mutant of Bradyrhizobium sp. strain ORS285 is unable to induce nodules on Nod factor-independent Aeschynomene species
auteur
Nico Nouwen, Clémence Chaintreuil, Joel Fardoux, Eric Giraud
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-021-00480-7⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03596861/file/2021_Nouwen_Scientific-Reports.pdf BibTex
titre
(112–113) Proposals to amend Recommendations 20A .1 and 23A .3 to expand the diversity of new generic names and epithets
auteur
Yohan Pillon, Helen C.F. Hopkins
article
Taxon, Botanischer Garten und Botanisches Museum, 2021, 70 (6), pp.1387-1388. ⟨10.1002/tax.12614⟩
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titre
Rhizobia use a pathogenic-like effector to hijack leguminous nodulation signalling
auteur
Safirah Tasa Nerves Ratu, Albin Teulet, Hiroki Miwa, Sachiko Masuda, Hien Nguyen, Michiko Yasuda, Shusei Sato, Takakazu Kaneko, Makoto Hayashi, Eric Giraud, Shin Okazaki
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-021-81598-6⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03274463/file/2021_Ratu_Scientific-Reports.pdf BibTex
titre
The Type III Effectome of the Symbiotic Bradyrhizobium vignae Strain ORS3257
auteur
Nicolas Busset, Djamel Gully, Albin Teulet, Joël Fardoux, Alicia Camuel, David Cornu, Dany Severac, Eric Giraud, Peter Mergaert
article
Biomolecules, MDPI, 2021, 11 (11), ⟨10.3390/biom11111592⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03602311/file/2021_Busset_biomolecules.pdf BibTex
titre
Diversity of non- Saccharomyces yeasts of grape berry surfaces from representative Cabernet Sauvignon vineyards in Henan Province, China
auteur
Junjie Zhang, Yimin Shang, Jinyong Chen, Brigitte Brunel, Shanshan Peng, Shuo Li, Entao Wang
article
FEMS Microbiology Letters, Wiley-Blackwell, 2021, 368 (20), ⟨10.1093/femsle/fnab142⟩
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titre
Genetic variation in host-specific competitiveness of the symbiont Rhizobium leguminosarum symbiovar viciae
auteur
Stéphane Boivin, Frederic Mahé, Frederic Debellé, Marjorie Prevent, Mathilde Tancelin, Marc Tauzin, Jerzy Wielbo, Sylvie Mazurier, Peter Young, Marc Lepetit
article
Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2021, 12, ⟨10.22541/au.159237007.72934061⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02967193/file/Boivin-SPS-2021.pdf BibTex
titre
Dynamic Development of White Lupin Rootlets Along a Cluster Root
auteur
Tamara Le Thanh, Bárbara Hufnagel, Alexandre Soriano, Fanchon Divol, Laurent Brottier, Célia Casset, Benjamin Péret, Patrick Doumas, Laurence Marquès
article
Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2021, 12, pp.15. ⟨10.3389/fpls.2021.738172⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03541238/file/Le%20Thanh%20T-et%20al-FrontPlantSci-2021.pdf BibTex
titre
Arachis hypogaea L. from Acid Soils of Nanyang (China) Is Frequently Associated with Bradyrhizobium guangdongense and Occasionally with Bradyrhizobium ottawaense or Three Bradyrhizobium Genospecies
auteur
Junjie Zhang, Shanshan Peng, Shuo Li, Jiangchun Song, Brigitte Brunel, Entao Wang, Euan James, Wenfeng Chen, Mitchell Andrews
article
Microbial ecology, Springer Verlag, 2021, ⟨10.1007/s00248-021-01852-2⟩
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titre
The Natural Antisense Transcript DONE40 Derived from the lncRNA ENOD40 Locus Interacts with SET Domain Protein ASHR3 During Inception of Symbiosis in Arachis hypogaea
auteur
Pritha Ganguly, Dipan Roy, Troyee Das, Anindya Kundu, Fabienne Cartieaux, Zhumur Ghosh, Maitrayee Dasgupta
article
Molecular Plant-Microbe Interactions, American Phytopathological Society, 2021, 34 (9), pp.1057-1070. ⟨10.1094/MPMI-12-20-0357-R⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03597062/file/2021_Ganguly_MPMI.pdf BibTex
titre
Analyzing Multifactorial RNA-Seq Experiments with DicoExpress
auteur
Kévin Baudry, Stefano Colella, Marie-Laure Martin-Magniette, Christine Paysant Le Roux
article
Journal of visualized experiments : JoVE, JoVE, 2021
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titre
Ensifer aridi LMR001T Symbiosis and Tolerance to Stress Do Not Require the Alternative Sigma Factor RpoE2
auteur
Meryem Belfquih, Ilham Sakrouhi, Hassan Ait-Benhassou, Emeric Dubois, Dany Severac, Abdelkarim Filali-Maltouf, Antoine Le Quere
article
Agronomy, MDPI, 2021, 11 (9), ⟨10.3390/agronomy11091787⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03443021/file/2021_Belfquih_Agronomy.pdf BibTex
titre
Development of an Illumina-based analysis method to study bradyrhizobial population structure—case study on nitrogen-fixing rhizobia associating with cowpea or peanut
auteur
Antoine Le Quéré, Seynabou Diop, Noémie Dehaene, Diariatou Niang, Francis Do Rego, Saliou Fall, Marc Neyra, Tatiana Karsova-Wade
article
Applied Microbiology and Biotechnology, Springer Verlag, 2021, 105 (18), pp.6943-6957. ⟨10.1007/s00253-021-11525-2⟩
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titre
The X-ray fluorescence screening of multiple elements in herbarium specimens from the Neotropical region reveals new records of metal accumulation in plants
auteur
Célestine Belloeil, Pierre Jouannais, Charles Malfaisan, Rolando Fernández, Severine Lopez, Dulce Navarrete Gutierrez, Swann Maeder-Pras, Paola Villanueva, Romane Tisserand, Melina Gallopin, Dubiel Alfonso-Gonzalez, Ilsa Fuentes Marrero, Serge Muller, Vanessa Invernon, Yohan Pillon, Guillaume Echevarria, Rosalina Berazaín Iturralde, Sylvain Merlot
article
Metallomics, Royal Society of Chemistry, 2021, 13 (8), ⟨10.1093/mtomcs/mfab045⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03298402/file/20210520_XRF%20Screen%20Manuscript_v1.pdf BibTex
titre
A nuclear phylogenomic study of the angiosperm order Myrtales, exploring the potential and limitations of the universal Angiosperms353 probe set
auteur
Olivier Maurin, Artemis Anest, Sidonie Bellot, Edward Biffin, Grace Brewer, Tristan Charles-Dominique, Robyn Cowan, Steven Dodsworth, Niroshini Epitawalage, Berta Gallego, Augusto Giaretta, Renato Goldenberg, Deise J.P. Gonçalves, Shirley Graham, Peter Hoch, Fiorella Mazine, Yee Wen Low, Catherine Mcginnie, Fabián Michelangeli, Sarah Morris, Darin Penneys, Oscar Alejandro Pérez Escobar, Yohan Pillon, Lisa Pokorny, Gustavo Shimizu, Vanessa Staggemeier, Andrew Thornhill, Kyle Tomlinson, Ian Turner, Thais Vasconcelos, Peter Wilson, Alexandre Zuntini, William Baker, Félix Forest, Eve Lucas
article
American Journal of Botany, Botanical Society of America, 2021, 108 (7), pp.1087-1111. ⟨10.1002/ajb2.1699⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03372269/file/Maurin%20et%20al.%202021.pdf BibTex
titre
Functional Diversification of euANT/PLT Genes in Oryza sativa Panicle Architecture Determination
auteur
Ai Luong, Hélène Adam, Carole Gauron, Pablo Affortit, Fabrice Ntakirutimana, Ngan Khong, Quang Le, Thi Le, Marie Fournel, Michel Lebrun, James Tregear, Stefan Jouannic
article
Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2021, 12, ⟨10.3389/fpls.2021.692955⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03438862/file/2021_Luong_Frontiers-in-Plant-Science.pdf BibTex
titre
Phylogenomics and biogeography of Cunoniaceae (Oxalidales) with complete generic sampling and taxonomic realignments
auteur
Yohan Pillon, Helen Hopkins, Olivier Maurin, Niroshini Epitawalage, Jason Bradford, Zachary Rogers, William Baker, Félix Forest
article
American Journal of Botany, Botanical Society of America, 2021, 108 (7), pp.1181-1200. ⟨10.1002/ajb2.1688⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03438851/file/2021_Pillon_American-Journal-of-Botany.pdf BibTex
titre
Temporal recovery of soil biological activity and diversity after 915-MHz microwave treatments
auteur
Géraldine Maynaud, Ezékiel Baudoin, Frédéric Mahé, Cécile Villenave, Jean-Claude Cleyet-Marel, Brigitte Brunel
article
Biology and Fertility of Soils, Springer Verlag, 2021, 57 (5), pp.603-616. ⟨10.1007/s00374-021-01553-5⟩
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BibTex
titre
A cluster of Ankyrin and Ankyrin-TPR repeat genes is associated with panicle branching diversity in rice
auteur
Giang Khong, Nhu Le, Mai Pham, Helene Adam, Carole Gauron, Hoa Le, Dung Pham, Kelly Colonges, Xuan Pham, Vinh Do, Michel Lebrun, Stefan Jouannic
article
PLoS Genetics, Public Library of Science, 2021, 17 (6), ⟨10.1371/journal.pgen.1009594⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03281312/file/2021_Khong_PlosGenetics.pdf BibTex
titre
International Committee on Systematics of Prokaryotes Subcommittee on the Taxonomy of Rhizobia and Agrobacteria Minutes of the closed meeting by videoconference, 6 July 2020
auteur
Philippe de Lajudie, Seyed Mousavi, J. Peter W. Young
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2021, 71 (5), ⟨10.1099/ijsem.0.004784⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03436268/file/2021_de-Lajudie_International-Journal-of-Systematic-and-Evolutionary-Microbiology.pdf BibTex
titre
A New Species of Argophyllum (Argophyllaceae) with Notes on the Species from New Caledonia and Nickel Hyperaccumulation
auteur
Yohan Pillon, Vanessa Hequet
article
Plants, MDPI, 2021, 10, ⟨10.3390/plants10040701⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03238655/file/plants-10-00701.pdf BibTex
titre
Mycorrhizal inoculation increases fruit production without disturbance of native arbuscular mycorrhizal community in jujube tree orchards (Senegal)
auteur
Babacar Thioye, Hervé Sanguin, Aboubacry Kane, Cheikh Ndiaye, Dioumacor Fall, Diaminatou Sanogo, Robin Duponnois, Sergio Miana de Faria, Samba Ndao Sylla, Amadou Bâ
article
Symbiosis, Springer Verlag, 2021, 83 (3), pp.361-372. ⟨10.1007/s13199-021-00757-5⟩
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BibTex
titre
Field management of Rotylenchulus reniformis on pineapple combining crop rotation, chemical-mediated induced resistance and endophytic bacterial inoculation
auteur
A. Soler, P.-A. Marie-Alphonsine, P. Quénéhervé, Y. Prin, Hervé Sanguin, P. Tisseyre, R. Daumur, C. Pochat, E. Dorey, R. Gonzalez Rodriguez, N. Portal, J. Smith-Ravin
article
Crop Protection, Elsevier, 2021, 141, pp.105446 -. ⟨10.1016/j.cropro.2020.105446⟩
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titre
Assemblages of anoxygenic phototrophic bacteria in tank bromeliads exhibit a host‐specific signature
auteur
Antoine Vergne, Vincent Darbot, Corinne Bardot, François Enault, Anne‐hélène Le Jeune, Jean‐françois Carrias, Bruno Corbara, Régis Céréghino, Céline Leroy, Christian Jeanthon, Eric Giraud, Isabelle Mary, Anne‐catherine Lehours
article
Journal of Ecology, Wiley, 2021, 109 (7), pp.2550-2565. ⟨10.1111/1365-2745.13657⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03383240/file/Vergne%20et%20al.%202021b.%20Assemblages%20of%20anoxygenic%20phototrophic%20bacteria%20in%20tank%20bromeliads.pdf BibTex
titre
NSP2, a key symbiotic regulator in the spotlight
auteur
Johan Quilbé, Jean-François Arrighi
article
Journal of Experimental Botany, Oxford University Press (OUP), 2021, 72 (4), pp.959-963. ⟨10.1093/jxb/eraa540⟩
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titre
The Peculiar Structure of Acetobacter pasteurianus CIP103108 LPS Core Oligosaccharide
auteur
Roberta Marchetti, Ferran Nieto Fabregat, Mateusz Pallach, Djamel Gully, Eric Giraud, Antonio Molinaro, Katarzyna Duda, Alba Silipo
article
ChemBioChem, Wiley-VCH Verlag, 2021, 22 (1), pp.147-150. ⟨10.1002/cbic.202000597⟩
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BibTex
titre
Defining the Rhizobium leguminosarum Species Complex
auteur
J. Peter W. Young, Sara Moeskjær, Alexey Afonin, Praveen Rahi, Marta Maluk, Euan James, Maria Cavassim, M. Harun-Or Rashid, Aregu Aserse, Benjamin Perry, En Wang, Encarna Velázquez, Evgeny Andronov, Anastasia Tampakaki, José Flores Félix, Raúl Rivas González, Sameh Youseif, Marc Lepetit, Stéphane Boivin, Beatriz Jorrin, Gregory Kenicer, Álvaro Peix, Michael Hynes, Martha Ramírez-Bahena, Arvind Gulati, Chang-Fu Tian
article
Genes, MDPI, 2021, 12 (1), ⟨10.3390/genes12010111⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03602544/file/2021_Young_genes.pdf BibTex
titre
RibBX of Bradyrhizobium ORS285 Plays an Important Role in Intracellular Persistence in Various Aeschynomene Host Plants
auteur
Nico Nouwen, Jean-Francois Arrighi, Djamel Gully, Eric Giraud
article
Molecular Plant-Microbe Interactions, American Phytopathological Society, 2021, 34 (1), pp.88-99. ⟨10.1094/MPMI-07-20-0209-R⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03274496/file/2021_Nouwen_Molecular-Plant-Microbe-Interactions.pdf BibTex
titre
The inequity of species names: The flora of New Caledonia as a case study
auteur
Yohan Pillon
article
Biological Conservation, Elsevier, 2021, Biological Conservation, 253, ⟨10.1016/j.biocon.2020.108934⟩
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https://hal.ird.fr/ird-03635374/file/Etymology%20R3.pdf BibTex
titre
Changes in Intraspecific Diversity of the Arbuscular Mycorrhizal Community Involved in Plant–Plant Interactions Between Sporobolus robustus Kunth and Prosopis juliflora (Swartz) DC Along an Environmental Gradient
auteur
Fatoumata Fall, Hervé Sanguin, Dioumacor Fall, Estelle Tournier, Niokhor Bakhoum, Cheikh Ndiaye, Diégane Diouf, Amadou Mustapha Bâ
article
Microbial ecology, Springer Verlag, In press, ⟨10.1007/s00248-021-01779-8⟩
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BibTex
titre
Infertile landscapes on an old oceanic island: the biodiversity hotspot of New Caledonia
auteur
Yohan Pillon, Tanguy Jaffré, Philippe Birnbaum, David Bruy, Dominique Cluzel, Marc Ducousso, Bruno Fogliani, Thomas Ibanez, Hervé Jourdan, Louis Lagarde, Audrey Léopold, Jérôme Munzinger, Robin Pouteau, Jennifer Read, Sandrine Isnard
article
Biological Journal of the Linnean Society, Linnean Society of London, 2021, 133 (2), pp.317-341. ⟨10.1093/biolinnean/blaa146⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03002846/file/OCBIL%20Manuscript%20R3sansref.pdf BibTex
titre
Genetics of nodulation in Aeschynomene evenia uncovers mechanisms of the rhizobium-legume symbiosis
auteur
Johan Quilbé, Léo Lamy, Laurent Brottier, Philippe Leleux, Joël Fardoux, Ronan Rivallan, Thomas Benichou, Rémi Guyonnet, Manuel Becana, Irene Villar, Olivier Garsmeur, Bárbara Hufnagel, Amandine Delteil, Djamel Gully, Clémence Chaintreuil, Marjorie Pervent, Fabienne Cartieaux, Mickaël Bourge, Nicolas Valentin, Guillaume Martin, Loïc Fontaine, Gaëtan Droc, Alexis Dereeper, Andrew Farmer, Cyril Libourel, Nico Nouwen, Frédéric Gressent, Pierre Mournet, Angélique d'Hont, Eric Giraud, Christophe Klopp, Jean-François Arrighi
article
Nature Communications, Nature Publishing Group, 2021, 12, ⟨10.1038/s41467-021-21094-7⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03141624/file/Quilb%C3%A9J-et%20alNatComm-2021.pdf BibTex

Chapitre d'ouvrage

titre
La découverte de nouvelles espèces végétales hyperaccumulatrices de métaux dans les herbiers
auteur
V.R. Invernón, R. Tisserand, P. Jouannais, D.M. Navarrete Gutiérrez, S. Muller, Yohan Pillon, G. Echevarria, S. Merlot
article
Pellens, R. (ed.). Les collections naturalistes dans la science du XXIe siècle : une ressource durable pour la science ouverte, ISTE Editions, pp.85-100, 2021, Encyclopédie Sciences. Biologie : Systématique, Phylogénomique et Taxonomie, 978-1-78948-049-8
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BibTex
titre
Fonctionnement microbien des sols rhizosphériques d'espèces végétables natives d'un écosystème minier de Madagascar
auteur
R.H. Baohanta, I. Ratsizafy, H. Maevatiana, F.N.J. Rakoto, M.D. Andrianandrasana, F. Randriatafika, J.B. Ramanamanjato, T.E. Razakatiana, H.R. Ravonjimalala, H. Randriambanona, Robin Duponnois, H. Ramanankierana
article
Profizi, Jean Pierre (ed.); Ardila-Chauvet, Stéphanie (ed.); Muller, S. (ed.); Rana, Anshuman (ed.); Ranarijaona, H. L. T. (ed.); Sonke, B. (ed.); Billot, C. (ed.); Couteron, Pierre (ed.); Delmas, M. (ed.); Diep, T.M.H. (ed.); Grandcolas, P. (ed.); Kokou, K. (ed.). Biodiversité des écosystèmes intertropicaux : connaissance, gestion durable et valorisation, IRD, pp.625-636, 2021, Synthèses, 978-2-7099-2938-7
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BibTex
titre
Dynamique temporelle des champignons endomycorhiziens associés à Mimosa latipinosa Lam. (Fabaceae) : cas du site minier de Mandena, Madagascar
auteur
I. Ratsizafy, R.H. Baohanta, M.D. Andrianandrasana, F. Randriatafika, R.A. Rajoharison, T.E. Razakatiana, H. Randriambanona, Robin Duponnois, H. Ramanankierana
article
Profizi, Jean Pierre (ed.); Ardila-Chauvet, Stéphanie. (ed.); Muller, S. (ed.); Rana, Anshuman (ed.); Ranarijaona, H. L. T. (ed.); Sonke, B. (ed.); Billot, C. (ed.); Couteron, Pierre (ed.); Delmas, M. (ed.); Diep, T.M.H. (ed.); Grandcolas, P. (ed.); Kokou, K. (ed.). Biodiversité des écosystèmes intertropicaux : connaissance, gestion durable et valorisation, IRD, pp.613-623, 2021, Synthèses, 978-2-7099-2938-7
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BibTex

Thèse

titre
Analyse génétique et moléculaire de l'établissement de la symbiose Nod-indépendante chez la légumineuse tropicale Aeschynomene evenia
auteur
Johan Quilbe
article
Génétique des plantes. Université Montpellier, 2021. Français. ⟨NNT : 2021MONTG001⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-03558336/file/2021_QUILBE_archivage.pdf BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
Autoregulation dependent and independent mechanisms are responsible for the systemic control of nodule formation by the plant N demand
auteur
Marjorie Pervent, Ilana Lambert, Marc Tauzin, Alicia Karouani, Martha Nigg, Marie-Françoise Jardinaud, Dany Severac, Stefano Colella, Marie-Laure Martin-Magniette, Marc Lepetit
article
2021
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BibTex

2020

Article dans une revue

titre
A review of Grevillea (Proteaceae) from New Caledonia with fie description of two new species
auteur
Pauline Majourau, Yohan Pillon
article
Phytotaxa, Magnolia Press 2020, 477 (2), pp.243-252. ⟨10.11646/phytotaxa.477.2.8⟩
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BibTex
titre
Effect of Plant Growth Promoting Rhizobacteria (PGPR) and Arbuscular Mycorrhizal Fungi (AMF) on Salt Stress Tolerance of Casuarina obesa (Miq.)
auteur
Nathalie Diagne, Maty Ndour, Pape Djighaly, Daouda Ngom, Marie Ngom, Ganna Ndong, Sergio Svistoonoff, Hafsa Cherif-Silini
article
Frontiers in Sustainable Food Systems, Frontiers Media, 2020, 4, ⟨10.3389/fsufs.2020.601004⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03126939/file/2020_Diagne_Frontiers-in-Sustainable-Food-Systems.pdf BibTex
titre
Coffee Microbiota and Its Potential Use in Sustainable Crop Management. A Review
auteur
Duong Benoit, Marraccini Pierre, Jean Luc Maeght, Philippe Vaast, Robin Duponnois
article
Frontiers in Sustainable Food Systems, Frontiers Media, 2020, 4, ⟨10.3389/fsufs.2020.607935⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03045648/file/fsufs-04-607935.pdf BibTex
titre
DiCoExpress: a tool to process multifactorial RNAseq experiments from quality controls to co-expression analysis through differential analysis based on contrasts inside GLM models
auteur
Ilana Lambert, Christine Paysant-Le Roux, Stefano Colella, Marie-Laure Martin-Magniette
article
Plant Methods, BioMed Central, 2020, 16 (1), ⟨10.1186/s13007-020-00611-7⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02921433/file/document.pdf BibTex
titre
PHO1 family members transport phosphate from infected nodule cells to bacteroids in Medicago truncatula
auteur
Nga Nguyen, Joaquin Clua, Pallavi Vetal, Dominique Jacques Vuarambon, Damien de Bellis, Marjorie Pervent, Marc Lepetit, Michael Udvardi, Alexander Valentine, Yves Poirier
article
Plant Physiology, American Society of Plant Biologists, 2020, 185 (1), pp.196-209. ⟨10.1093/plphys/kiaa016⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03274481/file/2021_Nguyen_Plant-Physiology.pdf BibTex
titre
Benefits of dual inoculation with arbuscular mycorrhizal fungi and rhizobia on Phaseolus vulgaris planted in a low-fertility tropical soil
auteur
A.T.E. Razakatiana, Jean Trap, R.H. Baohanta, M. Raherimandimby, C. Le Roux, R. Duponnois, H. Ramanankierana, Thierry Becquer
article
Pedobiologia, Elsevier, 2020, 83, pp.150685. ⟨10.1016/j.pedobi.2020.150685⟩
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titre
Roles of Arbuscular Mycorrhizal Fungi on Plant Growth and Performance: Importance in Biotic and Abiotic Stressed Regulation
auteur
Nathalie Diagne, Mariama Ngom, Pape Ibrahima Djighaly, Dioumacor Fall, Valérie Hocher, Sergio Svistoonoff
article
Diversity, MDPI, 2020, 12 (10), ⟨10.3390/d12100370⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03127168/file/2020_Diagne_Diversity.pdf BibTex
titre
Identification and characterization of Vietnamese coffee bacterial endophytes displaying in vitro antifungal and nematicidal activities
auteur
Duong Benoit, Nguyen Xuan Hoa, Phan Viet Ha, Stefano Colella, Trinh Quang Phap, Hoang Thi Giang, Nguyen Thi Tuyet, Marraccini Pierre, Lebrun Michel, Robin Duponnois
article
Microbiological Research, Elsevier, 2020, 242, ⟨10.1016/j.micres.2020.126613⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02958324/file/2021_Duong_Microbiological-Research.pdf BibTex
titre
Phylogenetic distribution and evolutionary dynamics of nod and T3SS genes in the genus Bradyrhizobium
auteur
Albin Teulet, Djamel Gully, Zoe Rouy, Alicia Camuel, Ralf Koebnik, Eric Giraud, Florent Lassalle
article
Microbial Genomics, Society for General Microbiology, 2020, 6 (9), ⟨10.1099/mgen.0.000407⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03127250/file/2020_Teulet_Microbial-Genomics.pdf BibTex
titre
Mesorhizobium jarvisii is a dominant and widespread species symbiotically efficient on Astragalus sinicus L. in the Southwest of China
auteur
Junjie Zhang, Yimin Shang, Chunzeng Liu, Brigitte Brunel, Entao Wang, Shuo Li, Shanshan Peng, Chen Guo, Wenfeng Chen
article
Systematic and Applied Microbiology, Elsevier, 2020, 43 (5), ⟨10.1016/j.syapm.2020.126102⟩
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titre
Responses of mature symbiotic nodules to the whole-plant systemic nitrogen signaling
auteur
Ilana Lambert, Marjorie Pervent, Antoine Le Quéré, Gilles Clement, Marc Tauzin, Dany Severac, Claire Benezech, Pascal Tillard, Marie-Laure Martin-Magniette, Stefano Colella, Marc Lepetit
article
Journal of Experimental Botany, Oxford University Press (OUP), 2020, 71 (16), pp.5039-5052. ⟨10.1093/jxb/eraa221⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02921428/file/eraa221.pdf BibTex
titre
A revision of Ventilago (Rhamnaceae) in New Caledonia and Vanuatu with notes on dyeing properties
auteur
Daniel Cahen, Marine Toussirot, Yohan Pillon
article
Willdenowia, Botanic Garden and Botanical Museum Berlin, 2020, 50 (2), pp.253-266. ⟨10.3372/wi.50.50211⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03127465/file/2020_Cahen_Willdenowia.pdf BibTex
titre
Genomic diversity of chickpea-nodulating rhizobia in Ningxia (north central China) and gene flow within symbiotic Mesorhizobium muleiense populations
auteur
Junjie Zhang, Shanshan Peng, Yimin Shang, Brigitte Brunel, Shuo Li, Yongfeng Zhao, Yifei Liu, Wenfeng Chen, Entao Wang, Raghvendra Pratap Singh, Euan James
article
Systematic and Applied Microbiology, Elsevier, 2020, 43 (4), ⟨10.1016/j.syapm.2020.126089⟩
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titre
The belowground bacterial and fungal communities differed in their significance as microbial indicator of Moroccan carob habitats
auteur
Hamza Khassali, Alex Baumel, Frédéric Mahé, Estelle Tournier, Pierre Tisseyre, Yves Prin, Lahcen Ouahmane, Hervé Sanguin
article
Ecological Indicators, Elsevier, 2020, 114, pp.1-9. ⟨10.1016/j.ecolind.2020.106341⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02935066/file/S1470160X20302788.pdf BibTex
titre
Virotia azurea (Proteaceae: Macadamieae), a striking new species endemic to New Caledonia and notes on V. francii and V. leptophylla
auteur
Helen C.F. Hopkins, Yohan Pillon
article
Candollea, 2020, 75 (1), pp.89-98. ⟨10.15553/c2020v751a9⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03128105/file/2020_Hopkins_Candollea.pdf BibTex
titre
Two distinctive Rhizobium genospecies nodulating Vicia villosa Roth in alkaline soils of Northwest China
auteur
Junjie Zhang, Yimin Shang, Chunzeng Liu, Entao Wang, Wenfeng Chen, Shanshan Peng, Benyin Li, Chen Guo, Pei Hou, Shuo Li, Brigitte Brunel
article
Plant and Soil, Springer Verlag, 2020, 451 (1-2), pp.485-497. ⟨10.1007/s11104-020-04549-6⟩
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titre
Deep modifications of the microbiome of rice roots infected by the parasitic nematode Meloidogyne graminicola in highly infested fields in Vietnam
auteur
Anne-Sophie Masson, Hai Ho Bich, Marie Simonin, Hue Nguyen Thi, Pierre Czernic, Lionel Moulin, Stéphane Bellafiore
article
FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2020, 96 (7), pp.fiaa099. ⟨10.1093/femsec/fiaa099⟩
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titre
Correction to: Tracing Rhizophagus irregularis isolate IR27 in Ziziphus mauritiana roots under field conditions
auteur
Babacar Thioye, Dirk Redecker, Diederik van Tuinen, Aboubacry Kane, Sergio Mania de Faria, Dioumacor Fall, Diaminatou Sanogo, Cheikh Ndiaye, Robin Duponnois, Samba Ndao Sylla, Amadou Mustapha Bâ
article
Mycorrhiza, Springer Verlag, 2020, 30 (1), pp.171-171. ⟨10.1007/s00572-020-00935-1⟩
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titre
Co-inoculation with a bacterium and arbuscular mycorrhizal fungi improves root colonization, plant mineral nutrition, and plant growth of a Cyperaceae plant in an ultramafic soil
auteur
A. Bourles, L. Guentas, C. Charvis, S. Gensous, Clarisse Majorel, T. Crossay, Y. Cavaloc, V. Burtet-Sarramegna, Philippe Jourand, H. Amir
article
Mycorrhiza, 2020, 30 (1), pp.121-131. ⟨10.1007/s00572-019-00929-8⟩
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titre
MICROBIAL SYMBIONTS AND NUTRIENTS (N AND P) SHARING: EFFECT ON SOIL MICROBIAL ACTIVITY IN THE UPLAND RICE (Oriza sativa) AND BEAN (Phaseolus vulgaris) INTERCROPPING
auteur
Adamson Tsoushima Ernest Razakatiana, Thierry Becquer, Herizo Randriambanona, Rondro Harinisainana Baohanta, Martial Doret Andrianandrasana, Christine Le Roux, Robin Duponnois, Heriniaina Ramanankierana
article
SCIENTIFIC PAPERS-SERIES A-AGRONOMY, 2020, 63 (1), pp.490-499
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titre
International Committee on systematics of prokaryotes : Subcommittee on the taxonomy of rhizobia and agrobacteria minutes of the closed meeting by videoconference, 17 july 2019
auteur
Philippe De Lajudie, Young J P
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2020, 70 (5), pp.3563-3571. ⟨10.1099/ijsem.0.004157⟩
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titre
Investigating some mechanisms underlying stress metal adaptations of two Burkholderia sensu lato species isolated from New Caledonian ultramafic soils
auteur
A. Bourles, H. Amir, S. Gensous, F. Cussonneau, V. Medevielle, Fardi Juillot, A. Bazire, M. Meyer, V. Burtet-Sarramegna, Y. Cavaloc, Philippe Jourand, L. Guentas
article
European Journal of Soil Biology, Elsevier, 2020, 97, 9 p. ⟨10.1016/j.ejsobi.2020.103166⟩
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titre
Wide Cross-species RNA-Seq Comparison Reveals Convergent Molecular Mechanisms Involved in Nickel Hyperaccumulation Across Dicotyledons
auteur
Vanesa Sanchez Garcia de la Torre, Clarisse Majorel-Loulergue, Guillem J. Rigaill, Dubiel A. Gonzalez, Ludivine Soubigou-Taconnat, Yohan Pillon, Louise Barreau, Sébastien Thomine, Bruno Fogliani, Valérie Burtet-Sarramegna, Sylvain Merlot
article
New Phytologist, Wiley, 2020, 229 (2), pp.994-1006. ⟨10.1111/nph.16775⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02890477/file/NPH-MS-2020-32526.R1_Proof_hi.pdf BibTex
titre
Host-specific competitiveness to form nodules in Rhizobium leguminosarum symbiovar viciae
auteur
Stéphane Boivin, Nassima Ait Lahmidi, David Sherlock, Maxime Bonhomme, Doriane Dijon, Karine Heulin-Gotty, Antoine Le Quere, Marjorie Pervent, Marc Tauzin, Georg Carlsson, Erik Jensen, Etienne-Pascal Journet, Raphael Lopez‐bellido, Marek Seidenglanz, Jelena Marinkovic, Stefano Colella, Brigitte Brunel, Peter Young, Marc Lepetit
article
New Phytologist, Wiley, 2020, 226, pp.555-568. ⟨10.1111/nph.16392⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02624294/file/LSTM_BRUNEL_NEW_PHYTOLOGIST_CC-BY-NC_Host_specific_comptetitiveness_to_form_nodules_rhizobium_leguminosarum_viciae.pdf BibTex
titre
A strong east–west Mediterranean divergence supports a new phylogeographic history of the carob tree ( Ceratonia siliqua , Leguminosae) and multiple domestications from native populations
auteur
Juan Viruel, Nicolas Le Galliot, Samuel Pironon, Gonzalo Feliner, Jean-Pierre Suc, Fatma Lakhal-Mirleau, Marianick Juin, Marjorie Selva, Magda Bou, Dagher Kharrat, Lahcen Ouahmane, Stefano Malfa, Katia Diadema, Hervé Sanguin, Frédéric Médail, Alex Baumel
article
Journal of Biogeography, Wiley, 2020, 47 (2), pp.460-471. ⟨10.1111/jbi.13726⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-02305921/file/MS_Phylogeo_Carob_revised_HAL.pdf BibTex

Chapitre d'ouvrage

titre
Establishment of actinorhizal symbiosis in response to ethylene, salicylic acid, and jasmonate
auteur
M. Ngom, M. Cissoko, K. Gray, Valérie Hocher, Laurent Laplaze, M.O. Sy, Sergio Svistoonoff, Antony Champion
article
Champion, Antony (ed.); Laplaze, Laurent (ed.). Jasmonate in plant biology : methods and protocols, Humana Press, pp.117-130, 2020, Methods in Molecular Biology, 978-1-0716-0141-9. ⟨10.1007/978-1-0716-0142-6_9⟩
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BibTex
titre
Advances in Frankia genome studies and molecular aspects of tolerance to environmental stresses
auteur
Nathalie Diagne, Pape Ibrahima Djighaly, Mariama Ngom, Céline Pesce, Antony Champion, Sergio Svistoonoff, Valérie Hocher, Louis Tisa
article
Molecular Aspects of Plant Beneficial Microbes in Agriculture, Elsevier, pp.381-389, 2020, ⟨10.1016/B978-0-12-818469-1.00031-6⟩
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titre
Plantes en symbiose
auteur
Eric Giraud
article
Agnèse, Jean-François (dir.); Dangles, Olivier (dir.); Rodary, Estienne (dir.); Verdier, Valérie (préf.); Sabrié, Marie-Lise (ed.); Mourier, Thomas (ed.); Lavagne, Corinne (ed.); Thivent, V. (rédac.). Biodiversité au Sud : recherches pour un monde durable, IRD, pp.66-67, 2020, 978-2-7099-2850-2
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titre
Partner preference in the legume-rhizobia symbiosis and impact on legume inoculation strategies
auteur
Stephane Boivin, Marc Lepetit
article
Regulation of Nitrogen-Fixing Symbioses in Legumes, 2020, Advances in Botanical Research, ⟨10.1016/bs.abr.2019.09.016⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02967176/file/ABR94C_9780081027998-340-365.pdf BibTex

Poster

titre
Incorporating phylogeography for modelling the distribution of the carob tree (Ceratonia siliqua, Leguminosae) in future climate change
auteur
Alex Baumel, Eleonora Potenza, Valentine Frelon, Juan Viruel, Gonzalo Nieto-Feliner, Magda Bou Dagher Kharrat, Lahcen Ouahmane, Hervé Sanguin, Stefano Malfa, Mario Diguardo, Samuel Pironon, Jean-Pierre Suc, Nicolas Le Galliot, Frédéric Médail, Agathe Leriche
article
Genetics to the rescue: Managing forests sustainably in a changing world. GENTREE final conference, Jan 2020, Avignon, France
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-02460403/file/Poster_Caroubier_Avignon_2020_vf.pdf BibTex

Thèse

titre
Evaluation et gestion des potentialités microbiennes du sol pour l’amélioration de la tolérance du caroubier aux contraintes hydriques
auteur
Hamza Khassali
article
Sciences agricoles. Université Montpellier; Université Cadi Ayyad (Marrakech, Maroc). Faculté des sciences Semlalia, 2020. Français. ⟨NNT : 2020MONTG052⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-03329633/file/2020_KHASSALI_archivage.pdf BibTex

Pré-publication, Document de travail

titre
Genetics of nodulation in Aeschynomene evenia uncovers new mechanisms of the rhizobium-legume symbiosis
auteur
Johan Quilbé, Léo Lamy, Laurent Brottier, Philippe Leleux, Joel Fardoux, Ronan Rivallan, Thomas Benichou, Rémi Guyonnet, Manuel Becana, Irene Villar, Olivier Garsmeur, Bárbara Hufnagel, Amandine Delteil, Djamel Gully, Clémence Chaintreuil, Marjorie Pervent, Fabienne Cartieaux, Mickaël Bourge, Nicolas Valentin, Guillaume Martin, Loïc Fontaine, Gaëtan Droc, Alexis Dereeper, Andrew Farmer, Cyril Libourel, Nico Nouwen, Frederic Gressent, Pierre Mournet, Angélique D’hont, Eric Giraud, Christophe Klopp, Jean-François Arrighi
article
2020
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https://hal.inrae.fr/hal-03030658/file/QuilbeJ.-et%20al-bioRixv-2020.pdf BibTex
titre
Rhizobium leguminosarum symbiovar viciae strains are natural wheat endophytes and can stimulate root development and colonization by arbuscular mycorrhizal fungi
auteur
Claudia Bartoli, Stéphane Boivin, Marta Marchetti, Carine Gris, Virginie Gasciolli, Mégane Gaston, Marie-Christine Auriac, Ludovic Cottret, Aurélien Carlier, Catherine Masson-Boivin, Marc Lepetit, Benoît Lefebvre
article
2020
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https://hal.inrae.fr/hal-02967159/file/Bartoli%20et%20al.pdf BibTex

2019

Article dans une revue

titre
Targeted amplicon sequencing of 40 nuclear genes supports a single introduction and rapid radiation of Hawaiian Metrosideros (Myrtaceae)
auteur
Julian Dupuis, Yohan Pillon, Tomoko Sakishima, Chrissen Gemmill, Srikar Chamala, W. Brad Barbazuk, Scott Geib, Elizabeth Stacy
article
Plant Systematics and Evolution, Springer Verlag (Germany), 2019, Plant Systematics and Evolution, 305 (10), pp.961-974. ⟨10.1007/s00606-019-01615-0⟩
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titre
Targeted amplicon sequencing of 40 nuclear genes supports a single introduction and rapid radiation of Hawaiian Metrosideros (Myrtaceae)
auteur
Julian Dupuis, Yohan Pillon, Tomoko Sakishima, Chrissen Gemmill, Srikar Chamala, W. Brad Barbazuk, Scott Geib, Elizabeth Stacy
article
Plant Systematics and Evolution, Springer Verlag (Germany), 2019, 305 (10), pp.961-974. ⟨10.1007/s00606-019-01615-0⟩
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titre
noeM, a New Nodulation Gene Involved in the Biosynthesis of Nod Factors with an Open-Chain Oxidized Terminal Residue and in the Symbiosis with Mimosa pudica
auteur
Benoit Daubech, Verena Poinsot, Agnieszka Klonowska, Delphine Capela, Clemence Chaintreuil, Lionel Moulin, Marta Marchetti, Catherine Masson-Boivin
article
Molecular Plant-Microbe Interactions, American Phytopathological Society, 2019, 32 (12), pp.MPMI-06-19-0168. ⟨10.1094/MPMI-06-19-0168-R⟩
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titre
Chitotetraose activates the fungal-dependent endosymbiotic signaling pathway in actinorhizal plant species
auteur
Mireille Chabaud, Joëlle Fournier, Lukas Brichet, Iltaf Abdou-Pavy, Leandro Imanishi, Laurent Brottier, Elodie Pirolles, Valérie Hocher, Claudine Franche, Didier Bogusz, Luis Wallid, Sergio Svistoonoff, Hassen Gherbi, David G. Barker
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2019, 14 (10), pp.e0223149. ⟨10.1371/journal.pone.0223149⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02961598/file/2019_chabaud_plos_one.pdf BibTex
titre
Parallel ecological filtering of ultramafic soils in three distant island floras
auteur
Yohan Pillon, Dubiel Alfonso González, Herizo Randriambanona, Porter Lowry Ii, Tanguy Jaffré, Sylvain Merlot
article
Journal of Biogeography, Wiley, 2019, 46 (11), pp.2457-2465. ⟨10.1111/jbi.13677⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02284387/file/JBiogeo2019-1.pdf BibTex
titre
A leguminous species exploiting alpha- and beta-rhizobia for adaptation to ultramafic and volcano-sedimentary soils: an endemic Acacia spirorbis model from New Caledonia
auteur
Bryan Vincent, Farid Juillot, Emmanuel Fritsch, Agnieszka Klonowska, Noëmie Gerbert, Sarah Acherar, Cédric Grangeteau, Laure Hannibal, Antoine Galiana, Marc Ducousso, Philippe Jourand
article
FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2019, 95 (8), ⟨10.1093/femsec/fiz099⟩
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titre
Production of Coconut Aroma in Solid-State Cultivation: Screening and Identification of Trichoderma Strains for 6-Pentyl-Alpha-Pyrone and Conidia Production
auteur
Rayhane Hamrouni, Josiane Molinet, Lucie Miche, Quentin Carboué, Nathalie Dupuy, Ahmed Masmoudi, Sevastianos Roussos
article
Journal of Chemistry , Hindawi Publishing Corporation, 2019, 2019, pp.1-7. ⟨10.1155/2019/8562384⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02279188/file/Hal%202019%20journal%20of%20chemistry.pdf BibTex
titre
Multiple colonizations, hybridization and uneven diversification in Cyrtandra (Gesneriaceae) lineages on Hawai'i Island
auteur
Melissa Johnson, Yohan Pillon, Tomoko Sakishima, Donald Price, Elizabeth Stacy
article
Journal of Biogeography, Wiley, 2019, Journal of Biogeography, 46 (6), pp.1178-1196. ⟨10.1111/jbi.13567⟩
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BibTex
titre
Genome-wide Association Study of apanel of Vietnamese Rice Landraces Reveals New QTLs for tolerance to water deficit during the vegetative phase
auteur
- Giang Thi Hoang, - Lam van Dinh, - Thom Thi Nguyen, - Nhung Kim Ta, Floran Gathignol, - Chung Duc Mai, Stefan Jouannic, - Khanh Dang Tran, - Trung Huu Khuat, - Vinh Nang Do, Michel Lebrun, Brigitte Courtois, Pascal Gantet
article
Rice, Springer Open, 2019, 12 (1), pp.4. ⟨10.1186/s12284-018-0258-6⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02620290/file/Publis19-agap-003_1.pdf BibTex
titre
Haloarcula sebkhae sp. nov., an extremely halophilic archaeon from Algerian hypersaline environment
auteur
Hélène Barreteau, Manon Vandervennet, Laura Guedon, Vanessa Point, Stéphane Canaan, Sylvie Rebuffat, Jean Peduzzi, Alyssa Carré-Mlouka
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2019, 69 (3), ⟨10.1099/ijsem.0.003211⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01990102/file/Barreteau-2018-IJSEM-HAL.pdf BibTex
titre
Mechanistic Insights into Microsecond Time-Scale Motion of Solid Proteins Using Complementary 15 N and 1 H Relaxation Dispersion Techniques
auteur
Petra Rovó, Colin Smith, Diego Gauto, Bert de Groot, Paul Schanda, Rasmus Linser
article
Journal of the American Chemical Society, American Chemical Society, 2019, 141 (2), pp.858-869. ⟨10.1021/jacs.8b09258⟩
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BibTex
titre
Ionomics suggests niche differences between sympatric heathers (Ericaceae)
auteur
Daniel Petit, Christelle Gady, Marilyne Soubrand, Emmanuel Joussein, Gaëlle Saladin, Yohan Pillon
article
Plant and Soil, Springer Verlag, 2019, Plant and Soil, 434 (1-2), pp.481-489. ⟨10.1007/s11104-018-3870-8⟩
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https://hal.ird.fr/ird-03635355/file/EricaRRR2sanscorrections.pdf BibTex
titre
Twenty years after Jaffré et al. (1998), is the system of protected areas now adequate in New Caledonia?
auteur
Thomas Ibanez, Philippe Birnbaum, Gildas Gâteblé, Vanessa Hequet, Sandrine Isnard, Jérôme Munzinger, Yohan Pillon, Robin Pouteau, Hervé Vandrot, Tanguy Jaffré
article
Biodiversity and Conservation, Springer Verlag, 2019, 28 (1), pp.245-254. ⟨10.1007/s10531-018-1659-y⟩
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titre
The plant-growth-promoting actinobacteria of the genus Nocardia induces root nodule formation in Casuarina glauca
auteur
Faten Ghodhbane-Gtari, Imen Nouioui, Karima Hezbri, Emily Lundstedt, Timothy D’angelo, Zakkary Mcnutt, Laurent Laplaze, Hassen Gherbi, Virginie Vaissayre, Sergio Svistoonoff, Hela Ben Ahmed, Abdelatif Boudabous, Louis S. Tisa
article
Antonie van Leeuwenhoek, Springer Verlag, 2019, 112 (1), pp.75-90. ⟨10.1007/s10482-018-1147-0⟩
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BibTex
titre
Multiple colonizations, hybridization and uneven diversification in Cyrtandra (Gesneriaceae) lineages on Hawai'i Island
auteur
Melissa A. Johnson, Yohan Pillon, Tomoko Sakishima, Donald K. Price, Elizabeth A. Stacy
article
Journal of Biogeography, Wiley, 2019, 46 (6), pp.1178-1196. ⟨10.1111/jbi.13567⟩
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BibTex
titre
Complete Genome Sequence of Bradyrhizobium sp. Strain ORS3257, an Efficient Nitrogen-Fixing Bacterium Isolated from Cowpea in Senegal
auteur
Antoine Le Quéré, Djamel Gully, Albin Teulet, Elisabeth Navarro, Daniel Gargani, Joel Fardoux, Stéphane Cruveiller, Marc Neyra, Eric Giraud, Tatiana Krasova Wade
article
Microbiology Resource Announcements, American Society for Microbiology, 2019, 8 (3), pp.1-2. ⟨10.1128/MRA.01449-18⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02617812/file/Publis19-bgpi-009_1.pdf BibTex
titre
Transcriptomic dissection of Bradyrhizobium sp. strain ORS285 in symbiosis with Aeschynomene spp. inducing different bacteroid morphotypes with contrasted symbiotic efficiency
auteur
Florian Lamouche, Djamel Gully, Anaïs Chaumeret, Nico Nouwen, Camille Verly, Olivier Pierre, Coline Sciallano, Joël Fardoux, Christian Jeudy, Attila Szücs, Samuel Mondy, Christophe Salon, István Nagy, Attila Kereszt, Yves Dessaux, Eric Giraud, Peter Mergaert, Benoît Alunni
article
Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2019, 21 (9), pp.3244-3258. ⟨10.1111/1462-2920.14292⟩
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titre
Minimal standards for the description of new genera and species of rhizobia and agrobacteria
auteur
Philippe M. Lajudie, Mitchell Andrews, Julie Ardley, Bertrand Eardly, Estelle Jumas-Bilak, Nemanja Kuzmanović, F. Lassalle, Kristina Lindström, Ridha Mhamdi, Esperanza Martínez-Romero, Lionel Moulin, Seyed Abdollah Mousavi, Xavier Nesme, Alvaro Peix, Joanna Pu\l Awska, Emma Steenkamp, Tomasz Stępkowski, Chang-Fu Tian, Pablo Vinuesa, Gehong Wei, Anne Willems, Jerri Zilli, Peter Young
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2019, 69 (7), pp.1852-1863. ⟨10.1099/ijsem.0.003426⟩
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BibTex
titre
La recherche participative au Sénégal, une bonne recette pour booster l'agriculture
auteur
Antoine Le Quéré, Tatiana Krasova Wade
article
The Conversation, The Conversation France, 2019, 21 novembre 2019, en ligne [4 p.]
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titre
Impact of mycorrhiza-based inoculation strategies on Ziziphus mauritiana Lam. and its native mycorrhizal communities on the route of the Great Green Wall (Senegal)
auteur
Babacar Thioye, Hervé Sanguin, Aboubacry Kane, Sergio Mania de Faria, Dioumacor Fall, Yves Prin, Diaminatou Sanogo, Cheikh Ndiaye, Robin Duponnois, Samba Ndao Sylla, Amadou Mustapha Bâ
article
Ecological Engineering, Elsevier, 2019, 128, pp.66-76. ⟨10.1016/j.ecoleng.2018.12.033⟩
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Amborella – Bearing witness to the past ?
auteur
Valerie Poncet, Philippe Birnbaum, Valérie Burtet-Sarramegna, Alexandre de Kochko, Bruno Fogliani, Gildas Gateble, Sandrine Isnard, Tanguy Jaffré, Dominique Job, François Munoz, Jérôme Munzinger, C.P. Scutt, Rémi Tournebize, Santiago Trueba, Yohan Pillon
article
Annual Plant Reviews Online, Wiley, 2019, 3, pp.1 - 41. ⟨10.1002/9781119312994.apr0689⟩
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Isolation and characterization of potential phosphate solubilizing bacteria in two regions of Senegal
auteur
C.V. Nadiéline, M.F. Ndiaye, S. Fall, Tatiana Krasova Wade, Antoine Le Quéré, D. Diouf
article
African Journal of Microbiology Research, Academic Journal, 2019, 13 (28), pp.609-618, (art. no 8F6E4DF62134). ⟨10.5897/AJMR2019.917⟩
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titre
Kermadecia brinoniae (Proteaceae: Macadamieae), a new species from New Caledonia previously confused with K. elliptica
auteur
Helen H.C.F. Hopkins, Yohan Pillon
article
Candollea, 2019, 74 (1), pp.85. ⟨10.15553/c2019v741a9⟩
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Transcriptomic Analysis With the Progress of Symbiosis in ‘Crack-Entry’ Legume Arachis hypogaea Highlights Its Contrast With ‘Infection Thread’ Adapted Legumes
auteur
Kanchan Karmakar, Anindya Kundu, Ahsan Z. Rizvi, Emeric Dubois, Dany Severac, Pierre Czernic, Fabienne Cartieaux, Maitrayee Dasgupta
article
Molecular Plant-Microbe Interactions, American Phytopathological Society, 2019, 32 (3), pp.271-285. ⟨10.1094/MPMI-06-18-0174-R⟩
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International Committee on Systematics of Prokaryotes Subcommittee on the Taxonomy of Rhizobia and Agrobacteria Minutes of the meeting by video conference, 11 July 2018
auteur
Philippe de Lajudie, J. Peter W. Young
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2019, 69 (6), pp.1835-1840. ⟨10.1099/ijsem.0.003335⟩
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Signalling in actinorhizal root nodule symbioses
auteur
Valérie Hocher, Mariama Ngom, Alyssa Carré-Mlouka, Pierre Tisseyre, Hassen Gherbi, Sergio Svistoonoff
article
Antonie van Leeuwenhoek, Springer Verlag, 2019, 112 (1), pp.23-29. ⟨10.1007/s10482-018-1182-x⟩
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titre
The Modification of the Flavonoid Naringenin by Bradyrhizobium sp. Strain ORS285 Changes the nod Genes Inducer Function to a Growth Stimulator
auteur
Nico Nouwen, Daniel Gargani, Eric Giraud
article
Molecular Plant-Microbe Interactions, American Phytopathological Society, 2019, 32 (11), pp.1517-1525. ⟨10.1094/MPMI-05-19-0133-R⟩
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titre
Two new species of Quintinia (Paracryphiaceae) with notes on the species from New Caledonia and Vanuatu
auteur
Yohan Pillon, Vanessa Hequet
article
Phytotaxa, Magnolia Press 2019, 397 (1), pp.45. ⟨10.11646/phytotaxa.397.1.4⟩
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Mutualistic co-evolution of T3SSs during the establishment of symbiotic relationships between Vigna radiata and Bradyrhizobia
auteur
Pongdet Piromyou, Pongpan Songwattana, Kamonluck Teamtisong, Panlada Tittabutr, Nantakorn Boonkerd, Piyada Alisha Tantasawat, Eric Giraud, Michael Göttfert, Neung Teaumroong
article
MicrobiologyOpen, Wiley, 2019, 8 (7), 16 p. ⟨10.1002/mbo3.781⟩
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titre
Short‐term effect of 915‐MHz microwave treatments on soil physicochemical and biological properties
auteur
Géraldine Maynaud, Ezkiel Baudoin, J. Bourillon, Robin Duponnois, Jean Claude Cleyet-Marel, Brigitte Brunel
article
European Journal of Soil Science, Wiley, 2019, 70 (3), pp.443-453. ⟨10.1111/ejss.12769⟩
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Symbiotic properties of a chimeric Nod-independent photosynthetic Bradyrhizobium strain obtained by conjugative transfer of a symbiotic plasmid
auteur
Pongpan Songwattana, Panlada Tittabutr, Jenjira Wongdee, Kamonluck Teamtisong, Dyah Wulandari, Albin Teulet, Joel Fardoux, Nantakorn Boonkerd, Eric Giraud, Neung Teaumroong
article
Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2019, 21 (9), pp.3442-3454. ⟨10.1111/1462-2920.14650⟩
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titre
Rhizobium sophorae, Rhizobium laguerreae, and two novel Rhizobium genospecies associated with Vicia sativa L. in Northwest China
auteur
Junjie Zhang, Yimin Shang, Shanshan Peng, Wenfeng Chen, Entao Wang, Philippe de Lajudie, Benyin Li, Chen Guo, Chunzeng Liu
article
Plant and Soil, Springer Verlag, 2019, 442 (1-2), pp.113-126. ⟨10.1007/s11104-019-04168-w⟩
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titre
The rhizosphere microbiome: A key component of sustainable cork oak forests in trouble
auteur
Fatima Zahra Maghnia, Younes Abbas, Frédéric Mahé, Yves Prin, Naima El Ghachtouli, Robin Duponnois, Hervé Sanguin
article
Forest Ecology and Management, Elsevier, 2019, 434, pp.29-39. ⟨10.1016/j.foreco.2018.12.002⟩
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titre
How deep can ectomycorrhizas go? A case study on Pisolithus down to 4 meters in a Brazilian eucalypt plantation
auteur
Agnès Robin, Céline Pradier, Hervé Sanguin, Frédéric Mahé, George Rodrigues Lambais, Arthur Prudêncio de Araujo Pereira, Amandine Germon, Maiele Cintra Santana, Pierre Tisseyre, Anne-Laure Pablo, Pauline Heuillard, Marie Sauvadet, Jean-Pierre Bouillet, Fernando Dini Andreote, Claude Plassard, Jose Leonardo de Moraes Goncalves, Elke Jurandy Bran Nogueira Cardoso, Jean-Paul Laclau, Philippe Hinsinger, Christophe Jourdan
article
Mycorrhiza, Springer Verlag, 2019, 29 (6), pp.637-648. ⟨10.1007/s00572-019-00917-y⟩
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Communication dans un congrès

titre
Impact of beneficial microorganisms on strawberry growth, fruit production, nutritional quality and volatilome
auteur
G. Lingua, V. Todeschini, Nassima Ait Lahmidi, E. Mazzucco, F. Marsano, F. Gosetti, E. Robott, E. Bona, N. Massa, Laurent Bonneau, E. Marengo, Diederik van Tuinen, G. Berta, Pierre-Emmanuel Courty, Daniel Wipf
article
Microbe-assisted crop production opportunities, challenges & needs (miCROPe 2019), Dec 2019, Vienne, Austria
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titre
Long-term clinical outcome and HAVCR2 mutations in 70 patients with subcutaneous panniculitis-like T-cell lymphoma: a study from the French Cutaneous Lymphoma Group
auteur
G. Sonigo, M. Battistella, M. Beylot-Barry, S. Oro, Nicolas Franck, S. Barete, S. Boulinguez, O. Dereure, N. Bonnet, G. Socie, P. Brice, O. Boccara, C. Bodemer, H. Adamski, M. D’incan, N. Ortonne, S. Fraitag, F. Brunet-Possenti, S. Dalle, F. Suarez, A. Març Ais, F. Skowron, D. Haidar, E. Maubec, G. Bohelay, L Laroche, A. Mahe, E. Birckel, Jd. Bouaziz, I. Brochériou, R. Dubois, S. Faiz, J. Fadlallah, C. Ram-Wolff, A. Carlotti, G. Bens, B. Balme, B. Vergier, S. Laurent-Roussel, L. Deschamps, O. Carpentier, P. Moguelet, Gwenaël Hervé, F. Comoz, F. Le Gall, G. Leverger, A. Finon, O. Augereau, C. Bléchet, R. Kerdraon, L. Lamant, E. Tournier, F. Franck, V. Costes Martineau, V. Szablewski, S. Taix, I. Beschet, Fabien Guérin, F. Sepulveda Garrido, M. Bagot, G. de Saint-Basile, D. Michonneau, A. de Masson
article
EORTC CLTF 2019, Sep 2019, Athens, Greece. pp.S7-S8, ⟨10.1016/S0959-8049(19)30530-1⟩
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titre
noeM, a novel nodulation gene involved in symbiosis with Mimosa pudica
auteur
Benoit Daubech, Verena Poinsot, Agnieszka Klonowska, Clemence Chaintreuil, P. Tisseyre, Lionel Moulin, Marta Marchetti, Catherine Masson-Boivin
article
18th Congress of International-Society-for-Molecular-Plant-Microbe-Interactions (IS-MPMI), International Society for Molecular Plant-Microbe Interactions, Jul 2019, Glasgow, United Kingdom. pp.193-194
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titre
The competitiveness to form nodules shapes the capacities of Rhizobium leguminosarum sv viciae communities to promote symbiosis with specific hosts
auteur
Stéphane Boivin, Nassima Ait Lahmidi, D. Sherlock, D Dijon, Karine Heulin-Gotty, Antoine Le Quere, Marjorie Pervent, Marc Tauzin, Sylvie Mazurier, M. Bonhomme, G. Carlsson, E. Jensen, Etienne-Pascal Journet, R.J Lopez-Bellido, M. Seidenglanz, J. Marinkovic, Stefano Colella, Brigitte Brunel, P. Young, Marc Lepetit
article
International Conference on Legume Genetics and Genomics ICLGG 2019, May 2019, Dijon, France
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Chapitre d'ouvrage

titre
Molecular Methods for Research on Actinorhiza
auteur
Gherbi Hassen, Hocher Valérie, Ngom Mariama, Diagne Nathalie, Joëlle Fournier, Carre-Mlouka Alyssa, Wall Luis G., Tisa Louis S., Svistoonoff Sergio
article
Methods in Rhizosphere Biology Research, Reinhardt D., Sharma A., pp.35-59, 2019, Rhizosphere Biology, ⟨10.1007/978-981-13-5767-1_4⟩
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titre
Cartographier les ressources pour gérer les priorités
auteur
Isabelle Guérin, François Roubaud, Christophe Guilmoto, Mireille Razafindrakoto, Marc Pilon, Isabelle Léglise, Pierre-Yves Le Meur, Fatoumata Ouattara, Christian Seignobos, Pierre Chauveau, Eric Léonard, Dominique Guillaud, Alain Froment, Nelly Robin, Michel Agier, Sophie Bava, Annabel Desgrées Du Loû, Flore Gubert, Eric Delaporte, Gonzague Jourdain, Alexandre Dumont, Serge Trèche, Jacques Berger, Pierre Traissac, Valérie Delaunay, Vincent Robert, Frédéric Darriet, Cheikh Sokhna, Michel Cot, Martine Peeters, Eric Leroy, Alice Desclaux, Marc Hougard, Didier Paugy, Michel Boussinesq, Philippe Solano, Dorothée Missé, Louis-Clément Gouagna, Jean Lemesre, Anne-Laure Bañuls, Christophe E. Menkès, Morgan Mangeas, Benjamin Sultan, Thomas Condom, Marie Gosset, Serge Janicot, Jean Nocquet, Luc Le Pennec, Sébastien Hardy, Philippe Charvis, Yann Hello, Emmanuel Bonnet, Emilie Strady, David Point, Bernard Ollivier, Isabelle C. Biegala, Christian Feller, Christian Valentin, Eric Giraud, Eric Blanchart, Pierre Montoroi, Philippe Cecchi, Jean Albergel, Jean-Michel Vouillamoz, Vincent Simonneaux, Gil Boulet, Thierry Ruf, Geneviève Michon, Jean-Baptiste Boutrais, Laure Emperaire, Robin Duponnois, Philippe Boulanger, Eugénie Hébrard, Valerie Verdier, Boris Szurek, Bruno Le Ru, Paul-André Calatayud, Olivier Dangles, Frédérique Aberlenc, Sevastianos Roussos, Gauthier Dobigny, Marc Legendre, Daniel Gaertner, Pierre Chavance, Pascal Bach, Arnaud Bertrand, Jérôme Vialard, Jacques Merle, Bruno Voituriez, Bernard Bourlès, Pierrick Penven, Gil Mahe, Thierry Lebel, Luc Descroix, Pierre Chevallier, Stéphane Calmant, Bruno Turcq, Adrien Favreau, Jean-Louis Rajot, Raphaël Pelissier, Philippe Cury, Riccardo Rodolfo-Metalpa, Hervé De Tricornot, Frédéric Simard, Jean-François Etard, Bernard Taverne, Florence Fournet, Alexis Drogoul, Marc Souris, Monique Simier, Marie Bonnin, Alain Ghesquière, Serge Hamon, Yves Vigouroux, Sophie Gonzalez, Jean-François Molino, Geneviève Bourdy, Christian Moretti, Pierre Ottino Garanger, Francisco Valdez, Benoît Antheaume, Nicolas Gratiot
article
Science et développement durable : 75 ans de recherche au Sud, IRD, 2019, 978-2-7099-2737-6
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Poster

titre
The Edaphic Environment: Impact of Olive Trees on the soil beneficial interaction between Durum Wheat roots and Am Fungi
auteur
A. Panozzo, Dominique Desclaux, H. Huang, Robin Duponnois, Yves Prin
article
4. World Congress on Agroforestry, May 2019, Montpellier, France. 933 p., 2019, Book of abstracts. 4th World Congress on Agroforestry 2019
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titre
GRaSP project Genetics of Rhizobia Selection by Pea
auteur
Estelle Amilhastre, Damien Pujos, Valentin Delefortrie, Stéphane Boivin, Solène Mazeau, Chantal Martin, Damien Ollivier, Julie Vera Cullimore, Clare Gough, Karine Heulin-Gotty, Marjorie Pervent, Emilie Vieille, Karen Boucherot, Véronique Biarnès, Anthony Klein, Jonathan Kreplak, Gregoire Aubert, Frederic Debellé, Marc Lepetit, Marion Dalmais, Xavier Pinochet, Virginie Bourion
article
9. International Conference on Legume Genetics and Genomics (ICLGG 2019), Let's harness the potential of legumes, May 2019, Dijon, France. 2019
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titre
Genetic diversity of nodulated root structure in a very diverse pea collection
auteur
Valentin Delefortrie, Amira Laroussi, Chantal Martin, Damien Ollivier, Aurélien Barbe, Mickaël Lamboeuf, Karine Heulin-Gotty, Stéphane Boivin, Marc Lepetit, H. Duborjal, M. Leveugle, Jonathan Kreplak, Gregoire Aubert, Virginie Bourion
article
9. International Conference on Legume Genetics and Genomics (ICLGG 2019), Let's harness the potential of legumes, May 2019, Dijon, France. 2019
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titre
Bacteriocyte reprogramming to maintain organismal homeostasis under nutritional stress in aphid symbiosis
auteur
Nicolas Parisot, Stefano Colella, Pierre Simonet, Karen Gaget, Marie-Gabrielle Duport, Patrice Baa-Puyoulet, Yvan Rahbé, Hubert Charles, Gérard Febvay, Patrick Callaerts, Federica Calevro
article
UK-France joint Meeting Aphid Special Interest Group – BAPOA, Apr 2019, Rothamsted, United Kingdom
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Rapport

titre
Identification d’indicateurs biologiques du fonctionnement des écosystèmes miniers restaurés. Acronyme : « Bioindic ». Rapport scientifique final
auteur
Fabian Carriconde, Nicolas Fernandez Nunez, Julie Ripoll, Audrey Léopold, Bruno Fogliani, Yawiya Ititiaty, Mélanie Lelievre, Kelly Letellier, Laurent Maggia, Géraldine Bidau, Laurent l'Huillier, Hamid Amir, Yvon Cavaloc, Marc Ducousso, Antoine Galiana, Laure Hannibal, Philippe Jourand, Michel Lebrun
article
[Rapport de recherche] Programme Bioindic. Tome Nickel et Environnement, CNRT Nickel et son environnement. 2019, 272 p
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03418319/file/CNRT-rappsc-BIOINDIC_Tome-ENV-Edition-2019_cp.pdf BibTex

2018

Article dans une revue

titre
Advances in genotyping microsatellite markers through sequencing and consequences of scoring methods for Ceratonia siliqua (Leguminosae)
auteur
Juan Viruel, Anne Haguenauer, Marianick Juin, Fatma Mirleau, Delphine Bouteiller, Magda Boudagher‐kharrat, Lahcen Ouahmane, Stefano La Malfa, Frederic Medail, Hervé Sanguin, Gonzalo Nieto Feliner, Alex Baumel
article
Applications in Plant Sciences, Wiley, 2018, 6 (12), pp.e01201. ⟨10.1002/aps3.1201⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01952501/file/Viruel%20J.%20et%20al.%202018%20Applications%20in%20Plant%20Sciences.pdf BibTex
titre
A phylogenetic framework of the legume genus Aeschynomene for comparative genetic analysis of the Nod-dependent and Nod-independent symbioses
auteur
Laurent Brottier, Clémence Chaintreuil, Paul Simion, Celine Scornavacca, Ronan Rivallan, Pierre Mournet, Lionel Moulin, Gwilym Lewis, Joël Fardoux, Spencer Brown, Mario Gomez-Pacheco, Mickaël Bourges, Catherine Hervouet, Mathieu Gueye, Robin Duponnois, Heriniaina Ramanankierana, Herizo Randriambanona, Hervé Vandrot, Maria Zabaleta, Maitrayee Dasgupta, Angélique D’hont, Eric Giraud, Jean-François Arrighi
article
BMC Plant Biology, BioMed Central, 2018, 18 (1), ⟨10.1186/s12870-018-1567-z⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-01961745/file/Brottier_etal_BMC_Pl_Biol_2018_18.pdf BibTex
titre
Transcriptomic profiling of Burkholderia phymatum STM815, Cupriavidus taiwanensis LMG19424 and Rhizobium mesoamericanum STM3625 in response to Mimosa pudica root exudates illuminates the molecular basis of their nodulation competitiveness and symbiotic evolutionary history
auteur
Agnieszka Klonowska, Rémy Melkonian, Lucie Miché, Pierre Tisseyre, Lionel Moulin
article
BMC Genomics, BioMed Central, 2018, 19 (1), ⟨10.1186/s12864-018-4487-2⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01794087/file/Klonowska18_Transcriptomic%20profiling%20of%20Mimosa%20symbionts.pdf BibTex
titre
Genetic diversity of rhizobia and plant growth promoting rhizobacteria of soil under the influence of Piliostigma reticulatum (DC.) Hochst and their impact on shrub growth
auteur
Nogaye Niang, Sandrine Demanèche, Ibrahima Ndoye, Elisabeth Navarro, Saliou Fall
article
African Journal of Agricultural Research, Academic Journals, 2018, ⟨10.5897/AJAR2018.13494⟩
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https://hal.ird.fr/ird-02497476/file/D9A4E3859299.pdf BibTex
titre
A genome-wide association study using a Vietnamese landrace panel of rice (Oryza sativa) reveals new QTLs controlling panicle morphological traits
auteur
- Kim Nhung Ta, - Ngan Giang Khong, - Thi Loan Ha, - Dieu Thu Nguyen, - Duc Chung Mai, - Thi Giang Hoang, - Thi Phuong Nhung Phung, Isabelle Bourrié, Brigitte Courtois, - Thi Thu Hoai Tran, - Bach Yen Dinh, - Tuan Nghia La, - Nang Vinh Do, Michel Lebrun, Pascal Gantet, Stefan Jouannic
article
BMC Plant Biology, BioMed Central, 2018, 18 (1), pp.282. ⟨10.1186/s12870-018-1504-1⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02621289/file/Publis18-agap-029_ta_genome_1.pdf BibTex
titre
Worldwide Occurrence and Activity of the Reef-Building Coral Symbiont Symbiodinium in the Open Ocean
auteur
Johan Decelle, Quentin Carradec, Xavier Pochon, Nicolas Henry, Sarah Romac, Frédéric Mahé, Micah Dunthorn, Artem Kourlaiev, Christian Voolstra, Patrick Wincker, Colomban de Vargas
article
Current Biology - CB, Elsevier, 2018, 28 (22), pp.3625-3633.e3. ⟨10.1016/j.cub.2018.09.024⟩
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titre
Cell remodeling and subtilase gene expression in the actinorhizal plant Discaria trinervis highlight host orchestration of intercellular Frankia colonization
auteur
Joëlle Fournier, Leandro Imanishi, Mireille Chabaud, Iltaf Abdou-Pavy, Andrea Genre, Lukas Brichet, Hernán Ramiro Lascano, Nacira Muñoz, Alice Vayssières, Elodie Pirolles, Laurent Brottier, Hassen Gherbi, Valerie Hocher, Sergio Svistoonoff, David Barker, Luis Wall
article
New Phytologist, Wiley, 2018, 219 (3), pp.1018-1030. ⟨10.1111/nph.15216⟩
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titre
Effect of native and allochthonous arbuscular mycorrhizal fungi on Casuarina equisetifolia growth and its root bacterial community
auteur
Nathalie Diagne, Ezékiel Baudoin, S. Svistoonoff, Christine Ouattara, Diegane Diouf, Aboubacry Kane, Cheikh Ndiaye, Kandioura Noba, Didier Bogusz, Claudine Franche, Robin Duponnois
article
Arid Land Research and Management, Taylor & Francis, 2018, 32 (2), pp.212-228. ⟨10.1080/15324982.2017.1406413⟩
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titre
Phylogenetics and systematics of the South Polynesian genera Apetahia and Sclerotheca (Campanulaceae subfam. Lobelioideae)
auteur
Elizabeth Stacy, Jean-Yves Meyer, Yohan Pillon
article
Botany Letters, Taylor & Francis, 2018, Botany Letters, 165 (2), pp.186-192. ⟨10.1080/23818107.2018.1452792⟩
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https://hal.ird.fr/ird-03644823/file/SclerothecaR2.pdf BibTex
titre
Mediterranean forests, land use and climate change : a social-ecological perspective
auteur
Thierry Gauquelin, Geneviève Michon, Richard Joffre, Robin Duponnois, Didier Genin, Bruno Fady, Magda Bou Dagher-Kharrat, Arezki Derridj, Said Slimani, Wadi Badri, Mohamed Alifriqui, Laurent Auclair, Romain Simenel, Mohamed Aderghal, Ezekiel Baudoin, Antoine Galiana, Yves Prin, Hervé Sanguin, Catherine Fernandez, Virginie Baldy
article
Regional Environmental Change, Springer Verlag, 2018, 18 (3), pp.623-636. ⟨10.1007/s10113-016-0994-3⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01594954/file/Hal%20Gauquelin%20et%20al%20revised%20manuscript%20-%20REEC%20-24-02.pdf BibTex
titre
Co-inoculation of a Pea Core-Collection with Diverse Rhizobial Strains Shows Competitiveness for Nodulation and Efficiency of Nitrogen Fixation Are Distinct traits in the Interaction
auteur
Virginie Bourion, Karine Heulin-Gotty, Véronique Aubert, Pierre Tisseyre, Marianne Chabert-Martinello, Marjorie Pervent, Catherine Delaitre, Denis Vile, Mathieu Siol, Gérard Duc, Brigitte Brunel, Judith Burstin, Marc Lepetit
article
Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2018, 8, ⟨10.3389/fpls.2017.02249⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02621629/file/Bourion-FPS-2018-OA_1.pdf BibTex
titre
Effect of peanut shells amendment on soil properties and growth of seedlings of Senegalia senegal (L.) Britton, Vachellia seyal (Delile) P. Hurter, and Prosopis juliflora (Swartz) DC in salt-affected soils
auteur
Dioumacor Fall, Niokhor Bakhoum, Fatoumata Fall, Fatou Diouf, Cheikh Ndiaye, Mathieu N. Faye, Valérie Hocher, Diégane Diouf
article
Annals of Forest Science, Springer Nature (since 2011)/EDP Science (until 2010), 2018, 75 (1), pp.32. ⟨10.1007/s13595-018-0714-x⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02976509/file/springer.pdf BibTex
titre
Phylogenetic diversity of Bradyrhizobium strains nodulating Calicotome spinosa in the Northeast of Algeria
auteur
Adouda Salmi, Farida Boulila, Yasmina Bourebaba, Christine Le Roux, Djellali Belhadi, Philippe de Lajudie
article
Systematic and Applied Microbiology, Elsevier, 2018, 41 (5), pp.452-459. ⟨10.1016/j.syapm.2018.05.005⟩
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BibTex
titre
Assessment of plant species diversity associated with the carob tree ( Ceratonia siliqua, Fabaceae) at the Mediterranean scales
auteur
Alex Baumel, Pascal Mirleau, Juan Viruel, Magda Bou Dagher Kharrat, Stefano La Malfa, Lahcen Ouahmane, Katia Diadema, Marwa Moakhar, Hervé Sanguin, Frédéric Médail
article
Plant Ecology and Evolution, Botanic Garden Meise and Royal Botanical Society of Belgium, 2018, 151 (2), pp.185-193. ⟨10.5091/plecevo.2018.1423⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01868445/file/Baumel_text_revised_HAL.pdf BibTex
titre
Actinorhizal signaling molecules : Frankia root hair deforming factor shares properties with NIN inducing factor
auteur
Maimouna Cissoko, Valérie Hocher, Hassen Gherbi, Djamel Gully, Alyssa Carré-Mlouka, Seyni Sane, Sarah Pignoly, Antony Champion, Mariama Ngom, Petar Pujic, Pascale Fournier, Maher Gtari, Erik Swanson, Céline Pesce, Louis S. Tisa, Mame Oureye Sy, Sergio Svistoonoff
article
Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2018, 9, 12 p. ⟨10.3389/fpls.2018.01494⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01956101/file/2018_Cissoko_Frontiers%20in%20Plant%20Science.pdf BibTex
titre
Structure and inflammatory activity of the LPS isolated from Acetobacter pasteurianus CIP103108
auteur
Mateusz Pallach, Flaviana Di Lorenzo, Fabio Alessandro Facchini, Djamel Gully, Eric Giraud, Francesco Peri, Katarzyna A. Duda, Antonio Molinaro, Alba Silipo
article
International Journal of Biological Macromolecules, Elsevier, 2018, 119, pp.1027-1035. ⟨10.1016/j.ijbiomac.2018.08.035⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01956104/file/2018_Pallach_International%20Journal%20of%20Biological%20Macromolecules.pdf BibTex
titre
Surface ocean metabarcoding confirms limited diversity in planktonic foraminifera but reveals unknown hyper-abundant lineages
auteur
Raphael Morard, Marie-José Garet-Delmas, Frédéric Mahé, Sarah Romac, Julie Poulain, Michal Kucera, Colomban de Vargas
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2018, 8, pp.2539. ⟨10.1038/s41598-018-20833-z⟩
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Vicia faba L. in the Bejaia region of Algeria is nodulated by Rhizobium leguminosarum sv. viciae, Rhizobium laguerreae and two new genospecies
auteur
Djellali Belhadi, Philippe de Lajudie, Nacer Ramdani, Christine Le Roux, Farida Boulila, Pierre Tisseyre, Abdelghani Boulila, Amar Benguedouar, Yahia Kaci, Gisele Laguerre
article
Systematic and Applied Microbiology, Elsevier, 2018, 41 (2), pp.122-130. ⟨10.1016/j.syapm.2017.10.004⟩
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Mesorhizobium wenxiniae sp. nov., isolated from chickpea (Cicer arietinum L.) in China
auteur
Junjie Zhang, Chen Guo, Wenfeng Chen, Philippe de Lajudie, Zhiyan Zhang, Yimin Shang, En Tao Wang
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2018, 68 (6), pp.1930-1936. ⟨10.1099/ijsem.0.002770⟩
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Interdependency of efficient nodulation and arbuscular mycorrhization in Piptadenia gonoacantha, a Brazilian legume tree
auteur
Caroline Bournaud, Euan K. James, Sergio M. de Faria, Michel Lebrun, Remy Melkonian, Robin Duponnois, Pierre Tisseyre, Lionel Moulin, Yves Prin
article
Plant, Cell and Environment, Wiley, 2018, 41 (9), pp.2008-2020. ⟨10.1111/pce.13095⟩
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Selection of arbuscular mycorrhizal fungal strains to improve Casuarina equisetifolia L. and Casuarina glauca Sieb. tolerance to salinity
auteur
Pape Ibrahima Djighaly, Nathalie Diagne, Mariama Ngom, Daouda Ngom, Valérie Hocher, Dioumacor Fall, Diégane Diouf, Laurent Laplaze, Sergio Svistoonoff, Antony Champion
article
Annals of Forest Science, Springer Nature (since 2011)/EDP Science (until 2010), 2018, 75 (3), 11 p. ⟨10.1007/s13595-018-0747-1⟩
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Molecular identification of arbuscular mycorrhizal fungal spores associated to the rhizosphere of Retama raetam in Tunisia
auteur
Mosbah Mahdi, Philippe de Lajudie, Mohamed Mars
article
Soil Science and Plant Nutrition, Taylor & Francis, 2018, 64 (3), pp.335-341. ⟨10.1080/00380768.2018.1431012⟩
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Naturally occurring variations in the nod-independent model legume Aeschynomene evenia and relatives: a resource for nodulation genetics
auteur
Clémence Chaintreuil, Xavier Perrier, Guillaume Martin, Joël Fardoux, Gwilym Lewis, Laurent Brottier, Ronan Rivallan, Mario Gomez-Pacheco, Mickaël Bourge, Léo Lamy, Béatrice Thibaud, Heriniaina Ramanankierana, Herizo Randriambanona, Hervé Vandrot, Pierre Mournet, Eric Giraud, Jean-François Arrighi
article
BMC Plant Biology, BioMed Central, 2018, 18 (1), pp.54 (1-15). ⟨10.1186/s12870-018-1260-2⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-01850345/file/Chaintreuil_etal_BMC_Plant_Biol_2018_18-1.pdf BibTex
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Phosphorus deficiency increases nodule phytase activity of faba bean–rhizobia symbiosis
auteur
Bouchra Makoudi, Ablaa Kabbadj, Mohammed Mouradi, Laurie Amenc, Odile Domergue, Matthew Blair, Jean-Jacques Drevon, Cherki Ghoulam
article
Acta Physiologiae Plantarum, Springer Verlag, 2018, 40, ⟨10.1007/s11738-018-2619-6⟩
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Rhodopseudomonas palustris Strain CGA009 Produces an O-Antigen Built up by a C-4-Branched Monosaccharide: Structural and Conformational Studies
auteur
Roberta Marchetti, Emiliano Bedini, Djamel Gully, Rosa Lanzetta, Eric Giraud, Antonio Molinaro, Alba Silipo
article
Organic Letters, American Chemical Society, 2018, 20 (12), pp.3656-3660. ⟨10.1021/acs.orglett.8b01439⟩
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Bradyrhizobium Lipid A: Immunological Properties and Molecular Basis of Its Binding to the Myeloid Differentiation Protein-2/Toll-Like Receptor 4 Complex
auteur
Luigi Lembo-Fazio, Jean-Marc Billod, Flaviana Di Lorenzo, Ida Paciello, Mateusz Pallach, Sara Vaz-Francisco, Aurora Holgado, Rudi Beyaert, Manuel Fresno, Atsushi Shimoyama, Rosa Lanzetta, Koichi Fukase, Djamel Gully, Eric Giraud, Sonsoles Martin-Santamaria, Maria-Lina Bernardini, Alba Silipo
article
Frontiers in Immunology, Frontiers, 2018, 9, 14 p. ⟨10.3389/fimmu.2018.01888⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02621527/file/2018_Lembo-Fazio_Frontiers%20in%20Immunology_1.pdf BibTex
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Hopanoid lipids: from membranes to plant–bacteria interactions
auteur
Brittany J. Belin, Nicolas Busset, Eric Giraud, Antonio Molinaro, Alba Silipo, Dianne K. Newman
article
Nature Reviews Microbiology, Nature Publishing Group, 2018, 16 (5), pp.304-315. ⟨10.1038/nrmicro.2017.173⟩
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Biochemical characterization and efficacy of Pleurotus, Lentinus and Ganoderma parent and hybrid mushroom strains as biofertilizers of attapulgite for wheat and tomato growth
auteur
Deborah L. Narh Mensah, Robin Duponnois, Julie Bourillon, Frédéric Gressent, Yves Prin
article
Biocatalysis and Agricultural Biotechnology, 2018, 16, pp.63-72. ⟨10.1016/j.bcab.2018.07.021⟩
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Zymomonas mobilis exopolysaccharide structure and role in high ethanol tolerance
auteur
Mateusz Pallach, Roberta Marchetti, Flaviana Di Lorenzo, Antonio Fabozzi, Eric Giraud, Djamel Gully, Luigi Paduano, Antonio Molinaro, Gerardino D’errico, Alba Silipo
article
Carbohydrate Polymers, Elsevier, 2018, 201, pp.293-299. ⟨10.1016/j.carbpol.2018.08.072⟩
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Dynamics of ethylene production in response to compatible Nod factor
auteur
Dugald Reid, Huijun Liu, Simon Kelly, Yasuyuki Kawaharada, Terry Mun, Stig U. Andersen, Guilhem Desbrosses, Jens Stougaard
article
Plant Physiology, American Society of Plant Biologists, 2018, 176 (2), pp.1764-1772. ⟨10.1104/pp.17.01371⟩
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